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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4701 - 4720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4701 | 2025-10-06 |
An improved reference library and method for accurate cell-type deconvolution of bulk-tissue miRNA data
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60521-x
PMID:40593558
|
研究论文 | 开发了一种改进的miRNA表达参考库和解卷积工具，用于准确估计复杂组织中的细胞类型比例 | 创建了新型miRNA表达参考库和专门针对miRNA数据的解卷积计算方法 | 当前单细胞RNA-Seq协议在miRNA表达定量方面存在滞后，且大多数miRNA分析样本缺乏匹配的mRNA表达或DNA甲基化数据 | 开发计算方法来估计批量组织miRNA数据中的细胞类型比例 | 复杂组织中的细胞类型组成 | 生物信息学 | 癌症、传染病 | miRNA测序、细胞类型解卷积 | NA | miRNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、批量miRNA测序 | NA | NA |
| 4702 | 2025-10-06 |
Different tumour-resident memory T-cell subsets regulate responses to anti-PD-1 and anti-CTLA-4 cancer immunotherapies
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60657-w
PMID:40593647
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研究论文 | 本研究揭示了不同肿瘤驻留记忆T细胞亚群在抗PD-1和抗CTLA-4免疫疗法中的调控作用 | 首次发现CD103+CD8+ T细胞和CD49a+CD4+ T细胞分别特异性调控抗PD-1和抗CTLA-4免疫疗法的疗效 | 研究主要基于临床前小鼠模型，人类数据验证仍需扩大样本量 | 探究肿瘤驻留记忆T细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的作用机制 | 肿瘤浸润淋巴细胞，特别是CD103+CD8+ T细胞和CD49a+CD4+ T细胞亚群 | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | 临床前小鼠模型和人类黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4703 | 2025-10-06 |
GPerturb: Gaussian process modelling of single-cell perturbation data
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61165-7
PMID:40593897
|
研究论文 | 提出一种基于高斯过程的稀疏扰动回归模型GPerturb，用于估计单细胞水平的基因扰动效应 | 采用高斯过程建模单细胞扰动数据，能够分离信号与噪声，捕获稀疏可解释的效应，并提供不确定性估计 | NA | 揭示基因表达与扰动之间的复杂依赖关系，推进单细胞水平基因调控的理解 | 单细胞RNA测序和CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | 高斯过程 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4704 | 2025-10-06 |
Systematic screening of metabolic pathways to identify two breast cancer subtypes with divergent immune characteristics
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05179-7
PMID:40594370
|
研究论文 | 通过代谢通路分析识别乳腺癌的两种代谢亚型及其免疫特征差异 | 建立了基于代谢通路的乳腺癌代谢分型系统(BCMSS)，首次系统评估代谢通路在乳腺癌异质性中的作用 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要前瞻性研究验证临床实用性 | 识别乳腺癌代谢亚型并分析其免疫特征和临床意义 | 乳腺癌患者和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,空间RNA测序 | 随机森林,共识聚类 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | TCGA发现队列1094例，9个独立验证队列总计超过4000例 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间RNA-seq | NA | NA |
| 4705 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing and computational findings reveal anti-estrogen receptor-positive breast cancer roles of formononetin
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06133-3
PMID:40594685
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和网络药理学方法揭示芒柄花素在抗ER阳性乳腺癌中的作用机制 | 首次在单细胞水平采用系统生物学方法研究芒柄花素的靶点及其抗ER阳性乳腺癌机制 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 确定芒柄花素在ER阳性乳腺癌中的靶点和分子机制 | ER阳性乳腺癌细胞和正常乳腺组织中的基质细胞、上皮细胞、成纤维细胞、中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和巨噬细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 网络药理学 | 系统生物学方法 | 单细胞测序数据 | 未在摘要中明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4706 | 2025-10-06 |
Causal effects of brain subregion gene expression on inflammatory bowel diseases revealed by Mendelian randomization and single cell analysis
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08633-8
PMID:40594700
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞分析揭示脑部亚区基因表达对炎症性肠病的因果效应 | 整合脑部和肠道单细胞RNA测序与基因组eQTLs进行跨组学分析，识别关键基因的细胞来源 | eQTL样本量显著影响显著关联的检测，组织间直接定量比较需谨慎解释 | 探究脑-肠轴在炎症性肠病发病机制中的作用 | 13个脑部亚区和结肠表达数量性状位点与炎症性肠病 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 跨组学分析, 全表型关联研究 | NA | 基因组eQTLs, 单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列（IIBDGC, UKB, FinnGen） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4707 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq analysis of mouse carotid artery under disturbed flow and human carotid plaques identifies key cell populations in atherosclerosis development
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07395-7
PMID:40594772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析扰动血流下小鼠颈动脉和人类颈动脉斑块，揭示了动脉粥样硬化发展中的关键细胞群 | 首次系统性地结合小鼠扰动血流模型和人类颈动脉斑块样本的单细胞RNA测序数据，识别出CD36阳性内皮细胞、VEGFA巨噬细胞和外膜成纤维细胞在动脉粥样硬化中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证 | 探索扰动血流如何通过影响细胞功能加重动脉粥样硬化 | 小鼠颈动脉和人类颈动脉斑块 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 功能富集分析, 代谢通量分析, 转录组噪声分析 | Seurat, scFEA, CellChat, Cytosig | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO和SRA数据库的多个数据集(GSE159677, GSE43292, GSE163154, GSE41571, PRJNA722117) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4708 | 2025-10-06 |
Identification of clusters related to programmed cell death and potential prognostic biomarkers for immunotherapy response in endometrial cancer
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06672-9
PMID:40595063
|
研究论文 | 本研究通过整合程序性细胞死亡通路和多组学数据，识别了子宫内膜癌的两种亚型并开发了预后评分系统 | 首次整合多种PCD通路构建子宫内膜癌预后评分系统，并利用单细胞RNA测序分析肿瘤异质性 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发预测子宫内膜癌免疫治疗反应和预后的生物标志物 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析 | 预后评分模型 | 基因组数据，转录组数据 | TCGA-EC和GEO数据库中的子宫内膜癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4709 | 2025-10-06 |
Potential role of TNFRSF12A in linking glioblastoma and alzheimer's disease via shared tumour suppressor pathways
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08000-7
PMID:40595248
|
研究论文 | 通过整合分析发现TNFRSF12A在胶质母细胞瘤和阿尔茨海默病中共同失调，可能通过肿瘤抑制通路连接两种疾病 | 首次通过多组学方法系统筛选并验证TNFRSF12A作为胶质母细胞瘤和阿尔茨海默病的交叉疾病候选基因 | 仅进行了部分功能验证，需要进一步的机制研究 | 探索肿瘤抑制基因在神经退行性疾病和癌症中的共同分子机制 | 胶质母细胞瘤和阿尔茨海默病 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤,阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化,转录组分析,单细胞RNA测序,细胞间通讯推断,体外验证 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1,217个肿瘤抑制基因 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 4710 | 2025-10-06 |
Reprogramming of human urine cells into cardiomyocytes via a small molecule cocktail in xeno-free conditions
2025-Jul-01, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-00963-y
PMID:40595290
|
研究论文 | 本研究通过小分子组合在无外源成分条件下将人尿源细胞重编程为功能性心肌样细胞 | 首次在无外源成分条件下使用15种小分子组合将人尿源细胞直接重编程为心肌样细胞 | 重编程效率为15.08%，仍有提升空间 | 开发用于心脏修复的可扩展自体细胞来源 | 人尿源细胞(hUCs)和小鼠及猪的心肌梗死模型 | 再生医学 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 透射电子显微镜, qPCR, 膜片钳记录, 细胞内钙测量 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 影像数据 | 人尿源细胞及小鼠和猪心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4711 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals BMP4-BMPR2 signaling promotes radiation resistance in hematopoietic stem cells following injury
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60557-z
PMID:40595466
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了BMP4-BMPR2信号通路在促进造血干细胞辐射抗性中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示BMPR2+造血干细胞作为辐射抵抗亚群的特征及其通过调控H3K27me3修饰维持自我更新能力的表观遗传机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用价值需进一步验证 | 探究电离辐射后造血干细胞异质性及骨髓微环境的分子调控机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及骨髓微环境 | 单细胞组学 | 造血系统损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠造血干细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4712 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomics of human kidney organoid endothelium reveals vessel growth processes and arterial maturation upon transplantation
2025-Jul-01, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-025-00418-x
PMID:40595660
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人肾脏类器官内皮细胞在移植后的血管生长过程和动脉成熟机制 | 首次在鸡胚胎移植模型中系统分析人肾脏类器官内皮细胞的分子景观，发现静脉向动脉表型转变的关键过程 | 研究基于鸡胚胎移植模型，与人体内环境存在差异；样本量相对有限 | 探究人肾脏类器官内皮细胞在移植后的分子变化和血管化机制 | 人诱导多能干细胞来源的肾脏类器官内皮细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约12,000个类器官内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4713 | 2025-10-06 |
Unraveling the role of HIF2α in melanoma progression and epithelial-mesenchymal transition
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02384-2
PMID:40595758
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和体外实验揭示了HIF2α在黑色素瘤进展和上皮-间质转化中的关键作用 | 首次系统阐明HIF2α通过调节肿瘤微环境和代谢通路促进黑色素瘤进展的机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要更多体内实验验证 | 探索HIF2α在黑色素瘤进展和上皮-间质转化中的作用机制 | 黑色素瘤患者样本和A375细胞系 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 实时PCR, 配体-受体相互作用分析, 富集分析 | NA | 转录组数据, 基因表达数据 | 黑色素瘤患者样本和对照组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4714 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the potential role of Postn(+) fibroblasts in promoting the progression of myocardial fibrosis after myocardial infarction
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04990-6
PMID:40595870
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定Postn阳性成纤维细胞在心肌梗死后心肌纤维化进展中的关键作用 | 首次发现并命名C1 Postn阳性成纤维细胞亚群，揭示其通过Cxcl12-Ackr3、Ptn-Ncl和Mdk-Lrp1信号通路与其他细胞相互作用促进心肌纤维化 | 需要进一步实验验证Tead1和Hdac2作为治疗靶点的潜力 | 探究心肌梗死后成纤维细胞亚群在心肌纤维化和心力衰竭进展中的作用机制 | 心肌梗死后心脏成纤维细胞亚群 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4715 | 2025-10-06 |
Leveraging autoencoder models and data augmentation to uncover transcriptomic diversity of gingival keratinocytes in single cell analysis
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08027-w
PMID:40596529
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研究论文 | 利用自编码器模型和数据增强技术探索牙龈角质形成细胞在单细胞水平的转录组多样性 | 首次将自编码器模型和数据增强技术应用于牙龈角质形成细胞的单细胞转录组分析，揭示了细胞亚群和差异基因表达谱 | 仅使用单一数据集(GSE266897)，未在其他独立数据集中验证模型性能 | 研究牙龈角质形成细胞的转录组多样性及其在牙周健康和炎症反应中的作用 | 牙龈角质形成细胞 | 单细胞分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | 自编码器(AE), 变分自编码器(VAE), 去噪自编码器(DAE) | 单细胞RNA测序数据 | GSE266897数据集中的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4716 | 2025-10-06 |
A novel necroptosis related prognostic signature for skin cutaneous melanoma based on transcriptome and single cell sequencing analysis
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07829-2
PMID:40596554
|
研究论文 | 基于转录组和单细胞测序分析构建皮肤黑色素瘤坏死性凋亡相关预后特征模型 | 首次结合WGCNA和单细胞测序分析鉴定坏死性凋亡相关基因，并建立包含9个基因的预后特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅通过PCR对单个基因进行确认 | 构建皮肤黑色素瘤的坏死性凋亡相关预后预测模型 | 皮肤黑色素瘤患者和A375细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序，单细胞测序，实时PCR | COX回归，LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA-SKCM，GSE65904和GSE215120数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4717 | 2025-10-06 |
The Key Role of COA6 in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Metabolic Reprogramming and Regulation of the Immune Microenvironment
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70685
PMID:40596639
|
研究论文 | 本研究揭示了COA6基因在胰腺导管腺癌代谢重编程和免疫微环境调控中的关键作用 | 首次系统阐明COA6通过调控OXPHOS通路影响胰腺癌肿瘤微环境和药物耐药性的机制 | 需要进一步研究开发COA6靶向治疗方法 | 探究COA6在胰腺导管腺癌中的功能及其对肿瘤微环境的调控机制 | 胰腺导管腺癌细胞系SW1990和PANC-1 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 两种胰腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4718 | 2025-10-06 |
Global Thyroid Cancer Patterns and Predictive Analytics: Integrating Machine Learning for Advanced Diagnostic Modelling
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70676
PMID:40596746
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习方法分析甲状腺癌分子特征，开发先进的诊断模型 | 结合单细胞转录组学和机器学习算法揭示髓系细胞通讯网络在甲状腺癌中的作用 | 需要在更广泛和异质性患者群体中进行前瞻性验证 | 提高甲状腺癌的早期诊断能力和靶向治疗开发 | 甲状腺癌临床标本和分子特征 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 定量PCR, ELISA, 单细胞转录组学 | 惩罚回归模型(Ridge, Lasso) | 基因表达数据, 细胞因子浓度数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4719 | 2025-10-06 |
Ensemble machine learning-based pre-trained annotation approach for scRNA-seq data using gradient boosting with genetic optimizer
2025-Jul-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06151-y
PMID:40596854
|
研究论文 | 提出一种基于集成机器学习的预训练注释框架，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型标注 | 整合梯度提升和遗传优化进行特征选择，通过集成学习和多数据集特征对齐策略提升数据稀缺情况下的注释准确性 | 未明确说明方法对特定细胞类型或复杂生物场景的适用性限制 | 开发稳健的单细胞RNA测序数据注释方法，提高细胞类型分类准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标注 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习, 梯度提升, 遗传算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4720 | 2025-10-06 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing reveals a cuproptosis-related LncRNA prognostic signature in neuroblastoma
2025-Jul-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14463-8
PMID:40596995
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，构建了一个与铜死亡相关的长链非编码RNA预后特征，用于神经母细胞瘤的风险分层 | 首次在神经母细胞瘤中整合bulk和单细胞RNA测序数据，构建铜死亡相关lncRNA预后特征，并通过功能验证确认其致癌作用 | 样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 开发神经母细胞瘤的精准预后评估模型 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, siRNA敲低 | Lasso-Cox回归模型, 风险评分模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 神经母细胞瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |