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当前共找到 31938 篇文献，本页显示第 4601 - 4620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4601 | 2025-10-06 |
TriCLFF: a multi-modal feature fusion framework using contrastive learning for spatial domain identification
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf316
PMID:40639417
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研究论文 | 提出基于对比学习的多模态特征融合框架TriCLFF，用于空间转录组数据中的空间域识别 | 开发了基于对比学习的多模态特征融合框架，能有效整合空间关联、基因表达水平和组织学特征 | NA | 开发空间转录组数据分析方法，实现精确的空间域识别 | 小鼠大脑前部、小鼠嗅球、人背外侧前额叶皮层和人乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 对比学习 | 空间多模态数据 | 四个数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, Stereo-seq | 10x Visium空间转录组平台，Stereo-seq空间转录组技术 |
| 4602 | 2025-10-06 |
High-resolution transcriptome atlas of bladder cancer highlights the functional myeloid subsets in modulating immune microenvironment
2025-Jul, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105801
PMID:40561775
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了膀胱癌中髓系细胞的功能亚群及其在调节肿瘤微环境中的作用 | 首次系统描绘了膀胱癌中TREM2+巨噬细胞和CMA1+肥大细胞等髓系细胞亚群的功能状态，并发现TREM2和APP作为免疫调节分子的新功能 | 样本量相对较小（11例患者），需要在更大队列中验证研究结果 | 深入探索膀胱癌肿瘤微环境中髓系细胞的功能特征和免疫调节机制 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和正常膀胱组织，以及体外培养细胞和小鼠肿瘤模型 | 单细胞生物学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组测序，密度梯度离心，体外培养，小鼠肿瘤模型，去卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例膀胱癌患者的配对肿瘤和正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4603 | 2025-10-06 |
Defining Keypoints to Align H&E Images and Xenium DAPI-Stained Images Automatically
2025-Jun-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14131000
PMID:40643521
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研究论文 | 开发了一种自动生成关键点文件的方法Xenium-Align，用于在Xenium Explorer软件中实现H&E图像和Xenium DAPI染色图像的对齐 | 提出了首个自动生成关键点的方法，替代了需要领域专家手动标记关键点的传统流程 | 方法运行时间效率有待优化，可用性需要进一步提升 | 开发自动图像配准方法，用于空间转录组学研究中的图像对齐 | 人类肾脏样本和皮肤样本，包括健康和疾病状态 | 空间转录组学 | 肾脏疾病,皮肤疾病 | 图像配准,关键点识别 | NA | H&E图像,Xenium DAPI染色图像 | 14个人类肾脏样本和1个人类皮肤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | 10x Xenium原位空间转录组平台 |
| 4604 | 2025-10-06 |
Tissue extracellular vesicles suppress neonatal cardiac regeneration: a Pak2-Erk1/2-mediated macrophage paracrine signaling
2025-Feb-14, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024193
PMID:39949198
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿心肌组织来源的细胞外囊泡通过Pak2-Erk1/2轴调控巨噬细胞旁分泌活动，从而抑制心肌细胞增殖的机制 | 首次发现出生后第8天心肌组织来源的细胞外囊泡通过Pak2-Erk1/2信号通路调控巨噬细胞功能，进而影响心肌细胞增殖能力 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；具体囊泡内容物的作用机制仍需进一步探索 | 探究心肌组织来源的细胞外囊泡对新生儿心脏再生能力的影响机制 | 小鼠心肌组织、细胞外囊泡、巨噬细胞、新生儿心肌细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、高通量组学、单细胞测序、共培养实验 | NA | 单细胞测序数据、组学数据 | 小鼠出生后第1天和第8天心肌组织 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4605 | 2025-10-06 |
Similarities and differences in the response and molecular characteristics of peripheral sensory neurons associated with pain and itch
2025-Feb-14, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024202
PMID:39953797
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研究论文 | 本研究通过双光子钙成像和单细胞RNA测序技术，探索了背根神经节神经元对疼痛和瘙痒刺激的响应差异及分子特征 | 首次系统比较了多感觉神经元和单感觉神经元对疼痛和瘙痒的响应差异，并揭示了不同神经元亚群在慢性疼痛和瘙痒发展中的独特转录组变化 | 研究主要聚焦于背根神经节神经元，未涉及中枢神经系统的调控机制 | 探究外周感觉神经元对疼痛和瘙痒刺激的响应差异及分子机制 | 小鼠背根神经节神经元 | 神经科学 | 慢性疼痛和瘙痒 | 双光子钙成像, 单细胞RNA测序 | NA | 钙成像数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4606 | 2025-10-06 |
Identifying ADGRG1 as a specific marker for tumor-reactive T cells in acute myeloid leukemia
2024-Sep-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00560-0
PMID:39243082
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定ADGRG1作为急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特异性标志物 | 首次发现ADGRG1可作为CD8+肿瘤反应性T细胞的特定标志物，并通过小鼠模型和CAR-T系统验证其功能 | 研究样本仅限于RUNX1::RUNX1T1融合基因的AML患者，需要更广泛的患者群体验证 | 探索急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特征和特异性标志物 | 新诊断AML患者的骨髓T细胞和Runx1; Mx1-Cre小鼠模型 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | STARTRAC-like算法 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 新诊断RUNX1::RUNX1T1融合基因AML患者的骨髓T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | NA | NA |
| 4607 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals pathogenic mechanism of renal fibrosis in imiquimod-induced lupus nephritis in mice
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102087
PMID:40641741
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示咪喹莫特诱导的小鼠狼疮性肾炎肾纤维化的致病机制 | 首次建立狼疮性肾炎肾脏的单核与空间转录组图谱，识别出外髓质内条纹区成纤维细胞特异性激活及促纤维化巨噬细胞亚型Lyz2 | 研究局限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 阐明狼疮性肾炎肾纤维化的细胞分子病理机制 | 咪喹莫特诱导的狼疮性肾炎小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | 狼疮性肾炎与对照组小鼠肾脏样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4608 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Alternative Splicing and Gene Regulatory Network Reveals Remarkable Expression and Regulation Dynamics During Human Early Embryonic Development
2025-Jul, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2025-00075
PMID:40641848
|
研究论文 | 通过整合基因表达水平、选择性剪接、异构体转换和基因调控网络，系统研究人类早期胚胎发育中的基因表达动态 | 首次在单细胞水平系统整合基因表达、选择性剪接和调控网络分析人类早期胚胎发育动态 | 仅关注E3到E7阶段的胚胎发育，未涵盖更广泛的发育时期 | 揭示人类早期胚胎发育过程中基因表达的动态特征 | 人类早期胚胎（E3-E7阶段） | 单细胞组学 | 发育生物学 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | E3到E7阶段人类胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4609 | 2025-10-06 |
Prognostic Value of TBC1D1 and Its Relationship With the Tumor Microenvironment in Pancreatic Cancer: A Study Based on Single-Cell Sequencing
2025-Jul, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2025-00092
PMID:40641846
|
研究论文 | 本研究评估TBC1D1在胰腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | 首次通过单细胞测序技术系统分析TBC1D1在胰腺癌不同细胞群体中的表达分布及其与肿瘤微环境的关联 | 样本量相对有限（168例患者），需要更大规模研究验证结果 | 评估TBC1D1在胰腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 168例胰腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4610 | 2025-10-06 |
PhytoCluster: a generative deep learning model for clustering plant single-cell RNA-seq data
2025-Jun, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00196-6
PMID:40641652
|
研究论文 | 提出了一种名为PhytoCluster的无监督深度学习算法，用于聚类植物单细胞RNA测序数据 | 开发了专门针对植物单细胞RNA测序数据的生成式深度学习聚类模型，在聚类准确性、噪声去除和信号保留方面优于现有方法 | NA | 解决植物单细胞RNA测序数据的高维度、稀疏性和生物噪声等计算挑战 | 植物单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 4个模拟数据集和5个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4611 | 2025-10-06 |
Insights into human melanocyte development and characteristics through pluripotent stem cells combined with single-cell sequencing
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112373
PMID:40641554
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研究论文 | 通过多能干细胞结合单细胞测序技术研究人类黑色素细胞的发育过程和特征 | 首次结合人类多能干细胞和单细胞测序技术系统研究黑色素细胞发育的细胞异质性、分化轨迹和信号通路相互作用 | 研究主要基于体外诱导模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类黑色素细胞的发育机制和生物学特性 | 人类多能干细胞诱导的黑色素细胞和正常人类黑色素细胞 | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4612 | 2025-10-06 |
Humanized mouse model reveals T cell ANXA2 as a potential therapeutic target in ischemic stroke
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112302
PMID:40641552
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研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠脑卒中模型，鉴定出ANXA2作为T细胞亚群的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次建立人源化T细胞缺血性脑卒中模型，发现ANXA2作为新型治疗靶点，并使用小分子抑制剂验证其神经保护作用 | 人源化小鼠模型仍与人类疾病存在差异，需要进一步临床验证 | 探索缺血性脑卒中后T细胞的分子机制并鉴定治疗靶点 | 人源化小鼠模型和人类缺血性脑组织及外周血样本 | 单细胞测序分析 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型和人类样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4613 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell transcriptomics of sheep ovarian development reveals dynamic transcriptional programs relevant to reproductive traits
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112422
PMID:40641558
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学分析绵羊卵巢发育过程，揭示与繁殖性状相关的动态转录程序 | 首次在绵羊卵巢发育关键阶段构建单细胞转录组图谱，并通过跨物种比较发现与人类生殖性状的关联 | 样本数量有限，仅涵盖四个发育阶段 | 解析绵羊卵巢发育的转录动态及其与人类生殖生物学的相关性 | 绵羊卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61,649个单细胞，覆盖胚胎期90天(E90)、青春期前3月(M3)、青春期后6月(M6)和成年期(Y2,Y4) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4614 | 2025-10-06 |
Rational therapeutic targeting of myeloid cells in glioblastoma: challenges and perspectives
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1472710
PMID:40642066
|
综述 | 探讨胶质母细胞瘤中髓系细胞的异质性与可塑性，以及靶向治疗的前景与挑战 | 整合多组学、单细胞转录组学和空间多模态分析揭示脑髓系细胞多样性及其在肿瘤微环境中的调控机制 | NA | 阐述胶质母细胞瘤中髓系细胞的治疗靶向策略 | 胶质母细胞瘤中的髓系细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和单核来源的胶质瘤相关巨噬细胞） | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学分析, 单细胞转录组学, 空间多模态分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4615 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics to identify the lactylation-related protein TUBB2A as a potential biomarker for glioblastoma in cancer cells by machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1601533
PMID:40642071
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，结合机器学习识别乳酸化相关蛋白TUBB2A作为胶质母细胞瘤的潜在生物标志物 | 创新性地开发了基于四分位距的乳酸化筛选方法，并在单细胞分辨率下评估胶质母细胞瘤中的乳酸化活性 | 研究样本量有限，需要进一步扩大验证 | 阐明乳酸化在胶质母细胞瘤患者异质性和复发中的具体作用机制 | 胶质母细胞瘤癌细胞和组织 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | AUCell, UCell, 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 | 人类胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4616 | 2025-10-06 |
Enhancing fibroblast-epithelial cell communications: Serpine2 as a key molecule in Fusobacterium nucleatum-promoted colon cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1563922
PMID:40642075
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了Fusobacterium nucleatum通过增强成纤维细胞-上皮细胞通讯促进结肠癌进展的分子机制 | 首次发现Serpine2作为Fn促进结肠癌进展和转移的关键分子标志物，并阐明了Fn通过增强成纤维细胞-巨噬细胞-上皮细胞相互作用促进癌症进展的新机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证；机制研究仍需进一步深入 | 阐明Fusobacterium nucleatum促进结肠癌进展的分子机制 | 结肠癌组织样本、临床组织样本、体外共培养实验 | 生物信息学 | 结肠癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习算法, 体外共培养实验 | 三种机器学习算法 | RNA-seq数据, 临床数据 | 临床组织样本和外部数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4617 | 2025-10-06 |
Amplification of select autonomous HERV loci and surrounding host gene transcription in monocytes from patients with post-acute sequelae of COVID-19
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621657
PMID:40642078
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现COVID-19后遗症患者单核细胞中特定自主HERV位点及其周围宿主基因转录的扩增 | 开发了基于窗口的HERV比对方法，首次在PASC患者单核细胞中鉴定出三个共同表达的HERV位点，并发现与邻近宿主基因的共扩增现象 | 样本量有限（12名PASC患者），仅分析了单核细胞数据，未涉及其他免疫细胞类型 | 研究COVID-19后遗症患者单核细胞中人类内源性逆转录病毒的激活模式 | COVID-19患者、流感患者、登革热患者、脓毒症患者和正常个体的单核细胞 | 基因组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | WHA（基于窗口的HERV比对方法） | 单细胞RNA测序数据 | 31名正常个体、多个COVID-19研究队列、12名PASC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4618 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the role of ribosome biogenesis in malignant clear cell renal cell carcinoma and the development of a machine learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1602898
PMID:40642093
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研究论文 | 通过多组学分析揭示核糖体生物发生在恶性透明细胞肾细胞癌中的作用，并开发基于机器学习的预后模型 | 首次系统整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，揭示核糖体生物发生在ccRCC中的关键作用，并构建了基于118种机器学习算法组合的预后模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证核糖体生物发生的具体分子机制 | 探究核糖体生物发生在ccRCC发病机制和预后中的作用，开发预后预测模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤组织 | 生物信息学, 机器学习 | 肾细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 代谢通量推断 | 机器学习算法组合 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 内部和外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4619 | 2025-10-06 |
Human neuron subtype programming via single-cell transcriptome-coupled patterning screens
2025-Jul-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn6121
PMID:40638726
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研究论文 | 通过单细胞转录组耦合模式筛选实现人类神经元亚型编程 | 结合形态发生素信号调控与转录因子过表达，首次系统筛选480种信号调节组合，通过单细胞转录组分析揭示神经元多样性 | 研究基于体外干细胞分化模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类神经元亚型编程的多样性及其调控机制 | 人多能干细胞分化的神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 700,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4620 | 2025-10-06 |
Advancements in single-cell techniques for examining the HIV reservoir: pathways to a cure
2025-Jul-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00655-25
PMID:40488537
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综述 | 本文综述了单细胞技术在HIV病毒储存库研究中的进展及其对治愈策略的推动作用 | 系统总结了单细胞测序、染色质可及性分析和多组学技术在研究HIV病毒储存库异质性和持久性机制中的应用 | NA | 探讨单细胞技术在揭示HIV病毒储存库特征和开发治愈策略中的应用 | HIV病毒储存库细胞，主要是静息CD4 T细胞和巨噬细胞等长寿细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞测序，染色质可及性分析，多组学技术 | NA | 基因组，转录组，表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |