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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4741 - 4760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4741 | 2025-10-06 |
ShinySC: an R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2025-Jul-01, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2025.100885
PMID:40609640
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研究论文 | 开发了一个基于R/Shiny的桌面应用程序，用于简化单细胞RNA测序数据分析 | 整合了多种自动细胞类型注释方法（基于参考、基于标记和基于GPT），支持多种数据格式和并行比较功能 | 在标准64GB内存台式机上最多支持20万个细胞的分析，分析时长依赖具体任务和注释方法 | 为无编程经验的临床医生和研究人员提供易用的单细胞RNA测序分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 最多支持20万个细胞的数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 支持10x Genomics、BD Rhapsody、Seurat、Scanpy和CellView等多种数据格式 |
| 4742 | 2025-10-06 |
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70346
PMID:40613570
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研究论文 | 通过多组学分析揭示棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态变化及其治疗潜力 | 首次整合多组学数据识别SLE中棕榈酰化相关基因，并通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示免疫细胞动态及因果关系 | 需要进一步研究验证发现并探索临床意义 | 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,加权基因共表达网络分析,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | GSE61635数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4743 | 2025-10-06 |
Chromatin accessibility module identified by single-cell sequencing underlies the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i6.107329
PMID:40606924
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研究论文 | 通过单细胞测序识别染色质可及性模块，揭示其在肝细胞癌诊断和预后中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据解析HCC中多层染色质调控网络，发现DGAT1作为染色质可及性核心调控基因 | 样本来源有限，功能验证主要基于体外实验，需要更多临床样本验证 | 解析多层染色质调控如何维持致癌转录和肿瘤-基质相互作用 | 肝细胞癌样本 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | ArchR, 共可及性网络分析 | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | 多个队列（TCGA、肝癌研究所、GSE25907） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4744 | 2025-10-06 |
Elevated Stanniocalcin-1 Expression in Uveal Melanoma Predicts Poor Patient Prognosis
2025-Jun-26, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20526
PMID:40571316
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研究论文 | 本研究探讨了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的表达及其与患者预后的关系 | 首次揭示了STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后价值及其在肿瘤微环境中的细胞来源 | 样本量较小（阶段IV仅4例），需要进一步实验验证机制 | 评估STC-1在葡萄膜黑色素瘤中的预后意义和生物学作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者和肿瘤组织 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 阶段III 36例，阶段IV 4例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4745 | 2025-10-06 |
IL-1β signaling modulates T follicular helper and regulatory cells in human lymphoid tissues
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188724
PMID:40392614
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β信号通过调节人类淋巴组织中滤泡辅助T细胞和滤泡调节性T细胞的平衡影响自身免疫反应 | 首次在人类淋巴组织中证实IL-1β信号通过IL-1R1/IL-1R2受体比例调控Tfh/Tfr细胞分化和功能，发现具有Treg和GC-Tfh特征的独特活化Tfr亚群 | 研究主要基于体外实验和表型分析，需要进一步体内功能验证 | 阐明IL-1β信号在人类滤泡T细胞稳态调控中的作用机制 | 人类次级淋巴器官（扁桃体、脾脏和肠系膜淋巴结）中的Tfh和Tfr细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术、单细胞转录组学、体外培养 | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 人类淋巴组织样本和自身免疫患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4746 | 2025-10-06 |
Type 2 diabetes alters quiescent pancreatic stellate cells to tumor-prone state
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187424
PMID:40548381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病如何改变静息胰腺星状细胞的亚群分布，促进胰腺导管腺癌发展 | 首次在单细胞水平鉴定出静息胰腺星状细胞中具有肿瘤免疫和血管生成促进功能的新亚群tapPafs，并发现2型糖尿病从癌前阶段就改变了这些亚群的比例 | 研究样本量相对较小，主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究2型糖尿病对静息胰腺星状细胞亚群的影响及其在胰腺癌发生中的作用 | 小鼠胰腺星状细胞和人类2型糖尿病患者的胰腺组织 | 单细胞生物学 | 胰腺癌、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和db/db糖尿病小鼠的胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4747 | 2025-10-06 |
Multi-omics Analysis Reveals Molecular Subtype of Mitochondrial Oxidative Stress and Prognostic Model Development in Sepsis
2025-Jun-20, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL38957
PMID:40613299
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研究论文 | 通过多组学分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征并构建预后风险模型 | 首次结合WGCNA和差异表达分析识别脓毒症中线粒体氧化应激相关基因特征，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证RNASE2的关键作用 | 数据来源于公共数据库，样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索脓毒症中线粒体氧化应激的分子亚型并开发预后模型 | 脓毒症患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, LASSO分析, Cox回归分析, ESTIMATE, ssGSEA | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库三个数据集(GSE54514, GSE65682, GSE95233)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4748 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals abnormal angiogenesis and placentation by loss of imprinted glutaminyl-peptide cyclotransferase
2025-Jun-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400099
PMID:40571662
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示印迹基因谷氨酰肽环转移酶缺失导致胎盘血管生成异常 | 首次发现谷氨酰肽环转移酶作为新型抗血管生成因子调控小鼠胎盘发育 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究印迹基因在胎盘血管生成和胚胎发育中的调控机制 | 谷氨酰肽环转移酶基因敲除小鼠的胎盘和胚胎组织 | 单细胞组学 | 胎盘发育异常 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 32,309个细胞（来自Qpct+/-和Qpct+/+小鼠胎盘） | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 4749 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6797967/v1
PMID:40585209
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示早期妊娠胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞之间的差异 | 首次系统比较了不同孕周、不同解剖位置（基底板和绒毛膜板）的细胞滋养层细胞，并确定了滋养层干细胞的细胞起源 | 研究样本仅来自妊娠早期胎盘，未涵盖更晚期的妊娠阶段 | 探究早期妊娠胎盘细胞滋养层细胞的转录多样性与滋养层干细胞的细胞起源 | 人类早期妊娠胎盘组织（6-14周）和滋养层干细胞系 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 早期（6-8周）和晚期（12-14周）妊娠胎盘组织，3个滋养层干细胞系，6个不同滋养层干细胞系的流式验证 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | 单细胞RNA测序技术 |
| 4750 | 2025-10-06 |
Safety and feasibility of 4-1BB co-stimulated CD19-specific CAR-NK cell therapy in refractory/relapsed large B cell lymphoma: a phase 1 trial
2025-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00940-3
PMID:40251398
|
研究论文 | 本研究评估了4-1BB共刺激的CD19特异性CAR-NK细胞疗法在难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者中的安全性和可行性 | 首次使用狒狒包膜假型慢病毒载体转导脐带血来源的NK细胞生成CD19-BBz CAR-NK细胞，并进行临床阶段试验 | 样本量较小（仅8名患者），为早期阶段临床试验 | 评估CAR-NK细胞疗法在B细胞淋巴瘤患者中的安全性和治疗效果 | 难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者 | 癌症免疫治疗 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，慢病毒转导 | 临床实验 | 临床数据，基因表达数据 | 8名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4751 | 2025-10-06 |
Tumor-associated macrophage-based predictive and prognostic model for hepatocellular carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325120
PMID:40601653
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的肝细胞癌预测和预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和批量测序数据，系统研究肿瘤相关巨噬细胞特征在肝细胞癌中的预后价值 | 需要在大规模前瞻性研究中进一步验证，并探索肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌进展中的功能机制 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌预后中的作用，并开发有效的预后分层模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量测序，生物信息学分析 | Cox回归，逻辑回归 | 基因表达数据 | 多个肝细胞癌队列 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 4752 | 2025-10-06 |
Identification of three T cell-related genes as diagnostic and prognostic biomarkers for triple-negative breast cancer and exploration of potential mechanisms
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1584334
PMID:40606662
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA和GEO数据库数据，识别出三个T细胞相关基因作为三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 首次将T细胞相关基因与三阴性乳腺癌诊断预后相结合，并构建了高精度的逻辑回归诊断模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别三阴性乳腺癌的诊断和预后生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 逻辑回归 | 转录组数据,临床数据 | TCGA-BRCA数据集和GEO数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4753 | 2025-10-06 |
Comprehensive bioinformatics analysis of the common mechanism of atherosclerosis and atrial fibrillation: emphasizing mitochondrial metabolic disorder and immune inflammation
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1595048
PMID:40607061
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同机制，重点关注线粒体代谢紊乱和免疫炎症 | 首次建立MRPS23作为连接线粒体功能障碍和免疫失调的新型生物标志物，提出'线粒体-免疫轴'心血管共病新范式 | 需要在临床前模型和临床队列中进一步验证以转化为诊断或治疗应用 | 揭示动脉粥样硬化和心房颤动的共同分子通路，识别诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化和心房颤动患者的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序，机器学习算法 | LASSO，SVM，随机森林 | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 多个独立数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 4754 | 2025-10-06 |
Interferon Regulatory Factor 4 Recruits Immature B Cells to Signal Tertiary Lymphoid Structure Immaturity and Progression of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.113737
PMID:40607252
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和临床数据构建了透明细胞肾细胞癌的三级淋巴结构相关预后风险评分，并揭示了干扰素调节因子4在促进TLS不成熟和免疫功能障碍中的机制作用 | 首次构建了ccRCC中TLS相关的预后风险评分，并发现IRF4通过招募不成熟B细胞阻碍TLS成熟的新机制 | 研究主要基于回顾性数据，需要进一步的功能验证实验确认IRF4的具体作用机制 | 探究三级淋巴结构在透明细胞肾细胞癌中的预后意义和调控机制 | 928名透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,多重免疫荧光分析 | 机器学习算法 | 转录组数据,临床数据,图像数据 | 928名ccRCC患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4755 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics analysis of IFNγ-induced macrophages and atherosclerotic plaques reveals macrophage-dependent STAT1-driven transcription in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590953
PMID:40607379
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示巨噬细胞中STAT1驱动的转录调控在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次发现STAT1与PU.1共结合通过表观遗传修饰调控巨噬细胞特异性IFNγ激活的转录反应，并鉴定出新的巨噬细胞依赖性基因特征 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要进一步临床验证 | 探究巨噬细胞STAT1介导的信号通路在动脉粥样硬化进展中的作用 | IFNγ诱导的巨噬细胞、人类和小鼠动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq, scRNA-seq, 多组学整合分析 | 统计分析、通路分析 | 基因组学、表观基因组学、转录组学数据 | 人类颈动脉和冠状动脉粥样硬化病变样本、LDLr-/-和ApoE-/-高脂饮食小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质可及性测序, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 4756 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of T cell-associated markers in Ewing sarcoma reveals prognostic signatures and immune dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586544
PMID:40607387
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后价值及免疫动态特征 | 首次系统鉴定CLEC11A、BDP1和ID3作为尤文肉瘤T细胞相关预后标志物，并构建了具有高预测准确性的预后模型 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索尤文肉瘤肿瘤微环境中T细胞相关标志物的预后价值及免疫调控机制 | 尤文肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 批量RNA测序, CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4757 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of peripheral blood and pleural effusion reveals functional diversity of γδ T cells in tuberculosis infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605827
PMID:40607390
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析结核病患者外周血和胸腔积液中γδ T细胞的功能多样性 | 首次在结核病患者中系统鉴定出7个γδ T细胞亚群，并发现效应性γδ2细胞在PBMC中占比最高(36.1%)，组织驻留γδ2细胞在PFMC中占比最高(70.5%) | NA | 探索γδ T细胞在结核病免疫应答中的具体作用和亚群分化机制 | 结核病患者的外周血单个核细胞(PBMC)和结核性胸腔积液(TPE) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4758 | 2025-10-06 |
Decoding neuroinflammation in Alzheimer's disease: a multi-omics and AI-driven perspective for precision medicine
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616899
PMID:40607399
|
综述 | 本文探讨了利用多组学和人工智能方法解析阿尔茨海默病神经炎症机制的前景 | 整合单细胞RNA测序与AI分析及多组学平台，突破传统组织分析信号平均化的限制 | NA | 解码阿尔茨海默病复杂的免疫炎症网络，实现疾病亚型精准分类和早期诊断 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | AI驱动分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4759 | 2025-10-06 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究通过综合分析基质金属蛋白酶在前列腺癌中的作用，发现MMP11是关键预后标志物并通过重塑肿瘤微环境促进癌症进展 | 首次系统评估24种MMP在前列腺癌中的表达特征和预后价值，并证实MMP11通过调控肿瘤微环境促进前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证MMP11的具体作用机制 | 探索基质金属蛋白酶在前列腺癌中的全面作用及其临床意义 | 前列腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,细胞功能实验 | COX回归分析 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 4760 | 2025-10-06 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证系统研究核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究NUP153在多种癌症中的表达模式、突变特征、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制并探索其临床适用性 | 探索核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 人类多种癌症类型，重点关注胃癌 | 生物信息学 | 多种癌症（胆管癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌、胃癌等） | 多组学分析、免疫组织化学、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx等公共数据库的多种癌症样本，以及胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |