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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-30 |
Pirfenidone regulates obesity-related renal injury through the SIRT3 signaling pathway
2025-Oct-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115709
PMID:41151486
|
研究论文 | 本研究探讨了吡非尼酮通过SIRT3信号通路调控肥胖相关性肾损伤的作用机制 | 首次揭示吡非尼酮通过SIRT3依赖方式改善肥胖相关肾损伤的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 探究吡非尼酮对肥胖相关肾损伤的治疗作用及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠、人近端肾小管上皮细胞(HK-2)和人原代肾近端小管上皮细胞(PTECs) | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序分析、分子对接、免疫共沉淀 | NA | 实验数据 | C57BL/6J小鼠模型和两种人肾小管上皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2025-10-30 |
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Oct-27, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.09.011
PMID:41151577
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研究论文 | 本研究开发了一种人类心脏-巨噬细胞组装体模型,用于模拟免疫-心脏相互作用并实现心律失常疾病建模 | 首次创建了整合自体人多能干细胞来源胚胎单核细胞的心脏类器官,生成生理相关的心脏组织驻留巨噬细胞 | 该模型为体外研究平台,仍需进一步验证其在体内环境中的生理相关性 | 研究免疫-心脏相互作用机制及炎症驱动的心律失常疾病建模 | 人类心脏-巨噬细胞组装体模型 | 发育生物学、心脏疾病模型 | 心律失常、心房颤动 | 单细胞转录组学、活体成像、蛋白质组学 | 心脏-巨噬细胞组装体模型 | 基因表达数据、影像数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2025-10-30 |
3D-generation of high-purity midbrain dopaminergic progenitors and lineage-guided refinement of grafts supports Parkinson's disease cell therapy
2025-Oct-27, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.001
PMID:41151578
|
研究论文 | 开发了一种三维分化方法SphereDiff,用于生成高纯度中脑多巴胺能祖细胞,并通过谱系引导优化提高帕金森病细胞治疗的安全性和有效性 | 开发了SphereDiff三维分化方法生成高纯度mDAPs;使用单细胞空间转录组学揭示移植后细胞分布模式;应用跨移植单细胞分裂条形码技术解析供体细胞克隆谱系命运 | 研究主要基于小鼠PD模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 提高帕金森病细胞治疗中中脑多巴胺能神经元的生产效率和移植安全性 | 人类多能干细胞、中脑多巴胺能祖细胞、帕金森病模型小鼠 | 再生医学 | 帕金森病 | 单细胞空间转录组学, 跨移植单细胞分裂条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 帕金森病模型小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-30 |
Discovery of disease-associated cellular states using ResidPCA in single-cell RNA and ATAC sequencing data
2025-Oct-27, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100538
PMID:41157948
|
研究论文 | 提出一种名为ResidPCA的稳健方法,用于在单细胞测序数据中发现与疾病相关的细胞状态 | ResidPCA方法在检测跨多种细胞类型表达的状态时,比传统PCA准确度高四倍以上,比基于NMF的方法高三倍以上 | NA | 推进对单细胞测序数据中疾病相关细胞异质性的理解 | 小鼠视觉皮层细胞和阿尔茨海默病队列样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | ResidPCA | 单细胞测序数据 | NA | NA | scRNA-seq, snATAC-seq, snRNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2025-10-30 |
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2025-Oct-27, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003859
PMID:41159285
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌发展过程中上皮细胞代谢通路失调和细胞通讯变化 | 首次在单细胞水平构建结直肠癌上皮细胞分化轨迹,揭示脂肪酸和胆汁酸代谢通路失调与乳酰化修饰在癌变过程中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大队列验证发现;机制研究主要基于计算推断,需要实验验证 | 探究结直肠癌发展过程中代谢通路重编程和细胞通讯变化机制 | 正常结肠组织、息肉组织和结直肠癌组织中的上皮细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析,细胞通讯分析,调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 包含正常、息肉和肿瘤结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 466 | 2025-10-30 |
Decidual cell invasion and decidualization at the trophoblast-decidual interaction in the progression of cesarean scar pregnancy
2025-Oct-25, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104747
PMID:41151220
|
研究论文 | 本研究探讨KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠中蜕膜细胞侵袭和蜕膜化过程中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示CSP中蜕膜细胞KISS1表达下调及其通过PI3K/AKT信号通路影响细胞侵袭迁移的机制 | 样本量有限,未涉及其他潜在信号通路的研究 | 阐明KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠进展过程中对蜕膜细胞侵袭过程的作用 | 剖宫产瘢痕妊娠和正常早孕宫内妊娠的蜕膜组织样本 | 单细胞测序分析 | 剖宫产瘢痕妊娠 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, qRTPCR, Western blotting, RNA干扰, RNA-seq, 荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | CSP和正常早孕宫内妊娠的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2025-10-30 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Oct-24, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习,系统识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次整合多组学数据识别FGL1作为AS-CAD的新型生物标志物,并通过单细胞测序解析其细胞来源 | 样本量有限,需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后价值 | AS-CAD患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序,机器学习,ELISA,免疫组化,Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,临床数据 | AS-CAD患者组织样本,独立临床队列,多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 468 | 2025-10-30 |
Interrogation of the cellular hierarchies reveals neoplastic evolution and therapeutic vulnerability in craniopharyngioma
2025-Oct-24, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf249
PMID:41159376
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示颅咽管瘤的细胞层级结构和肿瘤演化过程 | 首次在单细胞和空间水平揭示颅咽管瘤的肿瘤编程和演化,识别出PCP和RCC之间的疾病谱系连续性 | 研究样本数量有限,动物模型结果需要进一步临床验证 | 阐明颅咽管瘤的发病机制和肿瘤演化过程 | 颅咽管瘤(包括ACP、PCP亚型)和Rathke裂囊肿 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,离体垂体培养 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 469 | 2025-10-30 |
Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011768
PMID:41135951
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析,揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 | 首次在单细胞水平系统揭示了CAR-T治疗后肿瘤微环境的动态变化,发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证;机制研究主要在动物模型中进行,人类样本中的直接证据仍需进一步确认 | 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境的变化及其对治疗反应的影响 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞/祖细胞人源化小鼠模型 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | B-ALL患者治疗前后骨髓样本,人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-30 |
TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013025
PMID:41135953
|
研究论文 | 本研究揭示了TRIM28通过调控PARP1稳定性和NAD+代谢重编程促进肾透明细胞癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制驱动免疫逃逸:稳定PARP1并促进其SUMO化,以及通过NAD+耗竭削弱CD8+ T细胞功能 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索肾透明细胞癌中免疫检查点阻断疗法疗效有限的机制 | 肾透明细胞癌细胞模型、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 | 癌症免疫学 | 肾癌 | 单细胞转录组学、RNA-seq、代谢组学、质谱分析、虚拟筛选 | Geneformer | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE159115数据集 |
| 471 | 2025-10-30 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Oct-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
|
研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制的关联机制 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-10-30 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.25.650540
PMID:40654702
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了13线地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子机制 | 发现视锥细胞不仅来源于早期神经源性祖细胞,还来源于晚期神经源性祖细胞,这一过程由转录因子表达的异时性转变驱动 | 研究仅针对13线地松鼠,未在其他物种中验证 | 探索视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 | 13线地松鼠视网膜发育过程 | 发育生物学 | 视力障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 473 | 2025-10-30 |
Enhanced RNA Preservation in Mouse Brain Tissue: A Strategy Combining Cardiac Perfusion with Hypersaline Immersion
2025-Oct-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05379
PMID:41141763
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研究论文 | 开发了一种结合心脏灌注和高渗盐水浸泡的策略,用于增强小鼠脑组织RNA保存效果 | 首次将心脏灌注与高渗盐水浸泡相结合,建立了标准化的RNA保存框架,显著延长了RNA在组织切片中的完整性保持时间 | 仅在小鼠脑组织中验证,未在其他组织类型或物种中测试 | 解决空间转录组学研究中RNA降解问题,建立标准化的RNA保存方法 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,RNA完整性检测 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 474 | 2025-10-30 |
Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications
2025-Oct-21, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110705
PMID:41130333
|
评论 | 提出构建全球眼表生物学图谱的倡议,通过整合多组学技术系统解析眼表组织在健康和疾病状态下的生物学特征 | 首次提出建立全球眼表生物学图谱,采用单细胞和空间组学技术系统解析眼表微环境动态,并制定了临床转化路线图 | NA | 构建全面的眼表生物学图谱,推动精准眼科诊断和治疗 | 眼表组织(角膜、结膜、泪膜装置)及其微环境 | 数字病理 | 眼科疾病 | 单细胞/单核RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-30 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal intratumor heterogeneity and immune evasion in natural killer/T cell lymphoma
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113626
PMID:41142990
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和免疫逃逸机制 | 首次在NKTCL中鉴定出五个具有不同功能通路、分化轨迹和空间分布的恶性元程序亚群,并发现FABP5抑制剂可下调c-Myc抑制肿瘤生长 | NA | 探究自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境相互作用 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-30 |
Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry
2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
PMID:41083996
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研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析,发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例),空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本,包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,RNA测序 | CAF算法,空间分析,Cox回归分析 | 多通道图像数据,单细胞数据,RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例,验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 |
| 477 | 2025-10-30 |
EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes
2025-Oct-10, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
PMID:41076212
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研究论文 | 本研究探索EED226通过靶向关键免疫基因抑制中华半滑舌鳎脾细胞中LPS诱导的免疫反应 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能,发现跨物种保守的EED靶向治疗潜力 | 研究局限于中华半滑舌鳎这一特定鱼种,未验证其他硬骨鱼类的适用性 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫应答中的调控作用 | 中华半滑舌鳎脾细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,转录组分析,定量RT-PCR,系统发育分析 | NA | 基因表达数据,序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-30 |
Linking ion channel gene expression to neuronal firing patterns through a statistical-biophysical model
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101390
PMID:41142910
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研究论文 | 通过统计生物物理模型建立离子通道基因表达与神经元放电模式之间的定量联系 | 开发了基于生物物理模拟和现代机器学习技术的新型统计生物物理模型 | NA | 建立转录组特性与生理特性之间的机制联系 | 神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 形态学重建 | 统计生物物理模型, 机器学习 | 基因表达数据, 电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-30 |
Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
PMID:40220905
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌性免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达,并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要在临床前模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索iCCA免疫抑制机制并开发新的免疫治疗靶点 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-30 |
Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence
2025-Oct, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
PMID:40999941
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群,包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞 | 尚未将机制发现与靶向治疗完全衔接,需要改进动物模型和开展转化研究 | 探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞、成纤维细胞等免疫细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |