单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4661 - 4680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4661 | 2025-10-06 |
Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement
2025-May, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-025-01581-3
PMID:39893595
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析正畸牙齿移动过程中牙周韧带对机械刺激的响应机制 | 首次在单细胞水平揭示Mkx转录因子在牙周韧带机械传导中的特异性表达模式和保护作用 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明机械刺激下牙周韧带的基因表达变化和细胞群体动态 | 野生型大鼠牙周韧带细胞和人类牙周韧带细胞 | 单细胞基因组学 | 口腔正畸 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 大鼠PDL在0天、1周和2周时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4662 | 2025-10-06 |
The impact of ambient contamination on demultiplexing methods for single-nucleus multiome experiments
2025-Feb-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5977005/v1
PMID:39989953
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研究论文 | 本研究评估了基因型分型解复用方法在单核多组学实验中对环境RNA/DNA污染的敏感性 | 开发了ambisim基因型感知读取水平模拟器，能够灵活控制环境分子比例并生成真实的联合snRNA/snATAC数据 | 研究主要基于模拟数据，虽然验证了两个真实数据集，但样本数量有限 | 评估不同解复用方法在单核多组学测序实验中对环境污染的鲁棒性 | 单核RNA-seq和ATAC-seq数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单核多组学测序，基因型分型解复用 | NA | 单细胞多组学测序数据 | 两个联合snRNA/snATAC数据集 | NA | 单核多组学，单核RNA-seq，单核ATAC-seq | NA | NA |
| 4663 | 2025-10-06 |
The impact of ambient contamination on demultiplexing methods for single-nucleus multiome experiments
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.06.636969
PMID:39975005
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研究论文 | 本研究评估了基因分型解复用方法在单核多组学实验中对环境RNA/DNA污染的敏感性 | 开发了ambisim基因分型感知读取水平模拟器，可灵活控制环境分子比例并生成真实的联合snRNA/snATAC数据 | 方法在不同数据集和模式间的一致性存在差异，需要改进对环境材料的建模 | 评估基因分型解复用方法在单核多组学实验中的性能表现 | 单核RNA-seq和ATAC-seq数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单核多组学测序，基因分型解复用 | ambisim模拟器 | 单核RNA-seq和ATAC-seq测序数据 | 两个联合snRNA/snATAC数据集 | NA | 单核多组学测序 | NA | NA |
| 4664 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers related to epithelial-mesenchymal transition and anoikis in hepatocellular carcinoma using transcriptomics and single-cell sequencing
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1600546
PMID:40612108
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术鉴定与肝细胞癌上皮-间质转化和失巢凋亡相关的预后生物标志物 | 首次整合EMT相关基因和失巢凋亡相关基因，结合单细胞RNA测序技术识别肝细胞癌的新型生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索EMT相关基因和失巢凋亡相关基因在肝细胞癌中的作用机制并识别预后生物标志物 | 肝细胞癌患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，WGCNA，RT-qPCR | 风险模型，列线图 | 转录组数据，单细胞测序数据 | TCGA-HCC，ICGC-LIPI-JP和GSE149614数据集中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4665 | 2025-10-06 |
Recent advances in biomarker detection of oral squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1597086
PMID:40612351
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综述 | 全面探讨口腔鳞状细胞癌生物标志物检测技术的最新进展与应用前景 | 系统整合单细胞测序、空间转录组学、纳米孔测序、生物传感技术和人工智能等新兴技术在口腔癌生物标志物检测中的创新应用 | 存在临床验证空白、实施成本高和分析复杂性等可扩展性障碍 | 评估新兴检测技术在口腔鳞状细胞癌早期诊断中的应用潜力 | 口腔鳞状细胞癌生物标志物检测技术 | 数字病理 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 纳米孔测序, 生物传感技术, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4666 | 2025-10-06 |
A novel, rapid, and practical prognostic model for sepsis patients based on dysregulated immune cell lactylation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1625311
PMID:40612938
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研究论文 | 本研究基于免疫细胞乳酸化修饰开发了一种新型脓毒症预后模型 | 首次系统表征脓毒症乳酸化动态变化模式，并基于乳酸化相关枢纽基因构建预后预测模型 | 单中心前瞻性队列样本量有限(N=51)，需要更大规模多中心验证 | 探索脓毒症进程中乳酸化动态变化并开发基于乳酸化的预后预测模型 | 脓毒症患者和THP-1单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，机器学习，伪时间轨迹重建，体外实验 | 机器学习算法，预后预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 外部转录组数据集和51例前瞻性单中心脓毒症患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4667 | 2025-10-06 |
Applications and Prospects of Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Cervical Cancer
2025, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/1532745
PMID:40612935
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综述 | 总结单细胞RNA测序和空间转录组学在宫颈癌研究中的应用进展与前景 | 整合两种新兴技术（scRNA-seq和ST）在宫颈癌研究中的协同应用，弥补各自技术局限性 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨scRNA-seq和ST技术在宫颈癌研究中的应用价值和发展前景 | 宫颈癌肿瘤异质性、肿瘤微环境、进化轨迹和治疗靶点 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4668 | 2025-10-06 |
Bridging aging, immunity, and atherosclerosis: novel insights into senescence-related genes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557266
PMID:40612944
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探索衰老相关基因在动脉粥样硬化中的作用机制 | 首次系统识别了89个关键衰老相关基因，并发现PDLIM1、PARP14和SEL1L3作为动脉粥样硬化诊断生物标志物，揭示了它们在巨噬细胞分化中的阶段特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探索衰老、免疫与动脉粥样硬化之间的关联，寻找可靠的诊断生物标志物 | 人类组织样本和ApoE-/-动脉粥样硬化小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫荧光 | LASSO，SVM，RF | 基因表达数据，单细胞数据 | 来自GEO数据库的人类组织数据 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4669 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of human skin implicates APOE pro-inflammatory signaling in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591944
PMID:40612951
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤细胞图谱，揭示APOE信号通路在糖尿病足溃疡中的促炎作用 | 首次在糖尿病足溃疡中发现过度表达APOE的独特成纤维细胞亚群，并证明其通过FGF信号通路和药物代谢-细胞色素P450途径促进纤维化和炎症 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验证实 | 探究糖尿病足溃疡的发病机制和细胞分子基础 | 人类皮肤组织样本，特别是糖尿病足溃疡患者的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，体外实验 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量的人类皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4670 | 2025-10-06 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-04-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序在Coffin-Siris综合征患者中发现了一个新的SOX4基因从头突变，并探索了其在综合征性牙齿缺失中的作用机制 | 首次报道SOX4错义突变导致综合征性牙齿缺失，通过单细胞RNA测序和WGCNA分析验证了SOX4在牙齿发育中的关键作用 | 研究仅基于单个患者病例，样本量有限，需要更多病例验证 | 识别导致综合征性牙齿缺失的致病突变并探索其调控机制 | Coffin-Siris综合征患者和小鼠牙齿发育模型 | 遗传学 | Coffin-Siris综合征 | 全外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, WGCNA分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 1名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4671 | 2025-10-06 |
Microglial intervention in ischemic stroke: Roles and intervention strategies
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01166
PMID:39995094
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综述 | 探讨小胶质细胞在缺血性脑卒中中的双重作用及潜在干预策略 | 系统阐述小胶质细胞动态极化状态的关键调控通路，并提出结合传统药物与单细胞测序等新兴技术的治疗策略 | NA | 研究小胶质细胞在缺血性脑卒中中的作用机制和干预方法 | 小胶质细胞及其在脑卒中中的功能状态 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq,spatial transcriptomics | NA | NA |
| 4672 | 2025-10-06 |
Blood-brain barrier disruption and neuroinflammation in the hippocampus of a cardiac arrest porcine model: Single-cell RNA sequencing analysis
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01269
PMID:40146000
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析心脏骤停猪模型海马体中的血脑屏障破坏和神经炎症机制 | 首次在猪心脏骤停模型中应用单细胞转录组学，发现了新的小胶质细胞亚群及其与中性粒细胞的通讯机制 | 研究仅观察了6小时和24小时两个时间点，未能覆盖更长的恢复期 | 探索心脏骤停后脑损伤的细胞和分子机制 | 心室颤动诱导心脏骤停的猪模型海马体组织 | 单细胞转录组学 | 心脏骤停后脑损伤 | 单细胞RNA测序，Western blotting，qRT-PCR，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 心脏骤停猪模型和假手术对照猪的海马体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4673 | 2025-10-06 |
A single-cell landscape of the regenerating spinal cord of zebrafish
2026-Feb-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01163
PMID:40326988
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼脊髓损伤后再生过程中的细胞动态变化和分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘斑马鱼脊髓再生的细胞景观，发现神经元亚群持续激活轴突再生相关基因，同时抑制生长锥塌陷分子信号 | 研究主要关注分子和细胞层面，功能验证实验相对有限 | 探索斑马鱼脊髓损伤后的再生机制 | 斑马鱼脊髓损伤模型中的不同细胞类型 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同脊髓损伤阶段的斑马鱼样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4674 | 2025-10-06 |
Uncovering common transcriptional features shared by mature peripheral blood PMN-MDSCs and tumor-infiltrating neutrophils in humans
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2521396
PMID:40590753
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类外周血成熟PMN-MDSCs与肿瘤浸润中性粒细胞共享转录特征 | 首次在单细胞水平发现循环mPMN-MDSCs与肿瘤相关中性粒细胞共享具有免疫抑制和促肿瘤特征的转录组细胞簇 | 细胞簇命名较为随意，需进一步功能验证确认其生物学意义 | 探究循环成熟PMN-MDSCs与肿瘤浸润中性粒细胞的转录组相似性 | 非小细胞肺癌患者、G-CSF治疗供体的循环mPMN-MDSCs及人类肿瘤相关中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌患者和G-CSF治疗供体的mPMN-MDSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4675 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of the whole colony of Botrylloides diegensis: insights into tissue specialization and blastogenesis
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204265
PMID:40406997
|
研究论文 | 通过对Botrylloides diegensis整个群体进行单细胞转录组测序，解析细胞异质性并鉴定细胞和组织标记物 | 首次对B. diegensis整个群体进行单细胞转录组分析，识别了29个主要细胞簇并揭示了胃上皮等组织的区域特异性 | NA | 解析B. diegensis群体的细胞异质性和组织特异性 | Botrylloides diegensis群体的所有组成部分，包括个体、芽体和血管外衣 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 一个完整的B. diegensis群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4676 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape of immunological responses in patients with juvenile idiopathic arthritis
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101577
PMID:40605976
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示幼年特发性关节炎患者免疫细胞的异质性和功能变化 | 首次在JIA患者中系统绘制免疫细胞单细胞图谱，发现sJIA患者特有的干扰素反应异常和MIF-CXCR7/CD44配体-受体对 | 样本量有限（14例患者和4例健康对照），未包含所有JIA亚型 | 解析幼年特发性关节炎患者免疫细胞的转录组特征和功能变化 | 幼年特发性关节炎患者和健康个体的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析，细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 14例JIA患者和4例健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4677 | 2025-10-06 |
Blood and urine-based biomarkers in prostate cancer: Current advances, clinical applications, and future directions
2025-Sep, The journal of liquid biopsy
DOI:10.1016/j.jlb.2025.100305
PMID:40606769
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综述 | 全面概述前列腺癌诊断、预后和预测生物标志物的最新进展、临床应用及未来发展方向 | 整合了液体活检、单细胞组学、人工智能模型等新兴技术在前列腺癌生物标志物研究中的应用 | NA | 总结前列腺癌生物标志物的研究现状并展望未来发展方向 | 前列腺癌患者 | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检、机器学习 | 人工智能驱动模型 | 血液样本、尿液样本、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检 | NA | NA |
| 4678 | 2025-10-06 |
Scalable inference of transcriptional variability with BASiCS
2025-Aug-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2025.112157
PMID:40479909
|
研究论文 | 本文扩展了BASiCS单细胞RNA测序数据分析方法，提出了一种可扩展的贝叶斯推断方案 | 在BASiCS模型中引入了分治推断方案，实现了大规模单细胞RNA测序数据的可扩展贝叶斯推断 | 未明确说明具体数据集规模上限和计算资源需求 | 开发可扩展的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4679 | 2025-10-06 |
Cellular Landscape of Synovial Chondromatosis Synovium Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500034RR
PMID:40600952
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示滑膜软骨瘤病滑膜的细胞景观 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘滑膜软骨瘤病的细胞异质性和细胞状态改变，发现特异性成纤维细胞亚群扩增和巨噬细胞表型转变 | 样本量相对有限，功能验证实验尚未完全开展 | 解析滑膜软骨瘤病的细胞基础 | 健康个体和滑膜软骨瘤病患者的滑膜组织 | 单细胞组学 | 滑膜软骨瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和SC患者的滑膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4680 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of the decidua unveils the mechanism of anti-inflammatory exosomes for chorioamnionitis in nonhuman primates
2025-Jul-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp0467
PMID:40601753
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示携带srIκB的外泌体在非人 primates 绒毛膜羊膜炎模型中的抗炎机制 | 首次在非人灵长类动物妊娠模型中证明工程化外泌体通过抑制NF-κB信号通路治疗绒毛膜羊膜炎的机制 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索携带srIκB的外泌体对绒毛膜羊膜炎的治疗潜力及作用机制 | 妊娠期非人灵长类动物的蜕膜组织和绒毛膜蜕膜组织 | 单细胞分析 | 绒毛膜羊膜炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |