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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4881 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals Sox6 positive interneurons enriched in the prefrontal cortex of female mice vulnerable to chronic social stress
2025-Jun-28, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03088-9
PMID:40581656
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示雌性小鼠前额叶皮层中富含Sox6阳性中间神经元与慢性社交应激易感性相关 | 首次在雌性小鼠中发现Sox6中间神经元在慢性社交应激易感性中的富集现象及其与炎症反应和突触功能的关联 | 研究仅限于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究抑郁症在女性中高发的细胞和分子机制 | 雌性小鼠前额叶皮层的各类细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单核RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性小鼠前额叶皮层细胞 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
4882 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing has revealed the palmitoylation landscape in lung adenocarcinoma and identified ABHD17C as a novel biomarker
2025-Jun-27, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.024
PMID:40582697
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了肺腺癌中的蛋白质棕榈酰化修饰景观,并鉴定出ABHD17C作为新型生物标志物 | 首次在单细胞水平系统描绘肺腺癌棕榈酰化修饰图谱,发现C4上皮亚型与肿瘤转移相关,鉴定ABHD17C为关键调控因子 | NA | 探索肺腺癌中蛋白质棕榈酰化修饰的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 单细胞生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,拷贝数变异分析,伪时间分析,富集分析,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4883 | 2025-10-06 |
Uncovering minimal pathways in melanoma initiation
2025-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60742-0
PMID:40571713
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了黑色素瘤起始的最小通路,发现仅携带Braf突变的裸鼠也能产生缓慢生长的肿瘤 | 发现仅Braf单突变即可诱导黑色素瘤形成,并鉴定出神经嵴样细胞作为恶性前体细胞 | 无法找到解释大多数肿瘤发生的从头突变或结构变异 | 探索黑色素瘤起始的最小遗传通路 | 小鼠黑色素瘤模型 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4884 | 2025-10-06 |
Distinct expression of CD56 and CD19 marks molecular and functional endotypes of tetanus- versus RBD-specific human bone marrow plasma cells
2025-Jun-24, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf059
PMID:40581803
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研究论文 | 本研究通过分析CD56和CD19在人类骨髓浆细胞中的共表达模式,揭示了破伤风类毒素与SARS-CoV-2 RBD特异性浆细胞之间的分子和功能差异 | 首次发现CD56+CD19-骨髓浆细胞亚群在抗原特异性浆细胞中的差异分布,并揭示其与细胞组织滞留和长期存活的相关性 | 研究主要基于表型分析和已有单细胞RNA测序数据,缺乏功能性实验验证 | 探究不同抗原特异性骨髓浆细胞亚群的表型和转录特征差异 | 人类骨髓浆细胞,特别是破伤风类毒素和SARS-CoV-2 RBD特异性浆细胞 | 免疫学 | 传染病 | 多参数流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4885 | 2025-10-06 |
Direct single cell-type gene expression analysis in peripheral blood: novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for detection of bacterial infection
2025-Jun-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf103
PMID:40581066
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研究论文 | 开发了一种无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法DIRECT LS-TA,用于检测细菌感染 | 提出了基于比例的生物标志物方法,使用PSAP和CTSS作为新型单核细胞参考基因,可直接从外周血量化单核细胞特异性基因表达 | NA | 开发无需细胞分选的单细胞类型基因表达分析方法用于细菌感染检测 | 外周血单核细胞基因表达 | 基因表达分析 | 细菌感染 | 单细胞类型基因表达分析,比例生物标志物方法 | 数学细胞混合基因表达模型 | 基因表达数据 | 多个数据集验证 | NA | 基因表达分析 | NA | NA |
4886 | 2025-10-06 |
Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confers multidrug resistance in PCNSL
2025-Jun-21, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf154
PMID:40580931
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术识别了原发性中枢神经系统淋巴瘤中的浆母细胞样淋巴瘤细胞亚群,并揭示了其在多药耐药中的关键作用 | 首次在PCNSL中识别出浆母细胞样淋巴瘤细胞这一独特亚群,并阐明其通过特定分子特征导致多药耐药的机制 | 样本量相对有限(56例患者),且为观察性研究 | 探索PCNSL的分子特征和耐药机制 | 56例新诊断的原发性中枢神经系统淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学,B细胞受体测序,多重免疫组织化学,离体药物反应试验 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫组织化学图像,药物反应数据 | 56例PCNSL患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq,B细胞受体测序 | NA | NA |
4887 | 2025-10-06 |
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Jun-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.06.14.25328971
PMID:40585110
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研究论文 | 本研究通过跨种族分析发现HLA-DQB1*03:01独立影响1型发作性睡病的发病年龄 | 首次进行跨种族发病年龄研究,发现DQB1*03:01对发病年龄的强烈影响独立于DQA1等位基因和种族背景 | 尚未确定导致疾病的T细胞 | 研究HLA-DQB1*03:01对1型发作性睡病发病年龄的影响 | 5,339例1型发作性睡病患者(来自中国、欧洲、韩国、日本和美国) | 遗传学 | 发作性睡病 | GWAS, HLA基因型推算, TCR分析, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因分型数据, RNA-seq数据 | 5,339例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4888 | 2025-10-06 |
Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304
PMID:40358364
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研究论文 | 本研究探讨奥拉帕尼联合或不联合地加瑞克在新诊断前列腺癌中的疗效及生物学机制 | 首次在无同源重组修复基因突变的前列腺癌患者中研究PARP抑制剂联合雄激素阻断的疗效机制 | 样本量有限,为单中心研究 | 研究PARP抑制剂和雄激素阻断联合治疗对原发性前列腺癌的生物学效应 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,基因测序 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 未明确样本数量的前列腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4889 | 2025-10-06 |
Azacitidine, Venetoclax, and Magrolimab in Newly Diagnosed and Relapsed Refractory Acute Myeloid Leukemia: Phase Ib/II Study and Correlative Analysis
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0229
PMID:40198272
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研究论文 | 评估阿扎胞苷、维奈托克和马格罗利单抗三联疗法在初治和复发难治性急性髓系白血病患者中的安全性和疗效 | 首次在临床研究中评估CD47抗体马格罗利单抗与阿扎胞苷-维奈托克联合使用的协同治疗效果 | 样本量有限,未获得理想的生存结局数据 | 评估三联疗法在急性髓系白血病患者中的安全性和疗效 | 初治(不适合强化疗)和复发难治性急性髓系白血病成年患者 | 临床医学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析 | NA | 临床数据,基因表达数据 | 106名患者(初治队列54人,复发难治队列52人),其中27个纵向样本来自11名TP53突变患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4890 | 2025-10-06 |
Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance
2025-06-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284
PMID:40478933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者滑膜液免疫图谱,发现免疫蛋白酶体上调与治疗耐药性相关 | 首次在银屑病关节炎耐药患者中发现免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调,并通过功能实验验证其治疗潜力 | 样本量相对有限(41例PsA患者和9例OA对照),需要更大规模研究验证 | 探索银屑病关节炎治疗耐药性的免疫学机制 | 银屑病关节炎患者和骨关节炎对照患者的滑膜液免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4891 | 2025-10-06 |
Potential Key Genes for Giant Cell Arteritis Revealed Based on Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Analysis
2025-May-09, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000546323
PMID:40349694
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,识别出与巨细胞动脉炎发病风险相关的三个关键基因 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法探索CD4+ T细胞中标志性基因对GCA的因果效应 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和规模可能存在限制 | 识别与巨细胞动脉炎相关的关键基因并探索潜在致病机制 | 巨细胞动脉炎患者和CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析 | 两样本孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4892 | 2025-10-06 |
Fusion of spatiotemporal and network models to prioritize multiscale effects in single-cell perturbations
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf277
PMID:40545244
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研究论文 | 提出Perturb-STNet框架,通过融合时空和网络模型来识别单细胞扰动中的多尺度效应 | 开发了首个基于网络的时空模型框架,能够对单细胞扰动数据中的空间和时间差异表达调控因子进行排序 | 方法在复杂多细胞/多组织系统中的验证仍需进一步扩展 | 识别驱动发育和疾病过程的时空差异表达调控因子 | 单细胞扰动数据中的调控因子、细胞和邻域相互作用 | 计算生物学 | 肺癌、黑色素瘤、结肠炎 | 单细胞成像、空间转录组学 | 网络时空模型 | 单细胞时空数据 | 合成数据、肺癌数据、小鼠黑色素瘤模型、结肠炎数据 | NA | CODEX单细胞成像、MERFISH空间转录组学 | NA | CODEX单细胞成像时间序列数据、MERFISH空间转录组学时间序列数据 |
4893 | 2025-07-02 |
Correction to: ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf337
PMID:40580031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4894 | 2025-10-06 |
T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity
2025-04-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn2784
PMID:40279405
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜异位淋巴滤泡中T细胞与B细胞的广泛合作如何促进中枢神经系统自身免疫 | 首次通过活体成像直接观察T17-B细胞在脑膜异位淋巴滤泡中的持久抗原特异性接触,并发现中枢神经系统T细胞依赖B细胞维持促炎细胞因子谱 | 研究采用实验性自身免疫性脑脊髓炎模型,可能不完全反映人类多发性硬化症的复杂病理过程 | 探究脑膜异位淋巴滤泡在中枢神经系统自身免疫中的作用机制 | T细胞、B细胞及其在中枢神经系统的相互作用 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,活体成像 | T辅助17细胞过继转移实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4895 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2025-Apr-23, The world journal of men's health
DOI:10.5534/wjmh.240298
PMID:40583027
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研究论文 | 通过整合单细胞数据与孟德尔随机化分析,鉴定与前列腺癌细胞相关的预后基因 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化方法相结合,识别前列腺癌包膜侵袭相关的关键基因 | 样本量较小(仅6例前列腺癌病例),需要在更大队列中验证结果 | 研究前列腺癌包膜侵袭相关的预后基因 | 前列腺癌细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | hdWGCNA, Seurat, Cox回归 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 6例前列腺癌病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4896 | 2025-10-06 |
Identification of Recurrence-associated Gene Signatures and Machine Learning-based Prediction in IDH-Wildtype Histological Glioblastoma
2025-Apr-14, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02345-4
PMID:40227386
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析和机器学习方法,识别IDH野生型胶质母细胞瘤复发相关基因并建立预测模型 | 首次在IDH野生型组织学胶质母细胞瘤中鉴定8个复发相关基因,并开发了基于随机森林的高精度预测模型 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的泛化能力 | 探索胶质母细胞瘤复发的分子机制并建立复发预测模型 | IDH野生型组织学胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), RT-qPCR, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机森林(RF) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA-693队列190例, CGGA-325队列111例, 另有两个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
4897 | 2025-10-06 |
Psychological stress increases skin infection through the action of TGFβ to suppress immune-acting fibroblasts
2025-04-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ads0519
PMID:40215323
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和脂质组学分析揭示了心理压力通过TGFβ抑制真皮成纤维细胞免疫功能从而增加皮肤感染的机制 | 首次发现心理压力通过脑-皮肤轴介导的TGFβ信号通路抑制成纤维细胞产生抗菌肽cathelicidin的免疫防御功能 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中得到验证 | 探究心理压力增加皮肤感染易感性的分子机制 | 小鼠模型中的真皮成纤维细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学, 脂质组学分析 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4898 | 2025-10-06 |
Eutopic macrophages facilitate endometriosis progression via ferroptosis-mediated release of S100A9
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf027
PMID:40493892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现子宫内膜异位症患者在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡释放S100A9促进疾病进展 | 首次揭示在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡机制促进子宫内膜异位症发展的新机制 | NA | 探究巨噬细胞在子宫内膜异位症发病机制中的具体作用 | 子宫内膜异位症患者组织样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 小鼠模型 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4899 | 2025-10-06 |
Lysine methyltransferase SETD7 coordinates the emergence of mature and senescent subpopulations during the decidualization of endometrial stromal cells
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf028
PMID:40570096
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中调控细胞命运分化的新机制 | 首次发现SETD7通过稳定雌激素受体蛋白而非其组蛋白甲基化活性来调控蜕膜化,并鉴定其为细胞命运分化的关键调节因子 | 研究主要基于体外细胞模型和公共数据库分析,缺乏体内实验验证 | 探究SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中的调控作用 | 子宫内膜基质细胞(EnSC) | 表观遗传学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序, mRNA微阵列 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据和子宫内膜组织mRNA微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4900 | 2025-10-06 |
Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis
2025-02-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604
PMID:39982975
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研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化患者颈深淋巴结免疫景观,揭示EB病毒特征 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组与表位细胞索引技术,发现多发性硬化患者颈深淋巴结中EB病毒相关的B细胞失调机制 | 样本量有限,仅针对新诊断未治疗患者进行研究 | 探究多发性硬化发病机制中EB病毒的作用 | 多发性硬化患者的颈深淋巴结免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序, 转录组与表位细胞索引测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表位数据 | 新诊断未治疗多发性硬化患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |