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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-05 |
Predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma based on genes related to polyamine metabolism
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19985
PMID:41018906
|
研究论文 | 基于多胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次基于多胺代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型并构建预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者和HuH-7细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Cox回归, Lasso回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2025-10-05 |
Characterization of cancer-related fibroblasts in bladder cancer and construction of CAFs-based bladder cancer classification: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580986
PMID:41019085
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析表征膀胱癌中癌症相关成纤维细胞并构建基于CAFs的膀胱癌分类 | 首次系统鉴定膀胱癌中10个不同的CAF亚群，并建立基于pCAFs的膀胱癌分子分型系统 | 样本量有限，需要进一步实验验证各亚型的临床适用性 | 探索膀胱癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌组织和其中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2025-10-05 |
PLK2 as a key regulator of glycolysis and immune dysregulation in polycystic ovary syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610713
PMID:41019094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，发现PLK2是多囊卵巢综合征中糖酵解和免疫失调的关键调控因子 | 首次将PLK2确立为PCOS中内皮细胞糖酵解的核心调控基因，并揭示其通过NF-κB和IL-17信号通路促进慢性炎症和卵巢纤维化的机制 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析，需要进一步临床验证 | 阐明多囊卵巢综合征中卵巢基质细胞糖酵解失调的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Seurat, CellChat, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA | 基因表达数据 | 三个独立的批量RNA-seq数据集和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-05 |
A splicing-based multitissue association study of joint transcriptomes identified susceptibility genes for osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590008
PMID:41019096
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研究论文 | 通过跨组织和单组织转录组关联分析结合单细胞测序技术，鉴定骨关节炎易感基因LTBP1及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 首次整合跨组织/单组织TWAS分析与单细胞测序数据，系统揭示LTBP1基因通过TGF-β和Notch信号通路参与骨关节炎发病的新机制 | 未明确说明样本规模及具体测序平台技术细节 | 鉴定骨关节炎的易感基因并阐明其功能机制 | 骨关节炎相关遗传位点及LTBP1基因 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 转录组关联分析(TWAS), 全基因组关联研究(GWAS) | UTMOST, FUSION, MAGMA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性，发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统，其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 466 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要实验验证；样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等)，包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |
| 467 | 2025-10-05 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-Nov, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件的广泛失调，并利用CRISPR干扰实验验证了特定转座元件对炎症基因的调控作用 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统鉴定转座元件表达数量性状位点(teQTL)，并通过CRISPRi实验验证了神经元特异性转座元件调控机制 | 研究主要基于三个脑组织生物样本库，样本来源和数量可能存在限制 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件失调的遗传调控机制 | 人类阿尔茨海默病患者的脑组织样本和iPSC来源的神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序,全基因组测序,CRISPR干扰,xQTL分析 | 数量性状位点分析,共定位分析 | 基因组数据,转录组数据 | 三个大型人类AD脑组织生物样本库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 468 | 2025-10-05 |
Mouse blood cells types and aging prediction using penalized Latent Dirichlet Allocation
2024-Sep-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10763-8
PMID:39294566
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)的统计方法，用于分析小鼠血液单细胞RNA测序数据以预测细胞类型和衰老状态 | 提出了惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)这一新型统计方法，用于单细胞RNA测序数据的降维表示学习 | 仅使用小鼠血液数据进行验证，未在其他组织或物种中进行测试 | 开发计算方法来分析单细胞RNA测序数据，以理解衰老过程中的转录组变化 | 小鼠血液细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA) | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2025-10-05 |
scRNA-seq identifies unique macrophage population in murine model of ozone induced asthma exacerbation
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604740
PMID:39211080
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了臭氧诱导哮喘加重小鼠模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次在臭氧诱导哮喘加重模型中鉴定出独特的肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群，并揭示了其特异性基因表达通路 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 探究臭氧暴露导致哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 尘螨、豚草和臭氧暴露的小鼠肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 暴露于DRA、臭氧或DRA+臭氧的小鼠肺部免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-05 |
Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19
2024-07-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136
PMID:39018367
|
研究论文 | 通过比较临床样本和动物模型的单细胞RNA测序数据，揭示IFN-γ是急性COVID-19后呼吸系统后遗症的驱动因素 | 首次在人类和小鼠模型中同时发现促纤维化单核源性巨噬细胞反应及肺巨噬细胞与呼吸系统常驻T细胞的异常相互作用 | 主要关注呼吸系统后遗症，未涉及PASC其他临床表现 | 探究SARS-CoV-2感染后急性后遗症(PASC)的病因机制 | 人类PASC临床样本和小鼠PASC模型 | 单细胞组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 临床PASC样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 471 | 2025-10-05 |
Reusability report: Leveraging supervised learning to uncover phenotype-relevant biology from single-cell RNA sequencing data
2024-Mar, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-024-00804-y
PMID:41020135
|
研究论文 | 评估PENCIL监督学习框架在单细胞RNA测序数据中识别表型相关细胞的可重复性和可转移性 | 通过基因集变异分析增强PENCIL的细胞亚群识别能力，创建了预测皮肤癌免疫检查点阻断反应的细胞毒性T细胞免疫治疗反应特征 | 对输入扰动敏感，原始版本存在可重复性问题 | 评估和改进监督学习框架在单细胞RNA测序数据中识别表型相关细胞的性能 | 12个单细胞RNA测序数据集，代表四种不同表型 | 机器学习 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序，监督学习，基因集变异分析 | PENCIL框架 | 单细胞RNA测序数据 | 12个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-10-05 |
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-12, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12942
PMID:37812061
|
研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序方法鉴定人脑周细胞特异性标志物 | 首次使用EasySci单细胞转录组测序技术系统鉴定人脑周细胞特异性基因标志物SLC6A12和SLC19A1 | 在其他人体器官（肾、肺、肝、肌肉）中未观察到相同的周细胞染色模式，组织特异性较强 | 鉴定和优化人脑周细胞的通用组织学标志物 | 人和小鼠不同脑区的周细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个人和小鼠脑区样本，以及肾、肺、肝、肌肉等器官探索性样本 | NA | 单细胞RNA-seq | EasySci | 高通量低成本单细胞转录组测序方法 |
| 473 | 2025-10-05 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
|
研究论文 | 本研究使用STARmap PLUS原位测序技术构建了小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 | 开发了STARmap PLUS原位测序方法，首次在三维空间中以单细胞分辨率绘制了全脑分子细胞类型图谱 | 仅检测了1,022个基因，需要通过整合其他数据来推断全转录组表达谱 | 构建小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 | 成年小鼠大脑和脊髓 | 空间转录组学 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | 109万个高质量细胞 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | STARmap PLUS | STARmap PLUS原位测序技术，体素尺寸194×194×345纳米 |
| 474 | 2025-10-05 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞技术和空间转录组学构建了人类肺部空间分辨图谱，揭示了气管粘膜下腺中的免疫细胞生存微环境 | 发现了气管粘膜下腺中IgA浆细胞的生存微环境，并证明腺上皮细胞通过表达CCL28、APRIL和IL-6招募B细胞和IgA浆细胞，促进其局部存活和抗体分泌 | NA | 重新定义肺和气管的组织结构，解析人类肺部的空间组织结构 | 健康人类肺部的五个近端到远端位置 | 空间转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 人类肺部五个解剖位置的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-05 |
Transcription and splicing regulation by NLRC5 shape the interferon response in human pancreatic β cells
2022-09-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5732
PMID:36103539
|
研究论文 | 本研究揭示了NLRC5在人类胰腺β细胞中调控干扰素反应的关键作用，包括HLA I类表达和选择性剪接 | 首次发现NLRC5不仅调控HLA I类表达，还介导IFNα对选择性剪接的影响，这可能是β细胞新抗原产生的机制 | 研究主要使用体外诱导的多能干细胞来源的胰岛样细胞和细胞系，未涉及原代人体组织验证 | 阐明NLRC5在人类胰腺β细胞干扰素反应中的调控机制及其在1型糖尿病自身免疫中的作用 | 人类诱导多能干细胞来源的胰岛样细胞、EndoC-βH1胰岛素生成细胞和人类胰岛细胞 | 分子生物学 | 1型糖尿病 | RNA测序、单细胞RNA测序、靶向基因/蛋白检测 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-05 |
Single Molecule-Based fliFISH Validates Radial and Heterogeneous Gene Expression Patterns in Pancreatic Islet β-Cells
2021-05, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0802
PMID:33685924
|
研究论文 | 本研究使用fliFISH技术验证了小鼠胰岛β细胞中基因表达的径向和异质性模式 | 首次应用单分子水平的fliFISH技术在原位空间背景下量化胰岛β细胞的基因表达异质性 | 研究仅限于小鼠胰岛组织，未涉及其他物种或疾病模型 | 验证胰岛β细胞中基因表达的异质性模式和空间分布特征 | 小鼠胰腺胰岛β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | fliFISH（基于波动定位成像的荧光原位杂交），scRNA-Seq | NA | 图像，基因表达数据 | 小鼠胰腺胰岛切片 | NA | 单分子荧光原位杂交，单细胞RNA测序 | NA | 波动定位成像基荧光原位杂交（fliFISH） |
| 477 | 2025-10-05 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
|
研究论文 | 本研究通过分析胰腺组织中SARS-CoV-2进入因子ACE2的表达模式，探讨COVID-19与糖尿病之间的潜在关联 | 首次系统评估了人类胰腺在整个生命周期中ACE2的表达分布，并结合COVID-19患者胰腺组织验证了SARS-CoV-2的感染特征 | 内分泌细胞中ACE2的mRNA表达罕见，且病毒核衣壳蛋白主要局限于导管，限制了病毒直接感染内分泌细胞的证据 | 探究SARS-CoV-2感染是否通过ACE2直接感染胰腺内分泌细胞导致糖尿病发生 | 正常器官捐献者的胰腺组织和COVID-19患者的胰腺组织 | 数字病理学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 蛋白质印迹法, 免疫定位 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 五个公共单细胞RNA测序数据集和多个人类胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-06 |
Decoding chicken growth regulation through multi-omics insights and emerging genetic tools for growth optimization
2025-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105542
PMID:40652768
|
综述 | 本文综述了鸡生长性状的遗传调控机制，整合多组学方法和新兴基因工具以优化生长性能 | 强调单细胞RNA测序在解析生长相关组织细胞异质性中的应用，结合CRISPR/Cas9基因组编辑技术开辟精准育种新途径 | 现有遗传变异发现对可持续高效家禽生产的应用仍有限制 | 阐明鸡生长性状的遗传调控网络，推动精准育种策略开发 | 鸡的生长性状（体重和生长）及其遗传调控机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因组编辑, 多组学分析（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学） | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 基因组测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-06 |
[Single-cell transcriptomic analysis reveals immune dysregula-tion and macrophage reprogramming in diabetic foot ulcers]
2025-Sep-30, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0464
PMID:41025297
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示糖尿病足溃疡中免疫失调和巨噬细胞重编程机制 | 首次建立糖尿病足溃疡的单细胞图谱，揭示巨噬细胞通过COMPLEMENT和SPP1通路重塑炎症微环境的新机制 | 样本量有限，仅比较了糖尿病足溃疡与非溃疡组织，缺乏时间序列动态分析 | 阐明糖尿病足溃疡中巨噬细胞介导的炎症和组织损伤机制 | 糖尿病足溃疡患者和非溃疡糖尿病足患者的皮肤组织样本 | 单细胞组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 79,272个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2025-10-06 |
Transcriptome Analysis Identified SPP1-Positive Monocytes as a Key in Extracellular Matrix Formation in Thrombi
2025-Sep-30, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044299
PMID:41025474
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研究论文 | 本研究通过转录组分析发现SPP1阳性单核细胞在血栓细胞外基质形成中起关键作用 | 首次识别SPP1高表达单核细胞/巨噬细胞亚群在血栓成熟过程中的核心作用，并揭示其与成纤维细胞的密切通讯 | 样本量较小（3例血栓用于RNA分析），仅针对脑血管血栓进行研究 | 探究血栓成熟的分子机制 | 人类血栓样本（脑血管和肺动脉来源） | 转录组学 | 血栓性疾病 | 单细胞RNA测序, RNA表达分析, 免疫组织化学, 通路富集分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | NA | RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | 3例脑血管血栓用于RNA分析，66例脑栓塞患者血栓用于验证 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |