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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-06-25 |
Single-Cell RNA-Seq Combined With Bulk RNA-Seq Revealed the Involvement of Pancreatic Cancer Tissue-Resident Macrophages in Tumour Progression and the Immunotherapy Response
2026-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71212
PMID:42210511
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,揭示胰腺癌组织驻留巨噬细胞在肿瘤进展和免疫治疗反应中的作用 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据整合分析,识别了特定组织驻留巨噬细胞亚群,并建立了TAM评分系统,发现TRM_C4亚群在预测生存和免疫治疗反应中具有高效力 | 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏独立验证队列;具体机制尚未深入探索 | 探究胰腺癌微环境中巨噬细胞异质性及其对肿瘤进展和免疫治疗的影响 | 胰腺癌肿瘤相关巨噬细胞中的组织驻留巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2026-06-25 |
Identification of Polyamine Metabolism-Related Biomarkers in Psoriasis: A Study Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2026-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70289
PMID:42223029
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research paper | 基于转录组学和单细胞测序技术鉴定银屑病中多胺代谢相关生物标志物 | 首次综合运用转录组学与单细胞RNA测序技术,结合多种机器学习算法和诊断列线图,系统鉴定出五个多胺代谢相关基因(PSME2、PSMB5、PSMC4、PSMB10和SMOX)作为银屑病的新型生物标志物,并深入揭示其在树突状细胞分化中的动态表达 | 研究主要基于公开数据集和体外实验验证,缺乏临床样本的进一步验证及多中心研究支持 | 鉴定银屑病中多胺代谢相关基因作为生物标志物并阐明其机制 | 银屑病患者的皮肤组织样本及相关细胞类型 | machine learning | psoriasis | RNA-seq, scRNA-seq | CNN | transcriptomics, single-cell sequencing data | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2026-06-25 |
Exploring the potential targets and mechanisms of artemisinin in the treatment of diabetic kidney disease using network pharmacology and molecular docking
2026-Jun-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01894-0
PMID:42223693
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研究论文 | 利用网络药理学和分子对接技术探索青蒿素治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在靶点与机制 | 首次通过网络药理学、转录组数据、三种机器学习算法及单细胞测序分析,识别出FLT1为青蒿素治疗DKD的关键靶点,并通过体外实验验证了青蒿素通过恢复FLT1表达缓解高糖诱导的肾小球内皮细胞损伤 | 研究仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;FLT1的上下游信号通路机制尚未完全阐明 | 探讨青蒿素对DKD的潜在治疗作用及其分子机制 | 人肾小球内皮细胞(HRGECs)在高糖损伤模型下的反应 | 机器学习, 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 网络药理学, 分子对接, RNA-seq, 单细胞测序, Western blot, MTT, TUNEL, ELISA | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 64个共同靶点;人类肾小球内皮细胞(HRGECs) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2026-06-25 |
The role of stem cells in pituitary tumour formation
2026-Jun-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-26-0171
PMID:42227347
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综述 | 总结干细胞在垂体肿瘤形成中的作用及当前研究证据 | 系统总结垂体干细胞和肿瘤干细胞样群体在垂体肿瘤生物学中的潜在作用,包括肿瘤起始、维持和进展,并提供了已发表的单细胞RNA测序研究的策划概述 | 研究证据主要来自有限的动物模型和体外实验,缺乏大规模临床验证 | 阐明垂体干细胞在垂体肿瘤形成中的作用及转化意义 | 垂体干细胞和肿瘤干细胞样群体 | 机器学学习 | 垂体肿瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 465 | 2026-06-25 |
CCR5+ CD8+ T Cells Are Associated with Poor Response to PD-1 Blockade Therapy
2026-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114963
PMID:42278489
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研究论文 | 分析了非小细胞肺癌和黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据,发现CCR5+ CD8+ T细胞与PD-1阻断疗法的不良反应相关 | 首次系统揭示了CCR5+ CD8+ T细胞的转录组特征与PD-1/PD-L1阻断疗法低应答率之间的关联,并识别了CCL3/4-CCR5轴作为候选通路 | 基于公开数据集的分析,需要进一步的空间、功能和实验验证来确认CCL3/4-CCR5轴的作用机制 | 探究趋化因子受体表达与PD-1阻断疗法反应性之间的关联 | 非小细胞肺癌和黑色素瘤患者队列中的CD8+ T细胞,以及肝细胞癌和结直肠癌数据集的探索性分析 | 机器学习 | 非小细胞肺癌, 黑色素瘤, 肝细胞癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开数据集中非小细胞肺癌和黑色素瘤患者样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 466 | 2026-06-25 |
MAL2 drives hepatocellular carcinoma progression by recruiting regulatory T cells via CCL22 and inducing the immunosuppressive microenvironment
2026-May-29, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2026095
PMID:42212623
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研究论文 | 本研究揭示MAL2通过CCL22介导调节性T细胞招募驱动肝细胞癌进展并诱导免疫抑制微环境 | 首次阐明MAL2在肝细胞癌中通过CCL22趋化因子招募Treg细胞并诱导免疫抑制微环境的机制 | 未提及具体局限性 | 探究MAL2在肝细胞癌中的功能作用及其机制 | 肝细胞癌细胞系Hep-3B、HCC-LM3和H22 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、ELISA、免疫荧光染色 | NA | 文本、图像 | 公开单细胞RNA测序数据及细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 467 | 2026-06-25 |
A STAT1/ETC/GBP1 axis represents a potential therapeutic target for noncommunicable granulomatous skin disease
2026-May-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea0773
PMID:42213834
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析及体外实验,发现IFN-γ激活的巨噬细胞中氧化磷酸化(OXPHOS)是主要代谢通路,并鉴定出IFN-γ诱导的响应网络,其中鸟苷酸结合蛋白1(GBP1)是控制巨噬细胞活化的核心,提出STAT1/ETC/GBP1轴作为非传染性肉芽肿性皮肤病的潜在治疗靶点 | 首次揭示在环状肉芽肿和皮肤结节病巨噬细胞中,氧化磷酸化(OXPHOS)是IFN-γ激活的主要代谢通路,并确定GBP1为控制巨噬细胞活化的中心节点,同时提出二甲双胍作为电子传递链复合体I抑制剂可抑制肉芽肿形成,为药物再利用提供新策略 | 研究主要基于体外细胞实验和已有单细胞RNA测序数据的再分析,缺乏体内动物模型验证和临床患者样本的进一步确认 | 阐明环状肉芽肿和皮肤结节病巨噬细胞的分子机制,探究IFN-γ激活的代谢通路及潜在治疗靶点 | 环状肉芽肿和皮肤结节病患者的巨噬细胞及体外肉芽肿模型 | 数字病理学 | 非传染性肉芽肿性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA(未明确具体样本数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 468 | 2026-06-25 |
Vasoactive intestinal peptide associated 8-gene signature with prognostic and immune associations in melanoma
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048961
PMID:42216340
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研究论文 | 本研究构建了血管活性肠肽相关的8基因特征,用于黑色素瘤的风险分层,并分析了其与肿瘤免疫微环境及药物敏感性的关联 | 首次构建VIP相关基因特征(VIPsig)用于黑色素瘤预后评估,并探讨其与免疫浸润和药物敏感性的潜在联系 | 药物敏感性分析仅基于计算模拟,缺乏实验验证;特征用于治疗反应预测的实用性尚未验证,需在前瞻性队列中进一步研究 | 构建VIP相关基因特征以实现黑色素瘤风险分层,探索其与免疫微环境和药物敏感性的关联 | 黑色素瘤患者(TCGA-SKCM队列477例,GSE65904验证队列209例) | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 逐步Cox回归、梯度提升机、列线图 | 基因表达数据、临床信息、突变数据 | 训练集477例黑色素瘤患者,验证集209例黑色素瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2026-06-25 |
THE molecular mechanisms underlying synovial fibroblast differentiation in knee osteoarthritis revealed by single-cell transcriptome sequencing
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047870
PMID:42216392
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示膝骨关节炎滑膜成纤维细胞分化的分子机制 | 首次利用单细胞转录组测序技术系统解析膝骨关节炎滑膜成纤维细胞的分化轨迹和关键标志基因 | 样本量较小仅3个KOA样本,缺乏功能验证实验 | 阐明膝骨关节炎滑膜成纤维细胞分化的分子机制,为临床靶向治疗提供分子层面的理论支持 | 膝骨关节炎滑膜成纤维细胞 | 数字化病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 3个膝骨关节炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2026-06-25 |
Association of DNA damage repair related genes with prostate cancer: A multi-omics Mendelian Randomization analysis
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049185
PMID:42216412
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research paper | 采用孟德尔随机化方法探索DNA损伤修复相关基因甲基化、表达和蛋白丰度与前列腺癌风险的因果关系 | 首次通过多组学孟德尔随机化方法整合分析DNA损伤修复相关基因的遗传变异与前列腺癌的因果关系 | 依赖欧洲人群的数据集,结果在其他种族中的普适性需进一步验证 | 探究DNA损伤修复相关基因与前列腺癌之间的遗传因果关系 | DNA损伤修复相关基因RPA2和POLI与前列腺癌风险 | machine learning | prostate cancer | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, methylation sequencing | Mendelian Randomization | omics data | 多欧洲队列定量性状位点数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2026-06-25 |
The role of the sex determination cascade in the development of caste polyphenisms
2026-May-29, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2026.101551
PMID:42217621
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综述 | 综述性决定级联在蜜蜂和蚂蚁等社会性昆虫的等级多态性发展中的作用 | 强调性决定通路与胰岛素和保幼激素信号等保守发育通路的整合,以及选择性剪接和时空基因表达在调控塑性表型中的关键作用 | 研究偏向蜜蜂和雌性,缺乏对无刺蜂、社会寄生蜂和雄性等代表性不足群体的比较进化发育框架,知识空白显著 | 理解性决定级联如何调控等级分化,以及发育可塑性如何驱动与社会复杂性相关的等级特异性特征的进化 | 蚂蚁和蜜蜂,特别是corbiculate蜜蜂 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 长读长转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 472 | 2026-06-25 |
Spatial transcriptomics redraws the olfactory map
2026-May-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.043
PMID:42208495
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评论 | 通过空间转录组学技术推翻嗅觉受体组织的长期区域模型,揭示了受体沿连续梯度分布的可重复位置 | 利用基于图像的空间转录组学方法证明嗅觉受体组织并非遵循传统区域模型,而是沿连续梯度分布,将受体选择与轴突靶向通过共享分子密码耦合 | 评论文章未提及具体限制,但可能涉及技术的空间分辨率局限或样本覆盖范围有限 | 重新定义嗅觉受体组织的空间分布模式 | 嗅觉受体及其在嗅上皮中的组织分布 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像数据 | NA | NA | 基于图像的空间转录组学 | NA | NA |
| 473 | 2026-06-25 |
Clonal reshaping and clinical outcomes after rechallenge in ICI-associated myocarditis: integrated single-cell and TCR repertoire analysis
2026-May-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014290
PMID:42208979
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和T细胞受体分析,研究免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者在再次挑战后的克隆重塑与临床结局 | 首次结合单细胞转录组和TCR库分析,揭示病毒特异性记忆T细胞通过抗原特异性生态位占据调节再挑战后免疫相关不良事件风险的潜在机制 | 样本量有限(单细胞队列仅3例患者),研究结论需在更大队列中验证 | 探讨免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者再挑战免疫治疗的可行性、安全性及预测因子 | 23例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者,其中3例进行单细胞分析 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序、T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 23例临床样本(其中3例外周血单核细胞用于单细胞分析) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 474 | 2026-06-25 |
FAP-CD40 and PD1-IL2v combination therapy reprograms immunologically cold tumors through de novo intratumoral T cell-dendritic cell clusters
2026-May-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014620
PMID:42208978
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研究论文 | 该研究提出FAP-CD40与PD1-IL2v联合疗法,通过诱导肿瘤内T细胞-树突状细胞簇的形成,将免疫学冷肿瘤重新编程为热肿瘤 | 首次发现FAP-CD40和PD1-IL2v联合疗法能诱导肿瘤内形成T细胞-树突状细胞簇(TDC),这种结构对肿瘤消退至关重要,且独立于淋巴结引物作用 | 研究主要在KPC小鼠模型中进行,人类胰腺导管腺癌的异质性和微环境差异可能影响疗效的转化 | 探索FAP-CD40与PD1-IL2v联合疗法在免疫学冷肿瘤(如胰腺癌)中的治疗潜力和机制 | 胰腺导管腺癌小鼠模型(KPC肿瘤)中的免疫细胞亚群和肿瘤微环境 | 机器学习 | 胰腺癌 | 多重共聚焦成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠KPC肿瘤样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序;共聚焦成像系统用于多重成像 |
| 475 | 2026-06-25 |
ATF4 promotes immune evasion in oral squamous cell carcinoma by suppressing autophagic PD-L1 degradation
2026-May-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015038
PMID:42208982
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研究论文 | ATF4通过抑制自噬介导的PD-L1降解促进口腔鳞状细胞癌免疫逃逸 | 首次揭示内质网应激效应因子ATF4通过ROS-AKT-mTOR通路抑制自噬,从而稳定PD-L1蛋白,促进免疫逃逸的机制 | 未提及具体局限性 | 探究肿瘤内在应激反应通路如何调控PD-L1稳定性以促进免疫逃逸 | 口腔鳞状细胞癌患者标本、同源小鼠模型及CD8+ T细胞 | 机器学习 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人OSCC标本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2026-06-25 |
CCL19+ fibroblasts define a proliferative niche in chronic lymphocytic leukemia
2026-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.15.623868
PMID:42244527
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了CCL19+成纤维细胞在慢性淋巴细胞白血病增殖中心中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序管道深入表征反应性和CLL淋巴结,发现CCL19+成纤维细胞形成特异性的增殖微环境,并识别出多个关键的配体-受体相互作用 | 未明确说明 | 深入表征慢性淋巴细胞白血病淋巴结的细胞组成和微环境特征,揭示增殖中心的功能机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者的淋巴结和反应性淋巴结 | 自然语言处理 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序管道 |
| 477 | 2026-06-25 |
A direct SCN-to-DMH output pathway organizes circadian behavioral timing
2026-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.21.726959
PMID:42239300
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研究论文 | 本研究结合多种技术手段,鉴定并验证了从视交叉上核(SCN)到背内侧下丘脑(DMH)的直接输出通路在组织昼夜行为节律中的关键作用 | 首次通过联合神经元消融、局部分子时钟破坏、逆行追踪、单细胞RNA测序和交叉光遗传学技术,明确鉴定出SCN中一群分子特性独特的神经元直接投射至DMH,并证明该通路足以驱动昼夜运动节律的组织 | 未能阐明DMH下游如何进一步将信号传递给控制实际行为输出的运动系统,且SCN-DMH通路在调节非运动行为(如进食、睡眠)中的具体作用尚待探索 | 解析SCN如何将通过时间维持信号传递至下游脑区以组织昼夜行为节律 | 小鼠的视交叉上核(SCN)和背内侧下丘脑(DMH) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2026-06-25 |
Transient cell states encode positional information to direct asymmetric growth
2026-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.21.726925
PMID:42239415
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研究论文 | 利用空间单细胞转录组学和多组学揭示顶部钩中瞬时细胞状态编码位置信息并指导不对称生长 | 发现了顶部钩中先前未被识别的瞬时细胞状态群体,并确定GATA2作为通过赤霉素信号促进细胞伸长的中心调节因子 | NA | 研究组织如何从时空限制信号中生成不对称生长的机制 | 植物顶部钩及其中细胞状态 | 机器学习 | NA | 空间单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 479 | 2026-06-25 |
Single-Cell and Integrative Analyses Uncover Therapeutic Potential of RFX1-Mediated Cuproptosis in PitNETs
2026-May-12, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN49669
PMID:42216643
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research paper | 利用单细胞和整合分析揭示RFX1介导的铜死亡在垂体神经内分泌肿瘤中的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序和机器学习整合分析,发现RFX1作为关键调控因子可抑制肿瘤生长并增强细胞对铜死亡的敏感性,为PitNETs提供了新的治疗靶点 | 尚未明确指出该研究的局限性 | 探究铜死亡在PitNETs中的作用机制及潜在治疗价值 | 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)细胞 | machine learning | 垂体神经内分泌肿瘤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 随机森林 | 随机森林 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2026-06-25 |
scMVAF: a multi-view adaptive fusion clustering approach for single-cell RNA-sequencing data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf169
PMID:42218719
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研究论文 | 提出了一种针对单细胞RNA测序数据的多视图自适应融合聚类方法scMVAF,通过整合多个细胞视图的特征信息以学习更具判别性的嵌入表示,从而提升聚类性能 | 首次在多视图框架中结合基于去噪零膨胀负二项模型的自编码器与多视图融合模块,自动从不同细胞视图中学习统一特征空间,并通过伪标签迭代优化嵌入表示 | 未明确说明数据集规模限制或对高噪声数据的鲁棒性边界,且方法依赖于下采样特征生成视图,可能丢失部分全局信息 | 解决单细胞RNA-seq数据高维稀疏、含零计数误差导致的聚类难题,通过多视图信息融合提升细胞亚群识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器(基于去噪零膨胀负二项模型) | 基因表达数据 | 16个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |