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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4621 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the expansion and diversity of T cell subsets in the bone marrow microenvironment of chronic myeloid leukemia
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101626
PMID:40612663
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示慢性髓系白血病骨髓微环境中T细胞亚群的扩增和多样性变化 | 首次在单细胞水平系统解析CML患者骨髓T细胞图谱,发现CD8终末效应T细胞的独特特征及其与微环境细胞的相互作用 | 样本量有限,未涉及治疗前后动态变化分析 | 解析慢性髓系白血病骨髓免疫微环境中T细胞的改变特征 | 慢性髓系白血病患者的骨髓T细胞 | 单细胞组学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR-seq | NA | NA |
4622 | 2025-10-06 |
Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology
2025-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70220
PMID:40398874
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综述 | 探讨单细胞和空间组学技术在植物生物学中的潜力和应用 | 系统总结植物生物学中单细胞和空间组学技术的创新应用,并指出多组学、谱系追踪等新兴技术的未开发潜力 | 存在植物特异性技术障碍(如细胞壁复杂性、抗体资源有限)和资源可用性限制 | 推动单细胞和空间组学技术在植物研究中的应用与发展 | 植物生物学研究,重点关注模型植物物种 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据、空间分布数据 | 多个模型植物物种 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
4623 | 2025-10-06 |
Identification of novel macrophages and bone morphogenetic protein signals causing ectopic calcification and impairing muscle regeneration
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112841
PMID:40612505
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研究论文 | 本研究通过多种巨噬细胞耗竭方法发现F4/80(+)Csf1r(-)巨噬细胞和BMP信号在异位钙化中的关键作用 | 首次鉴定出F4/80(+)Csf1r(-)巨噬细胞亚群在异位钙化中的特异性增加,并揭示内皮-间质转化(EndoMT)是异位钙化的关键贡献者 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究异位钙化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肌肉组织中的巨噬细胞和间质祖细胞 | 分子生物学 | 肌肉疾病 | 单细胞测序、谱系追踪、巨噬细胞耗竭 | NA | 单细胞测序数据、组织学数据 | 使用notexin和BaCl注射的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4624 | 2025-07-06 |
Combining spatial transcriptomics and AI to enhance brain tumour diagnosis
2025-Jul-04, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-025-00851-6
PMID:40615732
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4625 | 2025-10-06 |
N6-methyladenosine-mediated upregulation of MANF promotes ER stress resistance in renal cell carcinoma
2025-Jul-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07798-4
PMID:40603319
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研究论文 | 本研究揭示了m6A修饰通过上调MANF促进肾细胞癌内质网应激抵抗的新机制 | 首次发现m6A去甲基化酶ALKBH5通过降低MANF mRNA的m6A修饰,减少RNA降解并增加MANF蛋白表达,从而增强肾细胞癌的内质网应激抵抗能力 | NA | 探索肾细胞癌治疗抵抗的新机制和潜在治疗策略 | 肾细胞癌及其前体细胞近端小管细胞 | 癌症生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4626 | 2025-10-06 |
Gasdermin D aggravates a mouse model of radiation-induced liver disease by promoting chemokine secretion and neutrophil recruitment
2025-Jul-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61397-7
PMID:40603284
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研究论文 | 本研究揭示了Gasdermin D在辐射诱导肝病中通过促进趋化因子分泌和中性粒细胞募集加重疾病进程的机制 | 首次发现GSDMD在辐射诱导肝病中的关键作用,阐明其通过STAT5A-CXCL1轴招募中性粒细胞的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究GSDMD在辐射诱导肝病发病机制中的作用 | 小鼠模型和细胞模型 | 分子病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞分选 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞图像数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4627 | 2025-10-06 |
AKR1C3 enhances radioresistance in esophageal adenocarcinoma via inhibiting ferroptosis through suppressing TRIM21-mediated ubiquitination of HSPA5
2025-Jul-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07773-z
PMID:40603306
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研究论文 | 本研究揭示了AKR1C3通过抑制铁死亡增强食管腺癌放疗抵抗的新机制 | 首次发现AKR1C3通过结合HSPA5并抑制TRIM21介导的泛素化降解来稳定GPX4,从而抑制铁死亡并增强放疗抵抗 | 研究主要基于体外模型和患者来源类器官,需要进一步体内验证 | 探索食管腺癌放疗抵抗的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 食管腺癌细胞和患者来源类器官 | 癌症生物学 | 食管癌 | RNA-seq, scRNA-seq, C11-Bodipy染色, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 脂质ROS水平数据, 超微结构图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4628 | 2025-10-06 |
scICE: enhancing clustering reliability and efficiency of scRNA-seq data with multi-cluster label consistency evaluation
2025-Jul-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60702-8
PMID:40603842
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研究论文 | 开发了一种名为scICE的单细胞RNA测序数据聚类一致性评估方法,显著提高了聚类分析的可靠性和效率 | 提出了多聚类标签一致性评估方法,相比传统共识聚类方法速度提升高达30倍,并能有效识别一致聚类结果 | 未明确说明方法在超大规模数据集(如超过10万个细胞)上的性能表现 | 提高单细胞RNA测序数据聚类分析的可靠性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 单细胞基因表达数据 | 48个真实和模拟单细胞RNA测序数据集,部分包含超过10,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4629 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing to identify an Immunogenic cell death related prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08602-1
PMID:40604056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在肝内胆管癌中鉴定免疫原性细胞死亡相关预后标志物 | 首次在肝内胆管癌中基于单细胞RNA测序数据建立免疫原性细胞死亡相关基因的预后特征 | 样本量相对有限,仅包含8名患者的单细胞数据 | 探索免疫原性细胞死亡相关基因对肝内胆管癌进展和患者预后的影响 | 肝内胆管癌患者组织和正常组织 | 单细胞转录组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP, CytoTRACE, Monocle2, CellChat | 单细胞转录组数据 | 8名肝内胆管癌患者的30,485个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4630 | 2025-10-06 |
Machine learning-based integration identifies plasma cells-related gene signature ST6GAL1 in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jul-02, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-025-03696-9
PMID:40604645
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法构建了浆细胞相关基因标志物,并鉴定ST6GAL1作为特发性肺纤维化的潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序结合机器学习方法系统筛选浆细胞相关基因,构建了具有预后价值的基因标志物 | 研究结果需要在更大样本中验证,且ST6GAL1作为治疗靶点的有效性需进一步实验证实 | 系统探索与特发性肺纤维化预后相关的浆细胞相关基因 | 特发性肺纤维化患者和博来霉素损伤小鼠模型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 网络药理学分析 | 机器学习集成方法 | RNA测序数据, 微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
4631 | 2025-10-06 |
Association between periodontitis and blood lipid levels: a cross-sectional study
2025-Jul-02, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-06341-3
PMID:40604728
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研究论文 | 本研究通过横断面调查和单细胞RNA测序分析探讨了血脂水平与牙周炎之间的关联及其细胞分子机制 | 首次结合大规模人群调查和单细胞RNA测序技术揭示肥大细胞通过脂质代谢和炎症信号通路调控成纤维细胞活动的机制 | 横断面研究设计无法确定因果关系,研究结果需要进一步的前瞻性研究验证 | 研究血脂水平与牙周炎的相关性及其潜在的细胞分子机制 | 来自2009-2014年国家健康与营养调查的5,342名参与者及其牙周组织样本 | 医学研究 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, 细胞代谢通路分析, CellChat细胞通讯分析 | 逻辑回归分析, 亚组分析 | 临床检测数据, 基因表达数据 | 5,342名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4632 | 2025-10-06 |
GADD45GIP1 promotes osteosarcoma progression by modulating RPL35 ubiquitination and alleviating endoplasmic reticulum stress via the PERK/eIF2α pathway
2025-Jul-02, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03866-z
PMID:40604925
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研究论文 | 本研究揭示GADD45GIP1通过调控RPL35泛素化并激活PERK/eIF2α通路缓解内质网应激,从而促进骨肉瘤进展的分子机制 | 首次发现GADD45GIP1在骨肉瘤中高表达并通过调控RPL35泛素化影响内质网应激的新机制 | 样本量相对有限(41例正常组织和67例肿瘤组织),需要更大规模研究验证 | 探究GADD45GIP1在骨肉瘤进展中的分子机制及其治疗潜力 | 骨肉瘤细胞系和临床组织样本 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 免疫共沉淀, 液相色谱-串联质谱 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 41例正常组织和67例肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4633 | 2025-10-06 |
The role of B12 deficiency and methionine synthase in methionine-dependent cancer cells
2025-Jul-02, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-025-00405-2
PMID:40605016
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研究论文 | 本研究揭示了癌细胞甲硫氨酸依赖性的机制,发现维生素B12缺乏导致甲硫氨酸合酶活性降低是主要原因 | 首次证实甲硫氨酸依赖性由B12缺乏导致的MTR活性降低引起,并通过表达B12非依赖性甲硫氨酸合酶实现功能挽救 | 研究仅限于体外培养的癌细胞系,尚未在体内模型或临床样本中验证 | 探究癌细胞甲硫氨酸依赖性的分子机制 | 癌细胞系 | 癌症代谢 | 癌症 | 单细胞RNA测序,同位素稀释,代谢通量分析 | NA | 基因表达数据,代谢物数据 | 多种癌细胞系 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4634 | 2025-10-06 |
CircERC1 facilitates chemoresistance through inhibiting pyroptosis and remodeling extracellular matrix in pancreatic cancer
2025-Jul-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02385-9
PMID:40605033
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研究论文 | 本研究揭示了环状RNA circERC1通过抑制细胞焦亡和重塑细胞外基质促进胰腺癌化疗耐药的新机制 | 首次发现circERC1作为外泌体包装的环状RNA在胰腺癌化疗耐药中的关键作用机制,揭示了其通过hnRNPA1-PKM2-NLRP3信号轴抑制细胞焦亡的新通路 | 研究主要基于体外和动物实验,需要进一步临床验证;机制研究虽深入但可能还存在其他未知调控途径 | 探索胰腺癌化疗耐药的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)组织、癌细胞系、肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | circRNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、RNA pull-down、质谱分析、RNA免疫共沉淀、Co-IP、EdU、集落形成、SRB活力测定、transwell、PET-CT、免疫组化、双荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据、蛋白质印迹数据、细胞功能实验数据、影像学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,circRNA测序 | NA | NA |
4635 | 2025-10-06 |
Investigating the potential role of EIF2S2 in OSCC progression through comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Jul-02, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02830-x
PMID:40605071
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证探讨EIF2S2在口腔鳞状细胞癌进展中的潜在作用 | 首次系统研究EIF2S2在OSCC中的表达模式及其与免疫微环境、突变负荷和免疫治疗疗效的关联 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证结果 | 探索EIF2S2在口腔鳞状细胞癌中的表达模式及其临床意义 | 口腔鳞状细胞癌组织样本 | 生物信息学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 免疫评分, 药物敏感性评估, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4636 | 2025-10-06 |
Identification of parthanatos-related molecular subtypes and development of prognostic risk models in ovarian cancer based on multi-omics analysis
2025-Jul-02, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01726-y
PMID:40605104
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别卵巢癌中与parthanatos相关的分子亚型并开发预后风险模型 | 首次在卵巢癌中系统研究parthanatos相关基因的预后价值,并构建具有临床适用性的风险模型 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证仅针对单个基因TGFBI | 探索parthanatos在卵巢癌中的预后意义并开发风险预测模型 | 卵巢癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,qRT-PCR,western blotting,集落形成实验,Transwell迁移实验 | 预后风险模型 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
4637 | 2025-10-06 |
Iterative clustering algorithm G-DESC-E and pan-cancer key gene analysis based on single-cell sequencing data
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf288
PMID:40608007
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研究论文 | 提出G-DESC-E迭代聚类算法并应用于单细胞测序数据的泛癌关键基因分析 | 首次将单细胞测序技术应用于泛癌分析领域的关键基因研究,提出结合网格划分、异常值过滤和Louvain预筛选的G-DESC-E聚类算法 | NA | 开发改进的单细胞数据聚类算法并识别与癌症发生发展相关的关键基因 | 单细胞测序数据中的基因表达谱和癌症亚型 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序 | G-DESC-E聚类算法(基于网格划分和Louvain算法) | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4638 | 2025-10-06 |
Dual nature of type I interferon responses and feedback regulations by SOCS1 dictate malaria mortality
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.027
PMID:39181199
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了I型干扰素在疟疾感染中的双重作用机制及SOCS1的调控功能 | 首次采用比较研究方法分析两种疟原虫模型,揭示I型干扰素反应的时相依赖性双重功能及SOCS1通过负反馈和前馈环路调控机制 | 研究仅针对两种特定疟原虫模型,结果可能不适用于所有疟疾感染情况 | 阐明I型干扰素在疟疾感染中的矛盾作用机制及SOCS1的调控角色 | 疟原虫感染模型(P. yoelii 17XL和P. berghei ANKA)及宿主免疫反应 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能缺失实验,数学模型 | 数学模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4639 | 2025-10-06 |
Integrated ultrasensitive metabolomics and single-cell transcriptomics identify crucial regulators of sheep oocyte maturation and early embryo development in vitro
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.040
PMID:39233000
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研究论文 | 本研究通过超灵敏代谢组学和单细胞转录组学整合分析,鉴定出促进绵羊卵母细胞成熟和早期胚胎发育的关键代谢物 | 首次将超灵敏代谢组学与单细胞转录组学相结合,在微量样本中识别体外培养系统缺失的关键代谢物 | 研究仅针对绵羊模型,结果在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 提高绵羊卵母细胞的发育能力,改善体外培养系统 | 绵羊卵母细胞和早期胚胎 | 单细胞组学 | 生殖发育 | 超灵敏代谢组学, 单细胞RNA-seq | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | 微量卵母细胞和胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
4640 | 2025-10-06 |
Calpain-2-Mediated Endothelial Focal Adhesion Disruption in Thoracic Aortic Dissection
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501112
PMID:40171827
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研究论文 | 本研究揭示了钙蛋白酶-2通过调控内皮细胞粘着斑蛋白导致胸主动脉夹层的分子机制 | 首次发现Calpain-2通过切割talin1和促进Itgav组装破坏内皮细胞粘着斑,是TAD的早期病理标志和驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究胸主动脉夹层发病的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 胸主动脉夹层患者样本和β-氨基丙腈诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 患者单细胞RNA测序数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |