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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-29 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2025-Oct-27, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析识别出糖尿病多发性神经病变的潜在药物靶点 | 首次将TNFRSF14确定为糖尿病多发性神经病变的潜在治疗靶点,并通过单细胞测序揭示其致病机制 | NA | 识别糖尿病多发性神经病变的新药靶点以提高治疗效果 | 糖尿病多发性神经病变患者及相关蛋白质 | 生物医学 | 糖尿病多发性神经病变 | 血浆蛋白质组学, 单细胞测序, 遗传分析 | NA | 蛋白质组数据, 遗传数据, 临床数据 | 大型前瞻性队列 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 462 | 2025-10-29 |
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2
2025-Oct-27, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
PMID:41145665
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研究论文 | 开发了CytoTRACE 2深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜能 | 提出了可解释的深度学习框架,在多种平台和组织中优于先前方法,能够详细绘制单细胞分化图谱 | NA | 预测细胞的绝对发育潜能,即细胞分化为其他细胞类型的能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2025-10-29 |
CSF1R and macrophage infiltration: Integrated magnetic resonance imaging radiomics and deep learning-driven models for the preoperative assessment of glioma
2025-Oct-27, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003827
PMID:41146428
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研究论文 | 本研究开发了基于磁共振影像组学和深度学习的CSF1R预测模型,用于术前评估胶质瘤 | 首次整合传统影像组学特征和深度学习特征构建CSF1R预测模型,并系统验证其与巨噬细胞浸润的关联 | 样本量相对有限,特别是单细胞测序样本较少(n=2),需要更大规模验证 | 开发非侵入性术前预测胶质瘤CSF1R水平的影像学方法 | 胶质瘤患者 | 医学影像分析 | 胶质瘤 | 磁共振成像、影像组学、深度学习、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 支持向量机、随机森林、朴素贝叶斯等12种机器学习分类器 | 磁共振图像、基因表达数据、免疫组化数据、单细胞测序数据 | 477例患者(训练集64例,内部测试38例,外部验证101例,生存分析255例,免疫组化16例,单细胞测序2例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-29 |
In vitro models of cancer-associated fibroblast heterogeneity uncover subtype-specific effects of CRISPR perturbations
2025-Oct-27, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70153
PMID:41146557
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研究论文 | 开发了能够可靠代表肿瘤中观察到的癌症相关成纤维细胞表型的共培养模型,并利用单细胞转录组学分析CAF亚型异质性 | 建立了能够模拟肿瘤微环境中CAF表型的可转化共培养模型系统,并首次系统评估了CRISPR扰动对不同CAF亚型的特异性影响 | 研究主要基于胰腺癌患者的CAF细胞系,模型系统的可转化性仍需进一步验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚型异质性及其对CRISPR扰动的特异性响应 | 胰腺癌患者来源的原代CAF和永生化肿瘤细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑 | 共培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | 胰腺癌患者来源的CAF细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2025-10-29 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Oct-25, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf248
PMID:41137658
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研究论文 | 开发了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于研究胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调节 | 首次将人血浆样培养基与稳定同位素示踪技术结合,在体外模型中保留了肿瘤微环境的完整性 | 体外模型仍无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫系统的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 癌症代谢研究 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪, 空间转录组学 | 体外培养模型 | 代谢组数据, 转录组数据 | 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-29 |
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Oct-25, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyaf362
PMID:41138165
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研究论文 | 评估ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤中的临床活性和转化研究 | 首次在临床研究中验证IDH1抑制剂联合PD-1抗体在mIDH1实体瘤中的免疫调节作用 | 样本量较小(n=15),临床获益有限 | 评估ivosidenib联合nivolumab在mIDH1晚期实体瘤中的初步疗效和安全性 | 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 药效学、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 临床数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 15例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 467 | 2025-10-29 |
Deciphering lactate/lactylation networks in AML: integrated scRNA-seq and transcriptomics reveal functions and prognostic model
2025-Oct-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14938-8
PMID:41139200
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组学数据,揭示乳酸/乳酸化网络在急性髓系白血病中的功能并构建预后模型 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统研究乳酸代谢和组蛋白乳酸化在AML中的预后价值,并构建了基于机器学习的7基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能实验验证机制 | 探索乳酸/乳酸化相关基因在急性髓系白血病中的预后价值和分子机制 | 急性髓系白血病患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 10种机器学习算法构建的预后模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2025-10-29 |
The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease
2025-Oct-25, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103973
PMID:41145025
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞在严重牙周病中的调控机制,重点关注NF-κB信号通路的作用 | 发现NF-κB信号通路在牙周病中性粒细胞异常功能中的关键调控作用,并证实其抑制剂可降低炎症因子表达 | NA | 探索严重牙周病中中性粒细胞的调控机制 | 牙周病中的中性粒细胞 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA转录组分析, 实时PCR, 免疫共染色 | hdWGCNA, pySCENIC, ClusterProfiler | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2025-10-29 |
Mapping Satellite Glial Cell Heterogeneity Reveals Distinct Spatial Organization and Implies Functional Diversity in the Dorsal Root Ganglion
2025-Oct-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511569
PMID:41134052
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性,并揭示了四种不同亚型的空间分布和功能多样性 | 首次在背根神经节中原位表征卫星胶质细胞异质性,识别并验证了四种功能不同的SGC亚型及其空间分布 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索背根神经节中卫星胶质细胞的异质性及其功能多样性 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,原位杂交,先进成像技术 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 470 | 2025-10-29 |
ARHGAP11A, a member of Rho GTPase activating protein family, as a prognostic biomarker linked to DNA damage response across pan-cancer
2025-Oct-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15106-8
PMID:41136949
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,发现ARHGAP11A作为RhoGAP家族成员在泛癌中过表达,与DNA损伤反应和免疫调节相关,是潜在的预后标志物 | 首次在泛癌水平系统分析RhoGAP家族基因,鉴定ARHGAP11A为最显著过表达成员,并揭示其与DNA损伤反应和免疫调节的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 | 探究RhoGAP家族基因在癌症中的作用,特别关注ARHGAP11A的生物学功能和临床意义 | 33种癌症类型的10,000多个样本,包括肿瘤组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序,Western blotting,集落形成实验 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,临床数据 | 超过10,000个样本,涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 471 | 2025-10-29 |
Whole-genome sequencing reveals individual and cohort level insights into chromosome 9p syndromes
2025-Oct-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01563-0
PMID:41137173
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析100名9号染色体综合征患者,揭示了个体和队列水平的基因组特征 | 首个大规模9号染色体综合征全基因组测序研究,开发了DiamondsDenovo计算工具和机器学习预测模型 | 样本量相对有限,仅针对9号染色体特定区域 | 深入解析9号染色体缺失和重复综合征的基因组结构特征 | 100名来自9号染色体综合征家庭的个体 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组序列数据 | 100名个体 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 472 | 2025-10-29 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
PMID:41125888
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育转变及与宿主细胞的相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术,系统解析疟原虫-按蚊相互作用网络,发现疟原虫偏好与中肠祖细胞互作的关键现象 | 部分发育阶段的生物学过程仍难以完全解析,需进一步验证 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育转变机制及宿主-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫与按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊子细胞,包含野外来源寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2025-10-29 |
Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging
2025-Oct-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
PMID:41125832
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序构建结肠衰老的细胞和空间图谱 | 开发了cSplotch计算框架,利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息,学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型,人类结肠衰老的适用性需要进一步验证 | 研究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织, 约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 474 | 2025-10-29 |
Multiomics data reveal microglia's promotion for choroidal neovascularization in endothelial cells
2025-Oct-22, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110701
PMID:41130334
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了小胶质细胞通过CSRP2基因促进脉络膜新生血管形成的机制 | 首次发现CSRP2在小胶质细胞和内皮细胞中显著上调,并证实其通过VEGF和TGF-β信号通路介导细胞间通讯 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现仍需进一步实验验证 | 阐明脉络膜新生血管形成的细胞类型和分子机制,探索潜在治疗靶点 | 年龄相关性黄斑变性患者的视网膜组织、RPE/脉络膜复合体和血液样本 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,免疫浸润分析,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 湿性AMD患者和健康对照的组织和血液样本(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-29 |
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2025-Oct-22, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
PMID:41132132
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的独特基因特征及其与疾病活动的相关性 | 首次在肉芽肿性肌炎中鉴定出包含1293个上调基因和256个下调基因的特定基因特征,并发现CHIT1是与疾病严重程度最显著相关的上调基因 | 样本量相对有限(38例GM患者),需要更大规模的研究验证结果 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本(包括GM患者、其他肌病患者和健康对照) | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA序列数据,空间转录组数据,图像数据 | 722例肌肉活检(含38例GM患者) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-29 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue
2025-Oct-21, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70278
PMID:41116748
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定老年小鼠白色脂肪组织中具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累 | 首次发现生理性衰老(而非高脂饮食诱导的肥胖)与特定表型的Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞在脂肪组织中的积累相关,并揭示其表达颗粒酶M的细胞毒性和促炎特性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;样本规模相对有限 | 比较生理性衰老和高脂饮食诱导的肥胖对脂肪组织免疫细胞组成的差异影响 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 年轻正常饮食小鼠、年轻高脂饮食小鼠和老年正常饮食小鼠的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-10-29 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Oct-16, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
PMID:41106220
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞癌中的表达模式,发现INF2和DSTN等15个关键基因的表达与患者生存和免疫细胞浸润相关 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序, 实时PCR, 单细胞RNA测序, 功能富集分析, 生存分析, 免疫细胞浸润分析 | 接收者操作特征分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2025-10-29 |
Integrating multi-modal omics to identify therapeutic atherosclerosis pathways for coronary heart disease
2025-Oct-15, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105966
PMID:41101252
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研究论文 | 通过整合尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织和单细胞表达数据,识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路 | 首次将多组学数据(尿液代谢产物、血浆蛋白、斑块组织和单细胞测序)整合应用于冠状动脉心脏病治疗靶点发现 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制结果的普适性 | 识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路和治疗靶点 | 尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织、单细胞表达数据 | 计算医学 | 冠状动脉心脏病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞表达数据 | 181,522例冠状动脉心脏病病例,954种尿液代谢产物,1,562种独特蛋白 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-29 |
Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons
2025-Oct-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69061
PMID:41144432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞分选技术揭示了神经元膜蛋白酶体在特定感觉神经元亚型中的表达及其在痛觉调节中的关键作用 | 首次在特定外周体感神经元亚群中发现并表征了神经元膜蛋白酶体(NMP),证明其选择性抑制可降低机械和疼痛敏感性而不引起神经病变 | 研究主要基于小鼠模型,在体实验仅限于爪部皮肤,人类相关性尚需进一步验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在体感神经元中的细胞亚型特异性表达及其在感觉信号传导中的功能 | 小鼠体感神经元,特别是MrgprA3和Cysltr2神经元亚群 | 神经科学 | 疼痛疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,抗体标记 | NA | 单细胞转录组数据,细胞分选数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-29 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623125
PMID:39605504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育阶段转换和寄生虫-蚊子相互作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序分析疟原虫和蚊子细胞在不同发育阶段和代谢条件下的相互作用,发现SIP2转录因子对子孢子感染人类肝细胞的关键作用 | 研究中涉及的部分生物学过程机制仍需进一步验证 | 研究疟原虫在按蚊体内的发育转换过程和寄生虫-宿主相互作用机制 | 疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 共享条形码分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 多个发育阶段的寄生虫和蚊子细胞,包括野外来源的寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |