单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 4861 - 4880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4861 | 2024-08-27 |
Identification and validation of potential biomarkers related to oxidative stress in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152791
PMID:39180853
|
研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学技术识别与特发性肺纤维化（IPF）中氧化应激相关的可靠诊断生物标志物 | 利用随机森林算法结合随机最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归识别诊断基因，并构建诺模图评估疾病风险 | NA | 识别与特发性肺纤维化中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 特发性肺纤维化中的氧化应激相关基因 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 使用GSE70866和GSE141939数据集，涉及437个氧化应激相关基因和10个差异表达的氧化应激相关基因 |
| 4862 | 2024-09-05 |
Vagal TRPV1 + sensory neurons regulate myeloid cell dynamics and protect against influenza virus infection
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.609013
PMID:39229208
|
研究论文 | 研究揭示了迷走TRPV1感觉神经元在调节骨髓细胞动态和保护小鼠免受流感病毒感染中的作用 | 首次阐明了迷走TRPV1感觉神经元在肺部抗病毒防御中的功能，并揭示了其在调节骨髓细胞反应和免疫病理学中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在其他物种或人体中验证这些发现 | 探讨迷走TRPV1感觉神经元在流感病毒感染中的作用及其对肺部免疫反应的影响 | 迷走TRPV1感觉神经元及其在流感病毒感染中的作用 | 免疫学 | 流感 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠 |
| 4863 | 2024-08-05 |
Targeting the dynamic transcriptional landscape of Treg subpopulations in pancreatic ductal adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing analysis with a focus on CTLA4 and TIGIT
2024-07, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152822
PMID:38852289
|
研究论文 | 本研究重新分析了一项来自PDAC的单细胞RNA测序数据集，探讨了肿瘤及正常组织的异质性，重点关注Treg细胞及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 首次揭示了PDAC中自然Tregs与诱导Tregs的数量差异，以及它们与其他细胞类型之间的关键通信途径 | 本研究主要依赖于已有的数据集，缺乏来自临床样本的直接验证 | 研究PDAC中的调节性T细胞与其他细胞在肿瘤微环境中的交互作用 | 调节性T细胞（Tregs）及其与其他肿瘤微环境细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |
| 4864 | 2024-12-08 |
Interstitial macrophages are a focus of viral takeover and inflammation in COVID-19 initiation in human lung
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232192
PMID:38597954
|
研究论文 | 研究定义了SARS-CoV-2病毒在人类肺组织中的细胞嗜性和转录组效应 | 首次详细描述了SARS-CoV-2病毒在人类肺组织中对间质巨噬细胞的感染及其引发的炎症和纤维化反应 | 研究仅限于健康人肺组织的体外实验，未涉及临床患者样本 | 揭示COVID-19早期阶段病毒感染和炎症反应的机制 | SARS-CoV-2病毒在人类肺组织中的感染和转录组变化 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康人肺组织样本 |
| 4865 | 2024-08-04 |
Accurately deciphering spatial domains for spatially resolved transcriptomics with stCluster
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae329
PMID:38975895
|
研究论文 | 本文介绍了一种新方法stCluster，用于提高空间转录组数据的空间域识别准确性 | stCluster结合了图对比学习和多任务学习，以优化空间转录组数据的表示 | 目前还未提及具体的局限性 | 优化空间转录组数据的解读，以更好地识别复杂空间域 | 空间转录组数据以及其与基因表达和空间组织的关系 | 数字病理学 | NA | 图对比学习 | NA | 空间转录组数据 | 覆盖组织、器官和胚胎等多个数据集和平台 |
| 4866 | 2024-08-05 |
The heterogeneity of tumour-associated macrophages contributes to the clinical outcomes and indications for immune checkpoint blockade in colorectal cancer patients
2024-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152805
PMID:38669865
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌患者临床结果和免疫检查点抑制治疗中的作用 | 研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞的异质性与患者预后及免疫疗法反应之间的关系 | 研究仅基于60名结直肠癌患者的数据，样本量相对较小 | 了解肿瘤相关巨噬细胞的异质性如何影响结直肠癌的临床结果和免疫治疗指征 | 结直肠癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 60名结直肠癌患者 |
| 4867 | 2025-01-28 |
Gene regulatory patterning codes in early cell fate specification of the C. elegans embryo
2024-Jan-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87099
PMID:38284404
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，确定了C. elegans胚胎1至102细胞阶段的转录组，揭示了119种胚胎细胞状态，并发现基因表达程序根据亚细胞谱系模块化 | 首次系统地研究了C. elegans胚胎早期和晚期原肠胚形成中间阶段的转录组，揭示了基因表达程序的模块化和同源基因调控模式的深度同源性 | 研究主要集中于C. elegans胚胎，可能不适用于其他物种 | 研究C. elegans胚胎早期细胞命运指定中的基因调控模式 | C. elegans胚胎1至102细胞阶段的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1至102细胞阶段的C. elegans胚胎细胞 |
| 4868 | 2024-10-24 |
Genetic variation in IL-4 activated tissue resident macrophages alters the epigenetic state to determine strain specific synergistic responses to LPS
2024-Jan-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3759654/v1
PMID:38712032
|
研究论文 | 研究探讨了不同遗传背景下IL-4激活的组织驻留巨噬细胞对LPS刺激的协同反应 | 揭示了遗传变异通过改变IL-4诱导的细胞内在表观遗传重编程，导致对LPS暴露的特定品系协同反应 | NA | 研究不同遗传背景下的组织驻留巨噬细胞对多重刺激的整合机制 | C57BL/6和BALB/c品系的组织驻留巨噬细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 混合骨髓嵌合小鼠 |
| 4869 | 2024-08-07 |
The role of T cells and shared genes in psoriasis and inflammatory bowel disease based on single-cell RNA and comprehensive analysis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152754
PMID:37806279
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和综合分析，探讨了银屑病和炎症性肠病中T细胞和共享基因的作用 | 本文通过单细胞RNA分析和免疫浸润分析，发现了在疾病中显著升高的CD4 T和γδ T细胞，并确定了具有优异诊断特性的共享基因 | NA | 研究银屑病和炎症性肠病中T细胞和共享基因的作用及其在疾病机制中的重要性 | 银屑病和炎症性肠病中的T细胞和共享基因 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 4870 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptional gene signature analysis identifies IL-17 signaling pathway as the key pathway in sepsis
2023-11, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2023.152763
PMID:38039751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组基因特征分析，识别出IL-17信号通路在脓毒症中的关键作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了IL-17信号通路在脓毒症中的重要作用，并验证了该通路相关基因在脓毒症患者中的上调表达 | 研究仅基于公开数据库的数据，未进行实验验证 | 旨在识别与脓毒症临床严重程度和预后相关的关键通路，为脓毒症的诊断和治疗提供潜在的生物标志物和治疗靶点 | 健康对照人群和脓毒症患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序 | t-SNE和UMAP降维分析 | 转录组数据 | 使用了来自脓毒症数据库GSE167363、GSE100159和GSE133822的血液样本数据 |
| 4871 | 2025-01-29 |
Single-cell atlas of multilineage cardiac organoids derived from human induced pluripotent stem cells
2022-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac002
PMID:39871934
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4872 | 2025-01-28 |
Exosomal miRNA reprogramming in pyroptotic macrophage drives silica-induced fibroblast-to-myofibroblast transition and pulmonary fibrosis
2025-Feb-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136629
PMID:39603130
|
研究论文 | 本文研究了二氧化硅纳米颗粒（SiNPs）通过诱导巨噬细胞焦亡和释放外泌体，进而驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞转化，促进肺纤维化的机制 | 揭示了SiNPs通过诱导巨噬细胞焦亡和外泌体释放，调控TGF-β信号通路，促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 揭示二氧化硅诱导肺纤维化的分子机制 | 二氧化硅纳米颗粒（SiNPs）、巨噬细胞、成纤维细胞、外泌体 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高通量miRNA测序、高光谱成像、人工智能病理识别 | NA | RNA测序数据、高光谱图像 | 体外和体内矽肺模型 |
| 4873 | 2025-01-28 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
|
研究论文 | 本文探讨了常驻滑膜巨噬细胞（RSMs）在滑液中的存在及其对免疫调节的影响 | 创建了一种新型的体外模型来验证人类滑膜中的RSMs，并发现这些细胞在炎症性关节炎中上调了促纤维化和促破骨细胞途径 | 滑膜屏障破裂后，这些细胞是否持续或引发滑液中的慢性炎症仍未知 | 识别人类滑液中的RSMs作为滑膜屏障完整性的间接测量 | 人类滑液和滑膜 | 免疫学 | 关节炎 | scRNA-seq | 体外模型 | 基因表达数据 | NA |
| 4874 | 2025-01-28 |
TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice
2025-Jan-27, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaf005
PMID:39868591
|
研究论文 | 本研究探讨了TLR7在肾小球巨噬细胞中的反应如何加速NZBWF1小鼠肾小球肾炎的进展 | 揭示了TLR7信号在肾小球巨噬细胞中的作用，特别是通过促进IL-1β的产生和C3的裂解与沉积来加速肾小球肾炎的进展 | 研究仅限于NZBWF1小鼠模型，未涉及人类样本 | 探讨TLR7在肾小球巨噬细胞中的反应对肾小球肾炎进展的影响 | NZBWF1小鼠 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NZBWF1小鼠 |
| 4875 | 2025-01-28 |
The construction of a breast cancer prognostic model by combining genes related to hypoxia and endoplasmic reticulum stress
2025-Jan-27, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2453941
PMID:39868728
|
研究论文 | 本研究通过结合与缺氧和内质网应激相关的基因，构建了一个乳腺癌预后模型 | 结合缺氧和内质网应激相关基因构建预后模型，并分析免疫浸润和药物敏感性 | 未提及样本量是否足够大，以及模型在其他数据集上的验证情况 | 预测乳腺癌患者的预后 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | Cox回归和Lasso回归 | RNA-seq数据和临床数据 | 未明确提及具体样本量 |
| 4876 | 2025-01-28 |
High-Viability Circulating Tumor Cells Sorting From Whole Blood at Single Cell Level Using Laser-Induced Forward Transfer-Assisted Microfiltration
2025-Jan-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414195
PMID:39868845
|
研究论文 | 本研究开发了一种激光诱导前向转移辅助微滤系统（LIFT-AMFS），用于从全血中高效分离和分子分析循环肿瘤细胞（CTCs） | 开发了一种新型的LIFT-AMFS系统，通过双步微滤器（DSMF）实现高存活率的CTCs分离和单细胞水平的高效捕获 | 未提及具体局限性 | 提高循环肿瘤细胞（CTCs）的分离效率和存活率，以支持下游分子分析和个性化治疗 | 循环肿瘤细胞（CTCs） | 生物医学工程 | 肿瘤 | 激光诱导前向转移（LIFT）、微滤技术、RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 |
| 4877 | 2025-01-28 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631842
PMID:39829792
|
研究论文 | 本文通过一项为期三年的纵向研究，探讨了多次COVID-19疫苗接种对78名无症状感染者的T细胞和抗体反应的长期影响 | 研究发现，尽管抗体滴度随每次加强针逐渐增加并稳定，T细胞反应迅速达到平台期并保持稳定，且约30%的参与者显示出对非Spike抗原的CD4+ T细胞反应 | 研究仅限于无症状感染者，未涵盖有症状感染者的免疫反应 | 探讨多次COVID-19疫苗接种对适应性免疫的长期影响 | 78名无症状感染者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫反应数据 | 78名无症状感染者 |
| 4878 | 2025-01-28 |
Deciphering the senescence-based tumoral heterogeneity and characteristics in pancreatic cancer: Results from parallel bulk and single-cell transcriptome data
2025-Jan, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70001
PMID:39865528
|
研究论文 | 本文通过整合分析和单细胞RNA测序数据，揭示了胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征 | 首次在胰腺癌中通过整合分析和单细胞RNA测序数据，揭示了基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征，并鉴定了与胰腺癌迁移和预后相关的衰老相关基因 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 揭示胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征，以促进胰腺癌的治疗和精准治疗发展 | 胰腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, ssGSEA算法, infercnv算法 | NA | RNA测序数据 | 来自TCGA-PAAD、PACA-AU、PACA-CA和GSE154778数据集的胰腺癌患者样本 |
| 4879 | 2025-01-28 |
Initial regional cytoarchitectonic differences in dorsal and orbitobasal human developing frontal cortex revealed by spatial transcriptomics
2024-Dec-18, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-024-02865-6
PMID:39692769
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术揭示了人类胎儿大脑皮层早期发育中背侧和眶基底区域在细胞结构上的差异 | 首次在转录组水平上深入研究了人类胎儿额叶发育过程中背侧和眶基底区域的细胞结构特征，并保留了空间信息 | 研究仅关注了15个孕周后的胎儿大脑发育，未涵盖其他关键发育阶段 | 探讨人类胎儿额叶发育过程中背侧和眶基底区域在细胞结构上的差异及其分子机制 | 人类胎儿额叶的背侧和眶基底区域 | 空间转录组学 | NA | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) | NA | 基因表达数据 | 15个孕周后的胎儿大脑样本 |
| 4880 | 2025-01-28 |
Association of Synovial Innate Immune Exhaustion With Worse Pain in Knee Osteoarthritis
2024-Dec-17, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43089
PMID:39690716
|
研究论文 | 本研究探讨了膝关节骨关节炎（OA）患者滑膜先天免疫细胞耗竭与更严重疼痛之间的关联 | 首次揭示了滑膜先天免疫调节细胞在OA疼痛中的作用，特别是免疫调节性巨噬细胞的耗竭和功能障碍与更严重疼痛的关联 | 样本量相对较小，特别是单细胞RNA测序部分仅涉及8名患者 | 识别与膝关节OA患者更严重疼痛相关的滑膜先天免疫细胞亚群和病理生理机制 | 122名轻度至重度膝关节OA疼痛患者的滑膜组织活检 | 生物医学研究 | 骨关节炎 | 空间转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织活检、转录组数据、蛋白质组数据 | 122名患者（其中32名用于空间转录组学和蛋白质组学分析，8名用于单细胞RNA测序） |