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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4681 - 4700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4681 | 2025-10-06 |
Hyperactivated Interferon-gamma Pathways in Perianal Fistulizing Crohn's Disease by Single-Cell and Spatial Multi-omics
2025-Jul-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193413
PMID:40608410
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研究论文 | 通过单细胞和空间多组学技术揭示肛周瘘管型克罗恩病中干扰素-γ通路的过度激活机制 | 首次结合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和空间转录组学系统解析PCD的免疫病理机制，发现致病性Th17细胞和LPS_髓系细胞驱动的IFN-γ信号过度激活是PCD的关键特征 | 样本量相对有限（PCD患者24例），需要更大规模研究验证发现 | 阐明肛周瘘管型克罗恩病的免疫病理机制并确定可干预的免疫治疗靶点 | 肛周瘘管型克罗恩病患者（24例）、无肛周病变的克罗恩病患者（10例）和特发性肛周瘘管患者（29例）的瘘管组织、瘘管开口和直肠黏膜样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 空间基因表达数据 | 63例患者（24例PCD, 10例NPCD, 29例IPF）的多个组织部位活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 质谱流式细胞术, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4682 | 2025-10-06 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Jul-03, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | 介绍REMODEL试验的设计和基线特征，该试验旨在研究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的作用机制 | 首次结合MRI评估和肾脏活检组织分析（包括单核转录组学和空间转录组学）来探索GLP-1受体激动剂的肾脏保护机制 | 样本量相对较小（总106人，活检亚组33人），观察期52周可能不足以评估长期效果 | 探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 | 2型糖尿病合并慢性肾病的成年患者 | 临床医学 | 2型糖尿病、慢性肾病 | 磁共振成像、单核转录组学、空间转录组学、组织病理学分析 | NA | 临床数据、影像数据、组织样本数据 | 106名参与者（其中33人参与肾脏活检亚组） | NA | 单核转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 4683 | 2025-10-06 |
scVDM: A Diffusion Model Integrated with Conditional VAE for Generative Single-cell Tasks
2025-Jul-03, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3585960
PMID:40608883
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研究论文 | 提出了一种结合条件VAE的扩散模型scVDM，用于单细胞数据的生成任务 | 将条件VAE与基于transformer的条件去噪器集成到潜在扩散模型中，通过自注意力机制深度挖掘潜在维度间的复杂关系 | NA | 解决单细胞RNA-seq数据中的噪声问题，实现条件数据生成、批次效应校正和药物扰动预测 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 扩散模型,条件VAE,transformer | 基因表达数据 | 五个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4684 | 2025-10-06 |
Dissecting FAP+ Cell Diversity in Pancreatic Cancer Uncovers an Interferon-Response Subtype of Cancer-Associated Fibroblasts with Tumor-Restraining Properties
2025-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3252
PMID:40215177
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析胰腺癌中FAP+间质细胞的异质性，发现具有肿瘤抑制功能的干扰素反应性癌症相关成纤维细胞亚型 | 首次发现并表征了干扰素反应性CAF亚型，证明其具有抑制肿瘤侵袭性和诱导抗肿瘤中性粒细胞表型的能力 | 研究主要基于体外共培养模型，体内验证仍需进一步深入 | 解析胰腺癌间质中FAP+细胞的异质性及其调控机制 | 胰腺导管腺癌中的FAP表达间质细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，类器官共培养模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4685 | 2025-10-06 |
NEDDylation Regulates CD8+ T-cell Metabolism and Antitumor Immunity
2025-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0127
PMID:40261130
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研究论文 | 本研究揭示了NEDDylation修饰通过调控CD8+ T细胞的代谢通路影响其抗肿瘤免疫功能 | 首次系统阐明NEDDylation在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的关键作用，并鉴定乳酸脱氢酶A等糖酵解酶为NEDD8修饰靶点 | NA | 探究NEDDylation修饰在CD8+ T细胞介导的抗肿瘤免疫应答中的调控机制 | 小鼠和人类CD8+ T细胞，包括肿瘤浸润淋巴细胞和CAR-T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，LC MS/MS蛋白质组学分析，基因敲除技术 | NA | 基因表达数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4686 | 2025-10-06 |
Combining Spatial Transcriptomics, Pseudotime, and Machine Learning Enables Discovery of Biomarkers for Prostate Cancer
2025-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0269
PMID:40293712
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学、伪时序分析和机器学习方法，发现前列腺癌的生物标志物 | 首次将空间转录组学、伪时序分析和机器学习相结合，识别可在常规临床方法中测量的可靠生物标志物 | 需要在前瞻性研究中进一步验证 | 发现前列腺癌早期诊断的生物标志物 | 前列腺癌患者和对照组的血清、前列腺组织和尿液样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 伪时序分析, 机器学习 | 机器学习预测模型 | 空间转录组数据, mRNA数据, IHC数据, 蛋白质组学数据 | 超过2000名前列腺癌患者和对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4687 | 2025-10-06 |
Single-cell omics in plant biology: mechanistic insights and applications for crop improvement
2025-Jul-02, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00074-8
PMID:40593253
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综述 | 本文综述单细胞组学技术在植物生物学中的最新进展及其在作物改良中的应用 | 系统整合单细胞转录组和表观基因组技术，揭示植物细胞异质性和基因调控网络的新机制 | 主要基于现有技术综述，缺乏原始实验数据验证 | 探讨单细胞组学技术在植物研究和作物育种中的应用前景 | 模式植物拟南芥及主要农作物和园艺植物 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4688 | 2025-10-06 |
Unveiling diagnostic biomarkers and therapeutic targets in lung adenocarcinoma using bioinformatics and experimental validation
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05227-2
PMID:40595823
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示肺腺癌的诊断生物标志物和治疗靶点 | 整合差异基因表达分析、WGCNA和机器学习方法筛选核心基因，并通过单细胞RNA测序分析基因在29种细胞亚型中的表达模式 | NA | 寻找肺腺癌的诊断标志物和治疗靶点 | 肺腺癌患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, WGCNA, 机器学习 | 随机森林, Stepglm[backward] | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4689 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of the murine limb skeleton integrating the developmental and adult stages
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05277-6
PMID:40596066
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研究论文 | 整合了小鼠肢体骨骼发育和成年阶段的单细胞转录组图谱 | 首次创建了涵盖小鼠肢体骨骼从诱导到成骨全过程的多时间点单细胞图谱，整合了10个公共数据集共133,332个细胞 | 仅聚焦于肢体骨骼系统，未涵盖全身所有骨骼区域 | 填补当前生物体全范围图谱项目中骨骼系统代表性不足的空白 | 小鼠肢体骨骼细胞及其发育前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 133,332个细胞，整合10个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4690 | 2025-10-06 |
Genotype-integrated single-cell transcriptome analysis reveals the role of DDX41 pR525H in a patient with myelodysplastic neoplasms
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06477-w
PMID:40596075
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研究论文 | 通过整合基因型的单细胞转录组分析揭示DDX41 pR525H突变在骨髓增生异常肿瘤患者中的作用机制 | 首次在携带种系和体细胞DDX41变异的MDS患者中实施整合pR525位点基因分型的单细胞RNA测序，揭示突变诱导的G2/M期细胞周期阻滞和非细胞自主性影响 | 基于单个病例报告，样本量有限，需要更多患者验证 | 阐明DDX41变异在骨髓肿瘤发生中的分子机制 | 骨髓增生异常肿瘤患者的原代造血细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常肿瘤 | 单细胞RNA测序，基因分型，TAS-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 1例MDS患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Terminator-Assisted Solid-phase cDNA amplification and sequencing (TAS-seq) |
| 4691 | 2025-10-06 |
Endothelial cells expressing CPE and vWF are involved in the Immunopathogenesis of primary biliary cholangitis
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07311-z
PMID:40596471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现表达CPE和vWF的内皮细胞亚群在原发性胆汁性胆管炎免疫发病机制中的作用 | 首次鉴定出CPE+vWF+内皮细胞新亚群，并揭示其通过APP-CD74轴与胆管细胞相互作用促进PBC发病的机制 | 研究中存在另一种未明确鉴定的内皮细胞类型，其具体特征和功能需要进一步研究 | 探究肝窦内皮细胞在原发性胆汁性胆管炎免疫发病机制中的作用 | 原发性胆汁性胆管炎患者和对照组的肝窦内皮细胞 | 单细胞组学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | Seurat, SingleR, Monocle2, Limma | 单细胞RNA测序数据 | PBC患者组和对照组（具体样本数量未明确说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | Cell Ranger单细胞分析系统 |
| 4692 | 2025-10-06 |
Automated integration of multi-slice spatial transcriptomics data in 2D and 3D using VR-Omics
2025-Jul-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03630-6
PMID:40598307
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研究论文 | 开发了用于多切片空间转录组数据自动集成分析的VR-Omics软件平台 | 首个提供端到端自动化处理多切片空间转录组数据的平台无关软件，支持2D共面和3D堆叠数据集成分析 | NA | 解决空间转录组学领域缺乏多切片数据自动集成分析工具的问题 | 小儿心脏横纹肌瘤组织样本 | 空间转录组学 | 小儿心脏横纹肌瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4693 | 2025-10-06 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-Jul-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
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研究论文 | 本研究探讨了儿童干燥综合征中SUV3表达降低对单核细胞功能的影响及其分子机制 | 首次揭示SUV3通过线粒体dsRNA介导的PKR激活导致先天性免疫功能障碍的新机制 | 研究样本量有限，主要基于体外实验模型 | 探究SUV3表达减少在儿童干燥综合征发病机制中的分子和功能影响 | 儿童干燥综合征患者的IFN富集单核细胞亚群 | 单细胞生物学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, fCLIP-qPCR, 透射电子显微镜, 体外功能分析 | 基因敲低模型 | 单细胞转录组数据, 分子相互作用数据, 显微图像 | 儿童干燥综合征患者单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4694 | 2025-10-06 |
Harnessing agent-based frameworks in CellAgentChat to unravel cell-cell interactions from single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jul-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279771.124
PMID:40316422
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研究论文 | 介绍CellAgentChat这一基于代理的模型，用于从单细胞和空间转录组数据解析细胞间相互作用 | 首次将基于代理的建模框架应用于细胞间相互作用分析，能够模拟个体细胞行为并生成动态可视化 | NA | 开发新方法以深入理解细胞间相互作用的复杂动态 | 细胞间相互作用和细胞通讯 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 基于代理的模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 八个不同的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4695 | 2025-10-06 |
Epigenetic regulation of neural stem cell aging in the mouse hippocampus by Setd8 downregulation
2025-Jul, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00455-8
PMID:40461639
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了Setd8下调通过表观遗传调控导致小鼠海马神经干细胞衰老的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，绘制了大脑衰老过程中染色质和转录组的纵向变化图谱，并确定Setd8下调是神经干细胞早期衰老的关键因素 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究表观遗传重塑与转录调控在海马神经干细胞衰老过程中的关系 | 小鼠海马神经干细胞和新生成的神经元 | 表观遗传学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 不同发育阶段的神经干细胞和神经元 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4696 | 2025-10-06 |
The rules of different B cell subtypes in colorectal cancer: friends or foes?
2025-Jul, Future oncology (London, England)
DOI:10.1080/14796694.2025.2511588
PMID:40491002
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综述 | 本文总结了结直肠癌中肿瘤浸润B细胞亚型的功能异质性及其在肿瘤微环境中的双重作用 | 基于单细胞RNA测序技术系统阐述结直肠癌中不同B细胞亚群的效应或调节特征 | 肿瘤浸润B细胞与肿瘤微环境中非免疫细胞的相互作用机制仍不明确 | 探讨不同B细胞亚型在结直肠癌肿瘤微环境中的功能角色 | 结直肠癌中的肿瘤浸润B细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4697 | 2025-10-06 |
Triggering Mechanisms of Hepatocyte Repopulation during Liver Regeneration
2025-Jul-01, Biomolecules & therapeutics
IF:3.0Q2
DOI:10.4062/biomolther.2025.035
PMID:40500106
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综述 | 本文综述了肝再生过程中肝细胞再殖的触发机制和细胞来源 | 重点关注肝细胞再殖的细胞和分子机制，整合了谱系追踪和空间转录组学等最新技术的研究发现 | 再生肝细胞的确切来源仍存在争议，不同损伤条件下的细胞贡献机制尚未完全阐明 | 阐明肝再生过程中肝细胞再殖的触发机制和细胞来源 | 肝细胞、胆管上皮细胞、肝祖细胞 | 肝脏再生生物学 | 肝损伤 | 谱系追踪, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4698 | 2025-10-06 |
An Efficient Organoid Cutting Method for Long-Term Culture and High-Throughput Analyses
2025-Jul, Tissue engineering and regenerative medicine
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s13770-025-00731-y
PMID:40522442
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研究论文 | 开发了一种高效类器官切割方法以改善长期培养并实现高通量分析 | 利用3D打印技术制造具有刀片导向装置的类器官切割夹具，实现无菌条件下快速均匀切割，并开发模具方法创建密集类器官阵列 | 未明确说明方法在不同类型类器官中的普适性验证范围 | 解决类器官长期培养中的缺氧和营养限制问题，提高培养效率和分析通量 | 人多能干细胞衍生的类器官 | 生物医学工程 | NA | 3D打印、类器官培养、冷冻切片 | NA | 图像、分子标记表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4699 | 2025-10-06 |
Rhaponticin inhibits the proliferation, migration, and invasion of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) cells through modulation of the IL6/STAT3 signaling pathway
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03019-8
PMID:40591033
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研究论文 | 本研究探讨了土大黄苷通过调控IL6/STAT3信号通路抑制头颈部鳞状细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭 | 首次揭示土大黄苷在头颈部鳞状细胞癌中的作用机制，通过多组学方法鉴定IL-6为关键靶点 | 研究主要基于细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探究土大黄苷抑制头颈部鳞状细胞癌侵袭和转移的具体分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系（CAL 27和SCC-9） | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 网络药理学, 分子对接, 生物信息学分析, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库头颈部鳞状细胞癌样本, GEO数据库单细胞RNA测序数据, 两种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4700 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis and validation of NT5DC2: emphasizing its prognostic significance and immunological role in TNBC
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02995-1
PMID:40591089
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研究论文 | 通过泛癌分析和体外实验验证NT5DC2在多种癌症特别是三阴性乳腺癌中的预后意义和免疫学作用 | 首次系统评估NT5DC2在泛癌中的表达模式，并深入揭示其在TNBC中通过MIF信号通路调节免疫抑制微环境的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，缺乏体内动物模型验证 | 阐明NT5DC2在多种癌症中的作用，并确认其在三阴性乳腺癌中的致癌意义 | 多种癌症类型，特别关注三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因表达谱分析，免疫浸润分析，基因集富集分析，体外实验 | ESTIMATE算法，CIBERSORT算法，KEGG通路富集分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个数据库中的多种癌症样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |