单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27667 篇文献,本页显示第 4741 - 4760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
4741 2025-01-30
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析,揭示了人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子卵巢在进化过程中的保守性和差异性 首次通过单细胞转录组和染色质可及性联合分析,揭示了卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化,并发现了跨物种的共同调控架构 研究主要依赖于非人类模型生物,可能无法完全反映人类卵巢的复杂性 研究卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化,以理解人类卵巢生理和疾病 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq) NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞样本
4742 2025-01-30
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
研究论文 本文通过比较分析单细胞RNA测序数据,揭示了人类iPSC-NK细胞分化和NK细胞发育过程中的关键转录因子调控网络 通过单细胞RNA测序技术,识别了iPSC-NK细胞分化过程中缺乏的关键因子,并验证了STAT5A-iPSCs新细胞系的抗肿瘤功能 研究中未明确提及样本的具体数量,可能影响结果的普遍性 旨在深入理解iPSC-NK细胞的分化过程,以优化其生产和工程化 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 未明确说明
4743 2025-01-30
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
综述 本文综述了单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新突破,并描述了整合这些单细胞测序数据的生物信息学策略及其在肿瘤研究中的应用 整合单细胞转录组和染色质可及性测序数据,以更深入地理解肿瘤发生和进展 讨论了该领域面临的挑战和预期发展,但未具体说明当前方法的局限性 总结单细胞测序方法的最新进展及其在肿瘤研究中的应用 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 生物信息学 肿瘤 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 NA 单细胞测序数据 NA
4744 2025-01-30
Generation of renal tubular organoids from adult SOX9+ kidney progenitor cells
2023-Dec, Life medicine
研究论文 本文研究了从成年SOX9+肾脏祖细胞生成肾小管类器官的能力 首次研究了SOX9阳性肾脏祖细胞自主生成肾脏类器官的能力,并发现其具有更强的肾小管分化潜力 SOX9肾脏祖细胞未能分化为肾小球细胞 研究SOX9阳性肾脏祖细胞的分化潜力及其在生成肾小管类器官中的应用 小鼠和人类的SOX9肾脏祖细胞 生物医学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠和人类的SOX9肾脏祖细胞
4745 2025-01-30
Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids
2023-Apr, Life medicine
研究论文 本文通过构建胆固醇暴露模型,利用人类多能干细胞衍生的脑类器官,揭示了母体高胆固醇暴露可能导致后代神经发育障碍的机制 首次使用人类多能干细胞衍生的脑类器官构建胆固醇暴露模型,揭示了高胆固醇对神经祖细胞增殖的抑制作用及其与自闭症谱系障碍(ASD)的潜在关联 研究主要基于体外模型,未涉及动物或人体实验,可能无法完全反映体内复杂环境 探讨母体高胆固醇暴露对后代神经发育的影响及其机制 人类多能干细胞衍生的脑类器官 神经发育生物学 自闭症谱系障碍(ASD) 单细胞测序 脑类器官模型 基因表达数据 NA
4746 2025-01-30
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
研究论文 本文通过两步诱导协议从人类孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡,以研究基因组印记在胚胎发育中的作用 首次从孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡,为研究基因组印记提供了新模型 由于发育缺陷和伦理限制,对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及父母起源偏差对人类发育和病理机制的影响 孤雌生殖干细胞(hPg-ESCs)及其衍生的扩展多能干细胞(hPg-EPSCs) 生物医学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA
4747 2025-01-30
Decoding liver fibrogenesis with single-cell technologies
2022-Dec, Life medicine
review 本文综述了单细胞RNA测序技术如何改变我们对肝纤维化调控机制的理解 利用单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化过程中疾病相关细胞亚群、分子事件和细胞间相互作用 需要进一步努力以全面理解这些变化对肝纤维化的功能贡献,并将新知识转化为有效的治疗方法 探讨单细胞RNA测序技术在肝纤维化研究中的应用 肝细胞、肝窦内皮细胞、肌成纤维细胞和巨噬细胞 生物信息学 肝病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA
4748 2024-12-09
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-Feb-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用 首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用,并提出了潜在的治疗策略 NA 探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制 肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞 NA 辐射诱导的肺损伤 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术 NA 细胞和组织微环境数据 NA
4749 2025-01-29
Improving Spatial Transcriptomics with Membrane-Based Boundary Definition and Enhanced Single-Cell Resolution
2025-Jan-28, Small methods IF:10.7Q1
研究论文 本文介绍了一种新的空间转录组学方法,通过使用基因编码的荧光蛋白标记细胞膜,精确索引切片上的测序点和细胞内的转录本 提出了一种基于细胞膜标记的新方法,相比基于细胞核的方法,显著提高了基因捕获数量,并实现了更一致的单细胞RNA测序数据表达谱 未提及具体的技术限制或挑战 改进空间转录组学技术,提高细胞边界定义的准确性和单细胞分辨率 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道 空间转录组学 NA 基因编码的荧光蛋白标记 NA 空间转录组数据 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道样本
4750 2025-01-29
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Jan-28, Small methods IF:10.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4751 2024-12-24
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究了视网膜波对视网膜神经节细胞类型转录组变化的影响 首次通过单细胞RNA测序揭示了视网膜波对不同类型视网膜神经节细胞基因表达的微弱影响 研究仅限于小鼠模型,且样本量较小 探讨视网膜波对视网膜神经节细胞基因表达的影响 视网膜神经节细胞的转录组变化 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 野生型小鼠和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞
4752 2025-01-29
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了造血衰老的三个表型特征的原因,特别是炎症如何促进这些衰老表型 提出了一个实验模型(IkappaBminus)来解析NFkappaB在造血衰老表型中的作用,并发现HSC自主的NFkappaB活动损害其功能,而骨髓环境中的炎症驱动髓系偏倚 研究主要基于实验模型,可能无法完全反映人类造血衰老的复杂性 解析造血衰老的三个表型特征的独立调控机制 造血干细胞(HSC)及其在衰老过程中的功能变化 生物医学 衰老相关疾病 scRNA-seq IkappaBminus模型 基因表达数据 小鼠和人类的HSC数据集
4753 2025-01-28
COSIME: Cooperative multi-view integration and Scalable and Interpretable Model Explainer
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了COSIME,一种用于多组学数据集成和可解释性模型解释的新方法 COSIME通过可学习的最优传输(LOT)的反向传播和蒙特卡洛采样,实现了多视图数据的集成和特征关系的解释 NA 解决多组学数据集成和特征关系解释的瓶颈问题 单细胞转录组学、单细胞空间转录组学、表观基因组学和代谢组学数据 机器学习 阿尔茨海默病 可学习的最优传输(LOT)、蒙特卡洛采样 深度神经网络 多组学数据 模拟数据和真实世界数据集
4754 2025-01-28
Inhibition of Glutamine Metabolism Suppresses Tumor Progression through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了抑制谷氨酰胺代谢通过重塑巨噬细胞免疫微环境来抑制肿瘤进展的机制 使用免疫活性小鼠模型和单细胞RNA测序技术,开发了一种仅在癌组织中生物激活的GLNi前药JHU083,揭示了其对肿瘤微环境中不同巨噬细胞亚型的影响 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 探索谷氨酰胺代谢抑制剂在癌症治疗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 免疫活性小鼠模型中的妇科癌症 癌症研究 妇科癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 免疫活性小鼠模型 RNA测序数据 免疫活性小鼠模型中的肿瘤样本
4755 2024-12-18
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2024-Dec-16, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本文研究了内源性逆转录元件(EREs)在早期类风湿性关节炎(eRA)中的表达及其与IFN-α产生和抗CCP自身抗体生成的关系 首次在eRA中研究了EREs的表达,揭示了EREs与IFN-I产生和抗CCP自身抗体的潜在因果关系 研究样本量较小,且仅限于早期类风湿性关节炎和早期银屑病关节炎患者 探讨EREs在早期类风湿性关节炎中的表达及其与IFN-α和抗CCP自身抗体的关系 早期类风湿性关节炎患者的全血和滑膜组织,以及早期银屑病关节炎患者的循环淋巴细胞亚群 NA 类风湿性关节炎 RT-PCR, Nanostring, 流式细胞术, 单细胞测序 NA 基因表达数据 22例eRA滑膜组织样本,56例全血样本,以及eRA和ePsA患者的循环淋巴细胞亚群
4756 2024-12-11
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓(PVTT)的免疫微环境特征 首次在单细胞分辨率下揭示了PVTT中免疫细胞的组成和功能,特别是C5aR+ TAMs在免疫抑制环境中的作用 研究主要集中在PVTT的免疫微环境,未涉及其他类型的肿瘤血栓 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 肝细胞癌中的门静脉肿瘤血栓(PVTT) 数字病理学 肝癌 时间飞行质谱(CyTOF),单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫荧光染色 NA 单细胞数据 使用了PVTT细胞系CSQT2和单核细胞系THP-1进行实验
4757 2024-12-12
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
研究论文 本研究提出了一种基于13种基本分类方法和灵活神经树(FNT)的集成方法,以提高基因调控网络(GRN)的识别准确性 开发了一种基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优的FNT模型,并证明了所提出的集成方法在多个数据集上优于多种现有算法 NA 提高基因调控网络的识别准确性 基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 灵活神经树(FNT) 基因数据 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集
4758 2024-10-26
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics IF:2.9Q3
研究论文 研究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 首次在脊椎动物中比较了约400个CXCR6直系同源基因,发现DRF基序在不同物种中的替代和CXCR6基因在某些鸟类和爬行动物中的反复丢失 研究主要集中在脊椎动物,未涵盖所有物种,且对基因丢失的具体机制和免疫影响的深入研究有限 探讨CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 CXCL16-CXCR6轴在不同脊椎动物中的基因变异和进化 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因序列 约400个CXCR6直系同源基因,涵盖多种脊椎动物
4759 2024-11-17
scDOT: optimal transport for mapping senescent cells in spatial transcriptomics
2024-Nov-08, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文开发了scDOT,结合空间转录组学和单细胞RNA测序,以提高重建单细胞分辨率空间图和识别衰老细胞的能力 scDOT通过整合最优传输和表达解卷积,学习细胞和spots之间的非线性耦合,推断细胞位置 NA 提高空间转录组学数据分辨率,识别衰老细胞及其空间组织 衰老细胞及其在空间转录组学数据中的组织 空间转录组学 NA 最优传输 NA 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 NA
4760 2024-10-28
Metabolic Reprogramming Induced by Aging Modifies the Tumor Microenvironment
2024-10-17, Cells IF:5.1Q2
研究论文 研究了衰老引起的代谢重编程如何影响肿瘤微环境(TME)以促进肿瘤发生 利用MMPC方法分析了衰老相关癌症类型的代谢可塑性事件,揭示了衰老相关代谢重编程对肿瘤微环境的影响 NA 探讨衰老与代谢重编程之间的相互作用如何影响肿瘤微环境 衰老相关癌症类型的代谢可塑性事件 生物信息学 癌症 RNA测序 MMPC(Modeling Metabolic Plasticity by Pathway Pairwise Comparison) RNA-seq数据 17种衰老相关癌症类型的批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据
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