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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 4781 - 4800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4781 | 2026-04-17 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术，揭示了宫颈癌中代谢与免疫相互作用的分子机制，并探索了苦参碱的潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术，系统性地构建了宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络，并探索了天然产物苦参碱的多靶点抗肿瘤机制 | 苦参碱的具体作用机制尚未完全明确，体外实验和分子对接结果仅为初步验证，需要进一步的体内实验和临床研究证实 | 阐明宫颈癌的分子机制，评估苦参碱干预的潜力，为宫颈癌治疗提供新的研究方向和治疗靶点 | 宫颈癌组织、TCGA数据库中的宫颈癌数据、苦参碱 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序、空间转录组、生物信息学分析、分子对接、体外实验 | CIBERSORT算法、ESTIMATE算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组 | NA | NA |
| 4782 | 2026-04-17 |
Integrative bioinformatics-machine learning-experimental validation identifies shared immunomodulatory targets in psoriasis and psoriatic arthritis and deciphers allicin's therapeutic mechanism
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04777-6
PMID:41408482
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、机器学习与实验验证，识别了银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，并揭示了蒜素（allicin）的治疗机制 | 整合了多组学数据、机器学习算法（随机森林和LASSO）、单细胞RNA测序分析以及反向药物筛选，首次系统性地识别了CXCL10、ISG15和IFI27作为银屑病和银屑病关节炎的共有免疫治疗靶点，并通过分子对接、动力学模拟和实验验证了蒜素通过抑制NF-κB信号通路调控这些靶点的治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，实验验证部分可能受样本量和体外实验模型的限制，蒜素在体内的药效和安全性仍需进一步临床研究证实 | 识别银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点，预测潜在治疗药物，并验证其作用机制 | 银屑病和银屑病关节炎患者的转录组数据、免疫相关基因、候选药物蒜素及其活性成分蒜素 | 生物信息学, 机器学习 | 银屑病, 银屑病关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4783 | 2026-04-17 |
Multimodal bioinformatic analyses of genome-scale expression beyond gene-centric differential expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag152
PMID:41978384
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综述 | 本文综述了基因组规模基因表达分析的概念和方法学进展，超越传统的病例对照比较和基因中心差异表达分析 | 强调使用转录组和多模态组学数据阐明基因表达多样机制，包括基因共表达和调控网络推断、上下文特异性网络模型及机器学习方法 | 作为综述文章，未进行原始研究，主要总结现有进展，未提出具体实验验证 | 提高对先进网络分析的认识并鼓励其应用，以探索基因表达调控的多因素性质 | 基因组规模基因表达数据，包括转录组和多模态组学数据 | 生物信息学 | NA | 转录组学、多模态组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习方法、网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 4784 | 2026-04-17 |
BCRInsight: an antibody language model to decode biological signals from BCR sequences
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag154
PMID:41978383
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研究论文 | 本文介绍了BCRInsight，一种基于Transformer架构和表型感知对比学习的抗体特异性预训练语言模型，用于从B细胞受体序列中解码生物信号 | BCRInsight整合了Transformer架构与表型感知对比学习，通过自监督学习从8000万个人类BCR序列中学习生物上下文表示，实现了在多个下游任务中的最先进性能，并展示了基于注意力的结构可解释性 | 未明确提及具体限制，但暗示单细胞测序的可扩展性和成本仍是主要障碍，且传统生物信息学方法难以建模抗体序列中的高阶非线性语义依赖 | 解码B细胞受体序列中嵌入的复杂序列语义，以阐明免疫动态并加速抗体发现 | 人类B细胞受体序列，包括健康、肿瘤和病毒感染状态下的单细胞免疫队列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | Transformer | 序列数据 | 8000万个人类BCR序列 | NA | NA | NA | NA |
| 4785 | 2026-04-17 |
Analysis of microsatellite instability intensity in single-cell resolution with scMnT reveals tumor heterogeneity in colorectal cancer
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag156
PMID:41978385
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scMnT的生物信息学方法，用于在单细胞分辨率下识别微卫星不稳定（MSI）细胞并量化MSI强度，揭示了结直肠癌中MSI强度的异质性及其与免疫治疗反应的相关性 | 首次在单细胞水平上量化MSI强度，突破了传统二元分类的局限，揭示了MSI在肿瘤内的异质性连续谱 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性，尚未在更大规模或更多癌种中进行验证 | 开发单细胞水平的MSI强度量化方法，探究MSI异质性在结直肠癌中的临床意义 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生物信息学分析方法（scMnT） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4786 | 2026-04-17 |
GDSim: accurate simulation for single-cell transcriptomes based on the guided diffusion model
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag163
PMID:41978379
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研究论文 | 本文提出了一种基于引导扩散模型的新型深度生成网络GDSim，用于准确模拟单细胞转录组数据 | 首次利用标签引导的扩散模型来捕获scRNA-seq数据中复杂的基因表达依赖关系，生成的模拟数据能紧密反映原始数据的真实分布 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据不足的问题，为下游分析提供高质量的模拟数据 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成网络，扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4787 | 2026-04-17 |
Engineering and evaluation of precision-glycosylated clickable albumin nanoplatform for targeting the tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.123973
PMID:41355949
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研究论文 | 本文开发了一种精确糖基化的可点击白蛋白纳米平台（CAN-DGIT），用于靶向肿瘤微环境，并结合空间转录组学评估纳米颗粒与TME的相互作用 | 通过精确控制糖基化程度和类型，实现了白蛋白纳米颗粒的可编程生物分布和细胞类型靶向，并创新性地整合PET成像与空间转录组学进行机制映射 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类临床试验；糖基化类型和靶向机制的普适性需进一步验证 | 开发一种精确糖基化的纳米药物递送平台，以选择性靶向肿瘤微环境并评估其相互作用 | 白蛋白纳米颗粒、糖基化配体（甘露糖、半乳糖、葡萄糖）、4T1肿瘤小鼠模型 | 纳米医学 | 肿瘤 | 点击化学、MALDI-TOF质谱、UV-vis光谱、PET成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 健康小鼠和4T1肿瘤小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4788 | 2026-04-17 |
Identification and validation of SUMOylation-related key genes for osteoarthritis through integration of single-cell, bulk RNA sequencing and animal model experiments
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1779874
PMID:41987786
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和动物模型实验，识别并验证了与骨关节炎相关的SUMOylation关键基因 | 首次结合单细胞测序、批量测序和动物模型，系统识别了骨关节炎中SUMOylation相关的关键基因和细胞类型 | 样本量相对较小，动物模型仅使用大鼠，且未深入探讨关键基因的具体作用机制 | 检测和验证骨关节炎中SUMOylation相关基因的关键作用 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，差异表达分析，PPI网络，机器学习，ROC曲线，免疫浸润分析，药物预测 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 三个公共数据集（GSE51588, GSE55235, GSE152805）和大鼠模型（三个OA和三个假手术样本） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 4789 | 2026-04-17 |
Hypoxic microenvironment in cancer: role in metabolic reprogramming
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1771365
PMID:41988136
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综述 | 本文综述了肿瘤缺氧微环境如何通过代谢重编程驱动肿瘤进展和治疗抵抗 | 系统整合了单细胞多组学、空间转录组学等新兴技术证据，并讨论了靶向缺氧信号、血管生成通路和代谢酶等创新治疗策略 | NA | 阐明缺氧诱导的代谢重编程机制及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用，并探讨利用缺氧相关代谢依赖性的精准肿瘤学策略 | 实体瘤及其缺氧微环境中的恶性细胞和基质细胞（包括癌症相关成纤维细胞、内皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞） | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学，空间转录组学，代谢成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 4790 | 2026-04-17 |
From forest floor to doctor's office: the immunological journey of Borrelia burgdorferi through vertebrate hosts
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1811554
PMID:41988178
|
综述 | 本文综述了伯氏疏螺旋体在脊椎动物宿主中的免疫生物学进展，重点关注其通过免疫调节建立持续性感染的机制 | 采用阶段结构化框架整合了2020年后活体成像、单细胞转录组学、空间分析和系统免疫学等新技术带来的新见解 | NA | 理解伯氏疏螺旋体如何通过免疫调节在脊椎动物宿主中建立持续性感染，并为诊断、疫苗和治疗提供信息 | 伯氏疏螺旋体及其在脊椎动物宿主中的感染过程 | 自然语言处理 | 莱姆病 | 活体成像、单细胞转录组学、空间分析、系统免疫学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4791 | 2026-04-17 |
The mechanism of PKM2/HIF-1α axis polarizing TAMs by upregulating glucose-serine metabolism to promote melanoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740155
PMID:41988200
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4792 | 2026-04-17 |
Histopathology and spatial transcriptomics jointly map myofiber-specific pathological programs in mTORC1-driven myopathy
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692123
PMID:41573854
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研究论文 | 本研究结合组织病理学和空间转录组学技术，在mTORC1过度激活的啮齿动物模型中，以单肌纤维分辨率揭示了肌纤维类型特异性的病理程序 | 首次将高分辨率Seq-Scope空间转录组学技术与组织病理学相结合，在单肌纤维水平上解析mTORC1驱动肌病的分子机制 | 研究基于啮齿动物模型，结果可能不完全适用于人类疾病；仅分析了两种特定肌肉（EDL和SOL），未涵盖所有肌肉类型 | 探究mTORC1过度激活如何通过不同代谢和结构途径破坏肌肉稳态，并将组织病理表型与分子状态直接关联 | mTORC1过度激活的啮齿动物模型中的骨骼肌组织，特别是趾长伸肌（EDL）和比目鱼肌（SOL） | 空间转录组学 | 肌病 | 空间转录组学，组织病理学分析 | NA | 空间转录组数据，组织病理图像 | 啮齿动物模型中的EDL和SOL肌肉组织样本 | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope | 高分辨率Seq-Scope技术 |
| 4793 | 2026-04-17 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，识别骨关节炎相关基因并预测潜在治疗药物 | 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别OA关键基因，并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物作用 | 研究主要基于生物信息学预测和斑马鱼模型，需进一步在哺乳动物或临床样本中验证 | 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 | 骨关节炎相关基因和候选药物 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR | 随机森林, 网络分析 | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的scRNA-seq和bulk-RNA seq数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4794 | 2026-04-17 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq identifies transcriptional and epigenetic blueprint guiding osteoclastogenic trajectory
2025-Sep-28, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf084
PMID:40577680
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq、ATAC-seq、批量RNA-seq和ChIP-seq技术，揭示了破骨细胞生成过程中转录和表观遗传调控的蓝图 | 首次在单细胞分辨率下结合多组学分析，系统描绘了破骨细胞生成的分化轨迹，并鉴定出IRF8作为破骨细胞生成的关键负调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明破骨细胞生成过程中的转录和表观遗传调控机制 | 野生型和IRF8条件性敲除小鼠的造血干细胞、祖细胞、单核细胞及破骨细胞前体 | 单细胞多组学 | 骨溶解性疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 批量转录组数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 4795 | 2026-04-17 |
Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis
2025-Sep-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825
PMID:40436260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，比较了局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的调控作用及其临床意义 | 首次整合单细胞测序和TCGA数据库，系统比较了LAIT和ICI对NK细胞的转录调控，并构建了基于NK细胞基因特征的预后模型 | 研究基于小鼠乳腺癌模型，临床转化需进一步验证；单细胞测序样本量有限 | 阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤微环境中NK细胞的调控机制 | 肿瘤浸润自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠乳腺癌模型，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4796 | 2026-04-17 |
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.002
PMID:40562034
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研究论文 | 本研究开发了一种结合化学筛选与单细胞RNA测序的ChemPerturb-seq平台，用于系统分析小分子处理后人源β细胞的分子变化，并发现了一种能增强皮下移植后β细胞存活的小分子混合物 | 创新性地将化学筛选与单细胞RNA测序结合，开发了ChemPerturb-seq平台，实现了高通量分析小分子对细胞分子层面的影响，并发现了性别特异性的小分子混合物效果 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未在人体临床试验中证实效果；且发现的小分子混合物对雌性小鼠有效，但对雄性小鼠效果有限，存在性别差异 | 旨在通过化学筛选和单细胞分析，发现能增强人源β细胞在皮下移植后存活和功能的小分子混合物 | 人源β细胞和原代胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | AI驱动的网站分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，涉及人源β细胞和原代胰岛的体外及小鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4797 | 2026-04-17 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
|
研究论文 | 本研究揭示了酒精相关性肝病中肠道与肝内CD8+ T细胞的反向调控机制及其在疾病进展中的关键作用 | 首次发现酒精暴露导致十二指肠CD8+ T细胞特异性减少而肝内CD8+ T细胞增加的反向调控现象，并证明BCL2在其中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的关联分析，需要进一步验证BCL2调控机制在人体中的直接作用 | 探究肠道与肝内CD8+ T细胞在酒精相关性肝病中的调控机制及其对疾病进展的影响 | ALD患者样本、野生型小鼠、CD8特异性Bcl2转基因小鼠和Cd8基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 酒精相关性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ALD患者样本及多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4798 | 2026-04-17 |
Identification of Immune Hub Genes in Obese Postmenopausal Women Using Microarray and Single-Cell RNA Seq Data
2025-Jun-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070783
PMID:40725440
|
研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了绝经后肥胖女性脂肪组织中的关键免疫枢纽基因 | 结合WGCNA、PPI网络分析和单细胞RNA测序验证，首次在绝经后肥胖女性中鉴定出与脂肪组织炎症相关的免疫枢纽基因，并揭示了NK细胞在这些基因表达中的重要作用 | 研究样本来源于公共数据库，可能受限于原始数据质量；动物模型验证仅使用斑马鱼，与人类生理存在差异 | 阐明绝经后肥胖女性脂肪组织中免疫失调的分子机制 | 绝经后肥胖女性的脂肪组织 | 生物信息学 | 肥胖症 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | WGCNA, PPI网络分析, ssGSEA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的微阵列数据集GSE151839和单细胞RNA测序数据集GSE176171，以及肥胖和对照斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 4799 | 2026-04-17 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过上调铜转运蛋白CTR1、消耗线粒体谷胱甘肽来诱导铜死亡，并发现放疗抵抗与BACH1下调导致的铜螯合蛋白MT1E/X表达升高有关，铜离子载体治疗可增强放疗敏感性 | 首次揭示了放疗诱导铜死亡的机制，并发现铜死亡诱导剂可协同放疗克服肿瘤放疗抵抗 | NA | 阐明放疗诱导铜死亡的机制，并探索通过靶向铜死亡克服肿瘤放疗抵抗的治疗策略 | 食管癌细胞、患者肿瘤样本、细胞系及患者来源的异种移植模型 | NA | 食管癌 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4800 | 2026-04-17 |
Machine learning approach to single cell transcriptomic analysis of Sjogren's disease reveals altered activation states of B and T lymphocytes
2025-Jun, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103419
PMID:40318561
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了干燥综合征患者外周血单个核细胞中B细胞和T细胞独特的基因表达模式和异常的激活状态 | 首次在干燥综合征患者中应用单细胞转录组学结合机器学习方法，系统揭示了B细胞和T细胞中独特的基因表达特征和激活状态改变 | 研究样本量未明确说明，且仅分析了外周血单个核细胞，未直接研究唾液腺等靶器官中的免疫细胞 | 探究干燥综合征的发病机制，识别参与疾病过程的细胞类型和功能变化 | 干燥综合征患者和症状性非干燥综合征对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |