单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 4881 - 4900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4881 | 2024-12-29 |
Single-Cell RNA-Seq Debiased Clustering via Batch Effect Disentanglement
2024-08, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2023.3260003
PMID:37030864
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCDC的单细胞RNA-seq去偏聚类方法，通过分离生物和非生物信息来解决批次效应问题 | SCDC方法在数据分区过程中分离生物和非生物信息，从而在存在批次效应的情况下实现去偏聚类 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA-seq数据中批次效应对聚类结果的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 4882 | 2024-12-29 |
The combined use of scRNA-seq and network propagation highlights key features of pan-cancer Tumor-Infiltrating T cells
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315980
PMID:39729479
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研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序和网络传播技术，揭示了泛癌肿瘤浸润T细胞的关键特征 | 结合单细胞RNA测序和网络传播技术，克服了单细胞转录组学中的噪声和稀疏性问题，并揭示了TI-Treg和Tex的发育、功能及其免疫代谢特异性 | NA | 提高免疫肿瘤学中药物选择性和有效性的未来治疗发展 | 肿瘤浸润调节性T细胞（TI-Tregs）和耗竭T细胞（Tex） | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 4883 | 2024-12-29 |
[Neuronal models based on olfactory epithelial cells in the study of the pathogenesis of mental disorders]
2024, Zhurnal nevrologii i psikhiatrii imeni S.S. Korsakova
DOI:10.17116/jnevro202412412120
PMID:39731365
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综述 | 本文综述了基于嗅觉上皮细胞的神经元模型在研究精神障碍发病机制中的应用 | 利用嗅觉上皮细胞模型研究精神疾病的分子机制，特别是通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析等先进技术 | NA | 研究精神障碍的发病机制及个性化治疗方法 | 精神分裂症、双相情感障碍和阿尔茨海默病 | 神经科学 | 精神障碍 | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 细胞数据 | NA |
| 4884 | 2024-12-28 |
Deciphering distinct pathogenic mechanisms of ankylosing spondylitis and systemic sclerosis via shared biomarkers ZSWIM6 and CCL3L3: Insights from an integrative bioinformatics approach
2025-Dec, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2024.2445557
PMID:39727004
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研究论文 | 通过共享生物标志物ZSWIM6和CCL3L3，揭示强直性脊柱炎和系统性硬化症的不同致病机制 | 首次通过整合生物信息学方法，识别出ZSWIM6和CCL3L3作为强直性脊柱炎和系统性硬化症的潜在生物标志物，并深入探讨了它们在两种疾病中的不同分子机制 | 研究主要依赖于公开的RNA-seq数据集，样本来源和数量可能限制了结果的普适性 | 探索强直性脊柱炎和系统性硬化症的不同炎症致病机制，以提供新的治疗见解 | 强直性脊柱炎和系统性硬化症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM, CIBERSORT | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE73754和GSE19617数据集中的外周血单核细胞样本，以及GSE194315数据集中的单细胞RNA测序数据 |
| 4885 | 2024-12-28 |
YAP Overcomes Mechanical Barriers to Induce Mitotic Rounding and Adult Cardiomyocyte Division
2025-Jan-07, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文研究了YAP5SA如何克服机械障碍，诱导成年心肌细胞的有丝分裂圆化和分裂 | 揭示了YAP5SA通过克服心肌微环境的机械约束，诱导心肌细胞有丝分裂圆化和分裂的新机制 | 研究主要基于细胞培养模型，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨成年哺乳动物心肌细胞如何重新进入细胞周期 | 成年哺乳动物心肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、标记基因分析、功能研究 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4886 | 2024-12-28 |
Histopathologic Analysis of Human Kidney Spatial Transcriptomics Data: Toward Precision Pathology
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.011
PMID:39097165
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学（ST）技术在人类肾脏样本中的应用，旨在通过形态学方法解释ST数据，提高对慢性肾脏病病变现象的理解 | 提出了基于形态学的ST数据分析方法，能够更准确地解释肾脏病变的细胞和分子机制 | 研究仅基于人类肾脏样本，未涉及其他组织或疾病模型 | 通过空间转录组学技术，提高对慢性肾脏病病变现象的理解，推动精准病理学的发展 | 人类肾脏样本 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学（ST） | NA | 空间转录组数据 | 人类肾脏样本 |
| 4887 | 2024-12-28 |
The contribution of the novel CLTC-VMP1 fusion gene to autophagy regulation and energy metabolism in cisplatin-resistant osteosarcoma
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00302.2024
PMID:39466176
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研究论文 | 本研究探讨了CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药机制中的作用及其通过调节自噬和凋亡平衡介导能量代谢重编程的分子机制 | 首次发现CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药中的关键作用，并通过单细胞转录组分析揭示了肿瘤细胞的异质性 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，尚未在临床样本中进行验证 | 探索CLTC-VMP1基因融合在骨肉瘤化疗耐药机制中的作用 | 骨肉瘤细胞系和小鼠模型 | 分子生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组分析、慢病毒载体 | NA | 转录组数据 | 人类骨肉瘤细胞系和小鼠模型 |
| 4888 | 2024-12-28 |
Convergent and divergent immune aberrations in COVID-19, post-COVID-19-interstitial lung disease, and idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00528.2024
PMID:39510135
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研究论文 | 本研究探讨了与COVID-19死亡率增加、COVID-19后间质性肺病（ILD）肺纤维化消退以及特发性肺纤维化（IPF）持续相关的循环免疫细胞的转录和表型变化 | 识别了基于50基因特征的三种基因组风险特征，揭示了单核细胞和T细胞亚群的基因组失衡，并强调了COVID-19后ILD与IPF之间的基因组差异 | 样本量相对较小，且未涵盖所有可能的免疫细胞类型 | 研究COVID-19、COVID-19后ILD和IPF中循环免疫细胞的转录和表型变化，以揭示其与疾病风险和预后的关系 | 227名COVID-19、COVID-19后ILD、IPF患者及对照组的全血和外周血单核细胞（PBMCs） | 免疫学 | COVID-19, 间质性肺病, 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, Luminex检测 | NA | 基因表达数据, 血浆生物标志物数据 | 227名受试者 |
| 4889 | 2024-12-28 |
Advances in Single-Cell Sequencing and Spatial Profiling of Kidney Disease
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.10.010
PMID:39722281
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4890 | 2024-12-28 |
Three-dimensional single-cell transcriptome imaging of thick tissues
2024-Dec-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90029
PMID:39727221
|
研究论文 | 本文提出了一种用于厚组织的三维单细胞转录组成像方法 | 首次将MERFISH技术应用于厚度达200 µm的厚组织样本，并结合共聚焦显微镜和深度学习提高成像速度和质量 | 目前仅在小鼠脑组织切片上进行了验证，尚未在其他组织或生物体中广泛应用 | 开发一种能够在厚组织中进行三维单细胞转录组成像的技术 | 小鼠脑组织切片 | 空间基因组学 | NA | MERFISH, 共聚焦显微镜, 深度学习 | 深度学习 | 图像 | 厚度达200 µm的小鼠脑组织切片 |
| 4891 | 2024-12-28 |
Gene expression and hormonal signaling in osteoporosis: from molecular mechanisms to clinical breakthroughs
2024-Dec-27, Journal of biomaterials science. Polymer edition
DOI:10.1080/09205063.2024.2445376
PMID:39729311
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综述 | 本文综述了骨质疏松症管理中的最新发现，特别是基因表达和激素控制 | 介绍了单细胞RNA测序和长链非编码RNA等最新方法，并探讨了激素信号传导和患者特异性治疗的新发现 | 需要进一步研究和科学家与临床医生的合作，以将这些新发现应用于实际医学治疗中 | 探讨骨质疏松症的管理方法，特别是基因表达和激素控制 | 骨质疏松症患者 | NA | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4892 | 2024-12-28 |
Spatial diversity of in vivo tissue immunity
2024-Dec-26, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxae051
PMID:39177484
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研究论文 | 本文探讨了体内组织免疫系统的空间多样性 | 利用活体成像和空间转录组学等先进技术揭示了免疫细胞在器官内的空间异质性及其功能 | 未提及具体的技术限制或研究中的不足之处 | 研究免疫系统在体内组织中的空间分布及其功能 | 肝脏、肾脏、肠道和肺等器官中的免疫细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 活体成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 4893 | 2024-12-28 |
Exploring the molecular mechanism of estrogen therapy effectiveness after TCRA in IUA patients at single-cell level
2024-Dec-26, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00583-x
PMID:39722036
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序探索了雌激素治疗在TCRA后IUA患者中的分子机制 | 首次在单细胞水平上建立了对雌激素治疗有反应和无反应患者的子宫内膜单细胞图谱，揭示了不同细胞亚型在治疗反应中的差异 | 样本量较小，仅包括10个人类子宫内膜样本 | 探索雌激素治疗在TCRA后IUA患者中疗效差异的分子机制 | IUA患者的子宫内膜样本 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 10个人类子宫内膜样本 |
| 4894 | 2024-12-28 |
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2024-Dec-26, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-024-03733-z
PMID:39725707
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综述 | 本文综述了新生儿出血后脑积水的分子病理生理学及新兴治疗方法 | 探讨了神经炎症通路在PHH中的作用，并评估了基于间充质干细胞的干预等新兴疗法的潜力 | 关于这些新疗法在新生儿中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未解决 | 评估PHH的分子病理生理学及新兴治疗方法 | 新生儿出血后脑积水（PHH） | NA | 新生儿疾病 | 全基因组/外显子组测序、蛋白质组学、表观遗传学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 4895 | 2024-12-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the critical role of alternative splicing in cattle testicular spermatagonia
2024-Dec-26, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00579-7
PMID:39726007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了牛睾丸精原细胞中可变剪接的关键作用 | 首次在牛睾丸精原细胞中揭示了YY1调控的可变剪接活动及其对剪接体蛋白的靶向作用 | 样本仅来自五头荷斯坦公牛，可能限制了结果的普适性 | 研究牛睾丸精原细胞中可变剪接的作用及其在精原细胞发育中的功能 | 牛睾丸精原细胞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自五头荷斯坦公牛的26,888个睾丸细胞 |
| 4896 | 2024-12-28 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct a neutrophil prognostic model for predicting prognosis and immune response in oral squamous cell carcinoma
2024-Dec-26, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-024-00712-7
PMID:39726033
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个用于预测口腔鳞状细胞癌预后和免疫反应的中性粒细胞预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建中性粒细胞预后模型，并揭示其在口腔鳞状细胞癌中的关键作用 | 研究依赖于现有数据集，未进行实验验证，可能影响模型的普适性 | 构建中性粒细胞预后模型，预测口腔鳞状细胞癌的预后和免疫反应 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），加权基因共表达网络分析（hdWGCNA） | Lasso-Cox回归模型 | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4897 | 2024-12-28 |
SPP1+ macrophages promote head and neck squamous cell carcinoma progression by secreting TNF-α and IL-1β
2024-Dec-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03255-w
PMID:39726047
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研究论文 | 本研究探讨了SPP1+巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）恶性进展中的作用及其机制 | 首次揭示了SPP1+巨噬细胞通过分泌TNF-α和IL-1β促进HNSCC进展的机制，并验证了其作为抗肿瘤治疗潜在靶点的可能性 | 样本量较小，仅涉及5名HNSCC患者，且未探讨SPP1+巨噬细胞在其他类型癌症中的作用 | 识别和验证SPP1+巨噬细胞在HNSCC恶性进展中的角色和功能 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者及其肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、多重免疫组化染色、多重免疫荧光染色、Luminex液体悬浮芯片检测 | NA | RNA测序数据、免疫组化数据、免疫荧光数据、细胞因子检测数据 | 5名HNSCC患者的配对肿瘤和正常组织 |
| 4898 | 2024-12-28 |
Spatial Proteomics towards cellular Resolution
2024-Dec-25, Expert review of proteomics
IF:3.8Q1
DOI:10.1080/14789450.2024.2445809
PMID:39710940
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研究论文 | 本文综述了基于非靶向质谱的空间蛋白质组学工作流程，并探讨了其在细胞分辨率方面的最新进展 | 强调了在组织解剖、样品处理、生物信息学和液相色谱-质谱技术方面的最新进展，推动空间蛋白质组学向细胞分辨率迈进 | 需要进一步发展数据分析和自动化智能组织解剖技术，以及高通量液相色谱-质谱分析 | 推动空间蛋白质组学向细胞分辨率发展，以更深入地理解组织微环境中的分子空间组织 | 组织微环境中的蛋白质表达 | 空间生物学 | NA | 非靶向质谱、液相色谱-质谱 | NA | 蛋白质表达数据 | 数千个样品 |
| 4899 | 2024-12-28 |
PKM2-mediated STAT3 phosphorylation promotes acute liver failure via regulating NLRP3-dependent pyroptosis
2024-Dec-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07227-w
PMID:39722076
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研究论文 | 本文探讨了PKM2通过调节STAT3磷酸化促进急性肝衰竭的机制，特别是通过调控NLRP3依赖的细胞焦亡 | 揭示了PKM2作为NLRP3的非代谢调节因子，通过核转位与STAT3结合，增强其磷酸化并招募到NLRP3启动子区域，从而增加NLRP3表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 研究PKM2在急性肝衰竭中的作用机制，特别是其通过NLRP3介导的细胞焦亡调控炎症反应的机制 | 急性肝衰竭小鼠模型及肝脏巨噬细胞 | 生物医学 | 急性肝衰竭 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | D-半乳糖胺/LPS诱导的急性肝衰竭小鼠 |
| 4900 | 2024-12-28 |
Cytokines reprogram airway sensory neurons in asthma
2024-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115045
PMID:39661516
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研究论文 | 本研究探讨了在过敏性气道炎症期间，气道伤害感受神经元的分子谱变化及其重编程的信号机制 | 首次识别了一类专门支配气道的炎症性迷走神经伤害感受神经元，并揭示了IL-1β、IL-13和BDNF在重编程中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 揭示过敏性气道炎症中伤害感受神经元获得促炎特性的具体机制 | 气道伤害感受神经元 | NA | 哮喘 | 逆行追踪、谱系报告、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 过敏性气道炎症小鼠模型 |