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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 4601 - 4620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4601 | 2026-03-30 |
Isolation of Pericytes from Mouse Cortical Tissue Using FACS for Single-cell Sequencing
2026-01-30, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69749
PMID:41697880
|
研究论文 | 本文建立了一种优化的FACS方法，用于从小鼠皮层组织中分离周细胞，适用于单细胞RNA测序 | 在已建立的CD13/CD31分选策略基础上，引入了20% BSA溶液重悬细胞的关键步骤，以最小化应激和聚集，从而最大化测序所需的细胞活力和RNA质量 | NA | 研究周细胞的异质性，并阐明其在神经血管疾病中的机制 | 小鼠大脑周细胞 | 单细胞测序 | 神经血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 3只成年C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4602 | 2026-03-30 |
AUTOENCODIX: a generalized and versatile framework to train and evaluate autoencoders for biological representation learning and beyond
2026-01, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00916-4
PMID:41366150
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研究论文 | 本文介绍了AUTOENCODIX，一个用于训练和评估自编码器的开源框架，旨在标准化和灵活处理生物表示学习任务 | 提出一个标准化、灵活且可比较的自编码器框架，支持基于本体和跨模态的自编码器，增强了表示学习的可解释性和数据模态转换能力 | 未明确说明框架在特定数据集或应用场景中的性能限制或潜在偏差 | 开发一个通用框架以标准化自编码器的训练和评估，促进生物表示学习的研究 | 自编码器架构及其在生物数据表示学习中的应用 | 机器学习 | NA | 自编码器深度学习 | 自编码器（包括基于本体和跨模态的自编码器） | 多模态数据（包括基因组、单细胞测序和成像数据） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4603 | 2026-03-30 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等方法，揭示了肠道微生物通过丁酸-GPR109A信号通路调控结肠上皮中具有吸收和分泌特征的非常规杯状细胞，从而影响结肠上皮细胞组成和功能 | 首次发现微生物通过丁酸及其受体GPR109A调控结肠隐窝间吸收性杯状细胞，揭示了微生物驱动上皮可塑性的新机制 | NA | 探究微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞身份和功能 | 结肠上皮细胞，特别是非常规隐窝间杯状细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学，抗生素介导的微生物耗竭，无菌小鼠，小鼠定植实验 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4604 | 2026-03-30 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
|
研究论文 | 本研究通过整合元素成像和空间转录组学，对结直肠癌肿瘤微环境中的金属依赖性信号通路进行了概念验证分析 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现了组织范围内金属-基因相互作用的全面探索，突破了传统孤立研究金属或基因的局限 | 本研究仅为单样本概念验证，样本量有限，未来需要扩大患者队列进行验证 | 探索肿瘤微环境中金属丰度、转运机制、细胞分布与肿瘤进展相关生物通路（如代谢、胶原重塑）之间的复杂相互作用 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 元素成像、空间转录组学、基因表达相关性分析 | 空间多模态工作流程 | 图像、基因表达数据、细胞组成数据、组织病理学特征 | 单一样本（结直肠癌肿瘤） | NA | 空间转录组学、元素成像 | NA | NA |
| 4605 | 2026-03-30 |
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-10-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15101430
PMID:41154658
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研究论文 | 本研究通过构建CD4+ T细胞特异性PKCλ/ι条件性敲除小鼠模型，探讨了PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的作用机制 | 首次在CD4+ T细胞中条件性敲除PKCλ/ι，揭示了其通过调控Tfh/Tfr细胞平衡和Breg细胞功能来减轻肝纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；单细胞测序样本量有限；具体信号通路细节有待进一步阐明 | 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的免疫调节作用 | 感染日本血吸虫的小鼠模型，重点关注CD4+ T细胞、Tfh细胞、Tfr细胞和Breg细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，RT-qPCR，ELISA，转录组分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据，流式细胞数据，基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4606 | 2026-03-30 |
Transcriptome Analysis Unravels CD4+ T-Cell and Treg-Cell Differentiation in Ovarian Cancer
2025-08-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15091241
PMID:41008548
|
研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA-seq数据集，对卵巢癌中肿瘤浸润CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs）的分化进行了全面的转录组分析 | 整合了七个多中心卵巢癌单细胞RNA-seq数据集，构建了强大的元数据资源，并利用BayesPrism算法从TCGA批量RNA-seq数据中量化Tregs，对患者进行分层 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限；样本来源为回顾性数据集，需要前瞻性研究进一步验证 | 研究卵巢癌中肿瘤浸润CD4+ T细胞，特别是调节性T细胞（Tregs）的分化、功能及其对预后的影响 | 卵巢癌患者肿瘤组织中的CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs） | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | BayesPrism算法 | 转录组数据 | OCSCDs数据集包含7个数据集，总计137,648个单细胞；使用了TCGA数据集和5个独立的批量RNA-seq队列进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4607 | 2026-03-30 |
Interpretable niche-based cell‒cell communication inference using multi-view graph neural networks
2025-06, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00809-6
PMID:40425827
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于空间转录组学的细胞间通讯推断工具STCase，利用多视图图神经网络识别细胞类型的生态位并揭示生态位特异性通讯事件 | 提出首个考虑生态位异质性的单细胞/斑点水平细胞间通讯推断方法，通过可解释的多视图图神经网络和CCC感知注意力机制 | NA | 开发能够捕捉生态位特异性细胞间通讯的计算工具 | 人类支气管腺体和口腔鳞状细胞癌组织 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 多视图图神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4608 | 2026-03-30 |
Multimodal learning for mapping genotype-phenotype dynamics
2025-04, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00765-7
PMID:39875699
|
研究论文 | 本研究提出了一个计算集成遗传学框架，用于同时分析和解释基因型及其相关表型的高维景观，并开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平上的基因型-表型关系流形 | 整合单细胞RNA测序等高通量基因分型方法与语言模型等先进学习方法，构建了一个用于分析基因型-表型动态关系的多模态基础模型，能够以更高分辨率解析细胞异质性 | NA | 解析复杂基因表达模式如何产生复杂表型这一生物学基本问题，探索基因表达与表型表现之间的动态相互作用 | 人类转录组学数据，特别是内皮细胞中的von Willebrand因子（VWF）基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 语言模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4609 | 2026-03-30 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCORPION的工具，用于从单细胞/核RNA测序数据重建可比较的基因调控网络，以支持群体水平的比较 | SCORPION利用消息传递算法和相同基线先验，克服了数据稀疏性和细胞异质性，在合成数据上优于12种现有基因调控网络重建技术，并能准确识别野生型和转录因子扰动细胞间的调控网络差异 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种工具，用于从单细胞转录组学数据重建可比较的基因调控网络，以进行群体水平的比较 | 单细胞/核RNA测序数据，特别是来自结直肠癌和相邻健康组织的200,436个细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 消息传递算法 | 单细胞转录组学数据 | 200,436个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4610 | 2026-03-30 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-02, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
|
研究论文 | 本文介绍了CellBarcode工具包及其条形码模拟套件CellBarcodeSim，用于从批量或单细胞测序数据中高效、灵活地提取和过滤多种条形码类型 | 开发了支持多种条形码类型和分析策略的通用工具，并提供了条形码模拟功能以优化识别过程 | 未明确提及具体的技术限制或性能边界 | 提高DNA细胞条形码识别的准确性和可重复性 | DNA细胞条形码 | 生物信息学 | NA | PCR和测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量测序 | NA | NA |
| 4611 | 2026-03-30 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在运行时间上具有线性与二次方的优势，且在合理条件下能高概率计算肿瘤的真实进展历史 | NA | 开发一种快速且准确的算法来推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的基因型矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4612 | 2026-03-29 |
Construction of TLS-related gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000925
PMID:41894176
|
研究论文 | 本研究构建了三级淋巴结构相关基因特征（TLSRS），用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次开发了基于三级淋巴结构相关基因的预后和免疫治疗反应预测模型，并利用单细胞、空间转录组学等技术验证了基因与TLS的关联 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证；基因特征的普适性需在更多独立队列中验证 | 预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应，推动精准医疗发展 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 差异基因表达分析、加权相关网络分析、LASSO回归、GSEA、单细胞RNA-seq、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，涉及肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4613 | 2026-03-29 |
Application of GBD 2021 and multiple omics to reveal the association and potential mechanism between glycated hemoglobin and intervertebral disc degeneration
2026-Mar-27, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05208-w
PMID:41893906
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研究论文 | 本研究整合全球疾病负担数据、孟德尔随机化分析、多组学数据和单细胞转录组学，全面揭示了糖化血红蛋白与椎间盘退变之间的关联及潜在机制 | 首次通过整合全球流行病学数据、孟德尔随机化因果推断、多组学整合分析及单细胞转录组学，系统揭示了HbA1c与IVDD的因果关系，并鉴定了五个关键HbA1c相关基因及其在椎间盘退变中的细胞特异性作用 | 研究主要基于公共数据库和已有测序数据，缺乏实验验证；单细胞分析样本量有限；药物靶向预测需进一步实验确认 | 阐明糖化血红蛋白对椎间盘退变的因果影响，鉴定关键相关基因并探索其分子机制及潜在治疗靶点 | 全球人群糖尿病与腰痛流行病学数据、椎间盘退变相关基因组数据、人髓核组织单细胞转录组数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 流行病学数据、基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 全球人群流行病学数据、大型GWAS汇总统计数据、单细胞RNA测序人髓核组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4614 | 2026-03-29 |
Microglia-mediated protection against Alzheimer's disease pathology and detrimental effects in white matter revealed by Ptpn6 deletion
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.023
PMID:41895269
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研究论文 | 本研究通过删除Ptpn6基因，揭示了小胶质细胞在阿尔茨海默病中的保护作用及其在白质中的潜在有害影响 | 首次在全基因组CRISPR筛选中识别Ptpn6作为巨噬细胞存活的关键调节因子，并展示了其在阿尔茨海默病模型中对小胶质细胞的双重作用 | 研究主要基于TauPS2APP小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性，且未详细探讨Ptpn6缺失在其他神经退行性疾病中的影响 | 探究Ptpn6基因在小胶质细胞功能中的作用及其对阿尔茨海默病病理的影响 | 小胶质细胞、巨噬细胞、TauPS2APP阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | TauPS2APP小鼠模型 | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4615 | 2026-03-29 |
Circuit and molecular mechanisms underlying incubation of methamphetamine craving in the prelimbic cortex
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.017
PMID:41895270
|
研究论文 | 本研究揭示了前边缘皮层中生长抑素和钙结合蛋白中间神经元在甲基苯丙胺渴求孵化中的时间和环路特异性作用 | 首次阐明了前边缘皮层中不同中间神经元亚型在药物渴求不同阶段的特异性贡献，并识别出KCNC2作为潜在的阶段特异性治疗靶点 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证 | 探究甲基苯丙胺使用障碍中渴求孵化的神经机制 | 前边缘皮层的生长抑素和钙结合蛋白中间神经元 | 神经科学 | 甲基苯丙胺使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4616 | 2026-03-29 |
Exploring cell types and their dynamic states in adipose tissue
2026-Mar-26, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2026.01.012
PMID:41896071
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综述 | 本文综述了脂肪组织中细胞类型及其动态状态的研究现状，包括单细胞转录组学在识别新型细胞类型和状态方面的应用 | 整合了单细胞转录组学技术的最新进展，系统性地描述了脂肪组织中多种细胞类型（如脂肪细胞、免疫细胞等）的动态状态变化及其在病理生理刺激下的可塑性机制 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结，可能未覆盖所有最新研究 | 探索脂肪组织中细胞类型的异质性及其动态功能状态，以理解脂肪组织的功能可塑性 | 脂肪组织中的细胞类型，包括脂肪细胞、脂肪干细胞和祖细胞、免疫细胞、血管细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4617 | 2026-03-29 |
Identification of Smmhc-expressing mesenchymal cells in orofacial bone at single-cell resolution
2026-Mar-23, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00518-4
PMID:41866504
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别并描述了小鼠口面部骨骼中表达Smmhc的间充质干细胞亚群，揭示了其在颅面骨稳态中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下识别出表达Smmhc的间充质干细胞亚群，并证明其作为多能祖细胞在口面部骨发育和稳态中的不可或缺功能 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 阐明口面部间充质干/基质细胞的异质性及其在颅面骨再生和稳态中的作用 | 小鼠口面部骨骼组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4618 | 2026-03-29 |
Enhancing gastric cancer immunotherapy: Insights from multi-omics analysis and innovations in photodynamic-chemotherapy nanoplatforms
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102635
PMID:41747719
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胃癌免疫检查点阻断治疗耐药的关键机制，并开发了一种新型纳米平台以增强免疫治疗效果 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析胃癌免疫治疗耐药机制，并创新性地开发了巨噬细胞膜伪装的中空介孔二氧化硅纳米颗粒作为靶向递送系统 | 研究主要基于临床前模型，尚未在大型临床试验中验证其安全性和有效性 | 克服胃癌免疫检查点阻断治疗的耐药性并开发新型联合治疗策略 | 胃癌患者组织样本以及基因工程和同系胃癌模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 测序数据, 图像数据 | 接受新辅助免疫检查点阻断治疗的胃癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4619 | 2026-03-29 |
Integrative CSF profiling identifies disease-specific immune responses in leptomeningeal disease
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102651
PMID:41794040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和T细胞受体测序技术，结合空间转录组学，分析了脑脊液中的免疫景观，揭示了不同中枢神经系统疾病中疾病特异性的免疫反应特征 | 首次整合单细胞RNA测序、T细胞受体深度测序和空间转录组学，全面描绘了脑脊液在软脑膜疾病中的免疫活性特征，并确认了脑脊液与肿瘤微环境之间的转录相似性 | 样本量相对有限，且仅针对特定癌症类型（中枢神经系统淋巴瘤、脑转移瘤和胶质母细胞瘤），可能无法完全代表所有软脑膜疾病亚型 | 旨在通过脑脊液液体活检技术，揭示软脑膜疾病的疾病特异性免疫反应，以指导治疗分层和免疫监测 | 中枢神经系统淋巴瘤、脑转移瘤和胶质母细胞瘤患者的脑脊液、血液样本以及脑部病变组织 | 数字病理学 | 软脑膜疾病 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据, 空间转录组数据 | 涉及中枢神经系统淋巴瘤、脑转移瘤和胶质母细胞瘤患者的脑脊液、血液和脑部病变样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4620 | 2026-03-29 |
Proteogenomic characterization delineates clinically relevant subtypes of advanced differentiated thyroid cancer
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102661
PMID:41794039
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和基因组学分析，将晚期分化型甲状腺癌分为三个分子亚型，并开发了一个机器学习分类器来预测这些亚型 | 首次通过蛋白质组学和基因组学分析，将晚期分化型甲状腺癌分为三个分子亚型，并开发了一个基于常规基因突变和数字病理数据的机器学习分类器 | 研究样本量相对有限，且临床证据为初步性，需要进一步验证 | 探索晚期分化型甲状腺癌的分子亚型，以指导个性化治疗 | 晚期分化型甲状腺癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 蛋白质组学分析，基因组学分析，单细胞转录组学，空间转录组学 | 机器学习分类器 | 基因突变数据，数字病理图像 | 113例晚期分化型甲状腺癌样本 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | NA |