单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 4721 - 4740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4721 | 2025-01-30 |
Decoding liver fibrogenesis with single-cell technologies
2022-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac040
PMID:39872749
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序技术如何改变我们对肝纤维化调控机制的理解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化过程中疾病相关细胞亚群、分子事件和细胞间相互作用 | 需要进一步努力以全面理解这些变化对肝纤维化的功能贡献，并将新知识转化为有效的治疗方法 | 探讨单细胞RNA测序技术在肝纤维化研究中的应用 | 肝细胞、肝窦内皮细胞、肌成纤维细胞和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4722 | 2024-12-09 |
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740
PMID:39642726
|
研究论文 | 研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用 | 首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用，并提出了潜在的治疗策略 | NA | 探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制 | 肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞 | NA | 辐射诱导的肺损伤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术 | NA | 细胞和组织微环境数据 | NA |
| 4723 | 2025-01-29 |
Improving Spatial Transcriptomics with Membrane-Based Boundary Definition and Enhanced Single-Cell Resolution
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401056
PMID:39871658
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的空间转录组学方法，通过使用基因编码的荧光蛋白标记细胞膜，精确索引切片上的测序点和细胞内的转录本 | 提出了一种基于细胞膜标记的新方法，相比基于细胞核的方法，显著提高了基因捕获数量，并实现了更一致的单细胞RNA测序数据表达谱 | 未提及具体的技术限制或挑战 | 改进空间转录组学技术，提高细胞边界定义的准确性和单细胞分辨率 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道 | 空间转录组学 | NA | 基因编码的荧光蛋白标记 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道样本 |
| 4724 | 2025-01-29 |
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401588
PMID:39871784
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4725 | 2024-12-24 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627027
PMID:39713433
|
研究论文 | 研究了视网膜波对视网膜神经节细胞类型转录组变化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了视网膜波对不同类型视网膜神经节细胞基因表达的微弱影响 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小 | 探讨视网膜波对视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 视网膜神经节细胞的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 |
| 4726 | 2025-01-29 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
|
研究论文 | 本文探讨了造血衰老的三个表型特征的原因，特别是炎症如何促进这些衰老表型 | 提出了一个实验模型（IkappaBminus）来解析NFkappaB在造血衰老表型中的作用，并发现HSC自主的NFkappaB活动损害其功能，而骨髓环境中的炎症驱动髓系偏倚 | 研究主要基于实验模型，可能无法完全反映人类造血衰老的复杂性 | 解析造血衰老的三个表型特征的独立调控机制 | 造血干细胞（HSC）及其在衰老过程中的功能变化 | 生物医学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | IkappaBminus模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类的HSC数据集 |
| 4727 | 2025-01-28 |
COSIME: Cooperative multi-view integration and Scalable and Interpretable Model Explainer
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.11.632570
PMID:39868220
|
研究论文 | 本文介绍了COSIME，一种用于多组学数据集成和可解释性模型解释的新方法 | COSIME通过可学习的最优传输（LOT）的反向传播和蒙特卡洛采样，实现了多视图数据的集成和特征关系的解释 | NA | 解决多组学数据集成和特征关系解释的瓶颈问题 | 单细胞转录组学、单细胞空间转录组学、表观基因组学和代谢组学数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 可学习的最优传输（LOT）、蒙特卡洛采样 | 深度神经网络 | 多组学数据 | 模拟数据和真实世界数据集 |
| 4728 | 2025-01-28 |
Inhibition of Glutamine Metabolism Suppresses Tumor Progression through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.10.632174
PMID:39868269
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制谷氨酰胺代谢通过重塑巨噬细胞免疫微环境来抑制肿瘤进展的机制 | 使用免疫活性小鼠模型和单细胞RNA测序技术，开发了一种仅在癌组织中生物激活的GLNi前药JHU083，揭示了其对肿瘤微环境中不同巨噬细胞亚型的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索谷氨酰胺代谢抑制剂在癌症治疗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 免疫活性小鼠模型中的妇科癌症 | 癌症研究 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 免疫活性小鼠模型 | RNA测序数据 | 免疫活性小鼠模型中的肿瘤样本 |
| 4729 | 2024-12-18 |
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2024-Dec-16, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43083
PMID:39681508
|
研究论文 | 本文研究了内源性逆转录元件（EREs）在早期类风湿性关节炎（eRA）中的表达及其与IFN-α产生和抗CCP自身抗体生成的关系 | 首次在eRA中研究了EREs的表达，揭示了EREs与IFN-I产生和抗CCP自身抗体的潜在因果关系 | 研究样本量较小，且仅限于早期类风湿性关节炎和早期银屑病关节炎患者 | 探讨EREs在早期类风湿性关节炎中的表达及其与IFN-α和抗CCP自身抗体的关系 | 早期类风湿性关节炎患者的全血和滑膜组织，以及早期银屑病关节炎患者的循环淋巴细胞亚群 | NA | 类风湿性关节炎 | RT-PCR, Nanostring, 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 22例eRA滑膜组织样本，56例全血样本，以及eRA和ePsA患者的循环淋巴细胞亚群 |
| 4730 | 2024-12-11 |
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001182
PMID:39656099
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓（PVTT）的免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PVTT中免疫细胞的组成和功能，特别是C5aR+ TAMs在免疫抑制环境中的作用 | 研究主要集中在PVTT的免疫微环境，未涉及其他类型的肿瘤血栓 | 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 | 肝细胞癌中的门静脉肿瘤血栓（PVTT） | 数字病理学 | 肝癌 | 时间飞行质谱（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞数据 | 使用了PVTT细胞系CSQT2和单核细胞系THP-1进行实验 |
| 4731 | 2024-12-12 |
Gene regulatory network inference based on novel ensemble method
2024-Dec-06, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae036
PMID:39324652
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于13种基本分类方法和灵活神经树（FNT）的集成方法，以提高基因调控网络（GRN）的识别准确性 | 开发了一种基于基因编程变体和粒子群优化的混合进化算法来搜索最优的FNT模型，并证明了所提出的集成方法在多个数据集上优于多种现有算法 | NA | 提高基因调控网络的识别准确性 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 灵活神经树（FNT） | 基因数据 | 三个模拟数据集和三个真实单细胞RNA-seq数据集 |
| 4732 | 2024-10-26 |
Evolutionary diversity of CXCL16-CXCR6: Convergent substitutions and recurrent gene loss in sauropsids
2024-12, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-024-01357-5
PMID:39400711
|
研究论文 | 研究CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 | 首次在脊椎动物中比较了约400个CXCR6直系同源基因，发现DRF基序在不同物种中的替代和CXCR6基因在某些鸟类和爬行动物中的反复丢失 | 研究主要集中在脊椎动物，未涵盖所有物种，且对基因丢失的具体机制和免疫影响的深入研究有限 | 探讨CXCL16-CXCR6轴在脊椎动物中的进化多样性及其对宿主免疫的影响 | CXCL16-CXCR6轴在不同脊椎动物中的基因变异和进化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列 | 约400个CXCR6直系同源基因，涵盖多种脊椎动物 |
| 4733 | 2024-11-17 |
scDOT: optimal transport for mapping senescent cells in spatial transcriptomics
2024-Nov-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03426-0
PMID:39516853
|
研究论文 | 本文开发了scDOT，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，以提高重建单细胞分辨率空间图和识别衰老细胞的能力 | scDOT通过整合最优传输和表达解卷积，学习细胞和spots之间的非线性耦合，推断细胞位置 | NA | 提高空间转录组学数据分辨率，识别衰老细胞及其空间组织 | 衰老细胞及其在空间转录组学数据中的组织 | 空间转录组学 | NA | 最优传输 | NA | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | NA |
| 4734 | 2024-10-28 |
Metabolic Reprogramming Induced by Aging Modifies the Tumor Microenvironment
2024-10-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201721
PMID:39451239
|
研究论文 | 研究了衰老引起的代谢重编程如何影响肿瘤微环境（TME）以促进肿瘤发生 | 利用MMPC方法分析了衰老相关癌症类型的代谢可塑性事件，揭示了衰老相关代谢重编程对肿瘤微环境的影响 | NA | 探讨衰老与代谢重编程之间的相互作用如何影响肿瘤微环境 | 衰老相关癌症类型的代谢可塑性事件 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序 | MMPC（Modeling Metabolic Plasticity by Pathway Pairwise Comparison） | RNA-seq数据 | 17种衰老相关癌症类型的批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 |
| 4735 | 2024-10-28 |
Podoplanin Expression in Early-Stage Colorectal Cancer-Associated Fibroblasts and Its Utility as a Diagnostic Marker for Colorectal Lesions
2024-10-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13201682
PMID:39451200
|
研究论文 | 研究了早期结直肠癌相关成纤维细胞中Podoplanin的表达及其作为诊断标志物的潜力 | 首次详细研究了早期结直肠癌中Podoplanin阳性成纤维细胞的来源和功能 | 研究仅限于免疫组化和单细胞RNA测序，未涉及临床验证 | 探讨Podoplanin在早期结直肠癌相关成纤维细胞中的表达及其作为诊断标志物的潜力 | 早期结直肠癌、腺瘤、神经内分泌肿瘤及其正常邻近组织和非肿瘤性结直肠病变 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 涉及多种类型的结直肠病变样本 |
| 4736 | 2024-11-02 |
WIP1-mediated regulation of p38 MAPK signaling attenuates pyroptosis in sepsis-associated acute kidney injury
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152832
PMID:38943814
|
研究论文 | 研究探讨了WIP1在脓毒症相关急性肾损伤中的作用及其通过p38 MAPK信号通路调控细胞焦亡的机制 | 首次揭示了WIP1在肾脏中的作用及其在脓毒症相关急性肾损伤中通过p38 MAPK信号通路调控细胞焦亡的机制 | 研究主要集中在小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体临床数据 | 探讨WIP1在脓毒症相关急性肾损伤中的作用及其调控机制 | 小鼠和人类肾2细胞 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质 | 小鼠和人类肾2细胞 |
| 4737 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis of macrophage subpopulations contributing to chemotherapy resistance in ovarian cancer
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152811
PMID:38941863
|
研究论文 | 这项研究探讨了巨噬细胞亚群在卵巢癌化疗耐药中的复杂功能和机制 | 识别并分析了卵巢癌中与化疗耐药相关的15个不同巨噬细胞亚群 | 尚未提及具体的实验设计和样本代表性 | 了解巨噬细胞在卵巢癌化疗耐药中的作用和机制 | 卵巢癌细胞中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 4738 | 2024-08-27 |
Identification and validation of potential biomarkers related to oxidative stress in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-09, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152791
PMID:39180853
|
研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学技术识别与特发性肺纤维化（IPF）中氧化应激相关的可靠诊断生物标志物 | 利用随机森林算法结合随机最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归识别诊断基因，并构建诺模图评估疾病风险 | NA | 识别与特发性肺纤维化中氧化应激相关的诊断生物标志物 | 特发性肺纤维化中的氧化应激相关基因 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 使用GSE70866和GSE141939数据集，涉及437个氧化应激相关基因和10个差异表达的氧化应激相关基因 |
| 4739 | 2024-09-05 |
Vagal TRPV1 + sensory neurons regulate myeloid cell dynamics and protect against influenza virus infection
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.609013
PMID:39229208
|
研究论文 | 研究揭示了迷走TRPV1感觉神经元在调节骨髓细胞动态和保护小鼠免受流感病毒感染中的作用 | 首次阐明了迷走TRPV1感觉神经元在肺部抗病毒防御中的功能，并揭示了其在调节骨髓细胞反应和免疫病理学中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在其他物种或人体中验证这些发现 | 探讨迷走TRPV1感觉神经元在流感病毒感染中的作用及其对肺部免疫反应的影响 | 迷走TRPV1感觉神经元及其在流感病毒感染中的作用 | 免疫学 | 流感 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠 |
| 4740 | 2024-08-05 |
Targeting the dynamic transcriptional landscape of Treg subpopulations in pancreatic ductal adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing analysis with a focus on CTLA4 and TIGIT
2024-07, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2024.152822
PMID:38852289
|
研究论文 | 本研究重新分析了一项来自PDAC的单细胞RNA测序数据集，探讨了肿瘤及正常组织的异质性，重点关注Treg细胞及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 首次揭示了PDAC中自然Tregs与诱导Tregs的数量差异，以及它们与其他细胞类型之间的关键通信途径 | 本研究主要依赖于已有的数据集，缺乏来自临床样本的直接验证 | 研究PDAC中的调节性T细胞与其他细胞在肿瘤微环境中的交互作用 | 调节性T细胞（Tregs）及其与其他肿瘤微环境细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |