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当前共找到 38157 篇文献，本页显示第 4581 - 4600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4581 | 2026-01-29 |
High-dimensional co-expression network analysis reveals persistent TRH gene expression throughout axolotl telencephalon regeneration
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1697212
PMID:41601481
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研究论文 | 本研究通过高维加权基因共表达网络分析，结合空间转录组学，揭示了蝾螈端脑再生过程中基因共表达的动态图谱，并识别了包括TRH在内的关键枢纽基因 | 整合hdWGCNA、空间转录组学和蛋白质-蛋白质相互作用网络，首次在蝾螈端脑再生中系统识别了枢纽基因，并发现了TRH基因在多个阶段的持续表达模式 | 研究主要为描述性分析，未进行实验验证枢纽基因的功能机制 | 识别蝾螈端脑再生过程中的枢纽基因并定位其细胞位置，以阐明脑再生的分子基础 | 蝾螈（Ambystoma mexicanum）的端脑再生过程 | 生物信息学 | NA | 高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、空间转录组学、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 时空转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4582 | 2026-01-29 |
Integrated multi-omics and single-cell analysis identify SERPINE1 as a key mediator of the inflammatory tumor microenvironment in PDAC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1716878
PMID:41601623
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与单细胞分析，揭示了SERPINE1是胰腺导管腺癌（PDAC）炎症性肿瘤微环境的关键调控因子 | 首次通过整合多组学与单细胞分析，系统性地将SERPINE1确立为PDAC炎症驱动基质重塑和免疫逃逸的核心协调者，并发现其作为药物靶点的新潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，体内功能验证和临床转化研究有待进一步开展 | 阐明PDAC炎症性肿瘤微环境中的关键调控因子及其在免疫抑制和肿瘤进展中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的细胞与分子 | 生物信息学，单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析，分子对接，CRISPR基因敲除 | NA | 基因组，转录组，单细胞转录组数据 | 来自TCGA、GEO、ArrayExpress数据库的多队列数据集，以及IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4583 | 2026-01-29 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与批量转录组数据集，揭示了RDH16在肝细胞癌中调节免疫浸润的新机制 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合，识别RDH16作为免疫调节生物标志物，并发现其与CD163⁺ M2巨噬细胞浸润的负相关关系 | 研究未直接验证RDH16在体内对免疫微环境的具体调控机制，且功能实验未显示其对肿瘤细胞增殖、迁移或侵袭的直接影响 | 探究肝细胞癌中肿瘤异质性及免疫微环境，识别可操作的生物标志物和免疫调节机制以改善患者预后 | 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织，重点关注RDH16基因表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关联 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序，孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织的比较 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 4584 | 2026-01-29 |
Revealing the role of regulatory microglial IRF7-NLRP3 interactions in optic nerve damage of normal-tension glaucoma based on single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700998
PMID:41601638
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序，揭示了正常眼压性青光眼中IRF7与NLRP3分子相互作用调控小胶质细胞炎症反应在视神经损伤中的作用机制 | 首次揭示了OPTN (E50K)突变通过削弱IRF7对NLRP3的抑制作用，导致促炎性小胶质细胞表型，从而加剧NTG视神经损伤的具体分子机制 | 研究基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性仍需进一步验证；研究聚焦于IRF7-NLRP3轴，可能存在其他未被探索的相关通路 | 探究正常眼压性青光眼（NTG）视神经损伤的分子机制，特别是小胶质细胞炎症反应的作用 | 野生型和OPTN (E50K)突变小鼠的视网膜小胶质细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序, Western blot, qPCR, 免疫荧光, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质印迹数据, 基因表达数据, 荧光成像数据 | 野生型和OPTN (E50K)突变小鼠的视网膜小胶质细胞（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4585 | 2026-01-29 |
Unveiling the immunometabolic landscape of colorectal cancer through PANoptosis-related gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615022
PMID:41601652
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研究论文 | 本研究通过分析PANoptosis相关基因表达，揭示了结直肠癌的免疫代谢景观，并构建了基于CPAN-index的风险分层模型 | 首次将PANoptosis相关基因与结直肠癌免疫代谢微环境关联，构建了CPAN-index风险分层工具，并验证了CDKN2A在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步的前瞻性临床验证和实验机制探索 | 探究PANoptosis相关基因在结直肠癌中的作用及其对免疫代谢微环境的影响 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 基因敲低 | LASSO回归模型 | RNA-seq数据 | 未明确具体样本数量，但使用了公共数据集和外部验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4586 | 2026-01-29 |
Decoding inflammatory regulation in ovarian cancer at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719669
PMID:41601649
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综述 | 本文综述了单细胞技术如何揭示卵巢癌微环境中炎症驱动的重塑、免疫细胞信号通路及动态的炎症-免疫相互作用 | 聚焦卵巢癌的“双重微环境”，整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学技术，从单细胞分辨率解析炎症调控机制 | 综述性文章，未开展原始实验研究；将单细胞见解转化为精准诊疗策略仍面临挑战 | 阐明炎症在卵巢癌发生发展中的调控作用，并探讨其临床转化前景 | 卵巢癌微环境（OCME），包括肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4587 | 2026-01-29 |
TRIM29 drives ulcerative colitis by disrupting lipid metabolism via lysosomal dysfunction: a multi-omics and experimental study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728932
PMID:41601651
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研究论文 | 本研究通过多组学和实验方法，揭示了TRIM29通过破坏溶酶体功能并重编程脂质代谢来驱动溃疡性结肠炎进展的机制 | 首次将TRIM29鉴定为溃疡性结肠炎进展的关键调控因子，并阐明了其通过溶酶体功能障碍影响脂质代谢的新轴心机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未在人类患者中进行直接验证，且机制细节有待进一步深入探索 | 探究溃疡性结肠炎的发病机制，特别是脂质代谢与疾病之间的因果关系 | 溃疡性结肠炎患者数据、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、结肠上皮细胞 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、集成机器学习、单细胞RNA测序、转录组分析 | LASSO、SVM、XGBoost | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4588 | 2026-01-29 |
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612262
PMID:41601657
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与机器学习模型，揭示了透明细胞肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并构建了一个基于巨噬细胞的预后特征模型 | 首次在KIRC中系统鉴定出五个转录不同的巨噬细胞亚群，特别是三个脂质相关巨噬细胞亚群，并利用随机生存森林模型构建了具有强预后性能的巨噬细胞中心特征 | 研究样本量相对有限（十个KIRC肿瘤的单细胞数据），且主要依赖公共数据库（如TCGA和CPTAC）进行验证，可能受数据异质性影响 | 旨在阐明KIRC中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，识别预后相关的巨噬细胞特征，并解析驱动KIRC进展的免疫代谢程序 | 透明细胞肾细胞癌（KIRC）患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA），机器学习模型 | 随机生存森林（RSF）模型，共使用了二十种机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，临床数据 | 十个KIRC肿瘤的单细胞RNA测序数据，并在TCGA和CPTAC独立队列中进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4589 | 2026-01-29 |
Multi-omics integration identifies NK cell dysregulation and a five-gene diagnostic signature in major depressive disorder
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700629
PMID:41601671
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了自然杀伤细胞功能障碍在重度抑郁症中的核心作用，并鉴定出五个关键基因作为诊断标志物 | 首次整合bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq数据，结合机器学习方法，系统性地识别了MDD中NK细胞的功能失调及其相关的五个关键基因诊断特征 | 样本量较小（仅3名MDD患者和3名健康对照），且仅基于外周血单核细胞进行分析，可能无法完全反映大脑内的病理变化 | 揭示重度抑郁症的细胞类型特异性转录组失调和免疫功能障碍机制，并寻找诊断生物标志物和治疗靶点 | 重度抑郁症患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 重度抑郁症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 机器学习, 伪时间轨迹分析, GSVA, scMetabolism, SCENIC | 机器学习 | 基因表达数据 | 3名MDD患者和3名健康对照的PBMCs单细胞数据，以及GSE39653数据集的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4590 | 2026-01-29 |
A multi-omics analysis of pancreatitis: bridging familial genetics and disease progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707821
PMID:41601670
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，整合家族性慢性胰腺炎和急性胰腺炎队列，揭示了胰腺炎的共享分子和细胞病理学机制 | 整合罕见家族性慢性胰腺炎的全外显子组测序与大型急性胰腺炎队列的单细胞RNA测序及批量转录组学数据，首次构建了连接遗传变异与免疫细胞特征的统一发病机制模型 | 研究样本量相对有限，特别是家族性慢性胰腺炎病例较少，且主要依赖公共数据集进行验证 | 探究胰腺炎的遗传基础和免疫细胞机制，以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 家族性慢性胰腺炎患者及其家庭成员，以及公共急性胰腺炎队列患者 | 多组学分析 | 胰腺炎 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 批量转录组学 | 人工智能驱动模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 2名儿科慢性胰腺炎患者及其家庭成员，以及119名急性胰腺炎患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4591 | 2026-01-29 |
From multi-omics to functional validation: the PTMRS stratifies TME and positions PDGFRB in CRC biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728291
PMID:41601676
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研究论文 | 本研究构建了一个基于翻译后修饰相关基因的风险特征模型（PTMRS），用于结直肠癌的预后分层，并通过实验验证了PDGFRβ在肿瘤微环境中的关键作用 | 首次整合多种翻译后修饰信号构建结直肠癌风险模型，并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了PTMRS与肿瘤微环境的关联，实验验证了PDGFRβ在成纤维细胞中的促癌功能 | 需要在体内模型和前瞻性临床队列中进一步验证 | 开发结直肠癌的精准预后分层工具并探索其生物学机制 | 结直肠癌患者样本、人类结肠成纤维细胞和结直肠癌细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞通讯分析（CellChat）、体外功能实验 | Cox偏最小二乘框架 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据集中的结直肠癌样本，多个独立队列和免疫治疗数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4592 | 2026-01-29 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization identifies mitochondrial targets in immune cells for Major Depressive Disorder
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700604
PMID:41601681
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组孟德尔随机化方法，识别了免疫细胞中与重度抑郁症风险相关的线粒体靶基因 | 整合多组学数据与机器学习，结合细胞类型特异性孟德尔随机化分析，首次在免疫细胞中鉴定出线粒体相关能量代谢基因对重度抑郁症风险的因果影响 | 研究主要基于遗传关联数据，需进一步实验验证基因功能机制；样本来源和模型验证可能限制结果的普适性 | 识别与重度抑郁症风险相关的免疫细胞中线粒体基因，为生物标志物和治疗靶点开发提供依据 | 免疫细胞中的线粒体相关能量代谢基因（MEMRGs）及重度抑郁症患者 | 生物信息学 | 重度抑郁症 | 单细胞转录组测序，孟德尔随机化，机器学习，ssGSEA，CIBERSORT | 机器学习模型（未指定具体类型），孟德尔随机化模型 | 多组学数据（包括转录组数据），遗传数据 | 未明确指定人类样本数量，但包括独立队列验证和CUMS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4593 | 2026-01-29 |
Single-cell transcriptional profiling revealed the protective effects of Buddleoside in sepsis-associated acute liver injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1713180
PMID:41601688
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了天然化合物Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用及其免疫调节机制 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明Buddleoside通过调节内皮细胞、中性粒细胞和巨噬细胞亚群来缓解脓毒症相关急性肝损伤的分子机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证；机制研究主要依赖转录组数据，缺乏蛋白质功能验证 | 评估Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用并探索其免疫调节机制 | 小鼠脓毒症相关急性肝损伤模型中的肝脏细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症相关急性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4594 | 2026-01-29 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710915
PMID:41601694
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析，揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制及预后生物标志物 | 首次结合单细胞和批量转录组数据，系统探索乳腺癌与甲状腺癌的共病分子机制，并利用机器学习构建预后模型，验证了SMR3B作为共享预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限，且样本来源和数量可能影响结果的普适性 | 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制，并识别共同的预后生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌的转录组数据，包括单细胞和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 拷贝数变异分析, 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4595 | 2026-01-29 |
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708670
PMID:41601785
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞，并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱（树突状细胞），并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 | 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 | 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，生物信息学算法 | Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，临床数据 | 来自TCGA、GEO（GSE68465和GSE31210）和单细胞数据集（GSE131907）的样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4596 | 2026-01-29 |
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/fragi.2025.1721744
PMID:41602167
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综述 | 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用，并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 | 超越对通路的简单罗列，提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架，并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 | 机制复杂性高，动物模型和体外系统存在局限性 | 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制，并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 | 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型（心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞）的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4597 | 2026-01-29 |
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1753206
PMID:41602548
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研究论文 | 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架，用于区分斑秃和雄激素性脱发 | 提出了一种结合生物学先验知识（MultiPLIER潜在变量）和关系式集合比较的少样本深度学习分类器，增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 | 研究样本量有限，且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 | 开发可解释的AI框架，用于小样本转录组诊断，以区分斑秃和雄激素性脱发 | 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 | 机器学习 | 脱发疾病 | RNA-seq | 少样本深度学习分类器（Relation-style set-to-set comparator） | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4598 | 2026-01-29 |
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health
IF:2.3Q3
DOI:10.3389/frph.2025.1747902
PMID:41602862
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 | 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学（约1微米分辨率）结合Salus Cellbins算法，首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征，克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 | 研究仅基于小鼠模型，未直接验证人类样本；高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 | 探究精子发生的分子基础和时空动态，以增进对男性生殖生物学的理解 | 小鼠睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | Salus-STS | Salus-STS高分辨率空间转录组学（约1微米分辨率） |
| 4599 | 2026-01-29 |
Epigenomic, transcriptomic and proteomic characterizations of reference samples
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.612110
PMID:39314461
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研究论文 | 本研究通过ATAC-seq、Methyl-seq、RNA-seq和蛋白质组学分析，全面表征了乳腺癌细胞系和配对B细胞系的表观基因组、转录组和蛋白质组景观，提供了多组学参考材料 | 首次为两种细胞系提供了包括表观基因组和蛋白质组在内的全面多组学参考数据，填补了现有参考材料在表观组学和蛋白质组学方面的空白 | 研究仅基于两种细胞系，可能无法完全代表更广泛的生物样本多样性 | 开发和验证用于下一代测序技术和临床应用的参考标准材料 | 乳腺癌细胞系和配对的B细胞系 | 多组学分析 | 乳腺癌 | ATAC-seq, Methyl-seq, RNA-seq, 蛋白质组学分析, 全基因组测序, HiC, scRNA-seq | NA | 基因组、表观基因组、转录组、单细胞RNA-seq和蛋白质组数据 | 两种细胞系（乳腺癌细胞系和配对B细胞系） | Illumina, PacBio, Nanopore | 全基因组测序, HiC, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 甲基化测序, RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4600 | 2026-01-29 |
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10167
PMID:39360029
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综述 | 本文通过挖掘小鼠和人类肾脏的单细胞及单核RNA测序数据库，发现肾小球壁层上皮细胞（PECs）表达全谱的视黄酸合成相关基因，并定位了ALDH1A2介导的视黄酸合成通路，探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 | 首次利用单细胞及单核RNA测序数据，系统性地将ALDH1A2介导的视黄酸合成通路定位到肾小球壁层上皮细胞，并揭示了该通路在多种肾脏疾病模型及患者中的表达变化 | 本文主要基于数据挖掘和生物信息学分析，提出的假说（即PECs中ALDH1A2介导的视黄酸合成在肾脏中发挥未定义的作用且其失调介导损伤）仍需通过条件性基因敲除、RNA沉默及转基因小鼠模型等实验进行验证 | 阐明ALDH1A2介导的视黄酸合成通路在肾脏（特别是肾小球壁层上皮细胞）中的定位、表达调控及其在肾脏生理和病理（如肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病等）中的潜在作用 | 小鼠和人类肾脏组织，特别是肾小球壁层上皮细胞（PECs） | 数字病理学 | 肾脏疾病（包括肾小球肾炎、急性肾损伤、慢性肾病、糖尿病肾病、局灶节段性肾小球硬化、多囊肾病等） | 单细胞RNA测序，单核RNA测序，Spearman秩相关系数分析，基因本体通路分析 | NA | RNA测序数据（单细胞及单核水平） | NA（涉及多个公开数据库中的小鼠模型及人类患者数据） | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |