单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28527 篇文献，本页显示第 4861 - 4880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4861 | 2025-03-16 |
Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01903-x
PMID:40072722
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胶质瘤微环境的复杂性，特别是恶性胶质瘤细胞与巨噬细胞/单核细胞之间的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 利用单细胞RNA测序技术深入分析了胶质瘤样本，识别了多种细胞亚群和巨噬细胞/单核细胞亚型，揭示了它们通过特定途径的相互作用，并开发了一个基于风险评分的预后模型 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 探索胶质瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 胶质瘤细胞和巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | RNA-seq数据 | 来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本 |
| 4862 | 2025-03-16 |
Transcription factor networks and novel immune biomarkers reveal key prognostic and therapeutic insights in ovarian cancer
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01788-w
PMID:40074978
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌单细胞RNA测序数据，构建了一个基于转录因子调控网络的9基因风险模型，用于预测卵巢癌的预后和免疫治疗效果 | 首次利用单细胞RNA测序数据构建卵巢癌的转录因子调控网络，并开发了一个9基因风险模型，同时鉴定了三个新的免疫相关生物标志物 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，样本量可能有限，且需要进一步验证模型在其他独立队列中的有效性 | 研究卵巢癌肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发预后预测模型并探索新的免疫治疗靶点 | 卵巢癌肿瘤微环境中的免疫细胞和转录因子 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），qPCR，免疫组化（IHC） | Lasso回归，ConsensusClusterPlus | 单细胞RNA测序数据，免疫组化数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了138种GDSC数据库药物进行敏感性预测 |
| 4863 | 2025-03-16 |
Integrative whole slide image and spatial transcriptomics analysis with QuST and QuPath
2025-Mar-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00841-9
PMID:40075141
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为QuST的QuPath扩展工具，用于在单细胞水平上整合全切片图像（WSI）和空间转录组学（ST）分析 | 提出了QuST工具，首次在单细胞水平上整合WSI和ST分析，为疾病生物学研究提供了新的视角 | 面临训练模式准备和分辨率差异等挑战 | 增强对疾病的理解，特别是在数字病理学领域 | 全切片图像（WSI）和空间转录组学（ST）数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学（ST） | NA | 图像和转录组数据 | NA |
| 4864 | 2025-03-16 |
Fatty acid metabolism shapes immune responses in chronic lymphocytic leukemia
2025-Mar-12, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00753-7
PMID:40075418
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸代谢在慢性淋巴细胞白血病（CLL）中的特征及其对免疫反应的影响，构建了相关的预后评分，并研究了脂肪酸代谢在CLL发展中的调控作用和机制 | 构建了基于脂肪酸代谢基因表达的预后风险评分，揭示了相关的免疫表型差异，并探索了脂肪酸氧化在CLL发展中的调控作用 | 研究主要基于RNA测序数据，缺乏对脂肪酸代谢在CLL中具体分子机制的深入实验验证 | 阐明脂肪酸代谢在CLL中的特征及其对免疫反应的影响，构建预后评分并探索其调控机制 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者和健康对照 | 肿瘤免疫学 | 慢性淋巴细胞白血病 | RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq） | Cox-LASSO回归 | RNA测序数据 | CLL患者和健康对照的RNA测序数据 |
| 4865 | 2025-03-16 |
From inflammation to remodelling: A novel BASP1+ monocyte subset as a catalyst for acute aortic dissection
2025-Mar-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.003
PMID:40057028
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研究论文 | 本文研究了BASP1+单核细胞亚群在急性主动脉夹层（AAD）发展中的作用及其机制 | 首次揭示了BASP1+单核细胞亚群在AAD中的关键作用及其通过特定信号通路促进炎症和血管重塑的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用和验证仍需进一步研究 | 探讨BASP1+单核细胞亚群在AAD发展中的作用及其机制 | 人类外周血和主动脉组织中的单核细胞/巨噬细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 免疫荧光, 激光散斑成像, 超声成像, Co-IP, ChIP测序 | BASP1-CreER/Lyz2-DreER-tdT报告小鼠 | 基因表达数据, 图像数据 | 人类外周血和主动脉组织样本, BASP1-CreER/Lyz2-DreER-tdT报告小鼠 |
| 4866 | 2025-03-16 |
Single-cell transcriptomics of clinical grade adipose-derived regenerative cells reveals consistency between donors independent of gender and BMI
2025-Mar-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04234-4
PMID:40038777
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术研究了临床级脂肪来源再生细胞（ADRCs）的异质性，发现不同供体之间的ADRCs组成和质量具有高度一致性，不受性别和BMI的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面绘制了ADRCs的异质性图谱，并发现供体、性别和BMI对ADRCs组成的影响较小 | 研究仅基于两项细胞试验干预研究，样本量可能有限，且未探讨其他潜在影响因素 | 探讨供体、性别和BMI对脂肪来源再生细胞（ADRCs）组成和质量的影响 | 临床级脂肪来源再生细胞（ADRCs） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两项细胞试验干预研究中的ADRCs样本 |
| 4867 | 2025-03-16 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Meihua Pig Testis Cells
2025-Mar-05, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15050752
PMID:40076035
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了梅花猪睾丸细胞的转录组图谱，并鉴定了不同发育阶段的细胞类型及其潜在标记基因 | 首次在梅花猪中应用单细胞RNA测序技术，构建了睾丸发育过程中生殖细胞和体细胞的单细胞发育图谱，并鉴定了精原细胞的候选标记基因TKTL1 | 研究仅限于梅花猪，未涉及其他物种或更广泛的样本 | 解析梅花猪睾丸发育过程中的细胞异质性及其转录组特征 | 梅花猪睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13,839个梅花猪睾丸细胞 |
| 4868 | 2025-03-16 |
MLLT3 Regulates Melanoma Stemness and Progression by Inhibiting HMGB1 Nuclear Entry and MAGEA1 M5C Modification
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408529
PMID:39716999
|
研究论文 | 本研究揭示了MLLT3作为转录因子在调节黑色素瘤干细胞特性和进展中的作用 | 首次发现MLLT3通过与HMGB1和YBX1的相互作用，抑制HMGB1核进入和MAGEA1的m5C修饰，从而调控黑色素瘤的干细胞特性和进展 | NA | 探讨MLLT3在黑色素瘤干细胞特性和进展中的调控机制 | 黑色素瘤干细胞 | 分子生物学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4869 | 2025-03-16 |
Spatial Transcriptomics Reveals Novel Mechanisms Involved in Perineural Invasion in Pancreatic Ductal Adenocarcinomas
2025-Mar-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050852
PMID:40075699
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中神经周围侵袭（PNI）的新机制 | 通过空间转录组学技术，首次揭示了PNI病灶对肿瘤微环境（TME）免疫景观的影响，并发现了内源性大麻素和多胺代谢在PNI、癌症生长和癌症疼痛中的作用 | 样本量较小，仅涉及13名PDAC患者 | 探索胰腺导管腺癌中神经周围侵袭的分子机制及其对肿瘤微环境的影响 | 胰腺导管腺癌患者的癌症和神经细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | Nanostring GeoMx Digital Spatial Profiler | NA | 转录组数据 | 13名PDAC患者 |
| 4870 | 2025-03-16 |
Cancer-Associated Fibroblasts Genes and Transforming Growth Factor Beta Pathway in Gastric Cancer for Novel Therapeutic Strategy
2025-Feb-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050795
PMID:40075643
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综述 | 本文综述了胃癌中癌症相关成纤维细胞基因（CAFGs）的分子特征及其在肿瘤进展和预后中的作用，探讨了其与TGFB通路的相互作用，以开发新的治疗策略 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析揭示了CAFGs不仅在CAFs中表达，还可能反映周围细胞的激活状态，并验证了多个CAFGs在胃癌中的预后相关性 | 与其他癌症相比，CAFGs在胃癌中的功能机制尚不明确，且由于现有微解剖数据的限制，CAFGs在胃癌中的表达模式尚未得到确认 | 探讨CAFGs在胃癌中的分子特征及其与TGFB通路的相互作用，以开发新的治疗策略 | 胃癌中的癌症相关成纤维细胞基因（CAFGs） | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4871 | 2025-03-16 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
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研究论文 | 本文通过Visium空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层（dlPFC）衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合空间转录组学和单核RNA测序技术，首次在非病理人类组织中揭示了dlPFC衰老和细胞衰老的异质性特征 | 研究局限于非病理组织，未涉及疾病状态下的细胞衰老特征 | 探索人类背外侧前额叶皮层（dlPFC）衰老和细胞衰老的转录组特征 | 人类背外侧前额叶皮层（dlPFC）的非病理组织 | 生物信息学 | NA | Visium空间转录组学（ST）、单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 4872 | 2025-03-16 |
Differences in immune cells and gene expression in human milk by parity on integrated scRNA sequencing
2025-Feb, Clinical and experimental pediatrics
IF:3.2Q1
DOI:10.3345/cep.2024.01585
PMID:39810510
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研究论文 | 本研究通过整合和分析公开的单细胞RNA测序数据集，探讨了胎次对人类母乳中免疫细胞异质性和基因表达的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统地分析了胎次对人类母乳中免疫细胞组成和基因表达的影响 | 研究依赖于公开数据集，可能受限于数据的多样性和样本量 | 阐明胎次对人类母乳中免疫细胞异质性和基因表达的影响 | 人类母乳中的免疫细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 4873 | 2025-03-16 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.19.604364
PMID:39071335
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研究论文 | 本文介绍了一种名为lr-kallisto的工具，用于长读长测序数据的转录组定量分析 | 开发了lr-kallisto工具，将kallisto的RNA-seq定量方法适配到长读长测序技术，提高了长读长数据的定量准确性和速度 | 未提及具体的研究局限性 | 实现长读长测序数据的快速准确转录组定量 | 长读长测序数据 | 生物信息学 | NA | ONT（Oxford Nanopore Technologies） | kallisto | RNA-seq数据 | 未提及具体样本数量 |
| 4874 | 2025-03-16 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
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研究论文 | 本文讨论了使用NanoString的GeoMx数字空间分析仪进行炎症性皮肤疾病转录组空间分析的技术和用户体验概述 | 提供了制造商指南中未涵盖的RNA捕获优化方法和潜在陷阱，并通过具体实验示例展示了这些策略 | NA | 探讨数字空间分析在炎症性皮肤疾病中的应用，为其他皮肤生物学研究者提供框架 | 炎症性皮肤疾病，包括银屑病、扁平苔藓和盘状红斑狼疮 | 数字病理学 | 炎症性皮肤疾病 | GeoMx数字空间分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4875 | 2024-12-15 |
Author Correction: Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain
2025-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01855-5
PMID:39672966
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4876 | 2025-03-16 |
Gpnmb and Spp1 mark a conserved macrophage injury response masking fibrosis-specific programming in the lung
2024-Dec-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182700
PMID:39509324
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠肺部损伤后巨噬细胞的不同亚群及其在纤维化和非纤维化修复中的作用 | 揭示了Gpnmb和Spp1标记的巨噬细胞亚群在组织损伤中的保守反应，并发现这些细胞不足以驱动纤维化 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探讨肺部损伤后巨噬细胞亚群在纤维化和非纤维化修复中的作用 | 小鼠肺部巨噬细胞 | 数字病理 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠肺部巨噬细胞样本 |
| 4877 | 2025-03-16 |
Predicting lung aging using scRNA-Seq data
2024-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012632
PMID:39700255
|
研究论文 | 本文开发了一种名为PolyEN的新回归模型，用于基于单细胞RNA测序数据预测年龄 | 提出了PolyEN模型，该模型能够学习随时间变化的基因表达连续表示，并整合基因信息进行年龄预测 | NA | 基于单细胞RNA测序数据进行年龄预测，以了解患者对多种疾病和状况的易感性 | 肺上皮细胞和肺内皮细胞 | 生物信息学 | 肺病 | scRNA-Seq | PolyEN | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 4878 | 2025-03-16 |
CosGeneGate selects multi-functional and credible biomarkers for single-cell analysis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae626
PMID:39592241
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CosGeneGate的新模型，用于在单细胞测序分析中选择更具代表性的标记基因 | CosGeneGate结合了基于细胞类型分类准确性和标记基因特异性表达模式的优点，选择非冗余且具有细胞类型特异性表达模式的标记基因 | 未明确提及具体局限性 | 提高单细胞测序分析中标记基因选择的效率和准确性 | 单细胞测序数据中的标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | CosGeneGate | 单细胞测序数据 | 公共数据集和新测序数据集 |
| 4879 | 2025-03-16 |
Metastasis of colon cancer requires Dickkopf-2 to generate cancer cells with Paneth cell properties
2024-Nov-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97279
PMID:39535280
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研究论文 | 本文研究了结肠癌转移过程中Dickkopf-2（DKK2）在生成具有Paneth细胞特性的癌细胞中的作用 | 揭示了DKK2在结肠癌转移过程中通过调控HNF4A蛋白水平促进具有Paneth细胞特性的癌细胞生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，尚未在更大规模的人群中进行验证 | 探讨结肠癌转移过程中癌细胞获得Paneth细胞特性的分子机制 | 结肠癌细胞、小鼠模型、患者样本 | 癌症研究 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、染色质免疫共沉淀测序 | NA | RNA测序数据、染色质可及性数据 | 小鼠模型和患者样本 |
| 4880 | 2025-03-16 |
Single-cell, spatial, and fate-mapping analyses uncover niche dependent diversity of cochlear myeloid cells
2024-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.30.621184
PMID:39554030
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、命运图谱和联体共生实验，揭示了小鼠耳蜗中五种髓系细胞的存在，包括三种组织驻留巨噬细胞亚群，并探讨了它们在耳蜗不同区域的特定功能 | 首次揭示了耳蜗中巨噬细胞的基因表达、空间分布、起源和功能的独特异质性，特别是在感觉器官中的巨噬细胞研究方面填补了空白 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探讨耳蜗中髓系细胞的多样性和功能，特别是巨噬细胞在耳蜗微环境中的作用 | 小鼠耳蜗中的髓系细胞，特别是组织驻留巨噬细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、命运图谱、联体共生实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠耳蜗组织 |