单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
4821 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过整合东亚和欧洲的基因组数据,进行了一项关于阿尔茨海默病的meta-GWAS研究,并利用单细胞转录组数据识别了受变异影响的差异表达基因 本研究首次在包括更多东亚人群的meta-GWAS中识别出与SORL1相关的显著SNPs,这些关联可能由于欧洲人群的低次要等位基因频率而在之前的研究中未被发现 研究样本主要来自韩国和欧洲,可能限制了结果的普遍性 探索阿尔茨海默病的遗传风险因素,特别是与β-淀粉样蛋白(Aβ)沉积相关的基因变异 阿尔茨海默病患者及健康对照 基因组学 阿尔茨海默病 GWAS, 单细胞转录组分析 NA 基因组数据, 单细胞转录组数据 发现数据集包括3,387名韩国参与者,复制数据集包括606名独立韩国参与者,以及来自13个队列的多民族淀粉样蛋白PET GWAS的汇总统计数据
4822 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过体外大鼠神经共培养模型,研究了细胞相互作用变化如何改变神经细胞类型对神经退行性相关因子的转录反应 使用单细胞RNA-seq技术,结合多条件实验设计,揭示了神经细胞类型组成变化对神经退行性相关基因表达的影响 研究主要基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂环境 探讨阿尔茨海默病(AD)中神经退行性变的具体机制 大鼠神经细胞共培养模型 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq, CRISPR-Cas9 NA 转录组数据 约12k细胞的转录组数据,多条件实验产生约40k转录组数据
4823 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过单核RNA测序和空间转录组学分析,研究了阿尔茨海默病中特定细胞类型的变化和丢失,揭示了疾病进展中的细胞和分子变化 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了阿尔茨海默病中易受损细胞类型的空间分布及其与病理蛋白的关系 研究样本仅限于阿尔茨海默病捐赠者,可能无法完全代表所有患者群体 研究阿尔茨海默病中细胞类型的变化及其与病理蛋白的关系,以揭示疾病的发生和进展机制 阿尔茨海默病捐赠者的脑组织 数字病理学 老年病 单核RNA测序(snRNAseq),空间转录组学 NA RNA测序数据,空间转录组数据 阿尔茨海默病捐赠者的脑组织样本
4824 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过比较人类和小鼠模型,揭示了阿尔茨海默病(AD)的共享分子变化,增进了对该疾病潜在机制的理解,并提高了有效治疗的前景 采用多组学方法整合空间转录组学和单核RNA测序数据,进行跨物种差异表达分析和多尺度共表达网络分析,揭示了进化保守的AD转录变化 研究主要依赖于死后组织样本,可能无法完全反映活体中的动态变化 揭示阿尔茨海默病的共享分子变化,增进对疾病机制的理解,并提高治疗前景 人类和小鼠的前额叶皮层组织,包括唐氏综合症(DS)中的AD病理 数字病理 老年病 空间转录组学(ST)、单核RNA测序(snRNA-seq)、荧光淀粉样成像 BayesSpace、hdWGCNA RNA测序数据、图像数据 人类和小鼠的前额叶皮层组织样本
4825 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文介绍了一种现代化的方法,用于优化人脑标本的收集和处理,以支持最新的单细胞和空间分子技术 开发了一种结合快速神经成像、半脑嵌入、薄片切割和交替固定或冷冻的现代化方法,用于优化脑组织质量和解剖精度 研究仅限于特定时间范围内收集的捐赠者大脑,排除了额颞叶变性病例 优化人脑标本的收集和处理方法,以支持现代分子细胞类型和通路分析 人脑标本,特别是阿尔茨海默病(AD)神经病理学进展的脑区 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞组学、空间转录组学、数字病理学分析 NA 脑组织样本、数字病理图像 84个捐赠者大脑,包括从无认知障碍到痴呆的不同阶段
4826 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了ABCA7和APOE Christchurch变异在阿尔茨海默病动物模型中的保护机制 通过CRISPR-Cas9技术引入ABCA7 V1613M和APOE R136S变异,揭示了这些变异在减少Ab生成和调节胶质细胞反应中的保护作用 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类临床试验 研究阿尔茨海默病的发病机制及治疗策略 小鼠模型(5xFAD和PS19) 基础科学 阿尔茨海默病 CRISPR-Cas9, 单细胞空间转录组学和蛋白质组学 小鼠模型 组织学、生物化学、转录组学和蛋白质组学数据 NA
4827 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过单细胞测序技术研究了阿尔茨海默病(AD)外周免疫系统的表观遗传和转录变化 揭示了AD外周免疫细胞中开放染色质的显著数量,并发现了与CXC基序趋化因子受体3基因启动子共可及的顺式调控DNA元件,以及在单核细胞中发现了新的RELA转录因子结合位点 NA 研究阿尔茨海默病(AD)外周免疫系统的表观遗传和转录变化 阿尔茨海默病(AD)患者的外周免疫细胞 表观遗传学 阿尔茨海默病 单细胞测序,包括转座酶可及染色质测定和RNA测序 NA 基因表达数据 NA
4828 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过整合单细胞基因组学和细胞重编程技术,研究了阿尔茨海默病(AD)病理背景下小胶质细胞的转录组和表观基因组 结合单细胞基因组学和CRISPR介导的扰动技术,揭示了小胶质细胞在AD中的炎症转录程序的动态变化 研究主要基于死后人脑样本,仅提供了疾病转录机制的静态快照 研究阿尔茨海默病(AD)病理背景下小胶质细胞的转录组和表观基因组,以揭示疾病相关的转录程序 小胶质细胞 基因组学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学、CRISPR、细胞重编程 NA 转录组数据、表观基因组数据 超过400个死后人脑样本,生成超过150,000个独特的小胶质细胞转录组
4829 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过优化人脑细胞核分离技术,增加脑血管细胞的代表性,并对健康与阿尔茨海默病(AD)捐赠者的顶叶皮层进行单细胞核转录组分析,揭示了脑血管功能障碍在AD中的作用 优化了人脑细胞核分离技术,增加了脑血管细胞的代表性,并整合了新的单细胞核转录组数据与公共数据集,创建了一个全面的脑血管图谱 研究样本主要来自澳大利亚脑库网络,可能限制了结果的普遍性 探讨脑血管功能障碍在阿尔茨海默病中的作用及其机制 健康与阿尔茨海默病捐赠者的顶叶皮层 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞核转录组测序(snRNA-seq),空间转录组分析 NA 转录组数据 72个大脑样本
4830 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了阿尔茨海默病(AD)中神经元周围网络(PNNs)的作用及其与淀粉样斑块形成的关系 研究发现PNNs在防止淀粉样斑块积累和维持小胶质细胞对斑块的正常反应中起关键作用 研究仅基于5xFAD小鼠模型,未涉及人类样本 探讨PNNs在阿尔茨海默病中的作用及其对淀粉样斑块形成的影响 5xFAD小鼠模型中的神经元周围网络(PNNs)和淀粉样斑块 神经科学 阿尔茨海默病 免疫组织化学和空间转录组学 5xFAD小鼠模型 图像和基因表达数据 每组4-6只小鼠,分别在4个月和8个月龄时采集样本
4831 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了外周循环中的免疫蛋白如何影响阿尔茨海默病(AD)中淀粉样蛋白β(Aβ)的积累速率 首次揭示了外周免疫蛋白与AD病理进展之间的关系,并识别了特定的外周免疫介质 研究样本量有限,且主要基于观察性数据,无法确定因果关系 研究外周免疫蛋白对AD病理进展的影响 阿尔茨海默病患者及健康对照 神经科学 阿尔茨海默病 11C-PiB PET, tau-PET, 单细胞RNA测序 NA 血浆蛋白数据、PET成像数据、基因数据 BLSA研究(n = 196),ARIC研究(n = 272, n = 11,596, n = 4,288)
4832 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过重新处理10个公开的单核RNA测序数据集,并与SEA-AD的多模态单细胞图谱整合,研究了阿尔茨海默病(AD)相关的分子和细胞变化 首次统一处理并整合多个公开数据集,使用SEA-AD的多模态单细胞图谱进行跨研究比较,识别出与AD一致的细胞变化 研究依赖于公开数据集的质量和临床元数据的一致性,可能存在数据预处理和分析策略的差异 研究阿尔茨海默病(AD)相关的分子和细胞变化,识别一致的细胞变化 780名捐赠者的4.3百万个细胞,来自背外侧前额叶皮层(DLPFC) 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序(snRNA-seq),单核ATAC测序(snATAC-seq),空间转录组学(MERFISH) NA 单细胞RNA测序数据,单细胞ATAC测序数据,空间转录组数据 780名捐赠者的4.3百万个细胞
4833 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了阿尔茨海默病(AD)中神经免疫反应的复杂性,特别是小胶质细胞的激活和外周免疫细胞的浸润 首次结合荧光激活核分选和单核RNA测序技术,全面描绘AD大脑中的免疫细胞图谱,并利用成像质谱流式技术提供空间背景 目前样本量有限,未来需要增加样本数量以验证初步发现 揭示AD发病机制中免疫细胞的复杂相互作用 人类新鲜冷冻和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的死后脑组织样本 数字病理学 阿尔茨海默病 荧光激活核分选、单核RNA测序、成像质谱流式技术 NA RNA测序数据、成像数据 来自英国脑库的所有Braak分期的样本
4834 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了APOE基因调控的胶质细胞如何影响神经元中α-突触核蛋白聚集的机制 首次使用空间转录组学技术结合10X Genomics Visium CytAssist平台,研究了APOE基因型对路易体痴呆(LBD)中α-突触核蛋白聚集的影响 样本量较小(对照组4个大脑,LBD组6个大脑),可能影响结果的普遍性 研究APOE基因调控的胶质细胞如何影响神经元中α-突触核蛋白的聚集 人类LBD大脑的颞叶皮层组织 数字病理学 路易体痴呆 空间转录组学,10X Genomics Visium CytAssist平台 NA 组织切片图像,基因表达数据 对照组4个大脑,LBD组6个大脑
4835 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了APOECh突变对阿尔茨海默病(AD)病理的影响,特别是对tau蛋白病变和淀粉样斑块的影响 通过CRISPR-Cas9技术引入ApoeCh突变,结合5xFAD和PS19转基因小鼠模型,研究了该突变对淀粉样斑块和tau蛋白病变的不同影响 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类临床试验 探讨APOECh突变在tau和Aβ斑块发展中的作用,特别是神经炎症的关联 5xFAD和PS19转基因小鼠模型 神经科学 阿尔茨海默病 CRISPR-Cas9, MERFISH, MSD技术 5xFAD和PS19转基因小鼠模型 图像, 转录组数据, 蛋白质组数据 5xFAD和PS19转基因小鼠
4836 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了轻度创伤性脑损伤(mTBI)和衰老过程中脑血管变化的共同分子机制 发现了mTBI和衰老血管之间的共同分子特征,涉及一个新的跨膜蛋白基因Tmem252 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 探讨不同神经系统疾病中脑血管变化的共同分子机制 WT C57BL/6J Sham小鼠和mTBI小鼠的脑血管细胞 生物医学 神经系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 29,114个高质量细胞,来自WT C57BL/6J Sham小鼠和mTBI小鼠的损伤侧半球
4837 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文探讨了炎症小体与阿尔茨海默病(AD)之间的关联,并利用CRISPR技术研究了其在AD中的分子机制 利用CRISPR技术在人类诱导多能干细胞分化的微胶质细胞(iMG)模型中,揭示了炎症小体在AD中的关键作用,并发现了潜在的药物靶点 研究主要基于体外模型,尚未在体内或临床环境中验证其发现 探索炎症小体在阿尔茨海默病中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 人类诱导多能干细胞分化的微胶质细胞(iMG) 基因组学 阿尔茨海默病 CRISPR、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、蛋白质组学 iMG模型 基因序列、蛋白质数据 NA
4838 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了阿尔茨海默病(AD)在性别特异性方面的分子因素,揭示了性别特异性对疾病的影响 首次在细胞分辨率上揭示了性别特异性对阿尔茨海默病的影响,并发现了85个性别特异性效应 未来需要进一步机制研究,将这些基因与其下游效应器在细胞类型特异性方式上连接起来 研究阿尔茨海默病在性别特异性方面的分子因素 424例来自宗教秩序研究和记忆与衰老项目(ROS/MAP)的背外侧前额叶皮层样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 负二项混合模型 RNA测序数据 424例样本(68%为女性,37%为AD病例)
4839 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了人类诱导多能干细胞衍生的神经干细胞外泌体(hiPSC-NSC-EVs)在阿尔茨海默病(AD)模型中的治疗效果 首次展示了hiPSC-NSC-EVs在AD模型中通过调节小胶质细胞活性和减少神经炎症信号级联反应来维持大脑功能的潜力 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 探索hiPSC-NSC-EVs作为AD疾病修饰干预的潜力 5x家族性AD(5xFAD)小鼠模型 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-sequencing) NA 基因表达数据 5xFAD小鼠模型,每周注射hiPSC-NSC-EVs或对照剂,持续两周
4840 2025-01-05
Basic Science and Pathogenesis
2024-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文介绍了MAD1小鼠模型,该模型通过替换小鼠的Aβ、Mapt和Apoe等位基因为人类对应基因,以更好地模拟晚发性阿尔茨海默病(LOAD)的病理过程 首次开发并表征了MAD1小鼠模型,该模型通过人类化基因替换,以生理水平表达相关基因,更准确地模拟LOAD的疾病进展 研究尚处于初步阶段,未观察到Aβ或tau蛋白的形成,且样本量较小 开发并验证一种更准确模拟晚发性阿尔茨海默病(LOAD)病理过程的小鼠模型 MAD1小鼠模型和野生型(WT)小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 NanoString CosMx单细胞空间转录组学、抗体空间蛋白质组学、snRNA-seq、免疫组织化学 小鼠模型 基因表达数据、蛋白质分布数据 4个月大的MAD1和WT小鼠(每组3只/性别),8个月大的MAD1小鼠(每组3只雄性,2只雌性)
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