单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4901 - 4920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4901 | 2025-10-06 |
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841
PMID:39919198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD22作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞表面标志物，并揭示其抑制T细胞效应程序的作用机制 | 首次发现CD22可作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞选择性表面标志物，并揭示CD22对T细胞效应程序的固有调控功能 | 寄生虫感染模型中IL-4依赖性T细胞激活和扩张的具体调控机制仍需进一步阐明 | 探究IL-4依赖性虚拟记忆CD8 T细胞激活和扩张的调控机制 | 虚拟记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4902 | 2025-10-06 |
Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta
2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2413191121
PMID:39793067
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研究论文 | 本研究探讨温度和性腺性别对红耳龟生殖细胞分化和减数分裂进程的独立影响 | 首次在温度依赖性性别决定物种中证明温度对生殖细胞性分化的直接影响独立于性腺体细胞 | 研究仅针对单一TSD物种（红耳龟），结果可能不适用于其他物种 | 探究温度是否直接影响生殖细胞分化和性别认同的其他方面 | 红耳龟（Trachemys scripta）胚胎和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 减数分裂铺片分析，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据，细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4903 | 2025-10-06 |
Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1556739
PMID:40160460
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了桦褐孔菌（Chaga）改善叶酸诱导的小鼠肾纤维化的细胞和分子机制 | 首次应用单细胞RNA测序技术研究桦褐孔菌治疗肾纤维化的作用，揭示了近端肾小管细胞、巨噬细胞和T细胞之间的相互作用网络 | 需要进一步的实验验证以确定其临床应用价值 | 探究桦褐孔菌治疗肾纤维化的潜在机制 | 叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型 | 单细胞测序 | 肾纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, UPLC-MS, 组织学染色 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 82,496个肾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4904 | 2025-10-06 |
Corrigendum: Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1629322
PMID:40510421
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correction | 本文是对先前发表文章的更正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4905 | 2025-10-06 |
Candida albicans: a historical overview of investigations into an important human pathogen
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0036
PMID:40522159
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综述 | 回顾白色念珠菌研究的历史发展，从早期临床观察到现代高通量基因组技术 | 整合多组学方法推进精准真菌学时代，追踪真菌种群基因组学的进化适应 | NA | 理解白色念珠菌的分子生物学、致病性和耐药机制 | 机会性致病真菌白色念珠菌 | NA | 侵袭性念珠菌病 | 全基因组测序,功能基因组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9基因组编辑,多组学方法 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4906 | 2025-10-06 |
Integrated Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing analyses identified OAS1 as a novel therapeutic target for erectile dysfunction via targeting fibroblasts
2024-Dec-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00587-7
PMID:39716299
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析，首次确定OAS1是通过靶向成纤维细胞治疗勃起功能障碍的新治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析与eQTL/pQTL数据来寻找ED治疗新靶点 | 需要进一步的实验和临床研究来验证OAS1在ED病理中的功能作用和治疗相关性 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点 | 勃起功能障碍患者 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, eQTL分析, pQTL分析 | NA | 基因表达数据, 基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4907 | 2025-10-06 |
MAIT cell plasticity enables functional adaptation that drives antibacterial immune protection
2024-12-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adp9841
PMID:39642244
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研究论文 | 本研究揭示了MAIT细胞的可塑性及其在抗菌免疫保护中的功能适应机制 | 首次在体内定义了MAIT1和MAIT17细胞亚群的可塑性，发现MAIT17细胞能够表型和功能转化为MAIT1细胞 | NA | 探究MAIT细胞的可塑性及其在抗菌免疫保护中的作用 | 小鼠和人类MAIT细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4908 | 2025-10-06 |
iGTP: Learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2024-Nov-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.03.29.24305092
PMID:39649598
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研究论文 | 提出了一种可解释的生成转录程序框架iGTP，用于从单细胞转录组数据中学习可解释的细胞嵌入表示 | 设计了结合转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用的新型可解释生成框架，能够建模不同生物状态间的相互作用 | NA | 开发可解释的深度学习方法，从单细胞转录组数据推断潜在的生物学机制 | 单细胞转录组数据中的细胞状态和生物过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 图神经网络, 潜在扩散模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4909 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional mapping reveals genetic and non-genetic determinants of aberrant differentiation in AML
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.26.573390
PMID:38234771
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建人类骨髓造血参考图谱，并分析AML中遗传和非遗传因素对异常分化的影响 | 构建了包含263,519个单细胞转录组的人类骨髓造血参考图谱，系统绘制了基因型与表型关联，揭示了AML中12种异常分化模式 | 依赖单细胞RNA测序数据，可能受技术偏差影响；样本来源有限 | 研究急性髓系白血病中遗传突变和非遗传因素对造血分化的影响机制 | 318例AML、混合表型急性白血病和急性红系白血病患者的120万个单细胞转录组 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 263,519个正常骨髓单细胞和120万个白血病单细胞，涵盖318个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4910 | 2025-10-06 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages (LAMs)
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614807
PMID:39386558
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了脂质相关巨噬细胞(LAMs)在多个组织和炎症条件下的保守性和组织特异性转录谱 | 首次系统性地比较了不同组织和炎症条件下LAMs的转录组特征，发现了保守性和组织特异性的基因程序 | 研究主要基于小鼠和人类的单细胞RNA测序数据，需要进一步的功能验证实验 | 探究脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组特征及其在代谢性疾病中的作用 | 小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞(LAMs) | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织和疾病模型的小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4911 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic characterization of pathologic niches in IPF
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl5473
PMID:39121212
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术表征特发性肺纤维化中的病理生态位 | 首次通过空间转录组学结合单细胞RNA测序图谱，识别出IPF中三种具有独特细胞组成和定位的疾病相关生态位 | NA | 解析特发性肺纤维化的空间病理生态位特征 | IPF患者和对照组的肺组织 | 空间转录组学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4912 | 2025-10-06 |
3D chromatin architecture, BRD4, and Mediator have distinct roles in regulating genome-wide transcriptional bursting and gene network
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4893
PMID:39121214
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研究论文 | 本研究通过数学建模分析单细胞RNA测序数据，揭示了3D染色质结构、BRD4和Mediator在调控全基因组转录爆发和基因网络中的不同作用 | 首次系统比较了不同调控因子在转录爆发动力学中的特异性作用，发现MED26主要调控爆发频率，MYC调控爆发大小，而cohesin和BRD4可同时调控两者 | 研究基于数学建模推断，需要进一步实验验证具体分子机制 | 解析转录爆发的分子调控机制 | 基因转录爆发动力学 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，数学建模 | 数学建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4913 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals mitochondrial calcium signaling as a modulator of endothelial-to-mesenchymal transition
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6182
PMID:39121218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现线粒体钙信号是内皮-间质转化的调节因子 | 首次识别线粒体钙摄取作为EndMT的关键驱动因素，并证明抑制MCU可阻止EndMT | 研究主要基于体外模型，临床样本有限 | 探索内皮-间质转化的分子机制及其在心血管疾病中的作用 | 内皮细胞、三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育、外周动脉疾病模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育样本、外周动脉疾病模型、严重肢体缺血患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4914 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics at the brain-electrode interface in rat motor cortex and the relationship to recording quality
2024-07-31, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ad5936
PMID:38885679
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析大鼠运动皮层中电极植入引起的基因表达变化及其与记录质量的关系 | 首次将空间转录组学应用于脑电极界面研究，识别出与记录质量相关的潜在生物标志物基因 | 研究仅在大鼠模型中进行，样本数量有限，需要进一步验证 | 探究脑部电极植入引起的组织反应及其对设备功能的影响 | 大鼠运动皮层中植入的密歇根式微电极阵列 | 空间转录组学 | 神经植入物相关组织反应 | 空间转录组学，免疫标记，电生理记录 | 回归分析 | 基因表达数据，电生理信号，免疫组织化学图像 | 大鼠脑组织切片，植入后24小时、1周和6周时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4915 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics reveals tumor heterogeneity and intercellular networks in colorectal cancer
2024-05-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06598-6
PMID:38729966
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术，揭示了结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间相互作用网络 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术结合应用于结直肠癌研究，识别了恶性细胞亚型并发现了肿瘤-基质区域间的关键配体-受体相互作用 | 样本量相对较小（仅3对结直肠癌肿瘤-正常-血液样本），研究结果需要在更大队列中验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间通讯机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、正常组织和血液样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 3对结直肠癌肿瘤-正常-血液样本，共41,700个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4916 | 2025-10-06 |
Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids
2024-05-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06703-9
PMID:38693114
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞开发了包含多种细胞类型的心脏类器官，用于模拟急性心肌梗死和心脏纤维化 | 首次开发了包含心肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的自组织心脏类器官，能够准确模拟成人心脏疾病状态 | 类器官模型仍无法完全复制体内心脏的复杂生理环境 | 建立临床相关的体外心脏疾病模型以替代动物实验 | 人诱导多能干细胞衍生的心脏类器官 | 干细胞与组织工程 | 心血管疾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、q-PCR、单细胞RNA测序 | 心脏类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4917 | 2025-10-06 |
MitoTracer facilitates the identification of informative mitochondrial mutations for precise lineage reconstruction
2023-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568285
PMID:38045409
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研究论文 | 开发了一种名为MitoTracer的开源计算算法，用于从单细胞测序数据中准确识别信息性线粒体突变并进行谱系重建 | 首次提供自动识别信息性线粒体突变的计算工具，在灵敏度和特异性方面优于现有方法 | NA | 开发用于单细胞谱系重建的计算工具 | 线粒体突变、单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 计算算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4918 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus Transcriptome Profiling of Dorsolateral Prefrontal Cortex: Mechanistic Roles for Neuronal Gene Expression, Including the 17q21.31 Locus, in PTSD Stress Response
2023-10-01, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.20220478
PMID:37491937
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研究论文 | 首次使用单核RNA测序技术研究创伤后应激障碍和重度抑郁症患者背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组机制 | 首次在PTSD中进行死后脑组织的单核RNA测序研究，揭示了细胞类型特异性机制，特别是在兴奋性和抑制性神经元中发现的17q21.31基因座相关差异表达基因 | 样本量相对有限（11例PTSD，10例MDD，11例对照），且为死后脑组织研究 | 阐明PTSD和MDD在背外侧前额叶皮层的细胞类型特异性转录组病理机制 | 人类死后背外侧前额叶皮层样本，包括PTSD患者、MDD患者和对照受试者 | 单细胞转录组学 | 创伤后应激障碍,重度抑郁症 | 单核RNA测序,诱导多能干细胞分化 | 差异基因表达分析 | 单核RNA测序数据 | 32个DLPFC样本（约415K细胞核），复制样本15个DLPFC样本（约160K细胞核） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 4919 | 2025-10-06 |
PIK3R1 and G0S2 are human placenta-specific imprinted genes associated with germline-inherited maternal DNA methylation
2025-Dec, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2025.2523191
PMID:40568952
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选发现并表征了两个人类胎盘特异性印记基因PIK3R1和G0S2 | 首次识别出胎盘特异性印记基因，这些基因与仅在胚胎植入前和胚外谱系中存在的瞬时种系DMRs相关 | 未发现这些基因在宫内生长受限或先兆子痫的胎盘样本中存在甲基化和表达差异 | 扩展胎盘特异性印记基因列表并研究其特性 | 人类胎盘组织、配子、囊胚和各种体细胞组织 | 表观遗传学 | 妊娠并发症 | 全基因组甲基化测序、单细胞RNA测序 | NA | 甲基化数据、RNA-seq数据 | 多种组织类型样本（包括配子、囊胚、胎盘等） | NA | 单细胞RNA-seq、全基因组甲基化分析 | NA | NA |
| 4920 | 2025-10-06 |
Development and Validation of a Flow-Dependent Endothelialized 3D Model of Intracranial Atherosclerotic Disease
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01310-4
PMID:39537986
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研究论文 | 开发并验证了一种基于患者特异性成像的流动依赖性内皮化3D颅内动脉粥样硬化疾病模型 | 首次创建了基于患者特异性神经影像的可内皮化并承受流动力的可重复ICAD模型，结合单细胞RNA测序分析流动依赖性内皮基因表达 | 依赖于神经影像数据的质量，模型复杂度可能限制高通量应用 | 开发用于研究颅内动脉粥样硬化疾病机制和治疗方法的实验模型 | 大脑中动脉的3D模型和人类内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，计算流体动力学，共聚焦显微镜 | 3D生物模型 | 图像，基因表达数据 | 使用SAMMPRIS临床试验的影像数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |