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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4581 | 2025-10-06 |
Endocrine islet β-cell subtypes with differential function are derived from biochemically distinct embryonic endocrine islet progenitors that are regulated by maternal nutrients
2024-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946483/v1
PMID:38496675
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研究论文 | 本研究通过细胞谱系追踪和单细胞分析揭示了胚胎内分泌胰岛前体细胞如何产生功能不同的β细胞亚型 | 首次发现胚胎胰岛前体细胞具有不同的基因表达和DNA甲基化特征,这些特征决定了成年后β细胞的功能差异和稳定性 | 研究主要在小鼠模型中进行,人类样本验证相对有限 | 探索胰岛β细胞异质性形成机制及其与糖尿病发生的关系 | 小鼠胚胎胰岛前体细胞和成年β细胞,以及人类胰岛细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 组合细胞谱系追踪,单细胞RNA测序,DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4582 | 2025-10-06 |
Decoding the crossroads of aging and cancer through single-cell analysis: Implications for precision oncology
2025-Sep-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35456
PMID:40268523
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综述 | 通过单细胞分析探讨衰老与癌症的交叉机制及其对精准肿瘤学的意义 | 整合单细胞技术与空间转录组学、分子探针和人工智能等先进工具,揭示衰老在肿瘤微环境中的异质性作用 | NA | 阐明衰老过程对癌症发生、发展及治疗耐药性的影响机制 | 衰老细胞与肿瘤微环境中的细胞异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞分析,空间转录组学,人工智能 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
4583 | 2025-10-06 |
Magnifying Glass on Sinonasal NUT Carcinoma Heterogeneity via Spatial Transcriptomics
2025-Jul-07, Head & neck
DOI:10.1002/hed.28231
PMID:40621801
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研究论文 | 通过空间转录组学技术探索鼻窦NUT癌的肿瘤异质性 | 首次应用空间转录组学技术研究罕见鼻窦NUT癌的肿瘤异质性 | 样本量较小(仅3例),行为相关性仅为推测性 | 阐明鼻窦NUT癌的肿瘤异质性及其临床意义 | 3例鼻窦NUT癌患者的福尔马林固定石蜡包埋组织 | 数字病理学 | 鼻窦癌 | 空间转录组学测序 | 图神经网络 | 空间基因表达数据 | 3例鼻窦NUT癌病例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium Spatial Gene Expression分析平台 |
4584 | 2025-10-06 |
CD8a + GZMK + T Cells Inhibit Osteoclastogenesis in Postmenopausal Osteoporosis via the p38-MAPK Pathway
2025-Jul-07, Calcified tissue international
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s00223-025-01402-9
PMID:40622431
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序鉴定出一种新型CD8a+GZMK+T细胞亚群,该细胞通过分泌GzmK抑制破骨细胞生成,为绝经后骨质疏松症提供新的治疗靶点 | 首次在绝经后骨质疏松症中鉴定出CD8a+GZMK+T细胞亚群,并阐明其通过p38-MAPK通路抑制破骨细胞生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;MAPK激动剂仅能部分逆转GzmK的抑制作用 | 探究绝经后骨质疏松症中骨髓T细胞的异质性和功能 | 小鼠股骨骨髓T细胞和原代骨髓巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞转录组测序, 流式细胞术, TRAP染色, 免疫荧光染色, qPCR, RNA测序, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠股骨骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4585 | 2025-10-06 |
Molecular mechanism and biological pathway of high-expressed RAD51 in regulating cell adhesion and potentially affecting oral squamous cell carcinoma
2025-Jul-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03085-y
PMID:40613957
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研究论文 | 本研究探讨RAD51高表达通过调控细胞粘附机制促进口腔鳞状细胞癌发展的分子机制 | 首次在多平台(RNA-seq、微阵列、IHC、scRNA-seq)上全面验证RAD51在OSCC中的表达模式及其在细胞粘附中的功能作用 | 研究样本量相对有限,需要进一步的功能验证实验 | 探索RAD51在口腔鳞状细胞癌中调控细胞粘附的分子机制和生物学通路 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 1006个OSCC样本(bulk RNA), 162个OSCC组织(IHC), 9693个恶性上皮细胞(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
4586 | 2025-10-06 |
Divide-and-conquer strategy with engineered ossification center organoids for rapid bone healing through developmental cell recruitment
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61619-y
PMID:40615395
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研究论文 | 本研究通过工程化构建骨化中心类器官,采用分而治之策略促进大尺寸骨缺损的快速愈合 | 开发了具有内核心骨形态发生/神经营养球和外壳促血管生成相的双层骨化中心类器官结构,首次通过原位类器官融合与成熟招募发育性Krt8骨骼干细胞 | 研究未详细探讨类器官在体内的长期安全性与稳定性 | 开发新型骨组织工程策略以解决大尺寸骨缺损修复中血管化延迟和再生缓慢的难题 | 骨缺损动物模型及工程化骨化中心类器官 | 组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序,3D打印,机器学习 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4587 | 2025-10-06 |
DOLPHIN advances single-cell transcriptomics beyond gene level by leveraging exon and junction reads
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61580-w
PMID:40615408
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研究论文 | 提出一种名为DOLPHIN的深度学习方法,通过整合外显子水平和连接点读取数据来改进单细胞转录组分析 | 首次将外显子水平和连接点读取数据整合到单细胞转录组分析中,使用图结构表示基因并通过变分图自编码器处理 | NA | 改进单细胞转录组分析的质量和分辨率 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器 | 外显子水平数据、连接点读取数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4588 | 2025-10-06 |
Multi-omics and experimental validation reveal mechanism of compound mylabris capsules in treating diffuse large B-cell lymphoma
2025-Jul-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-09767-5
PMID:40615583
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证揭示了复方斑蝥胶囊治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的作用机制 | 首次系统整合生物信息学分析、单细胞RNA测序和实验验证,阐明复方斑蝥胶囊主要成分豆甾醇通过调控CDK1和CDK2靶点抑制DLBCL的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊治疗弥漫性大B细胞淋巴瘤的作用机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞及相关基因靶点 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,体外实验 | 网络分析,PPI网络 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GEO和TCGA数据库中的DLBCL数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4589 | 2025-10-06 |
Uncovering key markers and therapeutic targets for renal fibrosis in diabetic kidney disease through bulk and single-cell RNA sequencing
2025-Jul-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06554-8
PMID:40615901
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研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键标志物和治疗靶点 | 结合WGCNA、机器学习、单细胞RNA测序和分子对接技术,首次系统鉴定PROM1和THY1作为糖尿病肾病肾纤维化的关键诊断标志物 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大临床队列中验证 | 识别糖尿病肾病中肾纤维化的关键基因标志物和潜在治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的基因表达数据、STZ诱导的糖尿病肾病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | WGCNA, ssGSEA, 机器学习, 单细胞RNA测序, 分子对接 | FibrosisScore模型, 机器学习模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 两个糖尿病肾病数据集, STZ小鼠模型, Nephroseq V5数据库临床数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4590 | 2025-10-06 |
Integrative analysis reveals the multilateral inflammatory mechanisms of CD14 monocytes in gout
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.01.046
PMID:40023733
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD14单核细胞在痛风中的多边炎症机制 | 首次在单细胞水平系统表征痛风患者CD14单核细胞的分子和细胞特征,发现S100Ahigh单核细胞亚群通过缺氧和脂肪酸代谢途径驱动炎症反应 | 样本量较小(8例患者和6例对照),需更大规模研究验证 | 阐明CD14单核细胞在痛风炎症反应启动中的具体作用机制 | 痛风患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 痛风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例痛风患者和6例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4591 | 2025-10-06 |
Microglia heterogeneity, modeling and cell-state annotation in development and neurodegeneration
2025-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01931-4
PMID:40195564
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综述 | 本文综述了小胶质细胞在发育和神经退行性疾病中的异质性、建模与细胞状态注释方法 | 提供了基于基因表达的小胶质细胞状态注释工具,整合了发育、神经退行性疾病、性别和中枢神经系统区域等多维度异质性分析 | NA | 深入理解小胶质细胞在健康和疾病状态下的转录异质性及其功能动态 | 小鼠和人类的小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4592 | 2025-10-06 |
Fibroblast Activation Protein (FAP)+ cancer-associated fibroblasts induce macrophage M2-like polarization via the Fibronectin 1-Integrin α5β1 axis in breast cancer
2025-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03359-3
PMID:40263422
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研究论文 | 本研究揭示了表达成纤维细胞活化蛋白的癌症相关成纤维细胞通过纤连蛋白1-整合素α5β1轴诱导巨噬细胞M2样极化,促进乳腺癌免疫抑制的机制 | 首次发现FAP CAFs通过分泌FN1激活巨噬细胞整合素α5β1-FAK-AKT-STAT3信号通路,驱动M2样极化,并证实靶向该轴可重塑肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型和临床标本,尚未在更广泛的人群中验证治疗策略的临床效果 | 探究FAP CAFs在乳腺癌免疫微环境中的调控机制及潜在治疗靶点 | 乳腺癌微环境中的FAP阳性癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,体内外实验,临床标本分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,临床数据,实验数据 | 临床标本和小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4593 | 2025-10-06 |
A dynamic and multimodal framework to define microglial states
2025-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01978-3
PMID:40394327
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研究论文 | 提出微胶质细胞状态连续体模型,挑战传统离散分类范式 | 首次提出微胶质细胞存在于连续体而非离散亚群的理论框架 | 主要基于计算方法分析,缺乏实验验证 | 建立微胶质细胞状态分类的稳健理论框架 | 中枢神经系统微胶质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 连续体模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4594 | 2025-10-06 |
Spatial multiomics decipher fibroblast-macrophage dynamics in systemic sclerosis
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.025
PMID:40410053
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研究论文 | 通过空间多组学技术解析系统性硬化症中成纤维细胞-巨噬细胞动态相互作用 | 首次构建系统性硬化症皮肤纤维化微环境的空间图谱,揭示ACKR3在肌成纤维细胞前体中的选择性表达及其调控巨噬细胞募集的机制 | 样本量相对有限(14例皮肤活检),需要更大规模研究验证发现 | 探索系统性硬化症皮肤组织中细胞空间组织和协调机制,为精准医疗提供新见解 | 系统性硬化症患者皮肤组织、SSc小鼠模型、伤口愈合驯鹿模型 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 14例皮肤活检(10例弥漫性皮肤SSc患者,4例健康对照) | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
4595 | 2025-10-06 |
CD4+ tissue-resident memory Th17 cells are a major source of IL-17A in Spondyloarthritis synovial tissue
2025-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.04.018
PMID:40413112
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间RNA分析,确定了CD4+组织驻留记忆Th17细胞是脊柱关节炎滑膜组织中IL-17A的主要来源 | 首次在脊柱关节炎滑膜组织中鉴定CD4+CXCR6+ TRM17细胞为主要的IL-17A产生细胞,并发现BRD1表观遗传调控因子在TRM17细胞生成中的关键作用 | 样本量相对较小(单细胞RNA测序n=11,空间RNA分析n=4),需要在更大队列中验证 | 确定脊柱关节炎滑膜组织中IL-17A的细胞来源及其调控机制 | 脊柱关节炎患者的滑膜组织和血液记忆CD4+ T细胞 | 单细胞生物学 | 脊柱关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间RNA分析, CellPhoneDB细胞通讯分析, siRNA, CRISPR | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 单细胞RNA测序:11例(5例轴性脊柱关节炎,6例银屑病关节炎);空间RNA分析:4例银屑病关节炎 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
4596 | 2025-10-06 |
Disruption of Morrbid alleviates autoinflammatory osteomyelitis in Pstpip2-deficient mice
2025-Jul-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052176
PMID:40503910
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎(CRMO)发病机制中的作用 | 首次发现Morrbid基因缺失可缓解Pstpip2缺陷小鼠的自发性炎症性骨髓炎症状 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究Morrbid基因在慢性复发性多灶性骨髓炎发病机制中的作用 | Pstpip2缺陷小鼠模型及Morrbid/Pstpip2双缺陷小鼠 | 单细胞组学 | 骨髓炎 | 单细胞转录组测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4597 | 2025-10-06 |
Inhibitor of DNA-Binding 3 Is a Novel Regulator of Limbal Epithelial Cell Migration Via the EphA2/Akt Signaling Pathway
2025-Jul-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.9.2
PMID:40590805
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研究论文 | 本研究揭示了ID3通过EphA2/Akt信号通路调控角膜缘上皮细胞迁移的新机制 | 首次发现ID3通过EphA2/Akt信号轴调控角膜上皮细胞迁移,揭示了ID3在角膜伤口愈合中的抑制作用 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 探索角膜伤口愈合过程中细胞迁移的调控机制 | 角膜缘上皮细胞、hTCEpi细胞系 | 细胞生物学 | 角膜损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA转染, 划痕实验 | NA | 基因表达数据, 细胞迁移数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4598 | 2025-10-06 |
Establishing the causative link between CFAP221 variants and asthenoteratozoospermia in humans
2025-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03472-y
PMID:40272718
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研究论文 | 本研究通过基因测序和功能分析确定了CFAP221基因变异与人类弱畸精子症之间的因果关系 | 首次发现CFAP221基因是男性不育的新致病基因,并揭示了其在精子鞭毛发育中的关键作用 | 研究仅基于两个中国家庭的病例,样本量较小 | 探索男性不育症中弱畸精子症的遗传病因 | 两个无血缘关系的中国不育男性家庭 | 生殖医学 | 男性不育症 | 全外显子组测序,桑格测序,扫描电镜,透射电镜,免疫荧光染色,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因组数据,图像数据,转录组数据 | 2个不育患者家庭 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
4599 | 2025-10-06 |
Peripheral blood cell-type and sex-specific signatures of alcohol misuse revealed by single-cell transcriptomics
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.21.655347
PMID:40501697
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示酒精滥用在外周血细胞类型和性别特异性中的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析酒精使用障碍患者外周血单核细胞的免疫细胞比例和基因表达差异,并发现性别和剂量依赖的免疫细胞功能特征 | 研究样本量有限,仅关注外周血单核细胞,未涉及其他组织或细胞类型 | 表征酒精使用障碍中的免疫失调机制 | 酒精使用障碍患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酒精使用障碍患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4600 | 2025-10-06 |
Characterization of T-bet expressing B cells in lupus patients indicates a putative prognostic and therapeutic value of these cells for the disease
2025-Jan-21, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxaf008
PMID:39918986
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研究论文 | 本研究探讨T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮患者中的预后和治疗价值 | 首次系统评估T-bet+ B细胞及其亚群在狼疮患者中的临床意义,并测试多种药物对这些细胞的调控作用 | 样本量较小(10名健康供体和22名活动性SLE患者),部分结论基于间接证据 | 评估T-bet+ B细胞作为系统性红斑狼疮预后标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 全血培养实验 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | 10名健康供体和22名活动性SLE患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |