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当前共找到 40705 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-06-17 |
Rexiao Kuining decoction ameliorates ulcerative colitis by restoring immune homeostasis via the protein kinase C alpha-FMS-like tyrosine kinase 3 ligand axis: multi-omics evidence
2026-Jun-08, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121985
PMID:42264446
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研究论文 | 本文通过整合多组学（包括UHPLC-MS、网络药理学、孟德尔随机化、转录组机器学习和单细胞RNA测序）及实验验证，发现热泻困宁汤通过调节PKCα-FLT3L轴恢复免疫稳态，从而改善溃疡性结肠炎 | 首次结合孟德尔随机化、转录组机器学习和单细胞RNA测序等多组学方法系统阐明热泻困宁汤治疗溃疡性结肠炎的分子机制，并发现PKCα-FLT3L轴在免疫稳态恢复中的关键作用 | 未提及明确局限性 | 研究热泻困宁汤对溃疡性结肠炎的治疗效果及其分子机制 | 溃疡性结肠炎患者、DSS诱导的小鼠结肠炎模型和LPS刺激的树突状细胞 | 自然语言处理（指转录组机器学习）、数字病理学（指标签注释） | 溃疡性结肠炎 | UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS、网络药理学、孟德尔随机化、转录组机器学习、单细胞RNA测序、分子对接与动力学模拟 | 机器学习模型（用于基因筛选） | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、质谱数据 | 训练集和验证集（AUC分别为0.97和0.93）涉及患者数据；小鼠和细胞实验样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2026-06-17 |
Single-cell and spatial transcriptomics unveil myeloid-lymphoid cross talk and the dermal immune niche underlying palmoplantar pustulosis
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.028
PMID:41740929
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示掌跖脓疱病中髓系-淋巴系交叉对话及其皮肤免疫微环境 | 首次通过单细胞转录组与空间转录组联合分析，系统描绘PPP进展过程中的免疫动态网络，并鉴定出CCL19+真皮上层淋巴样免疫微环境及CXCL1/6/8-ACKR1信号在诱导中性粒细胞募集中的关键作用 | 样本仅来自足部病变，未涉及手掌部位；功能验证和药物预测尚需进一步实验证实 | 探究掌跖脓疱病的免疫微环境及其发病机制 | 掌跖脓疱病患者的脓疱及非脓疱足部病灶样本 | 数字病理学 | 掌跖脓疱病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 来自PPP患者的脓疱及非脓疱足部病变组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞RNA测序，10x Visium用于高分辨率空间转录组分析 |
| 463 | 2026-06-17 |
Spatially resolved ex vivo drug response profiling in SMARCB1-deficient sinonasal carcinoma
2026-Jun, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00437-1
PMID:42070010
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研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组学和离体患者来源组织切片培养，解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性、微环境组织及治疗脆弱性，并发现mTOR抑制剂Sapanisertib能诱导肿瘤坏死并消耗特定恶性细胞亚群 | 首次为SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌建立了综合性的离体药物反应图谱，结合单核RNA测序、空间转录组学和患者来源组织切片培养，揭示了肿瘤内异质性和微环境组织，并鉴定出对mTOR抑制剂Sapanisertib敏感的恶性细胞亚群 | 研究主要基于一个指标病例，虽然补充了12例回顾性队列，但样本量仍然较小，可能无法完全代表该罕见肿瘤的多样性 | 解析SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的瘤内异质性和微环境组织，并评估其治疗脆弱性 | SMARCB1缺陷型鼻腔鼻窦癌的肿瘤组织和细胞 | 数字病理学 | 鼻腔鼻窦癌 | snRNAseq, 空间转录组学, 离体组织切片培养 | NA | 单核RNA测序数据, 空间转录组学数据, 组织切片培养数据 | 1例指标病例和12例回顾性队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 464 | 2026-06-17 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
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研究论文 | anndataR 提升了单细胞转录组学中 R 和 Python 之间的互操作性 | 提供了一个原生 R 包，允许 R 用户直接读取和写入 H5AD 文件，并轻松转换为 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象，无需依赖 Python 环境 | 仅描述了对兼容性的严格测试，未明确提及潜在的性能瓶颈或功能局限性 | 解决单细胞转录组数据在 R 和 Python 之间互操作性困难的问题 | H5AD 文件格式及 R 语言环境中的数据处理对象 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2026-06-17 |
CeSpGRN: inferring cell-specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag324
PMID:42225598
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研究论文 | 提出了从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络的方法CeSpGRN | 利用核加权高斯图模型实现细胞级别的基因调控网络推断，能有效整合多组学和空间位置信息 | 未明确说明局限性，但可能对数据质量要求高且计算复杂度较大 | 开发可从单细胞RNA-seq、配对scRNA-seq与scATAC-seq或空间转录组数据中推断细胞特异性基因调控网络的方法 | 单细胞多组学和空间转录组数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | 核加权高斯图模型 | 基因表达、染色质可及性和空间位置数据 | 模拟数据集和多个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2026-06-17 |
Endogenously generated Dutch-type Aβ non-fibrillar aggregates dysregulate presynaptic neurotransmission in the absence of detectable inflammation
2026-Jun, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71426
PMID:42261875
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研究论文 | 研究荷兰型Aβ非纤维聚集体在无炎症情况下对突触前神经传递的调控作用 | 首次发现内源性产生的荷兰型Aβ非纤维聚集体在不引发炎症的情况下即可导致突触前神经传递失调，并揭示其与线粒体复合物I活性降低和兴奋性神经元转录组变化相关 | 未明确阐述研究局限性 | 评估荷兰型Aβ非纤维聚集体积累对大脑生理、转录组、超微结构、组织学和代谢变化的影响 | APPE693Q转基因小鼠的大脑 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | APPE693Q转基因小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 467 | 2026-06-17 |
Benchmarking plant single cell RNA-sequencing sample processing strategies
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00800-5
PMID:42106556
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研究论文 | 系统比较单细胞RNA测序样品处理策略，以植物拟南芥为模型，评估细胞富集技术和测序平台 | 首次系统比较传统流式细胞术、图像流式细胞术和磁珠分选等细胞富集技术，以及10X Genomics和BD Rhapsody两个单细胞RNA测序平台在植物单细胞研究中的应用 | 研究仅基于拟南芥根组织，未涵盖其他植物组织或物种，且未评估长期储存等更多实验条件的影响 | 评估和优化植物单细胞RNA测序的样品处理流程，减少细胞富集和测序中的偏差 | 拟南芥根细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 拟南芥根组织样本，具体数量未提及 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 10x Chromium单细胞3'测序和BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 468 | 2026-06-17 |
Generation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hepatocellular Carcinoma Organoids following Drug Treatment
2026-May-26, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70511
PMID:42296231
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研究论文 | 开发了一种结合药物处理的肝细胞癌类器官生成与单细胞转录组分析的标准流程 | 建立了将类器官药物处理与下游单细胞转录组分析相连接的实用实验流程，并提供了提高可重复性和样本质量的关键技术注意事项 | NA | 建立肝细胞癌类器官药物处理前后单细胞转录组分析的工作流程 | 肝细胞癌类器官样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 469 | 2026-06-17 |
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-May-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70452
PMID:42258443
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研究论文 | 提出了一种从荷瘤小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化方案 | 针对肿瘤形成过程中肺组织纤维化和异质性特点，优化了组织灌注、酶消化、机械解离等步骤，实现了>85%的细胞活性率，并有效分离tdTomato标记的肿瘤细胞 | 未提及 | 开发从健康及荷瘤小鼠肺组织中高效制备高活性单细胞悬液的标准化流程 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型中的健康及荷瘤肺组织 | 单细胞转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | Kras; tdTomato报告基因小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 470 | 2026-06-17 |
Siglec-15 binds mucin-domain glycoproteins with extended glycans and marks an osteoclast-like, matrix remodeling myeloid state in human tumors
2026-May-22, Glycobiology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/glycob/cwag035
PMID:42286920
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研究论文 | 本研究揭示了Siglec-15与癌细胞表面表达延伸糖链的黏蛋白结构域糖蛋白结合，并在人类肿瘤中标记一种类破骨细胞、基质重塑的髓系细胞状态 | 首次通过免疫沉淀-质谱法在胰腺癌细胞系中鉴定出多个与Siglec-15结合的黏蛋白结构域糖蛋白，并明确复杂N-糖链和延伸型O-糖链对Siglec-15结合的作用，同时通过单细胞转录组数据关联Siglec-15表达与类破骨细胞及基质重塑髓系程序 | 研究主要在体外细胞系和公开数据集上进行，缺乏体内或临床样本验证，且THP-1共培养模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 阐明Siglec-15识别癌细胞的分子基础，并探讨其表达在肿瘤相关髓系细胞中的转录和功能程序 | 人类胰腺癌细胞系AsPC-1、公开的单细胞RNA测序数据集中的肿瘤相关髓系细胞、THP-1单核细胞共培养模型 | 糖生物学与肿瘤免疫学 | 胰腺癌、多种人类肿瘤 | 免疫沉淀-质谱、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | 单细胞数据集来自公开数据，具体样本量未提及；THP-1共培养模型使用一个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 471 | 2026-06-17 |
Machine learning-based study on Xin-Pi simultaneous treatment formula via drug nanodelivery systems regulating macrophage polarization and TEAD2/PKM2 synergistic repair strategy in myocarditis
2026-May-17, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100433
PMID:42150704
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研究论文 | 利用机器学习与药物纳米递送系统研究心脾同治法通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2协同修复策略治疗心肌炎的分子机制 | 首次系统阐明心脾同治法结合纳米载药系统通过调控巨噬细胞M1/M2极化平衡和TEAD2/PKM2代谢重编程网络修复心肌炎损伤的分子机制，并整合机器学习、单细胞测序、空间转录组学等多维技术 | 研究仅在动物模型中进行，尚需在人类队列和临床试验中验证其临床转化可行性 | 分析心脾同治方纳米载药系统通过调控巨噬细胞极化和TEAD2/PKM2信号通路治疗心肌炎的分子机制 | 心肌炎小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 蛋白质组学, 网络药理学 | 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 图像, 文本 | 心肌炎小鼠模型（具体样本数未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 472 | 2026-06-17 |
Spatiotemporal dynamics of adoptively transferred stem-like CD8+ T cells in the tumor microenvironment following vaccination
2026-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724323
PMID:42182429
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研究论文 | 本研究开发了一种优化过继性T细胞疗法的方法，并利用空间转录组学揭示疫苗接种后干细胞样和效应CD8 T细胞在肿瘤微环境中差异介导肿瘤控制的机制 | 首次结合干细胞样CD8 T细胞过继转移与静脉疫苗接种，利用空间转录组学揭示肿瘤微环境的转录组重塑机制 | NA | 优化过继性T细胞疗法，解析干细胞样CD8 T细胞在肿瘤微环境中的空间动态调控机制 | 肿瘤特异性CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 473 | 2026-06-17 |
Histone H3 lysine 18 lactylation-mediated SULF1 transcription promotes atherosclerosis by regulating endothelial-to-mesenchymal transition
2026-May-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag078
PMID:42126087
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研究论文 | 该论文研究了组蛋白H3赖氨酸18乳酰化介导的SULF1转录通过调控内皮-间充质转化促进动脉粥样硬化的机制 | 揭示了氧化应激下代谢与表观遗传通过H3K18la和HDAC3的精确串扰调控SULF1转录及EndMT的新机制 | 未提及具体限制 | 探讨SULF1在氧化应激诱导的内皮-间充质转化及动脉粥样硬化中的作用机制 | 内皮细胞、动脉粥样硬化斑块、小鼠模型 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉粥样硬化核心样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2026-06-17 |
δ-catenin controls layer-specific transcriptional maturation of astrocytes via Zbtb20
2026-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.12.724361
PMID:42182221
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研究论文 | 该研究鉴定了δ-连环蛋白通过Zbtb20控制星形胶质细胞层特异性转录成熟的机制 | 首次揭示δ-连环蛋白作为黏附连接组分连接细胞间相互作用与转录调控，协调神经细胞类型转录成熟，特别是星形胶质细胞的层特异性身份建立 | 未提及具体局限性 | 研究δ-连环蛋白在哺乳动物皮层回路发育中协调神经细胞类型转录成熟的机制 | δ-连环蛋白、Zbtb20转录因子、星形胶质细胞、皮层回路 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序和空间转录组学平台 |
| 475 | 2026-06-17 |
Integrating single-cell multi-omics and machine learning to reveal triaptosis heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2026-May-07, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00982-3
PMID:42098870
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学和机器学习，揭示透明细胞肾细胞癌中triaptosis异质性，并开发预后基因签名 | 首次在单细胞分辨率下描绘透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性景观，结合空间转录组学和机器学习构建预后模型 | 未提及具体局限性 | 探究透明细胞肾细胞癌中triaptosis的异质性及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本中的单细胞、空间转录组及大块转录组数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序、大块转录组分析 | 机器学习 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、大块转录组数据 | 单细胞、空间转录组和大块转录组样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 476 | 2026-06-17 |
SwiftTCR: efficient computational docking protocol of TCRpMHC-I complexes using restricted rotation matrices
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag306
PMID:42297379
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研究论文 | 开发了一种基于受限旋转矩阵的高效计算对接方案SwiftTCR，用于TCRpMHC-I复合物结构预测 | 利用TCR在pMHC上的一致偏振对接角度，大幅减少快速傅里叶变换旋转集，并开发超快速结构叠加工具GradPose加速聚类，实现比ClusPro服务器快25-40倍的计算速度 | 仅针对TCRpMHC-I类复合物，未涉及II类MHC；基准测试集规模较小（38个复合物） | 开发快速计算对接方法以预测TCR-pMHC复合物结构，支持癌症免疫治疗设计和T细胞识别机制研究 | TCR-pMHC-I类复合物 | 自然语言处理 | 癌症 | 计算对接 | 受限旋转矩阵 | 结构数据 | 38个TCRpMHC-I类复合物 | NA | NA | NA | NA |
| 477 | 2026-06-17 |
Loss of PINK1 impairs mitophagy and accelerates ovarian aging independent of Parkin
2026-05, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示PINK1缺失通过损害线粒体自噬加速卵巢衰老，而Parkin对卵巢生理影响甚微 | 首次发现PINK1独立于Parkin调控卵巢衰老，明确了PINK1缺失导致线粒体自噬障碍和卵巢功能衰退的机制 | 研究基于小鼠模型，尚需在人类卵巢组织中验证PINK1的作用 | 探究PINK1和Parkin在卵巢生理和衰老中的具体作用 | Pink1基因敲除小鼠和Parkin基因敲除小鼠 | 机器学 | 卵巢衰老 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | Pink1敲除小鼠和Parkin敲除小鼠的卵巢组织样本 | NA | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2026-06-17 |
Exploring the causal relationship between plasma proteins and obstructive sleep apnea: a study using genome-wide Mendelian randomization, single-cell RNA sequencing analysis, and network pharmacology
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05087-1
PMID:41711838
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和网络药理学，探索血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化、单细胞转录组测序和网络药理学策略，系统评估血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停的因果关系，并发现62个候选治疗靶点及潜在药物分子 | 未提及具体局限性 | 揭示血浆蛋白与阻塞性睡眠呼吸暂停的因果关系并发现潜在治疗靶点 | 阻塞性睡眠呼吸暂停患者及欧洲人群队列 | 自然语言处理 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 基因组关联研究,单细胞RNA测序,分子对接模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | 血浆蛋白数据来自35559人，OSA相关数据来自芬兰生物样本库的欧洲人群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2026-06-17 |
Environmental PET-microplastic exposure and risk of non-alcoholic fatty liver disease: An integrated computational toxicology and multi-omics study
2026-May, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05115-0
PMID:41731169
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研究论文 | 采用综合计算毒理学与多组学方法，系统阐明PET微塑料暴露与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）之间的分子机制关联 | 首次整合网络毒理学、多组学数据和机器学习框架，系统揭示PET纳米塑料暴露与NAFLD发病机制之间的分子联系，并通过SHAP分析和单细胞转录组学识别关键基因及细胞类型特异性表达模式 | 目前公共数据库中缺乏同时包含微塑料暴露测量和转录组谱的临床队列，研究依赖于计算毒理学框架和生物信息学分析 | 阐明PET纳米塑料暴露与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）之间的分子机制关系 | PET微塑料暴露与NAFLD的分子关联机制 | 机器学习 | 非酒精性脂肪性肝病 | 网络毒理学、多组学分析、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习算法（11种算法） | 多组学数据（转录组、单细胞转录组） | 训练集和独立验证集 | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2026-06-17 |
Guidelines for evaluating endothelial function in vascular tissue
2026-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00656.2025
PMID:41801061
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指南 | 本文提供了评估血管组织中内皮功能的指南，整合传统功能检测与现代分子方法 | 首次结合传统肌电图技术与现代组学方法（如单细胞转录组学、蛋白质组学）制定内皮功能评估的统一指南 | 未提及具体局限性，但可能面临技术整合的复杂性和不同实验室之间的标准化挑战 | 建立评估内皮功能的最佳实践，提高研究的严谨性、可重复性和发现能力 | 内皮细胞和血管组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |