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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4781 | 2025-10-06 |
FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders
2025-Jul-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.286372
PMID:39744817
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研究论文 | 本研究揭示了FLI1基因变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺陷和血小板功能障碍的新机制 | 首次发现FLI1与GATA1共同调控TLN1转录,并鉴定两个新型FLI1变异体(p.G307R和p.R340C) | 研究样本量有限,机制研究主要依赖体外实验 | 阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板功能影响的分子机制 | FLI1基因变异患者、巨核细胞、血小板和细胞系 | 分子生物学 | 血小板疾病 | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,测序数据 | FLI1变异患者样本和细胞系 | NA | single-cell RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
4782 | 2025-10-06 |
Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications
2025-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13912
PMID:40213927
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研究论文 | 通过过表达AtGRF5基因显著提高葫芦科作物的遗传转化效率,并阐明其分子机制 | 发现AtGRF5通过促进愈伤组织增殖和增加致密细胞来增强遗传转化效率,开发了ABA诱导型AtGRF5表达系统以减轻多效性影响 | NA | 提高葫芦科作物的遗传转化和基因编辑效率 | 葫芦科作物(黄瓜等) | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, DAP-seq, 时间序列转录组学 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4783 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792
PMID:40316244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LPS诱导的应急粒细胞生成过程中不同造血祖细胞亚群的转录变化 | 首次在单细胞水平揭示非谱系定型多能祖细胞在炎症刺激下向髓系和红系祖细胞重编程的动态过程 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究不同多能祖细胞亚群在LPS诱导的应急粒细胞生成中的作用 | 野生型小鼠的多能祖细胞(MPPs) | 单细胞生物学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 移植实验, 假时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和LPS处理组小鼠的MPPs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4784 | 2025-10-06 |
Differentiable graph clustering with structural grouping for single-cell RNA-seq data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf347
PMID:40511990
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的可微分图聚类方法,通过结构分组整合图聚类信息 | 设计了可微分聚类机制将离散的K路归一化割转化为可微分学习目标,通过谱松弛实现图聚类信息的整合 | 未在抽象中明确说明研究局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 图注意力自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 14个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4785 | 2025-10-06 |
Putting AML Differentiation States on the BoneMarrowMap
2025-Jul-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0083
PMID:40294281
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'BoneMarrowMap'的新型计算工具,可将白血病单细胞RNA测序数据映射到造血分化状态 | 开发了能够将白血病单细胞RNA测序数据集映射到造血分化状态的新型计算工具,并发现了12种与预后和治疗相关的复发性急性髓系白血病分化模式 | NA | 开发计算工具以分析白血病单细胞RNA测序数据并识别分化模式 | 急性髓系白血病患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大规模单细胞RNA测序数据重新分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4786 | 2025-10-06 |
T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70380
PMID:40579780
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了T淋巴母细胞淋巴瘤中T细胞分化阻滞模式的特征及其对肿瘤微环境和甲基化状态的影响 | 首次从T细胞分化阻滞角度系统阐明T-LBL与T-ALL的差异,发现DN/DP阶段阻滞模式驱动免疫抑制微环境和纵隔偏好,并揭示E2F2-UHRF1介导的抑癌基因高甲基化新机制 | 样本来源相对有限,需要更大规模队列验证研究结果 | 探究T淋巴母细胞淋巴瘤与T细胞急性淋巴细胞白血病之间的生物学差异和分子机制 | T淋巴母细胞淋巴瘤患者样本和T细胞急性淋巴细胞白血病数据 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 表达芯片 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 体细胞突变数据 | NCH-TALL-LBL队列样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
4787 | 2025-10-06 |
Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis
2025-Jul-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.002
PMID:40603206
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研究论文 | 本研究通过循环原位杂交技术结合空间信息聚类方法,在系统性硬化症皮肤中鉴定出新的成纤维细胞亚群及其致病作用 | 首次在单细胞分辨率下使用循环原位杂交技术进行空间转录组分析,并应用BANKSY算法进行空间信息聚类 | NA | 研究系统性硬化症皮肤中成纤维细胞亚群的空间分布和功能特征 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤组织 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 循环原位杂交, 单细胞RNA测序 | BANKSY聚类算法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4788 | 2025-10-06 |
Innovative Single-Cell Sequencing Techniques for B-Cell Analysis and Their Implications for Rational HIV-1 Vaccine Design
2025-Jul-01, Current HIV research
IF:0.8Q4
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在B细胞分析中的最新进展及其对HIV-1疫苗设计的启示 | 通过单细胞技术实现B细胞免疫库、基因表达和表型的多维度分析,为疫苗设计提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在传染病和疫苗接种背景下B细胞反应分析的应用 | B细胞及其在免疫反应中的动态变化 | 单细胞分析 | HIV-1感染 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4789 | 2025-10-06 |
Diversity of mast cell subpopulations in the tumor microenvironment of colorectal cancer and their prognostic implications
2025-Jun-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04119-8
PMID:40586903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其预后意义 | 首次在结直肠癌中鉴定出三个功能各异的肥大细胞亚群,并发现它们分别具有促肿瘤和抗肿瘤的不同功能特征 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关系 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 40例结直肠癌肿瘤样本的单细胞数据,整合HMU、GEO和TCGA队列的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
4790 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptome Analysis of B7-H4 in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: A Novel Therapeutic Target for Anti-Immune Checkpoint Inhibitors
2025-Jun-30, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01815-w
PMID:40586978
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和空间转录组学分析头颈部鳞状细胞癌中B7-H4的表达特征及其作为免疫检查点抑制剂新靶点的潜力 | 发现B7-H4与PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中呈现互斥表达模式,并证实B7-H4阳性与CD8+T细胞浸润减少相关 | 样本量有限(空间转录组分析仅6例),需要更大规模研究验证 | 探索B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的表达特征及其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本(94例HNSCC、94例相邻鳞状上皮内瘤变、69例正常口腔黏膜) | 数字病理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学, 空间转录组学 | NA | 组织图像, 基因表达数据 | 257个组织样本(94 HNSCC, 94 SIN, 69 NOM),其中6例进行空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4791 | 2025-10-06 |
Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect
2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011487
PMID:40588370
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研究论文 | 本研究证明低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法能增强免疫检查点抑制剂在远处未照射肿瘤中的疗效并诱导远隔效应 | 首次系统比较低剂量与高剂量放疗联合PD-L1阻断的疗效,并揭示肿瘤相关巨噬细胞在远隔效应中的关键作用机制 | 研究仅使用小鼠肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法在癌症治疗中的协同作用机制 | 免疫健全小鼠携带的MC38和CT26 murine肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序,肿瘤生长监测,巨噬细胞清除实验 | 动物模型 | 基因表达数据,肿瘤生长数据 | 多个小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4792 | 2025-10-06 |
Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium
2025-Jun-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088
PMID:40592367
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化 | 首次鉴定子宫内膜中GATA6+巨噬细胞亚群,揭示其来源于腹膜腔大腹膜巨噬细胞并通过Lars-Fos信号轴激活IL33表达抑制纤维化 | NA | 探索子宫内膜巨噬细胞亚群的来源和功能机制 | 正常子宫内膜和宫腔粘连患者的子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 宫腔粘连 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4793 | 2025-10-06 |
The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review
2025-Jun-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043019
PMID:40587734
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综述 | 本文综述了体外循环相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势 | 提出未来应聚焦炎症关键靶点并探索基因编辑和单细胞测序等先进技术 | 多年未取得突破性进展,导致管理策略和临床措施停滞 | 揭示体外循环相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效防治策略 | 心脏直视手术患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 基因编辑, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
4794 | 2025-10-06 |
Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes
2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426339122
PMID:40526717
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研究论文 | 本研究揭示了Sp140L作为疱疹病毒限制因子的功能,通过抑制病毒转录和激活干扰素刺激基因来抵御病毒感染 | 首次发现灵长类特异性蛋白Sp140L作为疱疹病毒限制因子,并揭示其通过连接病毒DNA感知与转录抑制来实现干扰素非依赖性先天免疫应答的新机制 | 研究主要聚焦于EB病毒和疱疹病毒saimiri,对其他DNA病毒的适用性需要进一步验证 | 探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制以及宿主限制因子的作用机制 | EB病毒感染的B细胞和疱疹病毒saimiri ORF3蛋白 | 病毒学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | EBNA-LP敲除感染的B细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4795 | 2025-10-06 |
Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status
2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s43046-025-00284-0
PMID:40484892
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研究论文 | 本研究通过分析胸膜间皮瘤患者的转录组数据,探讨NF2基因突变状态对肿瘤生物学特征和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示NF2突变在胸膜间皮瘤中通过改变免疫细胞浸润、细胞因子信号传导和化疗敏感性影响肿瘤微环境的机制 | 样本量相对有限(82例),且为回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明NF2基因突变对胸膜间皮瘤肿瘤生物学行为和治疗反应的影响 | 82例胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 胸膜间皮瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归模型,差异表达分析,功能富集分析 | 转录组数据,临床数据 | 82例胸膜间皮瘤病例 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
4796 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.83
PMID:40576432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了兔眼巩膜发育过程的细胞图谱,揭示了成纤维细胞的异质性和细胞间通讯网络 | 首次构建兔巩膜发育的单细胞转录组图谱,发现成纤维细胞亚型异质性、ECM重塑机制和跨物种保守特征 | 仅使用新西兰兔作为研究对象,样本时间点有限 | 阐明巩膜发育过程中成纤维细胞的异质性、分化轨迹和细胞间通讯 | 新西兰兔巩膜组织 | 单细胞转录组学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | VIA, CellChat, AUCell, CACIMAR, hdWGCNA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期25天和出生后7天、21天、180天四个发育阶段的兔巩膜组织 | BGI | 单细胞RNA测序 | BGISEQ-2000, DNBelab C Series Kit | DNBelab C系列单细胞RNA测序建库试剂盒,BGISEQ-2000测序平台 |
4797 | 2025-10-06 |
Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases
2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae688
PMID:39672802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验揭示了系统性硬化症及相关风湿性疾病中巨噬细胞通过高表达Fcγ受体增强吞噬活性和促炎反应的机制 | 首次在系统性硬化症中鉴定出FCGR3Ahi皮肤巨噬细胞和FCN1hi肺巨噬细胞的促吞噬表型,并证实FcγRI和FcγRII是驱动吞噬活性和IL-6炎症的关键因素 | 研究样本来源有限,主要依赖公共数据库和体外培养模型,缺乏在体功能验证 | 探究系统性硬化症及相关风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其分子机制 | 健康对照和系统性硬化症、类风湿关节炎、银屑病关节炎、中轴型脊柱关节炎患者的皮肤、肺组织巨噬细胞及单核源性巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症及相关风湿性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质印迹数据, 基因表达数据 | 使用公共数据集GSE138669/GSE212109,包含健康对照和SSc患者的皮肤和肺巨噬细胞;体外培养来自多种风湿病患者CD14+单核细胞分化的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4798 | 2025-10-06 |
Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3
2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf035
PMID:40184040
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Batf3通过促进肺驻留记忆CD4+T细胞发育来调控过敏性气道炎症的机制 | 首次发现Batf3缺陷小鼠缺乏表达Cxcr6的肺驻留CD4+T细胞亚群,并证明该转录因子对过敏原特异性CD4+记忆T细胞在肺脏积累的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;长期哮喘模型的分子机制仍需进一步探索 | 探究肺脏驻留记忆T细胞积累的细胞和分子机制 | 小鼠肺脏CD4+驻留记忆T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Batf3缺陷小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4799 | 2025-10-06 |
Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612512
PMID:39314489
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因标记技术揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的机制 | 首次系统阐明了心脏成纤维细胞在发育过程中通过胶原信号通路调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的分子机制 | 研究主要聚焦于发育阶段,对成年心脏中成纤维细胞功能的验证相对有限 | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育过程中对心肌和血管系统的调控作用 | 小鼠心脏成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq), RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 组织染色图像 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4800 | 2025-10-06 |
Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618
PMID:40279247
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研究论文 | 本研究揭示了病理α-突触核蛋白通过失调m6A甲基转移酶METTL3驱动小胶质细胞神经炎症的机制 | 首次发现METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中表达上调并发挥关键调控作用 | 未明确METTL3调控神经炎症的具体下游分子机制 | 探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制 | 人源小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者尸检组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 亚细胞定位研究, 功能分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质定位数据 | 人源细胞模型和神经退行性疾病患者尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |