单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 41092 篇文献,本页显示第 4741 - 4760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4741 2026-03-13
Molecular subtypes of vascular endothelial cell differentiation in keloid by single-cell sequencing
2026-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4742 2026-05-06
Induction alectinib or crizotinib for stage III NSCLC harboring ALK fusion: A study with 4-year follow-up
2026-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 评估阿来替尼或克唑替尼诱导治疗ALK融合阳性III期非小细胞肺癌的短期和长期疗效,并伴有4年随访数据 首次系统性评估ALK-TKI诱导治疗在局部晚期NSCLC中的疗效,结合纵向单细胞RNA测序分析肿瘤微环境变化 样本量较小(40例),且为回顾性研究,可能存在选择偏倚 验证ALK靶向诱导治疗在III期肺癌中的疗效和安全性 ALK融合阳性的IIIA-IIIB期非小细胞肺癌患者 医学影像分析 肺癌 ALK-TKI诱导治疗、单细胞RNA测序 NA 临床数据、纵向单细胞RNA测序数据 40例III期NSCLC患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
4743 2026-05-06
Patient-derived surgical samples reveal the cellular and molecular signatures of glioblastoma infiltration in distinct radiological zones
2026-May-05, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
研究论文 研究揭示胶质母细胞瘤在不同放射学区域浸润的细胞和分子特征 首次结合MRI分区与多区域活检,系统描述GBM周边区域的细胞景观与临床关联 基于MRI的nCE区域分类低估了水肿区域内的肿瘤浸润 定义GBM外周区域的细胞景观及其临床意义 45例胶质母细胞瘤患者的161份活检样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 免疫组化、单细胞RNA测序转录组分析 NA 图像、转录本数据 45例患者,161份活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4744 2026-05-06
Constitutive interferon epsilon expression shapes antiviral epithelial states in the female reproductive tract and intestine
2026-May-05, mBio IF:5.1Q1
研究论文 研究干扰素ε在雌性生殖道和肠道中组成型表达对抗病毒上皮状态的调控作用 首次揭示IFNε在雌性生殖道外(尤其是肠道)的功能,证明其作为组成型、空间限制性干扰素协调黏膜抗病毒防御的独特机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅限于原代细胞,缺乏体内功能验证;肠道中IFNε的具体调控机制尚未完全阐明 探究干扰素ε在不同黏膜表面(雌性生殖道和肠道)的细胞来源、表达规律及抗病毒功能 小鼠和人类原代雌性生殖道细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠(包括不同肠段和发情周期样本)及人类原代细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
4745 2026-05-06
Advances in sex-specific single-cell transcriptomic profiling in Parkinson's disease
2026-May-05, Journal of Parkinson's disease
综述 综述单细胞转录组学在帕金森病研究中的应用进展,重点关注性别特异性分子改变 系统总结了单细胞RNA测序技术揭示帕金森病中细胞异质性和性别特异性分子变化的创新发现 主要基于现有文献总结,未涵盖所有潜在性别差异研究,且技术方法仍在快速发展中 探讨单细胞转录组学如何深化对帕金森病病理机制的理解,并强调性别意识研究设计的重要性 帕金森病相关细胞类型,包括多巴胺能神经元、小胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4746 2026-05-06
Syrah: a pipeline to maximize spatial transcriptomics data output
2026-May-04, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 Syrah是一个用于最大化空间转录组学数据输出的分析流程,通过识别和纠正Slide-seqV2和Curio Seeker数据集中的条形码错误来显著提高可用读数 提出基于生化模型和条形码序列数据的错误校正方法,无需额外数据集或复杂计算,相比传统精确匹配方法可多恢复35%的读数 未提及 开发一种能够最大化空间转录组学数据输出的分析流程 Slide-seqV2和Curio Seeker空间转录组数据集 生物信息学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 Slide-seqV2, Curio Seeker Slide-seqV2和Curio Seeker空间转录组平台
4747 2026-05-06
Cell-o1: Training LLMs to Solve Single-Cell Reasoning Puzzles with Reinforcement Learning
2026-May-04, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出一个名为CellPuzzles的基准测试,将单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释重塑为批量级推理任务,并训练了7B参数的大语言模型Cell-o1,通过监督微调和强化学习实现最先进的批量级细胞类型注释性能 创新性地提出了批量级推理的细胞类型注释范式CellPuzzles,以及通过监督微调蒸馏推理轨迹和强化学习训练的Cell-o1模型,实现了跨多种组织、疾病和供体条件的高性能推理注释 未明确提及限制,但从上下文推断可能包括:模型依赖高质量推理轨迹数据、在极端复杂或少见细胞类型时的泛化能力可能受限、批量级精度提升但推理开销增加 提高大语言模型在单细胞RNA测序数据中批量级细胞类型注释的推理能力和准确性 来自不同组织、疾病和供体条件的单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释任务 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大语言模型 文本 CellPuzzles基准测试涵盖多种组织、疾病和供体条件,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4748 2026-05-06
Single-cell transcriptome sequencing (ScRNA-seq) uncovers the regulatory role of lodicule cells in rice floret opening (FO)
2026-May-04, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序揭示水稻浆片细胞在颖花开放中的调控作用 首次在单细胞水平解析浆片细胞调控水稻颖花开放的分子机制,发现了韧皮部与浆片细胞间的通信涉及钙离子、可溶性糖和水分的运输,并揭示了细胞壁重塑相关基因的异质性激活 未明确提及实验局限性,但样本仅涉及开花前后两个时间点,可能未覆盖整个发育过程的动态变化 探究水稻浆片细胞调控颖花开放的潜在分子机制 水稻小穗的开花前后样本 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 开花前和开花后两个时间点的小穗样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4749 2026-05-06
IgG2a-formatted 4-1BB agonism combined with S100A9 inhibition enhances T cell activation and tumor control in a preclinical model of multiple myeloma
2026-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了IgG2a形式4-1BB激动剂联合S100A9抑制剂在多发性骨髓瘤小鼠模型中增强T细胞活化和肿瘤控制的效果 首次验证了4-1BB激动剂的亚型特异性抗肿瘤效应,并建立了联合S100A9抑制剂的协同治疗策略 仅基于小鼠模型和有限的患者样本,缺乏临床试验验证 评估4-1BB刺激联合S100A9抑制在多发性骨髓瘤免疫治疗中的潜力 多发性骨髓瘤小鼠模型(5TGM1荷瘤小鼠)和新诊断多发性骨髓瘤患者骨髓样本 免疫治疗 多发性骨髓瘤 scRNA-seq,流式细胞术 NA 基因表达数据,免疫细胞表型数据 小鼠模型(具体数量未明确)和多名新诊断多发性骨髓瘤患者骨髓样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4750 2026-05-06
CD34+ cell-Derived Endothelial Cells Orchestrate Vascular and Immune Remodeling in the Transplanted Liver
2026-May-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序研究移植肝中CD34+细胞来源内皮细胞在血管和免疫重塑中的作用 首次绘制移植肝内皮细胞功能图谱,揭示受体CD34+细胞来源内皮细胞通过CXCL12-CXCR4轴招募并激活T细胞,并开发基于血小板的靶向递送策略减轻排斥反应 未提及 阐明移植后内皮细胞起源、特征及细胞间相互作用机制,并开发内皮细胞靶向策略减轻肝移植排斥反应 人类和鼠类肝移植物的内皮细胞以及受体CD34+细胞来源的内皮细胞 机器学习和单细胞组学 肝移植排斥反应 单细胞RNA测序、多重免疫组化、体外共培养模型 细胞间通讯分析工具(CellChat) 单细胞转录组数据 13个人类和4个鼠类肝移植物(肝移植后样本) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序文库构建和测序
4751 2026-05-06
The CXCL12-CXCR4 Axis Mediates Lymphocyte Immune Overactivation in IgG4-Related Chronic Rhinosinusitis
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示IgG4相关慢性鼻窦炎中CXCL12-CXCR4轴介导的淋巴细胞免疫过度活化机制 首次在单细胞水平解析IgG4相关慢性鼻窦炎的转录组变化,并阐明CXCL12-CXCR4轴在疾病发病机制中的核心作用 样本量较小(仅5例患者),且控制组数据来源于已发表数据,可能引入批次效应 揭示IgG4相关慢性鼻窦炎的发病机制 IgG4相关慢性鼻窦炎患者的鼻黏膜组织 数字病理学 IgG4相关慢性鼻窦炎 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多色免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, 组织图像 5例患者样本和3例已发表控制样本,共49063个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4752 2026-05-06
Epithelial-Associated CD207+ DCs Link Allergen Sensing and IL-25-Driven Th2 Inflammation in Asthma
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究揭示CD207+树突状细胞作为上皮相关抗原递呈细胞,在哮喘中连接IL-25信号与Th2型免疫应答的机制 首次鉴定CD207+树突状细胞作为上皮源性细胞因子IL-25的下游效应细胞,阐明其将过敏原感知与Th2炎症相联系的分子机制 尚未在人体哮喘模型中直接验证CD207缺失的治疗效果,且IL-25-CD207轴的上游调控网络仍需进一步解析 探究CD207+树突状细胞是否响应上皮源性细胞因子并参与哮喘Th2免疫应答 健康人肺组织单细胞RNA-seq数据、Cd207-/-小鼠尘螨诱导哮喘模型及U-BIOPRED队列哮喘患者气道样本 免疫学 哮喘(T2-high型) 单细胞RNA测序、流式细胞术、DC-T细胞共培养、Transwell气液界面共培养 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、共培养实验数据 人肺样本、Cd207-/-小鼠模型、U-BIOPRED队列哮喘患者气道样本 未知 单细胞RNA测序 NA NA
4753 2026-05-06
Transcriptomic profiling of insulinomas reveals a new "low-endocrine" subtype with low YY1 expressions
2026-May, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.] IF:2.8Q2
研究论文 对胰岛素瘤进行转录组分析,发现一种新的“低内分泌”亚型,其YY1表达水平较低 首次通过转录组分析识别出胰岛素瘤的低内分泌亚型,并揭示YY1表达水平与胰岛素合成途径的相关性 未详细说明样本量大小或临床数据的差异,以及YY1突变率与表达水平不一致的机制 探究胰岛素瘤的转录组异质性以及转录因子YY1的调控作用 胰岛素瘤肿瘤样本 数字病理学 胰岛素瘤 bulk RNA-seq, 全外显子测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium HD平台
4754 2026-05-06
Integrative transcriptomic profiling reveals molecular signatures of disease progression from gastroesophageal reflux disease to Barrett's esophagus: A foundation for single-cell resolution studies
2026-May, SLAS technology IF:2.5Q3
research paper 通过整合性转录组分析揭示了从胃食管反流病到巴雷特食管进展的分子特征,为单细胞分辨率研究奠定基础 首次系统性地在胃食管反流病和巴雷特食管之间进行大规模转录组比较,识别出1247个差异表达基因及相关信号通路,并揭示了疾病进展的分子标志物 缺少单细胞分辨率数据支撑,研究队列样本量较小(N=40),部分临床分子关联分析存在重叠分布 阐明胃食管反流病向巴雷特食管转变过程中的分子机制,建立单细胞转录组研究的框架基础 胃食管反流病和巴雷特食管患者的食管组织样本 数字病理学 食管癌 RNA测序 NA 转录组数据 40名患者(20名胃食管反流病,20名巴雷特食管) Illumina 批量RNA测序 Illumina NovaSeq 高通量RNA测序平台,使用HISAT2比对和StringTie定量分析
4755 2026-05-06
Activated microglia contribute to paraquat neurotoxicity through neuroinflammation and regulation of phenotypic polarization of astrocytes
2026-May, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了活化的小胶质细胞通过神经炎症和星形胶质细胞表型极化调控参与百草枯神经毒性的机制 首次利用单细胞RNA测序揭示PI3K/AKT通路在百草枯诱导的星形胶质细胞表型转化中的调控作用,并阐明小胶质细胞-星形胶质细胞互作在神经免疫毒性中的关键角色 未明确提及研究局限性 探究百草枯暴露下小胶质细胞调控星形胶质细胞表型极化及神经炎症的分子机制 小胶质细胞、星形胶质细胞、多巴胺能神经元 机器学习 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4756 2026-05-06
Elevated Cutaneous Interleukin-21 Links Eczematous Eruption to Interleukin-17A Inhibitor Treatment in Psoriasis
2026-May, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 研究发现皮肤中白细胞介素-21水平的升高与银屑病患者接受白细胞介素-17A抑制剂治疗后出现湿疹样皮疹相关 首次揭示了IL-21在抗IL-17A治疗相关EE发病机制中的关键调控作用,阐明了其通过JAK-STAT信号通路激活Th2/Th22反应的机制 未提及具体局限性 阐明银屑病患者接受抗IL-17A治疗后出现湿疹样皮疹的发病机制并鉴定致病分子 银屑病患者治疗前后的皮肤样本(包括出现和未出现湿疹样皮疹的样本) 机器学习 银屑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 组织病理分析, 蛋白质检测, ELISA, LEGENDplex, 体外实验 NA 转录组测序数据 银屑病患者皮肤样本(治疗前后,包括有和无EE的样本) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
4757 2026-05-06
The dual molecular identity of vestibular kinocilia bridges structural and functional traits of primary and motile cilia
2026-Apr-24, eLife IF:6.4Q1
研究论文 揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的结构与功能特征 首次通过单细胞RNA测序发现前庭毛细胞中动纤毛同时表达初级和运动纤毛相关基因,并证实其具有自发运动能力 未明确动纤毛自发运动在机械传导中的具体功能机制 阐明前庭动纤毛的分子组成、结构特征和功能特性 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 机器学习和数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 测序数据 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4758 2026-05-06
Decoding Organ-Specific Vulnerability to Triptolide Toxicity: A Systems Toxicology Approach Targeting Glucose Metabolism
2026-Apr-24, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 利用系统毒理学方法解析雷公藤甲素多器官毒性的分子机制,重点关注葡萄糖代谢紊乱 首次通过整合网络药理学、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟和单细胞RNA测序分析,系统揭示雷公藤甲素通过靶向糖酵解和磷酸戊糖途径关键酶导致器官特异性毒性的双重机制 该研究主要基于计算分析,缺乏体内外实验验证;孟德尔随机化分析受限于现有GWAS数据质量;分子对接结果需进一步晶体学验证 阐明雷公藤甲素导致多器官毒性的分子机制,为设计更安全的雷公藤甲素类似物提供理论基础 雷公藤甲素对肝脏、肾脏、心脏和生殖系统的毒性作用及其靶点 系统毒理学 药物毒性 网络药理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 蛋白质结构数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4759 2026-05-06
Mechanisms Underlying the Therapeutic Effects of GeXiaZhuYu Decoction Treating Colorectal Cancer based on Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations
2026-Apr-23, Current computer-aided drug design IF:1.5Q3
研究论文 本研究通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟,揭示了膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在分子机制 首次结合网络药理学、分子对接、分子动力学模拟和MM-GBSA结合自由能分析的多层次计算策略,从系统层面解析膈下逐瘀汤的活性成分与结直肠癌相关靶点的相互作用,并利用单细胞RNA-seq数据验证关键靶点的细胞类型特异性表达 研究结果基于计算分析,不直接暗示药理效应或因果机制,需要进一步实验验证 从系统层面表征膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在药理机制 膈下逐瘀汤的活性成分(槲皮素、木犀草素、山奈酚)与结直肠癌相关靶点(HSP90AA1、AKT1、TP53) 机器学习 结直肠癌 网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、MM-GBSA分析、单细胞RNA-seq NA 文本、基因表达数据 单细胞RNA-seq数据集GSE144735 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4760 2026-05-06
Single-Cell Ligand-Receptor Profiling Identifies Targetable Signaling Axes and Therapeutic Candidates in Lupus Nephritis
2026-Apr-22, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 通过单细胞配体-受体分析鉴定狼疮性肾炎中可靶向的信号轴及治疗候选药物 首次基于高关联配体-受体对进行狼疮性肾炎亚型分类,并结合分子对接和动力学模拟筛选老药新用候选物 仅基于公共单细胞数据,缺乏前瞻性队列验证;体内实验尚未开展 阐明配体-受体信号在狼疮性肾炎免疫微环境中的作用并发现治疗靶点 狼疮性肾炎患者肾脏组织的单细胞转录组数据 计算生物学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合多个公开单细胞RNA-seq数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序
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