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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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461 | 2025-10-05 |
Cryopreservation and post-thaw characterization of dissociated human islet cells
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0263005
PMID:35081145
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研究论文 | 本研究优化了分散人胰岛细胞的冷冻保存方法,并验证了冻存后细胞的功能特性 | 开发了迭代分级冷冻方法,首次系统评估了冻存后胰岛细胞的分子和功能表型完整性 | 研究仅针对分散的胰岛细胞,未评估完整胰岛组织的冷冻保存效果 | 优化胰岛细胞冷冻保存技术,为糖尿病研究和治疗提供细胞来源 | 分散的人胰岛细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,膜片钳电生理学 | NA | 基因表达数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
462 | 2025-10-05 |
Daytime SHP2 inhibitor dosing, when immune cell numbers are elevated, shrinks neurofibromas
2025-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503359
PMID:40992926
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研究论文 | 本研究探讨SHP2抑制剂在特定给药时间下对神经纤维瘤体积及免疫微环境的影响 | 发现SHP2抑制剂仅在白昼给药时(髓系细胞浸润较少时段)能有效缩小肿瘤,并揭示其疗效依赖于靶向单核细胞来源的巨噬细胞 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未验证人体适用性 | 探究SHP2抑制剂对神经纤维瘤体积和免疫微环境的调控机制 | 神经纤维瘤小鼠模型及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 神经纤维瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
463 | 2025-10-05 |
Lichenoid graft-versus-host disease shows a high interferon score, with IFNAR1 inhibition preventing skin inflammation
2025-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20760
PMID:40439472
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了苔藓样移植物抗宿主病的干扰素特征,并证明IFNAR1抗体可预防皮肤炎症 | 首次通过单细胞分辨率揭示lGVHD的干扰素特征,并验证IFNAR1阻断的治疗潜力 | 人类样本量较小(n=3),小鼠模型需进一步验证 | 解析苔藓样GVHD的免疫机制并评估I型干扰素通路阻断的治疗效果 | 人类lGVHD皮肤样本和小鼠ccGVHD模型 | 单细胞基因组学 | 移植物抗宿主病 | scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, qPCR, 微阵列 | 小鼠GVHD模型 | 基因表达数据 | 人类样本:3例lGVHD+4例对照(scRNA-Seq),13例lGVHD+10例对照(qPCR);小鼠公开数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
464 | 2025-10-05 |
The bone marrow immune ecosystem shapes daratumumab acquired resistance in plasma cell myeloma
2025-Oct, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02712-5
PMID:40750676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和数字空间分析仪探索多发性骨髓瘤患者对达雷妥尤单抗获得性耐药的骨髓免疫生态系统机制 | 首次揭示骨髓免疫生态系统通过IFN-γ激活MYC通路导致达雷妥尤单抗获得性耐药的新机制 | 样本量有限,主要基于配对样本分析,需要更大规模验证 | 探究多发性骨髓瘤对达雷妥尤单抗获得性耐药的免疫机制 | 多发性骨髓瘤患者治疗前后配对样本 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 数字空间分析 | 单细胞调控网络推断 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对样本分析,4个外部队列验证(GSE24080, GSE136337, GSE57317, coMMpass) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 数字空间分析仪 | NA |
465 | 2025-10-05 |
SPP1 exacerbates ischemic stroke by promoting ferroptosis induced brain injury
2025-Oct-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152627
PMID:40957318
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研究论文 | 本研究揭示SPP1通过PI3K/AKT信号通路加剧铁死亡诱导的脑损伤,从而恶化缺血性卒中 | 首次发现SPP1通过调控PI3K/AKT信号通路促进铁死亡在缺血性卒中中的作用机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在临床患者中验证 | 探究SPP1在缺血性卒中中铁死亡机制中的作用及潜在治疗靶点 | HT22细胞系和小鼠MCAO/R模型 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞测序, Western blot, 蛋白组学分析, 免疫荧光, 电子显微镜 | NA | 蛋白质表达数据, 细胞成像, 分子信号通路数据 | 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
466 | 2025-10-05 |
Computational Analysis of Exosome-Derived Signature in TNBC: Integrating Single-Cell and Bulk Transcriptomics for Prognosis Prediction
2025-Oct, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70368
PMID:40994257
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,开发了三阴性乳腺癌外泌体衍生预后标志物 | 首次将外泌体相关基因与单细胞分析结合,构建了能够预测免疫治疗反应的新型预后标志物 | 需要进一步验证EDPS与外泌体生物学的直接关系 | 探索外泌体相关基因在三阴性乳腺癌预后预测中的作用 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习,单变量Cox回归 | 基因表达数据 | 10个TNBC样本的31,140个细胞,TCGA和METABRIC队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
467 | 2025-10-05 |
How Single-Cell Transcriptomics of Hydractinia Is Informing the Evolution of Cnidarian Sensory Systems
2025-Sep-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf090
PMID:40504553
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术构建水螅虫细胞图谱,研究刺胞动物感觉系统的进化 | 构建了更新的成年水螅虫单细胞转录组图谱,探索细胞类型特异性标记和再生机制 | NA | 研究水螅虫的细胞生物学和感觉系统进化 | 水螅虫(Hydractinia symbiolongicarpus 和 H. echinata)的成年群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑,shRNA敲低,转基因报告系统 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
468 | 2025-10-05 |
Shedding Light on Patterns of Unconventional Expression of Opsin Genes in Hydra vulgaris
2025-Sep-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf100
PMID:40581592
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研究论文 | 本研究通过分析水螅的单细胞RNA测序数据,揭示了视蛋白基因在神经元和非神经元细胞类型中的非常规表达模式 | 首次系统描绘了水螅中视蛋白基因在细胞类型和分化状态间的表达谱,发现非神经元细胞中视蛋白表达的广泛存在 | 基于已发表的测序数据进行分析,缺乏实验验证 | 探究刺胞动物中非神经元细胞视蛋白表达的普遍性 | 淡水水螅(Hydra vulgaris) | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 已发表单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
469 | 2025-10-05 |
Chromosomal instability degrades developmental phenotypes essential for anti-GD2 immunotherapy outcomes in high-risk neuroblastoma
2025-Sep-26, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102375
PMID:41015032
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研究论文 | 本研究通过分析840个神经母细胞瘤样本,揭示了染色体不稳定性特别是11q缺失通过降解发育表型影响高危神经母细胞瘤抗GD2免疫治疗效果的机制 | 首次将胎儿期肾上腺单细胞RNA测序与临床预后关联,发现11q染色体缺失通过降解去甲肾上腺素能和代谢表型影响免疫治疗效果 | 仅分析了19对活检样本进行克隆进化研究,样本量相对有限 | 探索高危神经母细胞瘤抗GD2免疫治疗效果的基因组学相关因素 | 840个高危神经母细胞瘤肿瘤样本和19对活检样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,基因组分析 | NA | 基因组数据,单细胞RNA测序数据 | 840个肿瘤样本,19对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
470 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell transcriptomics and Mendelian randomization identify neutrophil-associated biomarker genes in colorectal cancer
2025-Sep-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03452-9
PMID:40996626
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法识别结直肠癌中中性粒细胞相关的生物标志物基因 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和共定位分析系统鉴定中性粒细胞相关基因在结直肠癌中的因果作用 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 揭示中性粒细胞浸润在结直肠癌中的作用机制并识别关键基因 | 结直肠癌患者的中性粒细胞和基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 免疫组化验证 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自GEO数据库(GSE231559)和BioBank Japan(BBJ-a-107)的多个队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
471 | 2025-10-05 |
Identification of immunosuppressive CD4+ T-cell subtype and construction of prognostic model for hepatocellular carcinoma
2025-Sep-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03556-2
PMID:40996677
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定肝细胞癌中免疫抑制性CD4+ T细胞亚型并构建预后模型 | 首次鉴定SPP1+TNFRSF18+ CD4+ T细胞作为肝细胞癌免疫逃避的关键驱动因素,并构建了基于九基因的预后模型 | 样本量相对较小(16例HCC患者),需要在更大队列中进一步验证 | 阐明CD4+ T细胞在肝细胞癌免疫逃避中的作用机制并开发预后预测工具 | 肝细胞癌患者组织样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 16例HCC患者(GSE149614),TCGA-LIHC队列,GSE109211验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
472 | 2025-10-05 |
Tabersonine inhibits inflammation and apoptosis through the JAK1/STAT3 signaling pathway to alleviate LPS-induced acute lung injury
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17885-3
PMID:40998926
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研究论文 | 本研究探讨了塔博赛宁通过JAK1/STAT3信号通路抑制炎症和细胞凋亡,缓解LPS诱导的急性肺损伤的作用机制 | 首次通过网络药理学预测结合实验验证,发现塔博赛宁通过靶向JAK1/STAT3通路发挥治疗急性肺损伤的作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未进行临床验证 | 探究塔博赛宁治疗急性肺损伤的分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 网络药理学分析、单细胞转录组分析、分子对接、Western blot、流式细胞术、TUNEL染色 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量,使用小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE225664单细胞转录组数据集 |
473 | 2025-10-05 |
Single-Cell transcriptomic profiles of peripheral blood immune cells reveal early monocyte and platelet activation in the transition from high-risk states to clinical sepsis
2025-Sep-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17078-y
PMID:40998960
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示外周血免疫细胞在脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的早期单核细胞和血小板激活特征 | 首次在单细胞水平上揭示了脓毒症高风险阶段向临床脓毒症转变过程中单核细胞和血小板的早期转录组重编程特征,发现了一个核心基因集(S100A8, S100A9, IFITM2, IFITM3)在不同高危人群中持续上调 | 研究样本量相对有限,需要在更大规模的前瞻性队列中验证这些发现 | 阐明从脓毒症高风险状态向临床脓毒症转变过程中的免疫细胞转录组变化特征 | 健康对照者、脓毒症高风险个体、临床脓毒症患者的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、高风险个体和临床脓毒症患者的外周血样本,以及独立队列的极早产脓毒症婴儿和糖尿病老年患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
474 | 2025-10-05 |
Evaluation of cell type annotation reliability using a large language model-based identifier
2025-Sep-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08745-x
PMID:40998963
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研究论文 | 开发了一种基于大语言模型的细胞类型注释可靠性评估工具LICT | 利用多模型集成和“人机对话”方法,提供客观的细胞类型注释可靠性评估框架 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
475 | 2025-10-05 |
MitoDelta: identifying mitochondrial DNA deletions at cell-type resolution from single-cell RNA sequencing data
2025-Sep-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11931-0
PMID:40999372
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研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性线粒体DNA缺失的计算方法 | 首个专门从单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性mtDNA缺失的计算流程,无需额外DNA测序数据 | 依赖单细胞RNA测序数据的质量和覆盖度,可能受转录组噪音影响 | 开发检测细胞类型特异性线粒体DNA缺失的计算方法 | 线粒体DNA缺失变异 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,计算分析 | beta-二项分布模型 | 单细胞RNA测序数据 | 已发表的帕金森病单核RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
476 | 2025-10-05 |
EMB is essential for enteric nervous system development mediated by PI3K signaling
2025-Sep-25, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01538-1
PMID:40999499
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研究论文 | 本研究揭示了EMB通过调控PI3K信号通路在肠道神经系统发育中的关键作用 | 首次发现EMB通过招募PP2A磷酸酶复合物至细胞膜促进PI3K-AKT通路激活,调控肠道神经嵴细胞发育的新机制 | EMB罕见变异与HSCR疾病的因果关系需要进一步验证 | 探究EMB在肠道神经系统发育中的功能机制 | 斑马鱼、小鼠模型及人类HSCR患者队列 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲除、迁移实验、类器官培养 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、表型数据、临床变异数据 | 斑马鱼和小鼠模型,以及HSCR患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
477 | 2025-10-05 |
Tumor-derived CCL5 recruits CCR1+ macrophages to suppress apoptosis and drive proliferation in duodenal adenocarcinoma
2025-Sep-25, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218064
PMID:41015267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示十二指肠腺癌中肿瘤细胞通过分泌CCL5趋化因子招募CCR1+巨噬细胞,抑制细胞凋亡并促进肿瘤增殖的机制 | 首次在十二指肠腺癌中发现肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴与巨噬细胞相互作用,揭示了该信号轴在免疫逃逸和化疗耐药中的关键作用 | 研究样本量相对有限,且主要基于体外器官样模型,需要进一步体内验证 | 阐明十二指肠腺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 | 十二指肠腺癌患者肿瘤组织及匹配的正常组织,患者来源的器官样模型 | 单细胞组学 | 十二指肠腺癌 | 单细胞RNA测序,器官样培养,功能实验,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 原发性十二指肠腺癌肿瘤组织及匹配的癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
478 | 2025-10-05 |
Molecular Insights into the Role of Tumor-specific Endothelial Cells in Metastasis
2025-Sep-25, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104964
PMID:41015325
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综述 | 本文综述肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤转移中的作用机制及靶向治疗策略 | 系统阐述肿瘤特异性内皮细胞区别于正常内皮细胞的独特基因表达特征及其在转移和免疫逃逸中的双重作用 | NA | 探讨肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤进展中的功能及靶向治疗潜力 | 肿瘤特异性内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
479 | 2025-10-05 |
Mechanically activated snai1b coordinates the initiation of myocardial delamination for trabeculation
2025-Sep-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62285-w
PMID:40993149
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼心脏发育过程中机械力激活的snai1b阳性心肌细胞通过启动分层过程参与小梁形成的新机制 | 首次发现snai1b阳性心肌细胞在机械力激活下启动心肌分层,且这些细胞不表现典型的上皮-间质转化特征 | 研究主要基于斑马鱼模型,需要在哺乳动物中进一步验证 | 探究心肌小梁形成过程中机械力激活的snai1b在心肌分层启动中的作用机制 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | CRISPR激活/抑制, 4-D应变分析, 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | 斑马鱼发育模型 | 基因表达数据, 影像数据, 转录组数据 | 4天受精后斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
480 | 2025-10-05 |
Lung NR3C1+ and CXCR6high T cells distinguish immunopathogenesis of human emphysema
2025-Sep-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08698-1
PMID:40993192
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类肺组织,揭示NR3C1+和CXCR6high CD4 T细胞在肺气肿免疫病理机制中的关键作用 | 首次发现NR3C1+ CD4 T细胞在非肺气肿型COPD中富集而在肺气肿型COPD中减少,并鉴定CXCR6效应记忆T细胞与肺功能保留的正相关性 | 研究样本量有限,仅基于两个独立的单细胞RNA测序数据集 | 探究T细胞在吸烟者慢性阻塞性肺疾病肺气肿发病机制中的作用 | 人类肺组织样本,包括肺气肿型COPD、非肺气肿型COPD和对照组 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个独立的人类肺组织单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |