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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4581 | 2025-10-06 |
Multi-omics and experimental validation reveal mechanism of compound mylabris capsules in treating diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jul-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-09767-5
PMID:40615583
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证揭示了复方斑蝥胶囊治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的作用机制 | 首次系统整合生物信息学分析、单细胞RNA测序和实验验证,阐明复方斑蝥胶囊主要成分豆甾醇通过调控CDK1和CDK2靶点抑制DLBCL的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的作用机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞及相关基因靶点 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,体外实验 | 网络分析,PPI网络 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GEO和TCGA数据库中的DLBCL数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4582 | 2025-10-06 |
Uncovering key markers and therapeutic targets for renal fibrosis in diabetic kidney disease through bulk and single-cell RNA sequencing
2025-Jul-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06554-8
PMID:40615901
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研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键标志物和治疗靶点 | 结合WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接技术,首次系统鉴定PROM1和THY1作为糖尿病肾病肾纤维化的关键诊断标志物 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大临床队列中验证 | 识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键基因标志物和潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据、STZ诱导的糖尿病肾病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | WGCNA, ssGSEA, 机器学习, 单细胞RNA测序, 分子对接 | FibrosisScore模型, 机器学习模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 两个糖尿病肾病数据集, STZ小鼠模型, Nephroseq V5数据库临床数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4583 | 2025-10-06 |
Integrative analysis reveals the multilateral inflammatory mechanisms of CD14 monocytes in gout
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.01.046
PMID:40023733
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD14单核细胞在痛风中的多边炎症机制 | 首次在单细胞水平系统表征痛风患者CD14单核细胞的分子和细胞特征,发现S100Ahigh单核细胞亚群通过缺氧和脂肪酸代谢途径驱动炎症反应 | 样本量较小(8例患者和6例对照),需更大规模研究验证 | 阐明CD14单核细胞在痛风炎症反应启动中的具体作用机制 | 痛风患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例痛风患者和6例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4584 | 2025-10-06 |
Microglia heterogeneity, modeling and cell-state annotation in development and neurodegeneration
2025-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01931-4
PMID:40195564
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综述 | 本文综述了小胶质细胞在发育和神经退行性疾病中的异质性、建模与细胞状态注释方法 | 提供了基于基因表达的小胶质细胞状态注释工具,整合了发育、神经退行性疾病、性别和中枢神经系统区域等多维度异质性分析 | NA | 深入理解小胶质细胞在健康和疾病状态下的转录异质性及其功能动态 | 小鼠和人类的小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4585 | 2025-10-06 |
Fibroblast Activation Protein (FAP)+ cancer-associated fibroblasts induce macrophage M2-like polarization via the Fibronectin 1-Integrin α5β1 axis in breast cancer
2025-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03359-3
PMID:40263422
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研究论文 | 本研究揭示了表达成纤维细胞活化蛋白的癌症相关成纤维细胞通过纤连蛋白1-整合素α5β1轴诱导巨噬细胞M2样极化,促进乳腺癌免疫抑制的机制 | 首次发现FAP CAFs通过分泌FN1激活巨噬细胞整合素α5β1-FAK-AKT-STAT3信号通路,驱动M2样极化,并证实靶向该轴可重塑肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型和临床标本,尚未在更广泛的人群中验证治疗策略的临床效果 | 探究FAP CAFs在乳腺癌免疫微环境中的调控机制及潜在治疗靶点 | 乳腺癌微环境中的FAP阳性癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,体内外实验,临床标本分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,临床数据,实验数据 | 临床标本和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4586 | 2025-10-06 |
A dynamic and multimodal framework to define microglial states
2025-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01978-3
PMID:40394327
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研究论文 | 提出微胶质细胞状态连续体模型,挑战传统离散分类范式 | 首次提出微胶质细胞存在于连续体而非离散亚群的理论框架 | 主要基于计算方法分析,缺乏实验验证 | 建立微胶质细胞状态分类的稳健理论框架 | 中枢神经系统微胶质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 连续体模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4587 | 2025-10-06 |
Spatial multiomics decipher fibroblast-macrophage dynamics in systemic sclerosis
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.025
PMID:40410053
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研究论文 | 通过空间多组学技术解析系统性硬化症中成纤维细胞-巨噬细胞动态相互作用 | 首次构建系统性硬化症皮肤纤维化微环境的空间图谱,揭示ACKR3在肌成纤维细胞前体中的选择性表达及其调控巨噬细胞募集的机制 | 样本量相对有限(14例皮肤活检),需要更大规模研究验证发现 | 探索系统性硬化症皮肤组织中细胞空间组织和协调机制,为精准医疗提供新见解 | 系统性硬化症患者皮肤组织、SSc小鼠模型、伤口愈合驯鹿模型 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 14例皮肤活检(10例弥漫性皮肤SSc患者,4例健康对照) | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
4588 | 2025-10-06 |
CD4+ tissue-resident memory Th17 cells are a major source of IL-17A in Spondyloarthritis synovial tissue
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.018
PMID:40413112
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间RNA分析,确定了CD4+组织驻留记忆Th17细胞是脊柱关节炎滑膜组织中IL-17A的主要来源 | 首次在脊柱关节炎滑膜组织中鉴定CD4+CXCR6+ TRM17细胞为主要的IL-17A产生细胞,并发现BRD1表观遗传调控因子在TRM17细胞生成中的关键作用 | 样本量相对较小(单细胞RNA测序n=11,空间RNA分析n=4),需要在更大队列中验证 | 确定脊柱关节炎滑膜组织中IL-17A的细胞来源及其调控机制 | 脊柱关节炎患者的滑膜组织和血液记忆CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 脊柱关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间RNA分析, CellPhoneDB细胞通讯分析, siRNA, CRISPR | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 单细胞RNA测序:11例(5例轴性脊柱关节炎,6例银屑病关节炎);空间RNA分析:4例银屑病关节炎 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
4589 | 2025-10-06 |
Disruption of Morrbid alleviates autoinflammatory osteomyelitis in Pstpip2-deficient mice
2025-Jul-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052176
PMID:40503910
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎(CRMO)发病机制中的作用 | 首次发现Morrbid基因缺失可缓解Pstpip2缺陷小鼠的自发性炎症性骨髓炎症状 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎发病机制中的作用 | Pstpip2缺陷小鼠模型及Morrbid/Pstpip2双缺陷小鼠 | 单细胞组学 | 骨髓炎 | 单细胞转录组测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4590 | 2025-10-06 |
Inhibitor of DNA-Binding 3 Is a Novel Regulator of Limbal Epithelial Cell Migration Via the EphA2/Akt Signaling Pathway
2025-Jul-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.9.2
PMID:40590805
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研究论文 | 本研究揭示了ID3通过EphA2/Akt信号通路调控角膜缘上皮细胞迁移的新机制 | 首次发现ID3通过EphA2/Akt信号轴调控角膜上皮细胞迁移,揭示了ID3在角膜伤口愈合中的抑制作用 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 探索角膜伤口愈合过程中细胞迁移的调控机制 | 角膜缘上皮细胞、hTCEpi细胞系 | 细胞生物学 | 角膜损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA转染, 划痕实验 | NA | 基因表达数据, 细胞迁移数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4591 | 2025-10-06 |
Establishing the causative link between CFAP221 variants and asthenoteratozoospermia in humans
2025-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03472-y
PMID:40272718
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研究论文 | 本研究通过基因测序和功能分析确定了CFAP221基因变异与人类弱畸精子症之间的因果关系 | 首次发现CFAP221基因是男性不育的新致病基因,并揭示了其在精子鞭毛发育中的关键作用 | 研究仅基于两个中国家庭的病例,样本量较小 | 探索男性不育症中弱畸精子症的遗传病因 | 两个无血缘关系的中国不育男性家庭 | 生殖医学 | 男性不育症 | 全外显子组测序,桑格测序,扫描电镜,透射电镜,免疫荧光染色,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因组数据,图像数据,转录组数据 | 2个不育患者家庭 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
4592 | 2025-10-06 |
Peripheral blood cell-type and sex-specific signatures of alcohol misuse revealed by single-cell transcriptomics
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.21.655347
PMID:40501697
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示酒精滥用在外周血细胞类型和性别特异性中的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析酒精使用障碍患者外周血单核细胞的免疫细胞比例和基因表达差异,并发现性别和剂量依赖的免疫细胞功能特征 | 研究样本量有限,仅关注外周血单核细胞,未涉及其他组织或细胞类型 | 表征酒精使用障碍中的免疫失调机制 | 酒精使用障碍患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酒精使用障碍患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4593 | 2025-10-06 |
Characterization of T-bet expressing B cells in lupus patients indicates a putative prognostic and therapeutic value of these cells for the disease
2025-Jan-21, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxaf008
PMID:39918986
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研究论文 | 本研究探讨T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮患者中的预后和治疗价值 | 首次系统评估T-bet+ B细胞及其亚群在狼疮患者中的临床意义,并测试多种药物对这些细胞的调控作用 | 样本量较小(10名健康供体和22名活动性SLE患者),部分结论基于间接证据 | 评估T-bet+ B细胞作为系统性红斑狼疮预后标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 全血培养实验 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | 10名健康供体和22名活动性SLE患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4594 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-07-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示面部浸润性脂肪增多症中FKBP5作为治疗靶点的作用机制 | 首次在单细胞水平解析面部脂肪组织的细胞图谱,发现FIL患者FAP细胞中FKBP5特异性高表达并证实其通过PI3K-AKT通路调控脂肪生成 | 样本量有限,具体PIK3CA变异与FKBP5表达关联的分子机制仍需深入探索 | 探究面部浸润性脂肪增多症的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 面部脂肪组织中的基质血管组分(SVF)和纤维脂肪生成前体细胞(FAPs) | 单细胞生物学 | 面部浸润性脂肪增多症 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FIL患者和非FIL个体的面部脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4595 | 2025-10-06 |
Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing
2024-07-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03816-y
PMID:38971839
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了角膜缘干细胞在角膜伤口愈合过程中的分子特征和细胞命运 | 首次在单细胞水平定义了LSCs的分子特征,发现了转录因子Creb5在损伤反应中的关键作用,并鉴定出Arg1+巨噬细胞通过分泌OSM促进伤口愈合的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探索角膜缘干细胞及其微环境细胞在角膜损伤修复中的分子和功能响应机制 | 正常小鼠和角膜上皮缺损模型小鼠的角膜组织 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,基因敲低实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠角膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4596 | 2025-10-06 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-04-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示口腔黏膜下纤维化中上皮细胞与T细胞的相互作用机制,并探索牙髓干细胞治疗潜力 | 发现具有促炎促纤维化功能的独特上皮细胞亚群Epi1.2,揭示MIF-CD74和CXCR4介导的上皮-T细胞相互作用机制,首次系统评估DPSCs治疗OSF的效果 | OSF致病机制尚未完全阐明,DPSCs临床应用效果需进一步验证 | 探索口腔黏膜下纤维化的致病机制并开发新的治疗策略 | 口腔黏膜组织、牙髓干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 口腔黏膜下纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、免疫组化、扫描电镜、原子力显微镜 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4597 | 2025-10-06 |
An integrated toolkit for human microglia functional genomics
2024-04-10, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03700-9
PMID:38600587
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研究论文 | 开发用于人类小胶质细胞功能基因组学的集成工具包,包括优化的iPSC分化方案和多组学分析平台 | 建立简化的两步20天分化流程,整合CRISPR-ON/OFF时序控制系统,并提供在线多组学数据比较平台 | 未提及与现有方法的直接比较数据,长期功能稳定性需要进一步验证 | 开发高效的人类小胶质细胞功能基因组学研究工具 | 人类iPSC衍生的小胶质细胞(iMG) | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC-Seq, 蛋白质组学, CRISPR-Cas9 | CRISPR-ON/OFF系统 | 转录组, 表观基因组, 蛋白质组, 功能测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 多组学分析 | NA | 在线可搜索平台(https://sherlab.shinyapps.io/IPSC-derived-Microglia/) |
4598 | 2025-10-06 |
Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3
2024-03-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03706-3
PMID:38539221
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD317+ MSC亚群具有增强的免疫抑制活性,其比例与MSC治疗效果一致性密切相关 | 首次揭示CD317+ MSC亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白的机制改善治疗一致性 | 未明确PTX3稳定TSG6的具体分子机制 | 研究MSC异质性和治疗不一致性的原因及解决方案 | 人间充质干细胞(MSCs)及其CD317+亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同批次培养基扩增的MSCs | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4599 | 2025-10-06 |
Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells
2024-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03670-y
PMID:38475896
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研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序发现人类表皮干细胞具有较短的细胞周期持续时间 | 挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点,发现表皮干细胞比更分化的祖细胞具有更短的细胞周期 | 研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞,未涉及体内环境验证 | 探究人类表皮干细胞的细胞周期特征和增殖行为 | 人类角质形成细胞,包括干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 活细胞成像,单细胞RNA测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | 原代培养的人类角质形成细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4600 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
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研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血系统恢复以缓解急性放射综合征的机制 | 首次阐明TPOm通过调控骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生的作用机制,并发现其能提升VEGF-C水平和增强间充质干细胞胶原蛋白表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在急性放射综合征治疗中对骨髓微环境的调节作用 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性放射综合征 | 流式细胞术、全组织块共聚焦显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、生存数据 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |