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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4781 | 2025-10-06 |
Identification of three T cell-related genes as diagnostic and prognostic biomarkers for triple-negative breast cancer and exploration of potential mechanisms
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1584334
PMID:40606662
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA和GEO数据库数据,识别出三个T细胞相关基因作为三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 首次将T细胞相关基因与三阴性乳腺癌诊断预后相结合,并构建了高精度的逻辑回归诊断模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 逻辑回归 | 转录组数据,临床数据 | TCGA-BRCA数据集和GEO数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4782 | 2025-10-06 |
Comprehensive bioinformatics analysis of the common mechanism of atherosclerosis and atrial fibrillation: emphasizing mitochondrial metabolic disorder and immune inflammation
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1595048
PMID:40607061
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同机制,重点关注线粒体代谢紊乱和免疫炎症 | 首次建立MRPS23作为连接线粒体功能障碍和免疫失调的新型生物标志物,提出'线粒体-免疫轴'心血管共病新范式 | 需要在临床前模型和临床队列中进一步验证以转化为诊断或治疗应用 | 揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同分子通路,识别诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化和心房颤动患者的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析,单细胞RNA测序,机器学习算法 | LASSO,SVM,随机森林 | 转录组数据,单细胞转录组数据 | 多个独立数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
4783 | 2025-10-06 |
Interferon Regulatory Factor 4 Recruits Immature B Cells to Signal Tertiary Lymphoid Structure Immaturity and Progression of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.113737
PMID:40607252
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和临床数据构建了透明细胞肾细胞癌的三级淋巴结构相关预后风险评分,并揭示了干扰素调节因子4在促进TLS不成熟和免疫功能障碍中的机制作用 | 首次构建了ccRCC中TLS相关的预后风险评分,并发现IRF4通过招募不成熟B细胞阻碍TLS成熟的新机制 | 研究主要基于回顾性数据,需要进一步的功能验证实验确认IRF4的具体作用机制 | 探究三级淋巴结构在透明细胞肾细胞癌中的预后意义和调控机制 | 928名透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,多重免疫荧光分析 | 机器学习算法 | 转录组数据,临床数据,图像数据 | 928名ccRCC患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4784 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics analysis of IFNγ-induced macrophages and atherosclerotic plaques reveals macrophage-dependent STAT1-driven transcription in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590953
PMID:40607379
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示巨噬细胞中STAT1驱动的转录调控在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次发现STAT1与PU.1共结合通过表观遗传修饰调控巨噬细胞特异性IFNγ激活的转录反应,并鉴定出新的巨噬细胞依赖性基因特征 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要进一步临床验证 | 探究巨噬细胞STAT1介导的信号通路在动脉粥样硬化进展中的作用 | IFNγ诱导的巨噬细胞、人类和小鼠动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq, scRNA-seq, 多组学整合分析 | 统计分析、通路分析 | 基因组学、表观基因组学、转录组学数据 | 人类颈动脉和冠状动脉粥样硬化病变样本、LDLr-/-和ApoE-/-高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性测序, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA |
4785 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of T cell-associated markers in Ewing sarcoma reveals prognostic signatures and immune dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586544
PMID:40607387
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和生物信息学分析,揭示了尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后价值及免疫动态特征 | 首次系统鉴定CLEC11A、BDP1和ID3作为尤文肉瘤T细胞相关预后标志物,并构建了具有高预测准确性的预后模型 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索尤文肉瘤肿瘤微环境中T细胞相关标志物的预后价值及免疫调控机制 | 尤文肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 批量RNA测序, CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4786 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of peripheral blood and pleural effusion reveals functional diversity of γδ T cells in tuberculosis infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605827
PMID:40607390
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研究论文 | 通过单细胞测序分析结核病患者外周血和胸腔积液中γδ T细胞的功能多样性 | 首次在结核病患者中系统鉴定出7个γδ T细胞亚群,并发现效应性γδ2细胞在PBMC中占比最高(36.1%),组织驻留γδ2细胞在PFMC中占比最高(70.5%) | NA | 探索γδ T细胞在结核病免疫应答中的具体作用和亚群分化机制 | 结核病患者的外周血单个核细胞(PBMC)和结核性胸腔积液(TPE) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4787 | 2025-10-06 |
Decoding neuroinflammation in Alzheimer's disease: a multi-omics and AI-driven perspective for precision medicine
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616899
PMID:40607399
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综述 | 本文探讨了利用多组学和人工智能方法解析阿尔茨海默病神经炎症机制的前景 | 整合单细胞RNA测序与AI分析及多组学平台,突破传统组织分析信号平均化的限制 | NA | 解码阿尔茨海默病复杂的免疫炎症网络,实现疾病亚型精准分类和早期诊断 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | AI驱动分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4788 | 2025-10-06 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究通过综合分析基质金属蛋白酶在前列腺癌中的作用,发现MMP11是关键预后标志物并通过重塑肿瘤微环境促进癌症进展 | 首次系统评估24种MMP在前列腺癌中的表达特征和预后价值,并证实MMP11通过调控肿瘤微环境促进前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析,需要更多实验验证MMP11的具体作用机制 | 探索基质金属蛋白酶在前列腺癌中的全面作用及其临床意义 | 前列腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,细胞功能实验 | COX回归分析 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
4789 | 2025-10-06 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证系统研究核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究NUP153在多种癌症中的表达模式、突变特征、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制并探索其临床适用性 | 探索核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 人类多种癌症类型,重点关注胃癌 | 生物信息学 | 多种癌症(胆管癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌、胃癌等) | 多组学分析、免疫组织化学、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx等公共数据库的多种癌症样本,以及胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
4790 | 2025-10-06 |
Identification and validation of a KRAS-macrophage-associated gene signature as prognostic biomarkers and potential therapeutic targets in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566432
PMID:40607411
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研究论文 | 本研究通过多平台数据分析识别并验证了KRAS-巨噬细胞相关基因特征作为黑色素瘤预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次构建了KRAS-巨噬细胞预后相关基因(KMPAG)特征,整合了单细胞RNA测序和临床数据分析,重新分类巨噬细胞亚群 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床队列验证 | 探索KRAS信号通路在黑色素瘤肿瘤微环境中对巨噬细胞浸润的影响及其预后价值 | 皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)患者和黑色素瘤细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, LASSO回归, 免疫组织化学, 功能实验 | LASSO回归模型, Monocle2算法, CellChat工具 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4791 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05821-4
PMID:39548496
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤的基因表达特征与临床病理特征的关联 | 首次在单细胞水平系统比较促性腺激素细胞和泌乳素细胞PitNET的肿瘤微环境差异,发现SPP1+巨噬细胞和增殖性淋巴细胞等新型细胞亚群与肿瘤侵袭性的关联 | 样本量相对有限(7例促性腺激素细胞和3例泌乳素细胞肿瘤),需更大规模验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤微环境细胞组成与肿瘤侵袭行为的关系 | 促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤患者 | 单细胞转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组织化学染色 | 差异表达分析,基因表达程序识别 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织切片图像 | 10例单细胞测序样本(7例促性腺激素细胞+3例泌乳素细胞),134例批量RNA-seq验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
4792 | 2025-10-06 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
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研究论文 | 研究发现PSMP/MSMP通过CCR2促进急性肾损伤,可能成为治疗新靶点 | 首次揭示PSMP在急性肾损伤中的关键作用机制,证明其通过CCR2介导巨噬细胞浸润和M1极化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究PSMP在急性肾损伤中的作用机制及治疗潜力 | 急性肾损伤患者样本和AKI小鼠模型 | 生物医学研究 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肾组织、尿液和血浆样本,多种AKI小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4793 | 2025-10-06 |
S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis
2024-06-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06849-6
PMID:38942784
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研究论文 | 本研究揭示了S100A8/A9高表达中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制 | 首次阐明S100A8/A9通过下调Nrf1抑制线粒体复合物I组分Ndufa3表达,进而导致线粒体功能障碍并激活ZBP1介导的PANoptosis | 机制研究主要在细胞水平进行,需要更多体内实验验证 | 探讨S100A8/A9在脓毒症中诱导内皮功能障碍的分子机制 | 中性粒细胞和内皮细胞 | 细胞生物学 | 脓毒症 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4794 | 2025-10-06 |
Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization
2024-06-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06840-1
PMID:38906852
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学对牙釉质型颅咽管瘤进行多组学整合分析,揭示其免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统解析ACP免疫微环境,发现GPNMB高表达的非小胶质细胞来源TAM与RHCG上皮细胞的共定位关系 | 样本数量有限,需要更大队列验证研究结果 | 阐明牙釉质型颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与角质化的关系 | 牙釉质型颅咽管瘤标本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, asmFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 58,081个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4795 | 2025-10-06 |
CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06816-1
PMID:38898019
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研究论文 | 本研究揭示了CSTF3通过调控lncRNA NEAT1的可变多聚腺苷酸化促进卵巢癌铂类耐药的新机制 | 首次发现CSTF3通过调控NEAT1的可变多聚腺苷化生成短异构体NEAT1_1,从而促进卵巢癌铂类耐药 | 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索卵巢癌铂类耐药的分子机制,寻找潜在生物标志物和治疗策略 | 卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织,卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,基因敲低,基因过表达 | 细胞系模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4796 | 2025-10-06 |
CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06784-6
PMID:38898023
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研究论文 | 本研究通过激活CXCR7受体重塑CXCL12介导的免疫反应,增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效 | 首次发现CXCR7作为CXCL12的非典型受体可负调控CXCL12表达,并证实选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAMs诱导的免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证 | 探索通过靶向肿瘤-巨噬细胞相互作用来增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制 | 胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序、转录组分析、体外共培养系统 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确样本数量,包括复发胶质母细胞瘤标本、公共数据库数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4797 | 2025-10-06 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-06-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
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研究论文 | 本研究揭示了趋化因子chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞反向迁移的机制 | 首次发现中性粒细胞反向迁移过程中CCRL2表达上调,并证实chemerin-CCRL2轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于动物模型,人类临床相关性有待验证;反向迁移的生理病理意义需进一步探索 | 探索中性粒细胞反向迁移的分子机制 | 中性粒细胞及其反向迁移现象 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序,体内细胞追踪 | NA | 基因表达数据,细胞追踪数据 | 急性肺损伤模型和气囊模型中的白细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4798 | 2025-10-06 |
The Mohawk homeobox gene represents a marker and osteo-inhibitory factor in calvarial suture osteoprogenitor cells
2024-06-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06813-4
PMID:38886383
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现Mohawk同源盒基因是颅骨缝间充质祖细胞的标记物,并作为骨生成抑制因子调控骨修复过程 | 首次发现Mkx基因在成年颅骨缝中标记具有肌腱/韧带相关基因表达的祖细胞群,并揭示其作为力学响应基因抑制骨分化的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的功能验证尚需进一步研究 | 探索颅骨缝间充质祖细胞的分子标记及其在骨修复中的调控机制 | 小鼠颅骨缝细胞 | 单细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4799 | 2025-10-06 |
Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-06-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06699-2
PMID:38886351
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研究论文 | 本研究开发了一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略,通过调控SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫 | 首次提出基于三种常用抗肿瘤药物的协同免疫化疗方案,并揭示了通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控APOA2-PD-L1轴的免疫调节新机制 | 研究主要在PDX小鼠模型中进行,临床验证样本有限 | 开发有效的肝细胞癌协同免疫化疗策略并阐明其作用机制 | 肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 2'-O-甲基化修饰, 多重免疫荧光染色 | PDX小鼠模型 | 基因表达数据, 免疫染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4800 | 2025-10-06 |
MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing
2024-06-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06775-7
PMID:38866777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集并通过EGFR/SREBP-1通路重编程脂质代谢 | 首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制,并筛选出小分子抑制剂sarizotan | 未明确说明样本量大小及临床验证的局限性 | 探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗潜力 | 肝内胆管癌细胞及构建的类器官模型 | 单细胞测序 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |