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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4901 | 2025-10-06 |
T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity
2025-04-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn2784
PMID:40279405
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜异位淋巴滤泡中T细胞与B细胞的广泛合作如何促进中枢神经系统自身免疫 | 首次通过活体成像直接观察T17-B细胞在脑膜异位淋巴滤泡中的持久抗原特异性接触,并发现中枢神经系统T细胞依赖B细胞维持促炎细胞因子谱 | 研究采用实验性自身免疫性脑脊髓炎模型,可能不完全反映人类多发性硬化症的复杂病理过程 | 探究脑膜异位淋巴滤泡在中枢神经系统自身免疫中的作用机制 | T细胞、B细胞及其在中枢神经系统的相互作用 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,活体成像 | T辅助17细胞过继转移实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4902 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2025-Apr-23, The world journal of men's health
DOI:10.5534/wjmh.240298
PMID:40583027
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研究论文 | 通过整合单细胞数据与孟德尔随机化分析,鉴定与前列腺癌细胞相关的预后基因 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化方法相结合,识别前列腺癌包膜侵袭相关的关键基因 | 样本量较小(仅6例前列腺癌病例),需要在更大队列中验证结果 | 研究前列腺癌包膜侵袭相关的预后基因 | 前列腺癌细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | hdWGCNA, Seurat, Cox回归 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 6例前列腺癌病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4903 | 2025-10-06 |
Identification of Recurrence-associated Gene Signatures and Machine Learning-based Prediction in IDH-Wildtype Histological Glioblastoma
2025-Apr-14, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02345-4
PMID:40227386
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析和机器学习方法,识别IDH野生型胶质母细胞瘤复发相关基因并建立预测模型 | 首次在IDH野生型组织学胶质母细胞瘤中鉴定8个复发相关基因,并开发了基于随机森林的高精度预测模型 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的泛化能力 | 探索胶质母细胞瘤复发的分子机制并建立复发预测模型 | IDH野生型组织学胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), RT-qPCR, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机森林(RF) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA-693队列190例, CGGA-325队列111例, 另有两个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
4904 | 2025-10-06 |
Psychological stress increases skin infection through the action of TGFβ to suppress immune-acting fibroblasts
2025-04-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ads0519
PMID:40215323
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和脂质组学分析揭示了心理压力通过TGFβ抑制真皮成纤维细胞免疫功能从而增加皮肤感染的机制 | 首次发现心理压力通过脑-皮肤轴介导的TGFβ信号通路抑制成纤维细胞产生抗菌肽cathelicidin的免疫防御功能 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中得到验证 | 探究心理压力增加皮肤感染易感性的分子机制 | 小鼠模型中的真皮成纤维细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学, 脂质组学分析 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4905 | 2025-10-06 |
Eutopic macrophages facilitate endometriosis progression via ferroptosis-mediated release of S100A9
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf027
PMID:40493892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现子宫内膜异位症患者在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡释放S100A9促进疾病进展 | 首次揭示在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡机制促进子宫内膜异位症发展的新机制 | NA | 探究巨噬细胞在子宫内膜异位症发病机制中的具体作用 | 子宫内膜异位症患者组织样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 小鼠模型 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4906 | 2025-10-06 |
Lysine methyltransferase SETD7 coordinates the emergence of mature and senescent subpopulations during the decidualization of endometrial stromal cells
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf028
PMID:40570096
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中调控细胞命运分化的新机制 | 首次发现SETD7通过稳定雌激素受体蛋白而非其组蛋白甲基化活性来调控蜕膜化,并鉴定其为细胞命运分化的关键调节因子 | 研究主要基于体外细胞模型和公共数据库分析,缺乏体内实验验证 | 探究SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中的调控作用 | 子宫内膜基质细胞(EnSC) | 表观遗传学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序, mRNA微阵列 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据和子宫内膜组织mRNA微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4907 | 2025-10-06 |
Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis
2025-02-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604
PMID:39982975
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研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化患者颈深淋巴结免疫景观,揭示EB病毒特征 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组与表位细胞索引技术,发现多发性硬化患者颈深淋巴结中EB病毒相关的B细胞失调机制 | 样本量有限,仅针对新诊断未治疗患者进行研究 | 探究多发性硬化发病机制中EB病毒的作用 | 多发性硬化患者的颈深淋巴结免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序, 转录组与表位细胞索引测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表位数据 | 新诊断未治疗多发性硬化患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
4908 | 2025-10-06 |
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841
PMID:39919198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD22作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞表面标志物,并揭示其抑制T细胞效应程序的作用机制 | 首次发现CD22可作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞选择性表面标志物,并揭示CD22对T细胞效应程序的固有调控功能 | 寄生虫感染模型中IL-4依赖性T细胞激活和扩张的具体调控机制仍需进一步阐明 | 探究IL-4依赖性虚拟记忆CD8 T细胞激活和扩张的调控机制 | 虚拟记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4909 | 2025-10-06 |
Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta
2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2413191121
PMID:39793067
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研究论文 | 本研究探讨温度和性腺性别对红耳龟生殖细胞分化和减数分裂进程的独立影响 | 首次在温度依赖性性别决定物种中证明温度对生殖细胞性分化的直接影响独立于性腺体细胞 | 研究仅针对单一TSD物种(红耳龟),结果可能不适用于其他物种 | 探究温度是否直接影响生殖细胞分化和性别认同的其他方面 | 红耳龟(Trachemys scripta)胚胎和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 减数分裂铺片分析,单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据,细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4910 | 2025-10-06 |
Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1556739
PMID:40160460
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了桦褐孔菌(Chaga)改善叶酸诱导的小鼠肾纤维化的细胞和分子机制 | 首次应用单细胞RNA测序技术研究桦褐孔菌治疗肾纤维化的作用,揭示了近端肾小管细胞、巨噬细胞和T细胞之间的相互作用网络 | 需要进一步的实验验证以确定其临床应用价值 | 探究桦褐孔菌治疗肾纤维化的潜在机制 | 叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型 | 单细胞测序 | 肾纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, UPLC-MS, 组织学染色 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 82,496个肾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4911 | 2025-10-06 |
Corrigendum: Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1629322
PMID:40510421
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correction | 本文是对先前发表文章的更正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4912 | 2025-10-06 |
Candida albicans: a historical overview of investigations into an important human pathogen
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0036
PMID:40522159
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综述 | 回顾白色念珠菌研究的历史发展,从早期临床观察到现代高通量基因组技术 | 整合多组学方法推进精准真菌学时代,追踪真菌种群基因组学的进化适应 | NA | 理解白色念珠菌的分子生物学、致病性和耐药机制 | 机会性致病真菌白色念珠菌 | NA | 侵袭性念珠菌病 | 全基因组测序,功能基因组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9基因组编辑,多组学方法 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
4913 | 2025-10-06 |
Integrated Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing analyses identified OAS1 as a novel therapeutic target for erectile dysfunction via targeting fibroblasts
2024-Dec-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00587-7
PMID:39716299
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析,首次确定OAS1是通过靶向成纤维细胞治疗勃起功能障碍的新治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析与eQTL/pQTL数据来寻找ED治疗新靶点 | 需要进一步的实验和临床研究来验证OAS1在ED病理中的功能作用和治疗相关性 | 识别勃起功能障碍的新型治疗靶点 | 勃起功能障碍患者 | 生物信息学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, eQTL分析, pQTL分析 | NA | 基因表达数据, 基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4914 | 2025-10-06 |
MAIT cell plasticity enables functional adaptation that drives antibacterial immune protection
2024-12-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adp9841
PMID:39642244
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研究论文 | 本研究揭示了MAIT细胞的可塑性及其在抗菌免疫保护中的功能适应机制 | 首次在体内定义了MAIT1和MAIT17细胞亚群的可塑性,发现MAIT17细胞能够表型和功能转化为MAIT1细胞 | NA | 探究MAIT细胞的可塑性及其在抗菌免疫保护中的作用 | 小鼠和人类MAIT细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4915 | 2025-10-06 |
iGTP: Learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2024-Nov-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.03.29.24305092
PMID:39649598
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研究论文 | 提出了一种可解释的生成转录程序框架iGTP,用于从单细胞转录组数据中学习可解释的细胞嵌入表示 | 设计了结合转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用的新型可解释生成框架,能够建模不同生物状态间的相互作用 | NA | 开发可解释的深度学习方法,从单细胞转录组数据推断潜在的生物学机制 | 单细胞转录组数据中的细胞状态和生物过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 图神经网络, 潜在扩散模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4916 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional mapping reveals genetic and non-genetic determinants of aberrant differentiation in AML
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.26.573390
PMID:38234771
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建人类骨髓造血参考图谱,并分析AML中遗传和非遗传因素对异常分化的影响 | 构建了包含263,519个单细胞转录组的人类骨髓造血参考图谱,系统绘制了基因型与表型关联,揭示了AML中12种异常分化模式 | 依赖单细胞RNA测序数据,可能受技术偏差影响;样本来源有限 | 研究急性髓系白血病中遗传突变和非遗传因素对造血分化的影响机制 | 318例AML、混合表型急性白血病和急性红系白血病患者的120万个单细胞转录组 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 263,519个正常骨髓单细胞和120万个白血病单细胞,涵盖318个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4917 | 2025-10-06 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages (LAMs)
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614807
PMID:39386558
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了脂质相关巨噬细胞(LAMs)在多个组织和炎症条件下的保守性和组织特异性转录谱 | 首次系统性地比较了不同组织和炎症条件下LAMs的转录组特征,发现了保守性和组织特异性的基因程序 | 研究主要基于小鼠和人类的单细胞RNA测序数据,需要进一步的功能验证实验 | 探究脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组特征及其在代谢性疾病中的作用 | 小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞(LAMs) | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织和疾病模型的小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4918 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic characterization of pathologic niches in IPF
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl5473
PMID:39121212
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术表征特发性肺纤维化中的病理生态位 | 首次通过空间转录组学结合单细胞RNA测序图谱,识别出IPF中三种具有独特细胞组成和定位的疾病相关生态位 | NA | 解析特发性肺纤维化的空间病理生态位特征 | IPF患者和对照组的肺组织 | 空间转录组学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4919 | 2025-10-06 |
3D chromatin architecture, BRD4, and Mediator have distinct roles in regulating genome-wide transcriptional bursting and gene network
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4893
PMID:39121214
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研究论文 | 本研究通过数学建模分析单细胞RNA测序数据,揭示了3D染色质结构、BRD4和Mediator在调控全基因组转录爆发和基因网络中的不同作用 | 首次系统比较了不同调控因子在转录爆发动力学中的特异性作用,发现MED26主要调控爆发频率,MYC调控爆发大小,而cohesin和BRD4可同时调控两者 | 研究基于数学建模推断,需要进一步实验验证具体分子机制 | 解析转录爆发的分子调控机制 | 基因转录爆发动力学 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,数学建模 | 数学建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4920 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals mitochondrial calcium signaling as a modulator of endothelial-to-mesenchymal transition
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6182
PMID:39121218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现线粒体钙信号是内皮-间质转化的调节因子 | 首次识别线粒体钙摄取作为EndMT的关键驱动因素,并证明抑制MCU可阻止EndMT | 研究主要基于体外模型,临床样本有限 | 探索内皮-间质转化的分子机制及其在心血管疾病中的作用 | 内皮细胞、三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育、外周动脉疾病模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育样本、外周动脉疾病模型、严重肢体缺血患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |