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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4681 - 4700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4681 | 2025-10-06 |
Unveiling diagnostic biomarkers and therapeutic targets in lung adenocarcinoma using bioinformatics and experimental validation
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05227-2
PMID:40595823
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示肺腺癌的诊断生物标志物和治疗靶点 | 整合差异基因表达分析、WGCNA和机器学习方法筛选核心基因，并通过单细胞RNA测序分析基因在29种细胞亚型中的表达模式 | NA | 寻找肺腺癌的诊断标志物和治疗靶点 | 肺腺癌患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, WGCNA, 机器学习 | 随机森林, Stepglm[backward] | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4682 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of the murine limb skeleton integrating the developmental and adult stages
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05277-6
PMID:40596066
|
研究论文 | 整合了小鼠肢体骨骼发育和成年阶段的单细胞转录组图谱 | 首次创建了涵盖小鼠肢体骨骼从诱导到成骨全过程的多时间点单细胞图谱，整合了10个公共数据集共133,332个细胞 | 仅聚焦于肢体骨骼系统，未涵盖全身所有骨骼区域 | 填补当前生物体全范围图谱项目中骨骼系统代表性不足的空白 | 小鼠肢体骨骼细胞及其发育前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 133,332个细胞，整合10个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4683 | 2025-10-06 |
Genotype-integrated single-cell transcriptome analysis reveals the role of DDX41 pR525H in a patient with myelodysplastic neoplasms
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06477-w
PMID:40596075
|
研究论文 | 通过整合基因型的单细胞转录组分析揭示DDX41 pR525H突变在骨髓增生异常肿瘤患者中的作用机制 | 首次在携带种系和体细胞DDX41变异的MDS患者中实施整合pR525位点基因分型的单细胞RNA测序，揭示突变诱导的G2/M期细胞周期阻滞和非细胞自主性影响 | 基于单个病例报告，样本量有限，需要更多患者验证 | 阐明DDX41变异在骨髓肿瘤发生中的分子机制 | 骨髓增生异常肿瘤患者的原代造血细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常肿瘤 | 单细胞RNA测序，基因分型，TAS-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 1例MDS患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Terminator-Assisted Solid-phase cDNA amplification and sequencing (TAS-seq) |
| 4684 | 2025-10-06 |
Endothelial cells expressing CPE and vWF are involved in the Immunopathogenesis of primary biliary cholangitis
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07311-z
PMID:40596471
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现表达CPE和vWF的内皮细胞亚群在原发性胆汁性胆管炎免疫发病机制中的作用 | 首次鉴定出CPE+vWF+内皮细胞新亚群，并揭示其通过APP-CD74轴与胆管细胞相互作用促进PBC发病的机制 | 研究中存在另一种未明确鉴定的内皮细胞类型，其具体特征和功能需要进一步研究 | 探究肝窦内皮细胞在原发性胆汁性胆管炎免疫发病机制中的作用 | 原发性胆汁性胆管炎患者和对照组的肝窦内皮细胞 | 单细胞组学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | Seurat, SingleR, Monocle2, Limma | 单细胞RNA测序数据 | PBC患者组和对照组（具体样本数量未明确说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | Cell Ranger单细胞分析系统 |
| 4685 | 2025-10-06 |
Automated integration of multi-slice spatial transcriptomics data in 2D and 3D using VR-Omics
2025-Jul-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03630-6
PMID:40598307
|
研究论文 | 开发了用于多切片空间转录组数据自动集成分析的VR-Omics软件平台 | 首个提供端到端自动化处理多切片空间转录组数据的平台无关软件，支持2D共面和3D堆叠数据集成分析 | NA | 解决空间转录组学领域缺乏多切片数据自动集成分析工具的问题 | 小儿心脏横纹肌瘤组织样本 | 空间转录组学 | 小儿心脏横纹肌瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4686 | 2025-10-06 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-Jul-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
|
研究论文 | 本研究探讨了儿童干燥综合征中SUV3表达降低对单核细胞功能的影响及其分子机制 | 首次揭示SUV3通过线粒体dsRNA介导的PKR激活导致先天性免疫功能障碍的新机制 | 研究样本量有限，主要基于体外实验模型 | 探究SUV3表达减少在儿童干燥综合征发病机制中的分子和功能影响 | 儿童干燥综合征患者的IFN富集单核细胞亚群 | 单细胞生物学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, fCLIP-qPCR, 透射电子显微镜, 体外功能分析 | 基因敲低模型 | 单细胞转录组数据, 分子相互作用数据, 显微图像 | 儿童干燥综合征患者单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4687 | 2025-10-06 |
Harnessing agent-based frameworks in CellAgentChat to unravel cell-cell interactions from single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jul-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279771.124
PMID:40316422
|
研究论文 | 介绍CellAgentChat这一基于代理的模型，用于从单细胞和空间转录组数据解析细胞间相互作用 | 首次将基于代理的建模框架应用于细胞间相互作用分析，能够模拟个体细胞行为并生成动态可视化 | NA | 开发新方法以深入理解细胞间相互作用的复杂动态 | 细胞间相互作用和细胞通讯 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 基于代理的模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 八个不同的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4688 | 2025-10-06 |
Epigenetic regulation of neural stem cell aging in the mouse hippocampus by Setd8 downregulation
2025-Jul, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00455-8
PMID:40461639
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了Setd8下调通过表观遗传调控导致小鼠海马神经干细胞衰老的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，绘制了大脑衰老过程中染色质和转录组的纵向变化图谱，并确定Setd8下调是神经干细胞早期衰老的关键因素 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究表观遗传重塑与转录调控在海马神经干细胞衰老过程中的关系 | 小鼠海马神经干细胞和新生成的神经元 | 表观遗传学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 不同发育阶段的神经干细胞和神经元 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4689 | 2025-10-06 |
The rules of different B cell subtypes in colorectal cancer: friends or foes?
2025-Jul, Future oncology (London, England)
DOI:10.1080/14796694.2025.2511588
PMID:40491002
|
综述 | 本文总结了结直肠癌中肿瘤浸润B细胞亚型的功能异质性及其在肿瘤微环境中的双重作用 | 基于单细胞RNA测序技术系统阐述结直肠癌中不同B细胞亚群的效应或调节特征 | 肿瘤浸润B细胞与肿瘤微环境中非免疫细胞的相互作用机制仍不明确 | 探讨不同B细胞亚型在结直肠癌肿瘤微环境中的功能角色 | 结直肠癌中的肿瘤浸润B细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4690 | 2025-10-06 |
Triggering Mechanisms of Hepatocyte Repopulation during Liver Regeneration
2025-Jul-01, Biomolecules & therapeutics
IF:3.0Q2
DOI:10.4062/biomolther.2025.035
PMID:40500106
|
综述 | 本文综述了肝再生过程中肝细胞再殖的触发机制和细胞来源 | 重点关注肝细胞再殖的细胞和分子机制，整合了谱系追踪和空间转录组学等最新技术的研究发现 | 再生肝细胞的确切来源仍存在争议，不同损伤条件下的细胞贡献机制尚未完全阐明 | 阐明肝再生过程中肝细胞再殖的触发机制和细胞来源 | 肝细胞、胆管上皮细胞、肝祖细胞 | 肝脏再生生物学 | 肝损伤 | 谱系追踪, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4691 | 2025-10-06 |
An Efficient Organoid Cutting Method for Long-Term Culture and High-Throughput Analyses
2025-Jul, Tissue engineering and regenerative medicine
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s13770-025-00731-y
PMID:40522442
|
研究论文 | 开发了一种高效类器官切割方法以改善长期培养并实现高通量分析 | 利用3D打印技术制造具有刀片导向装置的类器官切割夹具，实现无菌条件下快速均匀切割，并开发模具方法创建密集类器官阵列 | 未明确说明方法在不同类型类器官中的普适性验证范围 | 解决类器官长期培养中的缺氧和营养限制问题，提高培养效率和分析通量 | 人多能干细胞衍生的类器官 | 生物医学工程 | NA | 3D打印、类器官培养、冷冻切片 | NA | 图像、分子标记表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4692 | 2025-10-06 |
Rhaponticin inhibits the proliferation, migration, and invasion of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) cells through modulation of the IL6/STAT3 signaling pathway
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03019-8
PMID:40591033
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研究论文 | 本研究探讨了土大黄苷通过调控IL6/STAT3信号通路抑制头颈部鳞状细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭 | 首次揭示土大黄苷在头颈部鳞状细胞癌中的作用机制，通过多组学方法鉴定IL-6为关键靶点 | 研究主要基于细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探究土大黄苷抑制头颈部鳞状细胞癌侵袭和转移的具体分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系（CAL 27和SCC-9） | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 网络药理学, 分子对接, 生物信息学分析, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库头颈部鳞状细胞癌样本, GEO数据库单细胞RNA测序数据, 两种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4693 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis and validation of NT5DC2: emphasizing its prognostic significance and immunological role in TNBC
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02995-1
PMID:40591089
|
研究论文 | 通过泛癌分析和体外实验验证NT5DC2在多种癌症特别是三阴性乳腺癌中的预后意义和免疫学作用 | 首次系统评估NT5DC2在泛癌中的表达模式，并深入揭示其在TNBC中通过MIF信号通路调节免疫抑制微环境的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，缺乏体内动物模型验证 | 阐明NT5DC2在多种癌症中的作用，并确认其在三阴性乳腺癌中的致癌意义 | 多种癌症类型，特别关注三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因表达谱分析，免疫浸润分析，基因集富集分析，体外实验 | ESTIMATE算法，CIBERSORT算法，KEGG通路富集分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个数据库中的多种癌症样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4694 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis establishes a cancer associated fibroblast-related signature for predicting prognosis and therapeutic responses in neuroblastoma
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03023-y
PMID:40591170
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，建立了神经母细胞瘤中癌症相关成纤维细胞的预后预测模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序构建CAF相关预后特征，为神经母细胞瘤提供新的预后预测工具和免疫治疗策略基因组证据 | 样本量相对有限（8个单细胞样本），需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建癌症相关成纤维细胞相关预后模型并评估神经母细胞瘤患者的免疫状态 | 神经母细胞瘤患者样本 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，免疫组化 | LASSO Cox回归模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | 8个单细胞RNA测序样本，多个公共数据库的bulk RNA测序数据 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4695 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell sequencing analysis, bioinformatics analysis, and Mendelian randomization analysis to explore FABP4 prediction of prognosis and immune microenvironment in patients with lung squamous cell carcinoma
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02774-y
PMID:40591173
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序分析、生物信息学分析和孟德尔随机化分析，探索FABP4在肺鳞癌预后和免疫微环境中的预测作用 | 首次结合单细胞测序分析、生物信息学分析和孟德尔随机化分析，识别FABP4作为肺鳞癌预后和免疫微环境的关键预测分子 | NA | 寻找能够预测肺鳞癌发病、患者预后及肿瘤免疫微环境的风险因素 | 肺鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞测序分析, 生物信息学分析, 孟德尔随机化分析 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4696 | 2025-10-06 |
Klf5-adjacent super-enhancer functions as a 3D genome structure-dependent transcriptional driver to safeguard ESC identity
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60389-x
PMID:40592854
|
研究论文 | 本研究揭示了Klf5邻近超级增强子通过3D基因组结构依赖的转录调控机制维持胚胎干细胞身份 | 首次发现K5aSE通过染色质环化激活四个远端基因，并证明CTCF介导的拓扑关联域对维持该超级增强子功能至关重要 | 研究主要聚焦于Klf5邻近超级增强子，其他超级增强子的类似机制仍需进一步验证 | 探索超级增强子与主转录因子在胚胎干细胞命运决定中的调控机制 | 小鼠胚胎干细胞和拟胚体 | 表观遗传学 | NA | 多组学整合分析（H3K27ac、Hi-C、scRNA-seq）、CRISPRa、3D基因组筛选 | NA | 表观基因组数据、三维基因组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、染色质构象捕获 | NA | NA |
| 4697 | 2025-10-06 |
Identification of pyroptosis related genes and subtypes in atherosclerosis using multiomic and single cell analysis
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-04398-2
PMID:40592922
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研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞分析识别动脉粥样硬化中焦亡相关基因并定义疾病亚型 | 首次整合转录组学、单细胞RNA测序和机器学习构建多组学框架，发现TREM2在巨噬细胞脂质积累和焦亡中的双重作用 | NA | 阐明焦亡在动脉粥样硬化进展中的分子机制和治疗潜力 | 动脉粥样硬化患者样本、体外和体内模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组学, 单细胞RNA测序, 机器学习 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4698 | 2025-10-06 |
Integrated eQTL-pQTL Mendelian randomization and single-cell sequencing reveal therapeutic targets in ovarian clear cell cancer
2025-Jul-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03043-8
PMID:40593373
|
研究论文 | 通过整合eQTL-pQTL孟德尔随机化和单细胞测序技术，识别卵巢透明细胞癌的潜在治疗靶点 | 首次结合eQTL-pQTL孟德尔随机化与单细胞测序分析卵巢透明细胞癌，发现PPP1R14A和PTGS2两个潜在治疗靶点 | 需要进一步研究验证这些发现并阐明潜在机制 | 寻找卵巢透明细胞癌的新治疗靶点 | 卵巢透明细胞癌（OCCC）患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序，孟德尔随机化，共定位分析，药物筛选，分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据，单细胞测序数据 | eQTLGen联盟和deCODE的大规模GWAS队列数据，GEO数据库单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，全基因组关联分析 | NA | NA |
| 4699 | 2025-10-06 |
Spatially resolved C1QC+ macrophage-CD4+ T cell niche in colorectal cancer microenvironment: implications for immunotherapy response
2025-Jul-01, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00811-2
PMID:40593467
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了结直肠癌微环境中C1QC+巨噬细胞与CD4+ T细胞的空间共定位对免疫治疗反应的影响 | 首次构建了包含314,774个细胞的空间免疫图谱，发现C1QC+组织驻留巨噬细胞与CD4+ T细胞的空间共定位是免疫治疗响应的关键特征 | 样本量相对有限（空间转录组仅9例），且主要关注转移性结直肠癌患者 | 阐明结直肠癌空间肿瘤微环境特征及其与免疫治疗反应的关系 | 接受免疫治疗的转移性结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间多组学,成像质谱流式,空间蛋白质组学,空间转录组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,批量蛋白质组学 | NA | 空间多组学数据,单细胞数据,批量测序数据 | 成像质谱流式50例,空间蛋白质组学50例,空间转录组学9例 | NA | 空间多组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4700 | 2025-10-06 |
Production of live monkeys and their genetically matched embryonic stem cells from single embryos
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60694-5
PMID:40593544
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研究论文 | 本研究通过胚胎分割技术成功培育出活体猴及其基因匹配的自体胚胎干细胞 | 首次通过胚胎分割同时获得活体猴子和基因匹配的自体胚胎干细胞，并创建了基因匹配的aESCs、iPSCs和ntESCs组合 | 研究样本数量有限，仅从三个猴子胚胎中成功获得活体猴和干细胞 | 开发基因匹配的干细胞用于再生医学，解决免疫排斥问题 | 非人灵长类动物（猴子）胚胎和人类分割胚胎 | 再生医学 | NA | 胚胎分割技术，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个猴子胚胎，1个人类分割胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |