单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4861	2024-12-30	Single-cell transcriptome profiling identifies the activation of type I interferon signaling in ossified posterior longitudinal ligament 2024-Dec, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-024-1075-5 PMID:39441507	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了I型干扰素信号在OPLL患者骨化韧带中的激活，并探讨了其在骨化过程中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了I型干扰素信号在OPLL骨化过程中的激活，并验证了其在体外促进成骨分化的作用	研究主要基于体外实验，尚未在体内模型中验证I型干扰素信号阻断对OPLL的预防效果	探讨OPLL的分子机制及潜在预防干预措施	OPLL患者的骨化韧带	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	OPLL患者的骨化韧带样本
4862	2024-12-30	Immunological face of megakaryocytes 2024-Dec, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-024-1087-1 PMID:39542989	综述	本文综述了巨核细胞（MKs）在免疫系统中的新兴角色及其在生理和病理环境中的功能	揭示了巨核细胞作为独特免疫细胞的多样化能力，并发现了具有免疫调节功能的‘免疫巨核细胞’亚群	需要进一步研究确定巨核细胞的免疫功能是由整个巨核细胞群体还是特定亚群执行	探讨巨核细胞在免疫系统中的功能及其在生理和病理环境中的作用	巨核细胞及其免疫功能	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
4863	2024-12-30	The prognostic value and immunological role of calcium/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) in pan-cancer study 2024-Oct-11, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000040072 PMID:39465821	研究论文	本文通过整合多组学和临床数据，全面评估了钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶激酶2（CAMKK2）在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用	首次在泛癌研究中全面评估CAMKK2的分子景观，并发现其在不同癌症类型中的异常表达与生存结果相关	研究结果基于特定癌症队列，可能无法推广到所有癌症类型	评估CAMKK2在泛癌研究中的预后价值和免疫学作用	多种癌症类型中的CAMKK2基因	癌症研究	泛癌	多组学分析、单细胞转录组分析	NA	多组学数据、临床数据	多个癌症队列（如IMvigor210、GSE176307、GSE78220等）
4864	2024-12-29	CXC chemokine receptor 4 - mediated immune modulation and tumor microenvironment heterogeneity in gastric cancer: Utilizing multi-omics approaches to identify potential therapeutic targets 2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England) DOI:10.1002/biof.2130 PMID:39431668	研究论文	本研究通过多组学方法探讨了CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性	首次全面揭示了CXCR4在胃癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其与T细胞耗竭的关系	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证	探索CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性，寻找潜在治疗靶点	胃癌细胞系AGS和SNU-1	肿瘤免疫学	胃癌	空间转录组学、单细胞RNA测序、ELISA、PCR、CCK8实验、细胞划痕实验、集落形成实验	NA	基因表达数据、细胞实验数据	两种胃癌细胞系（AGS和SNU-1）
4865	2024-12-29	Construction of mitochondrial quality regulation genes-related prognostic model based on bulk-RNA-seq analysis in multiple myeloma 2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England) DOI:10.1002/biof.2135 PMID:39446019	研究论文	本文基于批量RNA测序分析，构建了与线粒体质量调控基因相关的多发性骨髓瘤预后模型	开发了一个与线粒体质量调控基因相关的预后模型，并利用多种生物信息学工具进行综合分析	NA	构建多发性骨髓瘤患者的线粒体质量调控基因相关预后模型	多发性骨髓瘤患者	生物信息学	多发性骨髓瘤	批量RNA测序、单细胞RNA测序、突变分析、免疫浸润分析	RiskScore模型	RNA测序数据、突变数据、单细胞RNA测序数据	NA
4866	2024-12-29	Navigating the immune landscape with plasma cells: A pan-cancer signature for precision immunotherapy 2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England) DOI:10.1002/biof.2142 PMID:39495620	研究论文	本研究通过泛癌单细胞RNA测序分析，发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig，能够显著预测患者对免疫治疗的反应	发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig，并通过机器学习算法验证了其在预测免疫治疗反应中的优越性	未提及具体的研究局限性	提高对肿瘤微环境中内在和外在免疫景观的理解，并为更精确的生物标志物引导的免疫治疗方法铺平道路	癌症患者	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序	机器学习算法	RNA测序数据	多个队列的癌症患者
4867	2024-12-29	Unveiling chemotherapy-induced immune landscape remodeling and metabolic reprogramming in lung adenocarcinoma by scRNA-sequencing 2024-Dec-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.95988 PMID:39729352	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了化疗对肺腺癌免疫景观和代谢重编程的影响	首次通过单细胞RNA测序技术全面分析化疗对肺腺癌免疫细胞和代谢的影响，并识别了两种巨噬细胞亚型	样本量较小，仅涉及9名患者，可能影响结果的普遍性	探讨化疗和免疫治疗对肺腺癌患者的影响，特别是免疫景观和代谢重编程	肺腺癌患者的肿瘤样本	数字病理学	肺癌	scRNA-seq, 流式细胞术, 免疫荧光, Seahorse检测, 肿瘤异种移植模型	NA	单细胞RNA测序数据	9名肺腺癌患者的83,622个细胞
4868	2024-12-29	Itaconate facilitates viral infection via alkylating GDI2 and retaining Rab GTPase on the membrane 2024-Dec-27, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-02077-8 PMID:39730330	研究论文	本文探讨了代谢物衣康酸通过烷基化GDI2并保留Rab GTPase在膜上，从而促进病毒感染的作用机制	揭示了衣康酸通过烷基化GDI2并影响Rab GTPase的分布来促进病毒感染的新机制	研究主要集中于VSV和IAV病毒，未涵盖其他病毒类型	研究衣康酸在病毒感染中的作用及其分子机制	巨噬细胞、上皮细胞、中性粒细胞	分子生物学	病毒感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4869	2024-12-29	Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition 2024-Dec-27, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-07408-7 PMID:39730911	研究论文	本文通过基因组尺度代谢模型，研究了上皮间质转化（EMT）过程中的代谢网络重编程	整合了时间序列转录组学、时间序列蛋白质组学和单细胞转录组学数据，揭示了EMT过程中的时间依赖性代谢脆弱性	研究主要基于细胞培养模型，可能无法完全反映体内复杂环境	揭示EMT过程中的代谢网络重编程及其对细胞功能的影响	上皮间质转化（EMT）过程中的细胞代谢	代谢组学	肺癌	基因组尺度代谢建模、CRISPR-Cas9筛选	基因组尺度代谢模型	转录组学数据、蛋白质组学数据、单细胞转录组学数据	NA
4870	2024-12-29	Organoids as a model system for researching human neuroendocrine tumor of the breast 2024-Dec-27, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-024-03621-w PMID:39731167	研究论文	本文首次建立了乳腺神经内分泌肿瘤（NETB）的类器官模型，并用于组织学染色、药物筛选和单细胞RNA测序	首次建立NETB的类器官模型，为临床研究提供了坚实的基础	样本量较小，仅基于一名中国女性患者的样本	研究乳腺神经内分泌肿瘤的发病机制和有效治疗方法	乳腺神经内分泌肿瘤（NETB）	数字病理学	乳腺癌	组织学染色、药物筛选、单细胞RNA测序	类器官模型	组织样本、RNA测序数据	一名中国女性患者的样本
4871	2024-12-29	Single-Cell Transcriptomics Uncovers Core Signature for Regulating Mitochondrial Homeostasis During Testicular Ageing 2024-Dec-27, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13797 PMID:39731228	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了果蝇睾丸老化过程中线粒体功能失调的特征及其调控机制	首次在单细胞水平上揭示了睾丸老化过程中线粒体功能的变化及其调控基因	研究仅限于果蝇模型，未涉及其他物种或人类	探究睾丸老化过程中线粒体功能失调的特征及其调控机制	果蝇的年轻和年老睾丸	单细胞转录组学	老年疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	年轻和年老果蝇的睾丸样本
4872	2024-12-29	Long-term in vitro expansion of a human fetal pancreas stem cell that generates all three pancreatic cell lineages 2024-Dec-26, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.10.044 PMID:39626658	研究论文	本文报道了从8-17周胎儿胰腺样本中衍生出18种人类胎儿胰腺类器官（hfPO）系，并发现其中4种能够在优化培养条件下长期扩展并生成胰腺的三种细胞谱系	首次报道了能够长期体外扩展并生成胰腺三种细胞谱系的人类胎儿三能干细胞/祖细胞	研究仅限于胎儿胰腺样本，未涉及成体胰腺或其他器官	研究人类胎儿胰腺干细胞的长期体外扩展及其多向分化能力	人类胎儿胰腺样本	干细胞研究	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	18种人类胎儿胰腺类器官（hfPO）系
4873	2024-12-29	snRNA-seq of long-preserved FFPE samples from colorectal liver metastasis lesions with diverse prognoses 2024-Dec-26, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-04323-8 PMID:39725704	研究论文	本研究利用snRandom-seq技术对长期保存的FFPE样本进行单核RNA测序，以探索结直肠癌肝转移患者不同预后的潜在影响因素	首次在长期保存的FFPE样本中成功应用单核RNA测序技术，揭示了结直肠癌肝转移患者不同预后之间的异质性	样本数量有限（18例），且所有样本均为长期保存的FFPE样本，可能存在RNA降解问题	探索结直肠癌肝转移患者不同预后的潜在影响因素	18例具有不同预后的结直肠癌肝转移患者的多个病灶样本	数字病理学	结直肠癌	snRNA-seq, snRandom-seq	NA	RNA测序数据	18例结直肠癌肝转移患者的82,285个细胞
4874	2024-12-29	Differential contributions of fetal mononuclear phagocytes to Zika virus neuroinvasion versus neuroprotection during congenital infection 2024-Dec-26, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.10.028 PMID:39532096	研究论文	本文探讨了胎儿单核吞噬细胞在先天性寨卡病毒感染中对神经侵袭与神经保护的不同贡献	首次揭示了胎儿单核细胞/巨噬细胞类型和小胶质细胞在寨卡病毒传播与清除中的不同功能角色，并通过单细胞RNA测序鉴定了与保护性和有害性贡献相关的转录谱	研究主要基于小鼠模型和人类脑类器官，可能无法完全反映人类胎儿在先天性感染中的复杂免疫反应	研究胎儿免疫细胞在先天性寨卡病毒感染中的功能差异	胎儿单核吞噬细胞、小胶质细胞、寨卡病毒	免疫学	寨卡病毒感染	单细胞RNA测序	小鼠模型、人类脑类器官	RNA测序数据	NA
4875	2024-12-29	Prostate Luminal Cell Plasticity and Cancer 2024-Dec-25, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.217430 PMID:39730086	综述	本文综述了前列腺癌中细胞可塑性对治疗抵抗的影响及其机制	总结了利用小鼠模型、单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术研究前列腺癌进展中细胞可塑性和克隆动态变化的最新发现	关于促进细胞可塑性的表观遗传变化如何影响肿瘤免疫原性的研究仍在进行中，尚未完全阐明	探讨前列腺癌中细胞可塑性的机制及其对治疗抵抗的影响	前列腺癌细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪	NA	NA	NA
4876	2024-12-29	Insulin-like growth factor binding protein 7 identified in aged dental pulp by single-cell RNA sequencing 2024-Dec-12, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.12.018 PMID:39674503	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了年轻和老年牙髓组织的异质性，并鉴定了老年牙髓的新标记物IGFBP7	首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了年轻和老年牙髓组织的异质性，并发现了IGFBP7在老年牙髓中的显著上调	需要进一步的研究来阐明IGFBP7影响牙髓衰老的确切机制	探索年轻和老年牙髓组织的异质性，并寻找老年牙髓的新标记物及其机制	年轻和老年牙髓组织	数字病理学	老年疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	8个牙髓样本，共32,012个细胞
4877	2024-12-29	An adult myogenic cell line of the Japanese fire-bellied newt Cynops pyrrhogaster 2024-12-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81899-6 PMID:39627485	研究论文	本研究建立了日本红腹蝾螈的成体肌源性细胞系CpM01，用于研究肌肉发育、修复和再生	首次在日本红腹蝾螈中建立了成体肌源性细胞系CpM01，并对其进行了详细表征	研究仅限于日本红腹蝾螈，未涉及其他蝾螈物种	研究成体蝾螈肌肉再生机制	日本红腹蝾螈的成体肌源性细胞	细胞生物学	NA	scRNA-seq	NA	基因表达数据	日本红腹蝾螈的成体肌源性细胞系CpM01
4878	2024-12-29	Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional changes in circulating immune cells from patients with severe asthma induced by biologics 2024-Dec, Experimental & molecular medicine DOI:10.1038/s12276-024-01368-y PMID:39672815	研究论文	本文通过单细胞RNA测序揭示了严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者在使用生物制剂治疗后循环免疫细胞的转录变化	首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了T2靶向生物制剂对血液免疫细胞基因表达的影响，并揭示了NF-κB信号通路的下调	样本量较小，仅包括8名患者，且需要进一步研究以确定与治疗反应和长期结果相关的潜在生物标志物	描述T2靶向生物制剂对血液免疫细胞基因表达的影响	严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者的循环免疫细胞	数字病理学	哮喘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	8名严重嗜酸性粒细胞性哮喘患者
4879	2024-12-29	Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Unravel Gene Signatures of Mitochondria-Associated Programmed Cell Death in Diabetic Foot Ulcer 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70319 PMID:39730319	研究论文	本研究通过转录组分析揭示了糖尿病足溃疡中线粒体相关程序性细胞死亡的关键基因和细胞类型	首次在单细胞水平上验证了糖尿病足溃疡中线粒体相关程序性细胞死亡的关键基因和细胞类型，并探索了调控这些基因的转录因子	研究样本量未明确提及，可能限制了结果的普适性	揭示糖尿病足溃疡中线粒体相关程序性细胞死亡的基因特征和关键细胞类型	糖尿病足溃疡患者	数字病理学	糖尿病足溃疡	转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、随机森林分析、实时聚合酶链反应分析	NA	转录组数据、单细胞数据	NA
4880	2024-12-29	A single-cell RNA-seq dataset describing macrophages in NSCLC tumor and peritumor tissues 2024-Oct-01, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-03885-x PMID:39353975	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，生成了非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤及肿瘤周围组织中巨噬细胞的转录组数据集	首次提供了NSCLC肿瘤及肿瘤周围组织中巨噬细胞的全面转录组数据，揭示了其在肿瘤微环境中的特征差异和相关性	未明确提及样本量及具体技术细节，可能限制数据的广泛应用	研究NSCLC肿瘤微环境中巨噬细胞的特性，以理解NSCLC的进展并识别关键临床治疗靶点	非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤及肿瘤周围组织中的巨噬细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA