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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4701 | 2025-10-06 |
Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269
PMID:40146000
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析心脏骤停猪模型海马体中的血脑屏障破坏和神经炎症机制 | 首次在猪心脏骤停模型中应用单细胞转录组学,发现了新的小胶质细胞亚群及其与中性粒细胞的通讯机制 | 研究仅观察了6小时和24小时两个时间点,未能覆盖更长的恢复期 | 探索心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制 | 心室颤动诱导心脏骤停的猪模型海马体组织 | 单细胞转录组学 | 心脏骤停后脑损伤 | 单细胞RNA测序,Western blotting,qRT-PCR,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 心脏骤停猪模型和假手术对照猪的海马体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4702 | 2025-10-06 |
A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163
PMID:40326988
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼脊髓损伤后再生过程中的细胞动态变化和分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘斑马鱼脊髓再生的细胞景观,发现神经元亚群持续激活轴突再生相关基因,同时抑制生长锥塌陷分子信号 | 研究主要关注分子和细胞层面,功能验证实验相对有限 | 探索斑马鱼脊髓损伤后的再生机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型中的不同细胞类型 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同脊髓损伤阶段的斑马鱼样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4703 | 2025-10-06 |
Uncovering common transcriptional features shared by mature peripheral blood PMN-MDSCs and tumor-infiltrating neutrophils in humans
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2521396
PMID:40590753
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类外周血成熟PMN-MDSCs与肿瘤浸润中性粒细胞共享转录特征 | 首次在单细胞水平发现循环mPMN-MDSCs与肿瘤相关中性粒细胞共享具有免疫抑制和促肿瘤特征的转录组细胞簇 | 细胞簇命名较为随意,需进一步功能验证确认其生物学意义 | 探究循环成熟PMN-MDSCs与肿瘤浸润中性粒细胞的转录组相似性 | 非小细胞肺癌患者、G-CSF治疗供体的循环mPMN-MDSCs及人类肿瘤相关中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌患者和G-CSF治疗供体的mPMN-MDSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4704 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of the whole colony of Botrylloides diegensis: insights into tissue specialization and blastogenesis
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204265
PMID:40406997
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研究论文 | 通过对Botrylloides diegensis整个群体进行单细胞转录组测序,解析细胞异质性并鉴定细胞和组织标记物 | 首次对B. diegensis整个群体进行单细胞转录组分析,识别了29个主要细胞簇并揭示了胃上皮等组织的区域特异性 | NA | 解析B. diegensis群体的细胞异质性和组织特异性 | Botrylloides diegensis群体的所有组成部分,包括个体、芽体和血管外衣 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 一个完整的B. diegensis群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4705 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape of immunological responses in patients with juvenile idiopathic arthritis
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101577
PMID:40605976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示幼年特发性关节炎患者免疫细胞的异质性和功能变化 | 首次在JIA患者中系统绘制免疫细胞单细胞图谱,发现sJIA患者特有的干扰素反应异常和MIF-CXCR7/CD44配体-受体对 | 样本量有限(14例患者和4例健康对照),未包含所有JIA亚型 | 解析幼年特发性关节炎患者免疫细胞的转录组特征和功能变化 | 幼年特发性关节炎患者和健康个体的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析,细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 14例JIA患者和4例健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4706 | 2025-10-06 |
Blood and urine-based biomarkers in prostate cancer: Current advances, clinical applications, and future directions
2025-Sep, The journal of liquid biopsy
DOI:10.1016/j.jlb.2025.100305
PMID:40606769
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综述 | 全面概述前列腺癌诊断、预后和预测生物标志物的最新进展、临床应用及未来发展方向 | 整合了液体活检、单细胞组学、人工智能模型等新兴技术在前列腺癌生物标志物研究中的应用 | NA | 总结前列腺癌生物标志物的研究现状并展望未来发展方向 | 前列腺癌患者 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检、机器学习 | 人工智能驱动模型 | 血液样本、尿液样本、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检 | NA | NA |
4707 | 2025-10-06 |
Scalable inference of transcriptional variability with BASiCS
2025-Aug-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2025.112157
PMID:40479909
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研究论文 | 本文扩展了BASiCS单细胞RNA测序数据分析方法,提出了一种可扩展的贝叶斯推断方案 | 在BASiCS模型中引入了分治推断方案,实现了大规模单细胞RNA测序数据的可扩展贝叶斯推断 | 未明确说明具体数据集规模上限和计算资源需求 | 开发可扩展的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4708 | 2025-10-06 |
Cellular Landscape of Synovial Chondromatosis Synovium Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500034RR
PMID:40600952
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示滑膜软骨瘤病滑膜的细胞景观 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘滑膜软骨瘤病的细胞异质性和细胞状态改变,发现特异性成纤维细胞亚群扩增和巨噬细胞表型转变 | 样本量相对有限,功能验证实验尚未完全开展 | 解析滑膜软骨瘤病的细胞基础 | 健康个体和滑膜软骨瘤病患者的滑膜组织 | 单细胞组学 | 滑膜软骨瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和SC患者的滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4709 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of the decidua unveils the mechanism of anti-inflammatory exosomes for chorioamnionitis in nonhuman primates
2025-Jul-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp0467
PMID:40601753
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示携带srIκB的外泌体在非人 primates 绒毛膜羊膜炎模型中的抗炎机制 | 首次在非人灵长类动物妊娠模型中证明工程化外泌体通过抑制NF-κB信号通路治疗绒毛膜羊膜炎的机制 | 研究仅限于非人灵长类动物模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索携带srIκB的外泌体对绒毛膜羊膜炎的治疗潜力及作用机制 | 妊娠期非人灵长类动物的蜕膜组织和绒毛膜蜕膜组织 | 单细胞分析 | 绒毛膜羊膜炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4710 | 2025-10-06 |
Hyperactivated Interferon-gamma Pathways in Perianal Fistulizing Crohn's Disease by Single-Cell and Spatial Multi-omics
2025-Jul-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193413
PMID:40608410
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研究论文 | 通过单细胞和空间多组学技术揭示肛周瘘管型克罗恩病中干扰素-γ通路的过度激活机制 | 首次结合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和空间转录组学系统解析PCD的免疫病理机制,发现致病性Th17细胞和LPS_髓系细胞驱动的IFN-γ信号过度激活是PCD的关键特征 | 样本量相对有限(PCD患者24例),需要更大规模研究验证发现 | 阐明肛周瘘管型克罗恩病的免疫病理机制并确定可干预的免疫治疗靶点 | 肛周瘘管型克罗恩病患者(24例)、无肛周病变的克罗恩病患者(10例)和特发性肛周瘘管患者(29例)的瘘管组织、瘘管开口和直肠黏膜样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间基因表达数据 | 63例患者(24例PCD, 10例NPCD, 29例IPF)的多个组织部位活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 质谱流式细胞术, 批量RNA-seq | NA | NA |
4711 | 2025-10-06 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Jul-03, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | 介绍REMODEL试验的设计和基线特征,该试验旨在研究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的作用机制 | 首次结合MRI评估和肾脏活检组织分析(包括单核转录组学和空间转录组学)来探索GLP-1受体激动剂的肾脏保护机制 | 样本量相对较小(总106人,活检亚组33人),观察期52周可能不足以评估长期效果 | 探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 | 2型糖尿病合并慢性肾病的成年患者 | 临床医学 | 2型糖尿病、慢性肾病 | 磁共振成像、单核转录组学、空间转录组学、组织病理学分析 | NA | 临床数据、影像数据、组织样本数据 | 106名参与者(其中33人参与肾脏活检亚组) | NA | 单核转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
4712 | 2025-10-06 |
scVDM: A Diffusion Model Integrated with Conditional VAE for Generative Single-cell Tasks
2025-Jul-03, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3585960
PMID:40608883
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研究论文 | 提出了一种结合条件VAE的扩散模型scVDM,用于单细胞数据的生成任务 | 将条件VAE与基于transformer的条件去噪器集成到潜在扩散模型中,通过自注意力机制深度挖掘潜在维度间的复杂关系 | NA | 解决单细胞RNA-seq数据中的噪声问题,实现条件数据生成、批次效应校正和药物扰动预测 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型,条件VAE,transformer | 基因表达数据 | 五个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4713 | 2025-10-06 |
Dissecting FAP+ Cell Diversity in Pancreatic Cancer Uncovers an Interferon-Response Subtype of Cancer-Associated Fibroblasts with Tumor-Restraining Properties
2025-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3252
PMID:40215177
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析胰腺癌中FAP+间质细胞的异质性,发现具有肿瘤抑制功能的干扰素反应性癌症相关成纤维细胞亚型 | 首次发现并表征了干扰素反应性CAF亚型,证明其具有抑制肿瘤侵袭性和诱导抗肿瘤中性粒细胞表型的能力 | 研究主要基于体外共培养模型,体内验证仍需进一步深入 | 解析胰腺癌间质中FAP+细胞的异质性及其调控机制 | 胰腺导管腺癌中的FAP表达间质细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,类器官共培养模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4714 | 2025-10-06 |
NEDDylation Regulates CD8+ T-cell Metabolism and Antitumor Immunity
2025-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0127
PMID:40261130
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研究论文 | 本研究揭示了NEDDylation修饰通过调控CD8+ T细胞的代谢通路影响其抗肿瘤免疫功能 | 首次系统阐明NEDDylation在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的关键作用,并鉴定乳酸脱氢酶A等糖酵解酶为NEDD8修饰靶点 | NA | 探究NEDDylation修饰在CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫应答中的调控机制 | 小鼠和人类CD8+ T细胞,包括肿瘤浸润淋巴细胞和CAR-T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,LC MS/MS蛋白质组学分析,基因敲除技术 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4715 | 2025-10-06 |
Combining Spatial Transcriptomics, Pseudotime, and Machine Learning Enables Discovery of Biomarkers for Prostate Cancer
2025-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0269
PMID:40293712
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学、伪时序分析和机器学习方法,发现前列腺癌的生物标志物 | 首次将空间转录组学、伪时序分析和机器学习相结合,识别可在常规临床方法中测量的可靠生物标志物 | 需要在前瞻性研究中进一步验证 | 发现前列腺癌早期诊断的生物标志物 | 前列腺癌患者和对照组的血清、前列腺组织和尿液样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 伪时序分析, 机器学习 | 机器学习预测模型 | 空间转录组数据, mRNA数据, IHC数据, 蛋白质组学数据 | 超过2000名前列腺癌患者和对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4716 | 2025-10-06 |
Single-cell omics in plant biology: mechanistic insights and applications for crop improvement
2025-Jul-02, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00074-8
PMID:40593253
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综述 | 本文综述单细胞组学技术在植物生物学中的最新进展及其在作物改良中的应用 | 系统整合单细胞转录组和表观基因组技术,揭示植物细胞异质性和基因调控网络的新机制 | 主要基于现有技术综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨单细胞组学技术在植物研究和作物育种中的应用前景 | 模式植物拟南芥及主要农作物和园艺植物 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
4717 | 2025-10-06 |
Unveiling diagnostic biomarkers and therapeutic targets in lung adenocarcinoma using bioinformatics and experimental validation
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05227-2
PMID:40595823
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示肺腺癌的诊断生物标志物和治疗靶点 | 整合差异基因表达分析、WGCNA和机器学习方法筛选核心基因,并通过单细胞RNA测序分析基因在29种细胞亚型中的表达模式 | NA | 寻找肺腺癌的诊断标志物和治疗靶点 | 肺腺癌患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, WGCNA, 机器学习 | 随机森林, Stepglm[backward] | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4718 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of the murine limb skeleton integrating the developmental and adult stages
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05277-6
PMID:40596066
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研究论文 | 整合了小鼠肢体骨骼发育和成年阶段的单细胞转录组图谱 | 首次创建了涵盖小鼠肢体骨骼从诱导到成骨全过程的多时间点单细胞图谱,整合了10个公共数据集共133,332个细胞 | 仅聚焦于肢体骨骼系统,未涵盖全身所有骨骼区域 | 填补当前生物体全范围图谱项目中骨骼系统代表性不足的空白 | 小鼠肢体骨骼细胞及其发育前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 133,332个细胞,整合10个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4719 | 2025-10-06 |
Genotype-integrated single-cell transcriptome analysis reveals the role of DDX41 pR525H in a patient with myelodysplastic neoplasms
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06477-w
PMID:40596075
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研究论文 | 通过整合基因型的单细胞转录组分析揭示DDX41 pR525H突变在骨髓增生异常肿瘤患者中的作用机制 | 首次在携带种系和体细胞DDX41变异的MDS患者中实施整合pR525位点基因分型的单细胞RNA测序,揭示突变诱导的G2/M期细胞周期阻滞和非细胞自主性影响 | 基于单个病例报告,样本量有限,需要更多患者验证 | 阐明DDX41变异在骨髓肿瘤发生中的分子机制 | 骨髓增生异常肿瘤患者的原代造血细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常肿瘤 | 单细胞RNA测序,基因分型,TAS-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 1例MDS患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Terminator-Assisted Solid-phase cDNA amplification and sequencing (TAS-seq) |
4720 | 2025-10-06 |
Endothelial cells expressing CPE and vWF are involved in the Immunopathogenesis of primary biliary cholangitis
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07311-z
PMID:40596471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现表达CPE和vWF的内皮细胞亚群在原发性胆汁性胆管炎免疫发病机制中的作用 | 首次鉴定出CPE+vWF+内皮细胞新亚群,并揭示其通过APP-CD74轴与胆管细胞相互作用促进PBC发病的机制 | 研究中存在另一种未明确鉴定的内皮细胞类型,其具体特征和功能需要进一步研究 | 探究肝窦内皮细胞在原发性胆汁性胆管炎免疫发病机制中的作用 | 原发性胆汁性胆管炎患者和对照组的肝窦内皮细胞 | 单细胞组学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | Seurat, SingleR, Monocle2, Limma | 单细胞RNA测序数据 | PBC患者组和对照组(具体样本数量未明确说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | Cell Ranger单细胞分析系统 |