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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-05-29 |
Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma
2025-Oct-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf128
PMID:40424600
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研究论文 | 揭示多胺乙酰化在胶质母细胞瘤中介导癌细胞与髓系细胞之间的代谢对话，促进间充质/多代谢表型 | 首次发现SAT1及其产物N1-乙酰亚精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞的代谢活动中起桥接作用，共同促进胶质母细胞瘤的间充质/多代谢状态和治疗抵抗 | 未提及 | 研究多胺代谢重塑如何影响胶质母细胞瘤的恶性细胞内在和微环境依赖的生物学过程，进而影响亚型分类 | 人源和鼠源胶质母细胞瘤肿瘤及细胞系 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 液相色谱-串联质谱法、单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 人源和鼠源胶质母细胞瘤肿瘤样本和细胞系（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2026-05-29 |
Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation
2025-10, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107923
PMID:40848957
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研究论文 | 通过体外和离体模型，研究选择性EPAC1激活剂在血管炎症中增强内皮功能的作用 | 首次证明选择性EPAC1激活剂可通过SOCS3上调抑制JAK/STAT3信号通路，有效改善IL-6介导的内皮功能障碍，并在多种模型中验证其治疗潜力 | 未提及临床验证；主要在动物模型和体外系统中进行，缺乏人体临床试验数据 | 探究EPAC1在调节血管炎症和内皮功能中的作用，评估选择性EPAC1激活剂的治疗潜力 | 健康及动脉粥样硬化小鼠主动脉、动脉粥样硬化人类冠状动脉、主动脉环、三细胞共培养系统（人血管内皮细胞、平滑肌细胞、巨噬细胞） | 心血管生物医学 | 血管炎症、动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（单细胞RNA）、功能性血管反应数据 | 小鼠主动脉（健康与动脉粥样硬化模型）、人类冠状动脉（动脉粥样硬化样本）、主动脉环、三细胞共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2026-05-29 |
Inflammatory macrophages drive smooth muscle dedifferentiation via YAP signaling in murine deep vein thrombosis
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.24.678378
PMID:41040135
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现炎症巨噬细胞通过YAP信号通路驱动小鼠深静脉血栓中平滑肌去分化 | 首次揭示早期深静脉血栓中平滑肌细胞去分化机制，发现炎症巨噬细胞通过抑制YAP信号驱动这一过程，并识别IL-1β为关键配体 | 仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；仅分析了血栓形成后24小时的时间点，缺乏长期动态观察 | 探究深静脉血栓发病中静脉平滑肌细胞的表型变化机制 | C57BL/6小鼠（雄性和雌性），原代小鼠主动脉平滑肌细胞，骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习和单细胞组学 | 深静脉血栓 | 单细胞RNA测序、常规RNA测序、Western印迹、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，每组包含雄性和雌性小鼠，具体样本数未在摘要中明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' v2（推测） |
| 464 | 2026-05-29 |
Size-Modulated Mesoderm-Endoderm Divergence and Myocardial Cavitation in Micropatterned Cardioids
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676874
PMID:41000917
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研究论文 | 利用微图案心脏类器官模型研究人类中胚层-内胚层协同发育及心肌空腔形成 | 首次整合微图案化心脏类器官、CRISPR工程化报告hiPSCs、深层组织成像和单细胞RNA测序，揭示中胚层-内胚层协同发育的谱系分叉和信号互作机制 | 未提及具体局限性 | 探索中胚层-内胚层在心脏发育中的协同作用及调控机制 | 人类诱导多能干细胞来源的微图案化心脏类器官 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、CRISPR基因编辑、深层组织成像 | 类器官模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 465 | 2026-05-29 |
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-09, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2024.12.020
PMID:39725169
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研究论文 | 本研究揭示干扰素ε（IFNε）是9p21.3缺失导致免疫冷肿瘤、免疫检查点治疗抵抗及内源性CXCL9/10诱导障碍的关键分子 | 首次明确IFNε而非IFNα是9p21.3缺失介导免疫逃逸的主要效应分子，并建立其与CD8 T细胞抑制和CXCL9/10趋化因子缺陷的直接因果关系 | 未提及具体限制 | 阐明9p染色体缺失如何通过IFN-I（特别是IFNε）驱动免疫逃逸和免疫检查点治疗抵抗的分子机制 | 人类肿瘤样本、细胞系、小鼠模型（含基因工程缺失模型），涵盖头颈鳞癌、非小细胞肺癌、黑色素瘤、尿路上皮癌和间皮瘤 | 数字病理学 | 肺癌, 黑色素瘤, 头颈癌, 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因编辑 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 36个免疫检查点治疗队列（13份报告）及多种细胞系与小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于小鼠空间单细胞RNA测序的合成chr4qC4 IFN-I缺失模型分析 |
| 466 | 2026-05-29 |
Anti-Peptidylarginine Deiminase 4 Autoantibodies Derived From Patients With Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
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研究论文 | 研究来自类风湿关节炎患者的抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞并加重炎症性关节炎的致病机制 | 首次证明抗PAD4抗体在胶原诱导关节炎模型中通过结合单核细胞触发炎症级联反应，促进免疫细胞募集和T细胞活化，最终加重关节炎严重程度 | 尚未完全阐明抗PAD4抗体在人体内的全部作用机制，且仅在小鼠模型和体外实验中验证 | 探讨抗PAD4抗体在类风湿关节炎发病机制中的作用 | 来自类风湿关节炎患者的抗PAD4单克隆抗体、胶原诱导关节炎小鼠模型、人单核细胞体外培养、人纤维样滑膜细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自类风湿关节炎患者的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 467 | 2026-05-29 |
From molecular chaos to precision medicine in the treatment of cardiac hypertrophy: A rational use of natural products by integrating artificial intelligence and multi-omics data
2025-09, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107898
PMID:40754044
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综述 | 本文综述了通过整合人工智能与多组学数据，利用天然产物治疗心脏肥厚的精准医学方法 | 创新性地结合人工智能、单细胞空间转录组学和机器学习算法，分析天然产物在心脏肥厚治疗中的多靶点药理作用，并首次探讨肠道菌群代谢物如TMAO和短链脂肪酸通过表观遗传调控影响心脏重构 | 仅基于现有文献进行综述，缺乏直接的实验验证和临床数据支持 | 提出从分子紊乱到精准医学的转化策略，利用天然产物结合AI和多组学技术实现心脏肥厚的治疗逆转 | 心脏肥厚的分子机制、天然产物（如人参皂苷Rb1、黄芩苷）、肠道菌群代谢物（如TMAO、短链脂肪酸）、关键药物靶点（SIRT3、TLR4） | 数字病理学, 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学, 多组学（未详细指定） | 机器学习算法（未具体说明模型类型） | 多组学数据（包括转录组、表观组等） | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 468 | 2026-05-29 |
Enhanced Translational Activity Is Linked to Lymphatic Endothelial Cell Activation in Cutaneous Leishmaniasis
2025-08, Lymphatic research and biology
IF:1.6Q4
DOI:10.1089/lrb.2024.0080
PMID:40279249
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、流式细胞术和嘌呤霉素掺入法，表征了皮肤利什曼病小鼠模型中淋巴管内皮细胞的转录和翻译反应，揭示了其抗原呈递和免疫激活特征 | 首次在单细胞水平上揭示皮肤利什曼病中淋巴管内皮细胞的翻译活性增强，并证明其具有抗原摄取和加工能力，凸显其在局部免疫调控中的潜在作用 | 研究基于小鼠模型，可能不完全反映人类疾病；未深入探讨LEC翻译活性增强的具体分子机制及功能后果 | 探究皮肤利什曼病中淋巴管内皮细胞的转录与翻译响应特征，及其在炎症微环境中的免疫功能 | 皮肤利什曼病小鼠模型中的真皮淋巴管内皮细胞 | 单细胞组学 | 皮肤利什曼病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，嘌呤霉素掺入 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠感染组与未感染对照组，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 469 | 2026-05-29 |
Study on the prediction model of liver cancer based on chronic liver disease and the related molecular mechanism
2025 Jul-Dec, Annals of hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.aohep.2024.101572
PMID:39278407
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研究论文 | 基于慢性肝病数据构建肝癌预测模型并探索相关分子机制 | 整合肝炎、肝硬化和肝细胞癌数据集，识别10个与疾病进展相关的基因并建立预后模型，通过单细胞测序揭示MIF信号通路的作用 | 模型验证仅依赖ROC分析，未提及外部独立验证队列 | 开发一种新的预测模型以准确分类肝细胞癌，提高患者生存率 | 肝炎、肝硬化和肝细胞癌患者的数据及单细胞测序样本 | 机器学习教育 | 肝癌 | 单细胞测序, 多变量Cox回归分析, 药物敏感性分析 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2026-05-29 |
Extracellular Origins of Cognition: Lessons from Primate Neocortical ECM
2025-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.13979
PMID:40696865
|
评论 | 评论一篇关于灵长类新皮层细胞外基质在发育过程中的分子组成和空间组织的研究 | 通过多模态方法整合单细胞转录组学、蛋白质组学和免疫组织荧光技术，构建了人类和非人灵长类发育中新皮层的细胞外基质图谱 | 作为评论文章，未提供具体实验数据或验证研究结果 | 强调细胞外基质在早期大脑发育中的作用及其在神经发育障碍疾病中的潜在参与 | 人类和非人灵长类的新皮层细胞外基质 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学，蛋白质组学，免疫组织荧光 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 471 | 2026-05-29 |
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656468
PMID:40502104
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research paper | 提出了MIC-Drop-seq方法，将高通量基因破坏与多重单细胞RNA测序结合，用于斑马鱼胚胎的大规模表型分析 | 通过Multiplexed Intermixed CRISPR Droplets技术同时破坏50个转录调控因子，结合多重scRNAseq实现单细胞水平的大规模遗传筛选，能捕获细胞外效应并发现新功能 | NA | 开发可扩展的单细胞表型分析方法，用于大规模绘制脊椎动物胚胎基因功能图谱 | 斑马鱼胚胎中的50个转录调控因子突变体 | machine learning | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序（scRNAseq）, 液滴微流控 | NA | RNA测序数据 | 1000个斑马鱼胚胎 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 多重单细胞RNA测序与液滴微流控系统结合 |
| 472 | 2026-05-29 |
Artificial variables help to avoid over-clustering in single-cell RNA sequencing
2025-04-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.014
PMID:40081375
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研究论文 | 提出一种名为“recall”的方法，通过人工变量避免单细胞RNA测序数据中的过度聚类问题 | 利用人工变量控制双重使用数据的影响（即“double dipping”），防止过度聚类，可适用于多种聚类算法 | 未明确说明 | 开发一种保护单细胞RNA测序分析免受过度聚类影响的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用模拟和真实数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2026-05-29 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-04, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
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综述 | 挑战迷走神经仅传递饱腹信号的传统观点，强调其在编码膳食信息中更复杂的作用 | 整合单细胞转录组学、神经回路图谱和功能性成像的最新进展，系统揭示迷走神经传入神经元在膳食信息编码中的多样性亚群、多模态感知和下游脑回路，拓展了其超越饱腹感的功能 | 限于综述性质，可能未涵盖最新未发表研究或具体实验验证 | 全面更新迷走神经感觉通路在肠道-大脑沟通中的作用，特别是其作为膳食信息整合器的功能 | 迷走神经传入神经元及其相关神经回路 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、神经回路图谱、功能性成像 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2026-05-29 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Critical Blood Biomarkers and Potential Mechanisms in Epilepsy
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70172
PMID:39753851
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析，识别癫痫的关键血液生物标志物和潜在机制 | 首次通过孟德尔随机化结合单细胞转录组学，系统揭示了癫痫风险相关基因及其对免疫微环境的影响，并建立了抗癫痫药物反应预测模型 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限、动物模型与人类的差异、以及预测模型需进一步临床验证 | 阐明癫痫的遗传因果因素及其与免疫环境的动态关系 | 癫痫患者外周血样本、癫痫小鼠模型的海马组织 | 自然语言处理 | 癫痫 | 孟德尔随机化、单细胞转录组学、CIBERSORT免疫浸润分析、RNA-seq | 预测模型（具体类型未提及） | 基因表达数据、免疫细胞组成数据 | 未明确说明，但涉及eQTLGen和GWAS数据、癫痫患者外周血样本及小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 475 | 2026-05-29 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究了仿刺参围口神经环中神经元的超微结构和转录谱，鉴定出六种神经元细胞类型 | 首次对海参神经元细胞进行单细胞转录组分析，鉴定了六种神经元类型及神经肽前体基因和G蛋白偶联受体的表达模式 | 仅聚焦于围口神经环区域，未涵盖海参其他神经组织；尚未对鉴定出的神经元类型进行功能验证 | 阐明海参神经元细胞的类型、分子特征和进化意义 | 仿刺参（Apostichopus japonicus）围口神经环中的神经元细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2026-05-29 |
Dual spatial host-bacterial gene expression in Mycobacterium abscessus respiratory infections
2024-10-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06929-5
PMID:39384974
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研究论文 | 该文章展示了在福尔马林固定石蜡包埋组织中利用定制细菌探针进行空间转录组学分析，以同时检测宿主和细菌基因表达的方法 | 首次在FFPE组织中成功实现宿主和病原体双空间转录组分析，揭示了宿主-病原体相互作用的时空信息 | 研究基于小鼠模型和特定细菌（脓肿分枝杆菌），可能未涵盖所有感染类型 | 探索使用定制细菌探针在FFPE组织中进行宿主和病原体空间转录组分析的可行性 | 慢性感染脓肿分枝杆菌的小鼠肺组织 | 空间转录组学 | 分枝杆菌感染 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肺组织样本（具体数量未提供） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE空间转录组学平台 |
| 477 | 2026-05-29 |
Imputing spatial transcriptomics through gene network constructed from protein language model
2024-10-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06964-2
PMID:39369061
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研究论文 | 提出stImpute方法，利用蛋白质语言模型ESM-2构建基因网络，基于参考单细胞RNA-seq数据对空间转录组学进行基因表达插补 | 首次将蛋白质语言模型ESM-2用于构建基因-基因关系网络，结合自编码器和图神经网络提升空间转录组学基因插补准确性和细胞聚类能力 | 未明确阐述局限性，但依赖参考scRNA-seq数据质量，且仅适用于有限基因检测的空间转录组学技术 | 开发一种基于基因网络的空间转录组学缺失基因插补方法，提升预测准确性和细胞群体识别能力 | 图像型空间转录组学数据与参考单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序、单细胞RNA测序 | 自编码器、图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2026-05-29 |
Spatial multi-omics in whole skeletal muscle reveals complex tissue architecture
2024-10-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06949-1
PMID:39369093
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研究论文 | 结合RNA断层扫描和质谱成像技术，揭示整个小鼠胫骨前肌的空间转录组、代谢组和脂质组组织，发现肌纤维类型比例的显著区域化分布 | 首次结合两种空间组学技术（RNA断层扫描和质谱成像）在全肌肉水平上解析三维空间组织，发现基因表达沿近端-远端轴的意外强烈区域化及代谢差异 | 仅针对小鼠胫骨前肌进行了分析，尚未验证在其他肌肉或物种中的普遍性 | 阐明整个骨骼肌组织的完整空间结构，揭示肌纤维类型比例、基因表达和代谢的沿轴区域化分布 | 小鼠胫骨前肌、趾长伸肌和比目鱼肌的整个肌肉组织 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 质谱成像 | NA | 图像, 文本 | 24只小鼠的胫骨前肌、趾长伸肌和比目鱼肌样本 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 空间脂质组学 | NA | RNA tomography（RNA断层扫描）和MSI（质谱成像） |
| 479 | 2026-05-29 |
STPDA: Leveraging spatial-temporal patterns for downstream analysis in spatial transcriptomic data
2024-10, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出STPDA框架，利用空间-时间模式分析空间转录组数据，实现基因表达空间动态的高分辨率解析 | 创新性结合ARMA和LSTM模型同时捕捉全局与局部时空动态，将空间-时间模式整合进下游分析流程，实现配体-受体相互作用识别和细胞类型分类等任务性能超越现有方法 | 未提及验证数据集多样性及计算资源需求等局限性 | 开发适用于空间转录组数据下游分析的时空模式计算框架 | 空间转录组数据中的基因表达时空模式及细胞类型、配体-受体相互作用 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | ARMA, LSTM | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 480 | 2026-05-29 |
Single-cell transcriptome sequencing revealed the metabolic changes and microenvironment changes of cardiomyocytes induced by diabetes
2024-10, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序分析糖尿病小鼠心肌细胞的代谢变化和微环境变化 | 通过单细胞转录组测序揭示糖尿病诱导的代谢重组及心肌细胞与心肌成纤维细胞、淋巴内皮细胞等微环境成分间配体-受体相互作用改变 | 仅基于一个公开数据集进行分析，缺乏实验验证；研究对象为小鼠模型，结论向人类转化需进一步验证 | 探究糖尿病对心肌细胞异质性及细胞间通讯特性的影响 | 对照组和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠心脏 | 单细胞转录组学 | 糖尿病性心肌病 | 单细胞RNA测序 | 无明确模型应用 | 基因表达数据 | GEO数据库GSE213337数据集，包含糖尿病和对照小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |