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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4861 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq combined with ATAC-seq analysis to explore the metabolic balance mechanism of CCl4-induced liver inflammatory injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1600685
PMID:40589742
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序联合分析探索CCl4诱导的肝脏炎症损伤的代谢平衡机制 | 首次结合scRNA-seq和ATAC-seq技术系统研究CCl4诱导的慢性肝损伤中代谢平衡恢复机制,发现Zhx2和Zbtb20在代谢平衡调节中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;机制研究仍待深入 | 探索四氯化碳诱导的肝损伤后细胞代谢机制 | CCl4诱导的慢性肝损伤小鼠模型 | 生物信息学 | 药物性肝损伤 | scRNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq, 功能富集分析, 转录因子分析 | NA | 基因组学数据, 表观基因组学数据, 转录组学数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4862 | 2025-10-06 |
Sphingosine-1-phosphate stimulates colorectal cancer tumor microenvironment angiogenesis and induces macrophage polarization via macrophage migration inhibitory factor
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1564213
PMID:40589755
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和体外实验,阐明鞘氨醇-1-磷酸在结直肠癌肿瘤微环境中通过巨噬细胞移动抑制因子促进血管生成和诱导巨噬细胞极化的机制 | 首次在单细胞转录组水平揭示S1P通过MIF通路调控肿瘤相关巨噬细胞极化和血管生成的作用机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步的体内实验验证 | 探究S1P在结直肠癌肿瘤微环境中的作用机制及其对血管生成和巨噬细胞极化的影响 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结直肠癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组化染色, 空间转录组学 | 细胞水平实验模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | 人类组织样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
4863 | 2025-10-06 |
Therapeutic implications of cancer-associated fibroblast heterogeneity: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580315
PMID:40589759
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析探索癌症相关成纤维细胞异质性及其在肿瘤微环境中的功能作用 | 识别了四种CAF亚群并开发了基于预后基因的风险评分模型,首次系统揭示CAF异质性对免疫治疗敏感性的影响 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;实验验证仅针对HIP1R基因 | 探索癌症相关成纤维细胞异质性及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的功能作用 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚群 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, siRNA干扰, qPCR, Western blotting | Cox回归, LASSO回归, 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4864 | 2025-10-06 |
Cell types and neuronal genetic architecture in the rat CSF-contacting nucleus and the role of 5-HT in this nucleus in mediating morphine addiction through the brain-CSF circuit
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1603486
PMID:40589789
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了大鼠脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征,并探讨了其在吗啡成瘾中的作用机制 | 首次系统描绘脑脊液接触核的单细胞转录组图谱,发现该核团通过调节5-HT释放参与吗啡成瘾的新机制 | 研究主要聚焦大鼠模型,人类相关性需要进一步验证;机制研究仍处于探索阶段 | 阐明脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征,探讨其在吗啡成瘾中的功能作用 | 大鼠脑脊液接触核 | 神经科学 | 药物成瘾 | 单细胞RNA测序, GO分析, KEGG通路分析, 条件性位置偏爱测试, 化学遗传学技术, ELISA, UPLC-MS | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据, 行为学数据, 生化检测数据 | 单细胞测序数据已存入中国国家生物信息中心(编号: CRR790158) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4865 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomic Analyses of Spermatogenesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4698-4_3
PMID:40601269
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研究论文 | 本章概述了空间转录组技术及其在精子发生研究中的应用 | 将空间转录组技术应用于精子发生研究,解决了传统转录组方法无法保留组织空间结构的问题 | 仅提供了基于小鼠睾丸的示例分析,方法适用范围有待进一步验证 | 开发空间转录组技术在精子发生研究中的应用方法 | 小鼠睾丸组织和精子发生过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,组织切片图像 | 小鼠睾丸组织样本 | Curio Biosciences | 空间转录组学 | Seeker (SlideSeq V2) | Curio Biosciences Seeker平台(基于SlideSeq V2技术) |
4866 | 2025-10-06 |
Monoclonal antibodies that block Roundabout 1 and 2 signaling target pathological ocular neovascularization through myeloid cells
2024-11-20, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn8388
PMID:39565875
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研究论文 | 开发靶向ROBO1和ROBO2胞外域的单克隆抗体,通过抑制SLIT-ROBO信号通路治疗病理性眼新生血管 | 首次开发能同时阻断ROBO1和ROBO2信号传导的人源单克隆抗体,并证明其通过调节髓系细胞功能抑制眼新生血管 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证疗效和安全性 | 开发靶向SLIT-ROBO信号通路的治疗性抗体,抑制病理性眼新生血管 | ROBO1和ROBO2受体、SLIT配体、髓系细胞(小胶质细胞/巨噬细胞) | 生物医学研究 | 眼血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,抗体开发 | NA | 基因表达数据,成像数据 | 氧诱导视网膜病变和激光诱导角膜新生血管小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4867 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis of adult hippocampal neurogenesis in the human brain
2024 Sep-Oct, Journal of psychiatry & neuroscience : JPN
IF:4.1Q1
DOI:10.1503/jpn.240026
PMID:39414359
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研究论文 | 通过空间转录组学和多重荧光原位杂交技术研究人类大脑中成人海马神经发生的分布和特征 | 首次在人类死后海马样本中结合空间转录组学和多重荧光原位杂交技术评估成人海马神经发生现象 | 样本量较小且仅包含男性样本 | 评估人类成人海马神经发生的存在和特征 | 死后人类齿状回样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 多重荧光原位杂交 | NA | 空间转录组数据, 荧光原位杂交图像 | 婴儿1例(2岁), 青少年1例(16岁), 年轻成人2例(平均23.5岁), 中年男性8例(平均43岁) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4868 | 2025-10-06 |
Microglia-specific IL-10 gene delivery inhibits neuroinflammation and neurodegeneration in a mouse model of Parkinson's disease
2024-08-21, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adm8563
PMID:39167665
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研究论文 | 本研究开发了一种小胶质细胞特异性IL-10基因递送方法,在帕金森病小鼠模型中抑制神经炎症和神经退行性变 | 首次实现小胶质细胞特异性IL-10基因递送,通过单细胞转录组学揭示IL-10诱导独特的小胶质细胞状态 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 开发针对帕金森病神经炎症的靶向基因治疗方法 | 帕金森病小鼠模型中的多巴胺能神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学,病毒基因递送 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多个常用帕金森病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4869 | 2025-10-06 |
Natural killer cells promote neutrophil extracellular traps and restrain macular degeneration in mice
2024-08-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi6626
PMID:39141700
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研究论文 | 本研究揭示自然杀伤细胞通过促进中性粒细胞胞外诱捕网形成抑制小鼠黄斑变性的机制 | 首次发现NK细胞在脉络膜新生血管病变中的关键保护作用,并阐明其通过CCR5介导的招募机制和NKG2D依赖的NETs形成通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;年龄相关NK细胞功能变化机制需进一步探索 | 探究自然杀伤细胞在新生血管性年龄相关性黄斑变性发病机制中的作用 | nvAMD患者样本、小鼠模型、人源NK细胞 | 免疫学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序,Olink蛋白质组学分析,基因敲除研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据,病理图像 | nvAMD患者和小鼠模型的未明确样本量 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
4870 | 2025-10-06 |
Control of goal-directed and inflexible actions by dorsal striatal melanocortin systems, in coordination with the central nucleus of the amygdala
2024-Jul, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102629
PMID:38763506
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研究论文 | 本研究揭示了背侧纹状体黑皮质素系统与杏仁核中央核协同调控目标导向行为和刻板行为的作用机制 | 首次发现表达黑皮质素-4受体的多巴胺D1受体纹状体神经元群体,并阐明其在行为灵活性调控中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究背侧纹状体在行为灵活性调控中的神经机制 | 小鼠的背内侧纹状体和背外侧纹状体神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学,行为实验,神经元功能调控 | NA | 基因表达数据,行为数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4871 | 2025-10-06 |
Wnt Signaling Inhibition Prevents Postnatal Inflammation and Disease Progression in Mouse Congenital Myxomatous Valve Disease
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320388
PMID:38660802
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研究论文 | 本研究通过抑制Wnt信号通路,探索其在预防小鼠先天性黏液样瓣膜疾病发生和进展中的作用 | 首次发现Wnt信号在黏液样瓣膜疾病早期激活,并证明早期而非晚期抑制Wnt信号可预防疾病发生 | 研究仅使用小鼠模型,Wnt抑制在疾病进展阶段无效 | 阐明Wnt信号在先天性黏液样瓣膜疾病发生发展中的作用机制 | Fbn1C1039G/+马凡综合征模型小鼠的 mitral 瓣膜 | 单细胞转录组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,组织学评估 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 野生型和Fbn1C1039G/+突变型小鼠 mitral 瓣膜 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4872 | 2025-10-06 |
Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate
2024-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241247484
PMID:38715201
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研究论文 | 通过唾液腺组织重组实验探索间充质在细胞命运决定中的作用 | 首次采用单细胞RNA测序和成像分析对重组组织进行无偏倚分子表征,发现双向诱导现象 | 研究仅限于小鼠胚胎唾液腺,体外重组环境可能无法完全模拟体内条件 | 阐明组织相互作用在细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠胚胎腮腺和颌下腺的上皮与间充质组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,成像分析 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠胚胎唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4873 | 2025-10-06 |
Similarity Network Analysis of the Adaptive Immune Response in the Proximal Airway
2024-Jul, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.31376
PMID:38450771
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和相似性网络分析研究特发性声门下狭窄患者近端气道适应性免疫应答的T细胞受体特征 | 首次在近端气道黏膜中应用GLIPH2算法进行T细胞受体相似性网络分析,揭示了iSGS患者瘢痕组织中低频率克隆共享抗原靶点的现象 | 样本量相对有限(iSGS患者32例,健康对照10例),且为观察性研究 | 探究近端气道黏膜适应性免疫应答中T细胞库的分布特征和抗原靶点 | 特发性声门下狭窄患者和健康对照者的气道黏膜组织 | 免疫学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,相似性网络分析 | GLIPH2算法 | 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 | 32例iSGS患者,10例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4874 | 2025-10-06 |
Non-canonical Wnt pathway expression in the developing mouse and human retina
2024-Jul, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109947
PMID:38815793
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠和人类视网膜及视网膜类器官的单细胞RNA测序数据,探索非经典Wnt通路在视网膜发育中的作用 | 首次系统比较了小鼠和人类视网膜发育过程中非经典Wnt通路组分的表达差异,并发现了物种特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证相对有限 | 阐明非经典Wnt通路在视网膜发育和突触形成中的作用 | 小鼠视网膜、人类视网膜、人类视网膜类器官 | 发育生物学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 多个发育时间点的小鼠视网膜、人类视网膜和视网膜类器官scRNAseq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4875 | 2025-10-06 |
Molecular heterogeneity of quiescent melanocyte stem cells revealed by single-cell RNA-sequencing
2024-07, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13169
PMID:38613320
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示毛囊中静止黑色素干细胞分子异质性 | 首次在单细胞水平鉴定出静止黑色素干细胞新亚群,包括两个具有差异免疫豁免状态的亚群 | 研究仅使用成年雌性C57BL/6J小鼠,样本来源和数量有限 | 解析静止黑色素干细胞转录组景观和分子异质性 | 毛囊静止黑色素干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雌性C57BL/6J小鼠皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4876 | 2024-08-07 |
Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes..
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0041
PMID:38900953
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4877 | 2025-10-06 |
Positionally distinct interferon stimulated dermal immune acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet's syndrome
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600500
PMID:38979312
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了Sweet综合征中成纤维细胞通过I型干扰素信号通路促进中性粒细胞招募的机制 | 首次在Sweet综合征中发现位置特异的免疫活性成纤维细胞亚群,并阐明其通过不同趋化因子空间分布调控中性粒细胞浸润 | 研究基于存档临床样本,样本数量有限,且为观察性研究 | 探究Sweet综合征中中性粒细胞浸润的细胞分子机制 | Sweet综合征患者皮肤组织样本和原代人真皮成纤维细胞 | 数字病理学 | Sweet综合征 | 单核RNA测序, 批量转录组学, 单分子空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 存档临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4878 | 2025-10-06 |
Sex differences and immune correlates of Long COVID development, persistence, and resolution
2024-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.18.599612
PMID:38948732
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析长新冠发展的性别差异和免疫相关性 | 首次系统揭示长新冠发展、持续和消退过程中性别特异的免疫失调机制 | 样本量较小(45例患者),需要更大规模研究验证 | 探究长新冠发展的免疫学基础及性别差异 | 45名发展为长新冠或康复的COVID-19患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, 血浆蛋白质组学 | NA | 血液样本 | 45例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
4879 | 2025-10-06 |
Anti-PD-1 cancer immunotherapy induces central nervous system immune-related adverse events by microglia activation
2024-06-12, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj9672
PMID:38865481
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研究论文 | 本研究揭示了抗PD-1免疫疗法通过直接激活小胶质细胞引发中枢神经系统免疫相关不良事件的机制 | 首次发现抗PD-1抗体可直接作用于小胶质细胞而非通过外周T细胞激活引发CNS-irAEs,并鉴定Syk为关键治疗靶点 | 患者队列样本量有限,机制研究主要基于小鼠模型 | 探究抗PD-1免疫疗法引发中枢神经系统不良反应的细胞机制 | 小鼠模型和接受抗PD-1治疗的患者中枢神经组织 | 免疫学 | 癌症免疫治疗相关神经系统并发症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 成像质谱流式细胞术 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 小鼠实验模型和患者队列组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
4880 | 2025-10-06 |
Single cell spatial transcriptomic profiling of childhood-onset lupus nephritis reveals complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.09.566503
PMID:38014158
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研究论文 | 通过单细胞空间转录组技术分析儿童发病狼疮性肾炎肾脏组织,揭示基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 | 首次在单细胞分辨率下构建儿童狼疮性肾炎的空间转录组图谱,揭示免疫细胞定位与组织位置相关的基因表达变化 | 组织学疾病活动评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱,样本量有限(8例患者+2例对照) | 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 | 儿童狼疮性肾炎患者和对照者的肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 8例儿童狼疮性肾炎患者和2例对照,超过400,000个细胞 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |