单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4781	2025-01-22	An exhausted-like microglial population accumulates in aged and APOE4 genotype Alzheimer's brains 2024-01-09, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2023.12.001 PMID:38159571	研究论文	本文研究了晚期阿尔茨海默病（AD）的主要风险因素——高龄和APOE4基因变异如何改变神经免疫功能，并识别出一种在AD环境中可能代表炎症小胶质细胞耗竭状态的终末炎症小胶质细胞（TIM）群体	通过整合纵向单细胞图谱和转录组及染色质可及性分析，识别出与年龄和APOE4负担增加相关的终末炎症小胶质细胞（TIM）群体，并在人类AD患者大脑中检测到类似群体	研究主要基于AD模型小鼠，人类样本的验证仍需进一步扩展	探讨高龄和APOE4基因变异如何影响神经免疫功能，并识别与AD相关的特定小胶质细胞群体	AD模型小鼠和人类AD患者的大脑免疫细胞	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞转录组分析、染色质可及性分析、多重空间转录组学	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据	AD模型小鼠和人类AD患者的大脑样本
4782	2025-01-22	Dendritic cell effector mechanisms and tumor immune microenvironment infiltration define TLR8 modulation and PD-1 blockade 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1440530 PMID:39697344	研究论文	本研究探讨了TLR8激动剂与PD-1阻断联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制	通过单细胞RNA测序和定制多重染色技术，利用同一病灶的纵向采样优势，揭示了TLR8激动剂与PD-1阻断联合治疗的免疫效应机制	研究样本量较小，仅涉及三名患者	解析TLR8激动剂与PD-1阻断联合治疗在头颈部鳞状细胞癌患者中的作用机制	头颈部鳞状细胞癌患者	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序，定制多重染色	NA	RNA测序数据，染色数据	三名头颈部鳞状细胞癌患者
4783	2025-01-22	Proximal immune-epithelial progenitor interactions drive chronic tissue sequelae post COVID-19 2023-Nov-28, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3587418/v1 PMID:38077031	研究论文	本文研究了COVID-19后急性后遗症（PASC）的长期生理后果，特别是呼吸系统PASC的病理生理机制	通过空间转录组学和成像技术，发现了免疫细胞与上皮祖细胞之间的失调近端相互作用，这在呼吸系统PASC中独特存在，而在急性COVID-19或特发性肺纤维化（IPF）中不存在	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探讨COVID-19后急性后遗症（PASC）的病理生理机制，特别是呼吸系统PASC的驱动因素	PASC患者的肺功能异常和/或病毒感染介导的肺纤维化	病理生理学	COVID-19后遗症	空间转录组学、成像技术	小鼠模型	转录组数据、图像数据	三个独立的PASC患者临床队列
4784	2025-01-22	Distinct human Langerhans cell subsets orchestrate reciprocal functions and require different developmental regulation 2021-10-12, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.012 PMID:34508661	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，识别了人类皮肤表皮中两种稳态（LC1和LC2）和两种激活的Langerhans细胞（LCs）亚群，并揭示了它们在发育调控和功能上的差异	首次在人类皮肤中识别出两种稳态和两种激活的LCs亚群，并揭示了EGR1和Notch信号通路在LC1和LC2分化中的关键作用	研究主要基于体外培养的HSC-LCs，可能不完全反映体内LCs的行为	探索人类皮肤中Langerhans细胞的异质性及其功能差异	人类皮肤表皮中的Langerhans细胞和由CD34造血干细胞衍生的LCs	免疫学	NA	单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据	人类皮肤表皮样本和CD34造血干细胞衍生的LCs
4785	2025-01-21	Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis 2025-Jan-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.123315 PMID:39675550	研究论文	本研究探讨了平滑肌细胞（SMC）中CD47的激活通过TSP1在调节VSMC表型和动脉粥样硬化发展中的作用	研究发现Cd47在动脉粥样硬化动脉中的表型调节SMCs中上调，并且SMC特异性Cd47缺失可减轻动脉粥样硬化	研究中未观察到SMC限制性Cd47缺陷小鼠在体重增加、肝脏和脂肪组织质量、血浆总胆固醇和空腹血糖方面的显著差异	研究SMC CD47激活在调节VSMC表型和动脉粥样硬化发展中的作用	平滑肌细胞（SMC）和动脉粥样硬化	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子生物学技术、免疫组织学方法	细胞特异性敲除小鼠	基因表达数据、组织样本	人类动脉粥样硬化血管组织和VSMCs、小鼠模型
4786	2025-01-21	Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions 2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.03.601990 PMID:39005270	研究论文	本文介绍了一种通过移植人类诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经细胞生成的人鼠嵌合脑模型，用于研究人类神经细胞的发育和功能	创新性地使用共移植方法生成包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的人鼠嵌合脑模型，并通过超分辨率成像和单细胞RNA测序技术揭示了神经元与胶质细胞之间的动态相互作用	模型依赖于小鼠宿主环境，可能不完全模拟人类大脑的复杂性	研究人类神经细胞在体内的发育和功能，特别是胶质细胞与神经元之间的相互作用	人类诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经细胞	神经科学	神经系统疾病	超分辨率成像、3D重建技术、单细胞RNA测序	人鼠嵌合脑模型	图像、基因表达数据	NA
4787	2025-01-21	TRIM24 Cooperates with Ras Mutation to Drive Glioma Progression through snoRNA Recruitment of PHAX and DNA-PKcs 2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400023 PMID:38828688	研究论文	本文揭示了表观遗传调节因子TRIM24在胶质瘤进展中的作用，特别是其与HRas突变共同驱动胶质瘤向类上皮性胶质母细胞瘤（Ep-GBM）转变的机制	首次发现TRIM24通过与HRas突变协同作用，通过snoRNA招募PHAX和DNA-PKcs，促进胶质瘤向Ep-GBM样肿瘤的转变	研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩展	探讨TRIM24在胶质瘤进展中的分子机制及其潜在治疗策略	胶质瘤细胞、人类神经干细胞（hNSCs）、临床Ep-GBM样本	分子生物学	胶质瘤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	临床Ep-GBM样本及体外实验模型
4788	2025-01-21	ARID1B maintains mesenchymal stem cell quiescence via inhibition of BCL11B-mediated non-canonical Activin signaling 2024-May-30, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48285-2 PMID:38816354	研究论文	本文探讨了ARID1B在间充质干细胞（MSCs）静息状态维持中的作用及其机制	揭示了ARID1B通过抑制BCL11B介导的非经典Activin信号通路来维持MSCs静息状态的新机制	研究主要基于小鼠切牙模型，尚未在人类细胞中验证	研究ARID1B在间充质干细胞静息状态维持中的作用及其分子机制	小鼠切牙模型中的GLI1+间充质干细胞	细胞生物学	NA	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	单细胞RNA测序数据, 单细胞ATAC测序数据	小鼠切牙模型中的间充质干细胞
4789	2025-01-21	Triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) regulates phagocytosis in glioblastoma 2024-05-03, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noad257 PMID:38237157	研究论文	本文研究了髓系细胞表达的触发受体2（TREM2）在胶质母细胞瘤中的吞噬作用调控机制	揭示了TREM2在胶质母细胞瘤中的吞噬作用而非免疫抑制功能，并提出了其作为脑肿瘤潜在治疗策略的可能性	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探讨TREM2在胶质母细胞瘤免疫病理和进展中的作用	胶质母细胞瘤中的髓系细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、流式细胞术	小鼠胶质瘤模型	RNA测序数据、流式细胞数据	未明确提及具体样本数量
4790	2024-08-13	Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar 2025-Feb, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022 PMID:39128494	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4791	2025-01-20	Analysis of the effect of ALA-PDT on macrophages in footpad model of mice infected with Fonsecaea monophora based on single-cell sequencing 2025, Open medicine (Warsaw, Poland) DOI:10.1515/med-2024-1132 PMID:39822988	研究论文	本文通过单细胞测序技术分析了ALA-PDT治疗对感染Fonsecaea monophora的小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响	首次使用单细胞测序技术研究ALA-PDT对巨噬细胞免疫反应的影响，揭示了治疗后巨噬细胞抗原识别相关基因表达上调的机制	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类临床试验	探讨ALA-PDT治疗对感染Fonsecaea monophora的小鼠足垫模型中巨噬细胞免疫反应的影响	感染Fonsecaea monophora的小鼠足垫模型中的巨噬细胞	数字病理学	真菌感染	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	小鼠足垫模型
4792	2025-01-20	Single-cell RNA sequencing reveals the diversity of the immunological landscape response to genital herpes 2024-Dec, Virologica Sinica IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.virs.2024.10.003 PMID:39426602	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了生殖器疱疹（GH）患者免疫景观的多样性及其对HSV-2感染的反应	首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了GH患者的免疫细胞多样性及其在HSV-2感染和复发中的反应	研究主要依赖于外周血样本，可能无法完全代表局部感染部位的免疫反应	探讨HSV-2感染和复发的机制，特别是免疫细胞在其中的作用	健康个体和复发性GH患者的免疫细胞	生物信息学	生殖器疱疹	单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR），ELISA	NA	RNA序列数据	健康个体和复发性GH患者的外周血样本
4793	2025-01-20	Single-cell RNA-sequencing reveals a profound immune cell response in human cytomegalovirus-infected humanized mice 2024-Oct, Virologica Sinica IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.virs.2024.08.006 PMID:39153545	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人巨细胞病毒（HCMV）感染的人源化小鼠中免疫细胞的深刻反应	利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上研究了HCMV感染的人源化小鼠中PBMCs的基因表达变化	研究依赖于人源化小鼠模型，可能无法完全模拟人类体内的复杂环境	研究HCMV感染与宿主免疫反应之间的相互作用	人源化小鼠中的PBMCs	生物信息学	病毒感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4794	2025-01-20	The bone marrow is the primary site of thrombopoiesis 2024-01-18, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023020895 PMID:37879046	研究论文	本文研究了成年小鼠骨髓、脾脏和肺中巨核细胞的相对丰度及其对血小板生成的贡献	通过多种成像技术和单细胞RNA测序数据分析，揭示了骨髓是血小板生成的主要场所，而非脾脏或肺	研究主要基于小鼠模型，人类数据的直接适用性尚需进一步验证	探讨不同器官中巨核细胞的丰度及其对血小板生成的贡献	成年小鼠的骨髓、脾脏和肺	生物医学	NA	全组织光片成像、定量组织学成像、流式细胞术、活体成像、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	图像、RNA测序数据	成年小鼠的骨髓、脾脏和肺样本
4795	2025-01-19	Targeting MXD1 sensitises pancreatic cancer to trametinib 2025-Jan-16, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2024-333408 PMID:39819860	研究论文	本研究揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）对trametinib耐药的分子机制，并确定了MXD1作为可药物靶点	发现了trametinib耐药PDAC中病毒模拟反应过度激活的癌细胞亚群，并证明MXD1作为组蛋白甲基转移酶的辅助因子，通过增加转座元件（TE）位点的H3K4三甲基化来增强染色质可及性，从而激活病毒模拟反应	研究主要基于患者来源的异种移植模型和原代细胞系，临床验证仍需进一步研究	阐明PDAC对trametinib耐药的机制，并识别与耐药相关的可药物靶点，以提高trametinib耐药PDAC的治疗效果	胰腺导管腺癌（PDAC）	癌症研究	胰腺癌	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、靶向切割和标记测序	患者来源的异种移植模型（PDX）	RNA测序数据、染色质可及性数据	患者来源的异种移植模型和原代细胞系
4796	2025-01-19	Elucidating stearoyl metabolism and NCOA4-mediated ferroptosis in gastric cancer liver metastasis through multi-omics single-cell integrative mendelian analysis: advancing personalized immunotherapy strategies 2025-Jan-15, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01769-z PMID:39812999	研究论文	本研究通过多组学单细胞整合孟德尔分析，探讨了硬脂酰代谢和NCOA4介导的铁死亡在胃癌肝转移中的作用，推进了个性化免疫治疗策略	揭示了硬脂酰代谢在胃癌肝转移中的关键作用，并首次将NCOA4基因与铁死亡机制联系起来，为理解肿瘤微环境异质性提供了新视角	研究主要基于单细胞测序和空间转录组学数据，仍需进一步实验验证其生物学机制	探讨硬脂酰代谢和铁死亡在胃癌肝转移中的作用机制，为开发个性化免疫治疗策略提供依据	胃癌肝转移患者的肿瘤微环境	肿瘤生物学	胃癌	单细胞多组学技术、空间转录组学、孟德尔随机化分析	NA	单细胞测序数据、空间转录组数据	NA
4797	2025-01-19	Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis 2025-Jan, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-024-00582-1 PMID:39715784	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，生成了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱，揭示了细胞类型特异性和动脉粥样硬化特异性表达变化及空间受限的细胞间通讯改变	结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，首次生成了人类动脉粥样硬化斑块的高分辨率图谱，揭示了细胞类型特异性和动脉粥样硬化特异性表达变化及空间受限的细胞间通讯改变	样本量较小，仅包含12个人类标本	研究人类动脉粥样硬化的细胞类型特异性和空间受限的细胞间通讯变化	人类动脉粥样硬化斑块	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	RNA测序数据, 空间转录组数据	12个人类标本
4798	2025-01-19	Single-Cell RNA Sequencing before and after Light Chain Escape Reveals Intrapatient Multiple Myeloma Subpopulations with Divergent Osteolytic Gene Expression 2025-Jan-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0170 PMID:39699274	研究论文	本文使用单细胞RNA测序技术研究了一位具有高风险多发性骨髓瘤并伴有轻链逃逸（LCE）的患者，揭示了LCE与LAMP5过表达之间的新联系及其对骨溶解和预后的影响	通过单细胞RNA测序技术揭示了LCE与LAMP5过表达之间的新联系，并验证了其对骨溶解和预后的影响	研究仅基于一位患者的数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性	研究高风险多发性骨髓瘤患者中LCE的分子机制及其对骨溶解和预后的影响	高风险多发性骨髓瘤患者	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	一位患者
4799	2025-01-19	Multinucleated giant cells are hallmarks of ovarian aging with unique immune and degradation-associated molecular signatures 2024-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.03.626649 PMID:39677686	研究论文	本研究通过先进成像技术和激光捕获显微切割技术，深入分析了多核巨细胞（MNGCs）在卵巢衰老中的存在及其独特的转录组特征	首次定义了卵巢MNGCs在不同年龄和物种中的存在，并揭示了其与降解过程、免疫功能和高代谢活性相关的分子特征	MNGCs的大尺寸限制了其通过单细胞RNA测序等技术进行分离和分析	研究卵巢衰老过程中多核巨细胞的功能和分子特征	小鼠和非人灵长类动物的卵巢	生物医学	老年疾病	激光捕获显微切割技术、先进成像技术	NA	图像、转录组数据	小鼠和非人灵长类动物的卵巢样本
4800	2025-01-19	Over Activation of IL-6/STAT3 Signaling Pathway in Juvenile Dermatomyositis 2024-Oct, Rheumatology and therapy IF:2.9Q2 DOI:10.1007/s40744-024-00699-6 PMID:39073510	研究论文	本研究探讨了IL-6/JAK/STAT3信号通路在青少年皮肌炎（JDM）中的异常激活及其在肌肉损伤中的作用	首次通过单细胞RNA测序和免疫组化技术揭示了JDM患者中IL-6/JAK/STAT3信号通路的异常激活，并发现IL-6通过触发钙超载和活性氧（ROS）产生参与肌肉损伤的发病机制	样本量较小，仅包括72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本	阐明IL-6激活JAK/STAT3信号通路的机制及其在JDM发病中的作用	青少年皮肌炎（JDM）患者	生物医学	皮肌炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）	NA	血清样本、肌肉活检样本	72名新诊断的JDM患者和两名患者的肌肉活检样本