单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31406 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-09-21 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis reveals prognostic stemness genes in leiomyosarcoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1604413
PMID:40963856
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别平滑肌肉瘤中的预后干性基因 | 结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，利用机器学习识别恶性细胞并计算干性指数，发现六个新的预后标志物 | NA | 识别平滑肌肉瘤的可靠预后标志物和治疗靶点 | 平滑肌肉瘤（LMS）患者及其肿瘤细胞 | 生物信息学 | 平滑肌肉瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 机器学习 | Cox回归, Lasso回归 | RNA测序数据，临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的平滑肌肉瘤样本 |
| 442 | 2025-09-21 |
Case Report: A large granular cell tumor of the cervical esophagus with single cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1580121
PMID:40963874
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病例报告 | 本文报告一例罕见的大型食管颗粒细胞瘤病例，并首次应用单细胞RNA测序技术分析其细胞特征 | 首次对食管颗粒细胞瘤进行单细胞RNA测序分析，发现神经样细胞亚群富集及X染色体区域显著拷贝数变异 | NA | 探索食管颗粒细胞瘤的恶性潜能标志物并评估大型食管缺损修复方法的有效性 | 一例患有大型颈段食管颗粒细胞瘤的患者 | 数字病理学 | 食管肿瘤 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者（包含肿瘤及癌旁组织样本） |
| 443 | 2025-09-21 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals a Pathological Niche Formed by FAP+ Fibroblasts, Immune, and Endothelial Cells in Psoriatic Lesions
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S541106
PMID:40963886
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，揭示银屑病病变中由FAP+成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞形成的病理微环境 | 首次发现银屑病病变特异性CD4+组织驻留记忆T细胞亚群和Venous endo2内皮细胞亚群，并揭示它们与FAP+成纤维细胞的空间共定位形成类似三级淋巴结构的致病微环境 | NA | 阐明银屑病发病机制的细胞和分子机制 | 银屑病患者的病变皮肤组织 | 生物信息学 | 银屑病 | scRNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 444 | 2025-09-21 |
Nociceptive Neurons Promote Myeloid-Derived Suppressor Cell Mobilization to Alleviate Post-Stroke Neuroinflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.119474
PMID:40963921
|
研究论文 | 本研究探讨了伤害性神经元通过释放CGRP调控骨髓免疫反应以缓解脑梗死后神经炎症的机制 | 首次揭示伤害性神经元在脑梗死后通过CGRP信号促进髓系偏向造血和MDSC动员的抗炎作用，并开发靶向纳米颗粒递送系统以克服CGRP的降压副作用 | 研究主要基于小鼠MCAO模型和有限人类样本，临床转化需进一步验证 | 探究伤害性神经元在脑梗死后免疫调控中的作用及治疗策略 | MCAO小鼠模型和脑卒中患者颅骨骨髓样本 | 神经免疫学 | 脑卒中 | 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、受体敲除、纳米颗粒靶向递送 | NA | 分子生物学数据、细胞学数据 | 小鼠模型及人类卒中患者骨髓样本（具体数量未明确说明） |
| 445 | 2025-09-21 |
Dimeric CCK2R radiotheranostic tracers synergize with mTOR inhibition for enhanced tumor therapy
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.117021
PMID:40963930
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研究论文 | 本研究开发了一种新型二聚体CCK2R靶向放射性示踪剂，并探索其与mTOR抑制剂联用增强肿瘤治疗的协同效应 | 首次设计并评估二聚体CCK2R靶向放射性药物，结合mTOR抑制和单细胞RNA测序揭示放射增敏机制，发现GSTK1为关键调控因子 | 研究主要聚焦于临床前模型，尚未进行人体试验验证 | 开发高效靶向CCK2R的放射性诊疗药物并提升肿瘤放疗敏感性 | 神经内分泌肿瘤，特别是甲状腺髓样癌(MTC)和小细胞肺癌(SCLC) | 放射医学与分子影像 | 神经内分泌肿瘤 | PET成像、放射性核素治疗、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 分子影像数据、基因表达数据 | 临床前动物模型（具体样本量未明确说明） |
| 446 | 2025-09-21 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Lactylation Related Genes in Lung Adenocarcinoma
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S533289
PMID:40964497
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨乳酸化修饰在肺腺癌中的作用及其相关基因 | 首次系统研究乳酸化修饰在肺腺癌中的水平及其作为预后标志物和治疗靶点的双重定位 | 样本量有限（TCGA n=365），且主要依赖公共数据库和体外实验验证 | 探究乳酸化修饰在肺腺癌中的表达水平及其临床意义 | 肺腺癌组织及细胞系（如H1299） | 生物信息学 | 肺癌 | 免疫组化、免疫荧光、Western blot、RNA测序、KEGG通路分析、COX回归分析 | NA | 多组学数据（包括基因表达和蛋白质修饰数据） | TCGA数据库365例样本，GEO数据库单细胞RNA测序数据 |
| 447 | 2025-09-21 |
Research Progress of Natural Killer Cells in Hashimoto's Thyroiditis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S545646
PMID:40964505
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综述 | 本文综述了自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的双重作用及其潜在治疗靶点价值 | 通过单细胞RNA测序技术揭示NK细胞功能异质性，并发现NLRP3炎症小体异常激活驱动NK细胞介导的甲状腺滤泡细胞焦亡新机制 | NA | 探讨自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎免疫失衡中的作用机制 | 桥本甲状腺炎患者及自然杀伤细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 448 | 2025-09-21 |
Randomized Spatial PCA (RASP): a computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629785
PMID:39763720
|
研究论文 | 提出一种名为RASP的计算高效降维方法，用于处理高分辨率空间转录组数据 | 基于随机化两阶段PCA框架，结合稀疏矩阵运算和可配置空间平滑，计算速度比现有方法快数个数量级 | NA | 开发高效降维方法以识别组织中的空间域并理解组织结构和生物过程机制 | 人类和小鼠组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术（包括10x Visium, Stereo-Seq, MERFISH, 10x Xenium） | 随机化主成分分析（PCA） | 空间基因表达数据 | 四个公开ST数据集，包含数十万个位置 |
| 449 | 2025-09-21 |
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.590643
PMID:38712198
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据，构建了人类海马体的分子图谱 | 首次结合snRNA-seq和SRT技术，在保留细胞结构组织的同时解析海马体细胞类型的分子特征和空间分布 | 样本仅来自10名神经典型成人捐赠者，可能限制结果的普适性 | 定义海马体细胞类型和空间域的分子特征 | 人类前海马体组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学(SRT), 非负矩阵分解(NMF) | NMF | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 10名成人神经典型捐赠者的海马体组织切片 |
| 450 | 2025-09-21 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
|
研究论文 | 提出一种名为spoon的统计框架，用于消除空间转录组数据中的均值-方差关系偏差，以更准确地识别空间可变基因 | 首次在空间转录组数据中证明均值-方差关系存在，并采用Empirical Bayes技术开发偏差校正方法 | NA | 改进空间转录组数据分析中空间可变基因（SVGs）的识别准确性 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，Empirical Bayes | 统计模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和真实数据（具体数量未说明） |
| 451 | 2025-09-21 |
Shear stress is uncoupled from atheroprotective KLK10 in atherosclerotic plaques
2024-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过比较健康和动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应激的转录组反应，揭示了动脉粥样硬化斑块中生理剪切应激与保护性因子KLK10的解耦现象 | 发现动脉粥样硬化病变中Nos3高表达内皮细胞出现炎症和凋亡基因富集，且保护性因子KLK10表达显著降低，解释了剪切应激在疾病进展中的矛盾作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；单细胞RNA测序样本量有限 | 探究动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应激的反应机制 | 小鼠动脉内皮细胞（健康C57BL/6、轻度病变Apoe-/-正常饮食、重度病变Apoe-/-高脂饮食） | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 3D光片成像、计算流体动力学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | 三组小鼠模型（具体数量未明确说明） |
| 452 | 2025-09-21 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569014
PMID:38168452
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研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽通过加速细胞周期G1期进程促进植物再生过程中的细胞重编程 | 首次发现损伤部位附近细胞通过缩短G1期加速分裂，并证实谷胱甘肽在G1期向S期转变中的关键调控作用 | 研究局限于拟南芥根系模型，尚未在其他植物体系或创伤类型中验证 | 探究细胞周期动态在植物细胞重编程过程中的作用机制 | 拟南芥根系细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 拟南芥根系细胞（具体数量未明确说明） |
| 453 | 2025-09-21 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2024-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.23.609477
PMID:39229093
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研究论文 | 提出SPACE框架，通过调整细胞类型混杂效应改进空间可变基因聚类以提升空间域检测精度 | 无需预先设定基因簇数量、空间模式或细胞类型信息即可实现SVG聚类，并有效消除细胞类型共享造成的混杂效应 | 未明确说明方法对低质量数据或极端噪声场景的鲁棒性 | 改进空间转录组学中的空间域检测精度 | 空间可变基因（SVGs） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | 聚类框架（无监督学习） | 空间基因表达数据 | 基于综合模拟和真实数据分析（未明确样本数量） |
| 454 | 2025-09-21 |
SpotSweeper: spatially-aware quality control for spatial transcriptomics
2024-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597765
PMID:38895212
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研究论文 | 提出一种名为SpotSweeper的空间转录组学数据质量控制方法，专注于识别局部异常和区域伪影 | 首次针对空间转录组学设计空间感知的质量控制方法，能够区分生物异质性和技术伪影，并检测特有的组织学伪影 | NA | 开发专门用于空间转录组学数据的质量控制工具，提高数据可靠性 | 空间转录组学数据中的单个位点和区域 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学（SRT），单核RNA测序（snRNA-seq） | 多尺度分析方法 | 空间转录组数据 | 使用公开可用的Visium数据，具体样本量未明确说明 |
| 455 | 2025-09-21 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了PD-L1表达巨噬细胞在关节炎中的保护作用及其机制 | 首次揭示PD-L1+巨噬细胞通过表达MerTK和IL-10在关节炎中发挥保护作用，并证实其在人类滑膜组织中存在 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证仍需扩展 | 探究PD-L1在滑膜组织中的免疫调节作用及其在关节炎中的保护机制 | 小鼠模型（CIA）和人类滑膜组织（健康个体和类风湿关节炎患者） | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、并生技术、Cre-Lox基因敲除、RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 分子表达数据、细胞表型数据、基因测序数据 | 小鼠模型及人类滑膜组织样本（具体数量未明确说明） |
| 456 | 2025-09-21 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
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研究论文 | 本研究探讨了靶向非连接性Claudin-1的单克隆抗体在肝细胞癌治疗中的作用及机制 | 首次揭示非连接性CLDN1作为HCC治疗靶点，并通过抗体干预调控肿瘤干细胞特性、代谢和免疫微环境 | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 开发肝细胞癌的新型靶向治疗方法 | 肝细胞癌（HCC）细胞系、患者来源的3D体外模型及异种移植小鼠模型 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、单克隆抗体技术 | NA | 基因表达数据、体内外实验数据 | 大量细胞系衍生异种移植模型和患者来源异种移植模型（具体数量未明确说明） |
| 457 | 2025-09-20 |
Immunobiology of primary sclerosing cholangitis
2025-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001080
PMID:39226402
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综述 | 本文全面回顾了原发性硬化性胆管炎（PSC）的免疫生物学研究进展，重点关注免疫细胞类型和新技术应用 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术，揭示PSC肝脏中免疫细胞的时空异质性 | 部分新发现细胞类型的胆道定位及其在PSC免疫病理中的作用尚未完全阐明 | 探讨免疫系统在PSC发病机制中的关键作用 | 原发性硬化性胆管炎（PSC）患者肝脏免疫微环境 | 免疫生物学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 基因组数据、空间转录组数据 | NA |
| 458 | 2025-09-20 |
Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
PMID:40220905
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤源性可溶性CD109通过调控肿瘤相关巨噬细胞重塑肿瘤免疫微环境，从而抑制免疫反应 | 首次发现sCD109作为‘分泌型免疫检查点’通过双重机制（激活FcγRI/SYK/NF-κB信号通路和竞争性抑制CD73蛋白降解）调控巨噬细胞表型 | 研究主要基于临床前模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索肝内胆管癌免疫抑制微环境的形成机制并开发免疫治疗新靶点 | 肝内胆管癌（iCCA）及其肿瘤免疫微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式、RNA测序、质谱分析 | NA | 多组学数据（蛋白质组、转录组、单细胞数据） | 未明确说明样本数量，但使用多组学方法分析iCCA样本 |
| 459 | 2025-09-20 |
Decoding the resistin-CAP1 pathway in intermediate monocytes mediating liver allograft rejection
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.04.037
PMID:40345627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了中间单核细胞通过resistin-CAP1通路介导肝移植排斥反应的机制 | 首次在肝移植领域应用空间转录组学技术，并发现中间单核细胞通过resistin-CAP1信号轴参与T细胞介导的急性排斥反应 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，人类临床应用的有效性和安全性仍需进一步验证 | 探索肝移植排斥反应的新型免疫治疗靶点 | 大鼠移植肝脏和外周血单核细胞样本，以及人类T细胞功能验证 | 生物医学研究 | 肝移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 纳米金技术 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | 24个大鼠移植肝脏和外周血单核细胞样本 |
| 460 | 2025-09-20 |
Preterm Birth Conditions Alter Muscle Stem Cells and Their Niche, Causing Lasting Impairments in Muscle Regeneration and Function
2025-Oct, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.70058
PMID:40955870
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研究论文 | 研究早产相关条件通过炎症微环境破坏肌肉干细胞功能，导致肌肉再生和功能持久受损的机制 | 首次揭示TNF-α/NF-κB信号通路在早产相关肌肉干细胞损伤中的关键作用，并证明早期使用TNF-α抑制剂可恢复干细胞功能 | 人类样本数据趋势相似但样本量有限，动物模型与人类生理存在差异 | 探究早产相关条件对骨骼肌干细胞功能及再生能力的影响机制 | 啮齿动物模型和早产/足月人类婴儿肌肉样本 | 发育生物学 | 早产相关并发症 | 单细胞转录组测序、体外细胞培养、离体肌肉收缩特性分析、体内肌肉损伤实验 | NA | 基因表达数据、细胞形态数据、生理功能数据 | 啮齿动物模型及人类早产/足月婴儿肌肉样本（具体数量未明确说明） |