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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-04-11 |
Targeting the Microglia-Astrocyte OSM-OSMR Axis Restores Blood-Brain Barrier Integrity After Experimental Cerebral Ischemia-Reperfusion in Mice
2026-Apr-10, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05810-2
PMID:41961341
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研究论文 | 本文通过实验揭示了小鼠脑缺血再灌注后,小胶质细胞OSM与星形胶质细胞OSMR轴在血脑屏障破坏中的关键作用,并证明靶向该轴可恢复屏障完整性 | 首次在小鼠脑缺血再灌注模型中,通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析,明确了小胶质细胞OSM与星形胶质细胞OSMR轴是介导血脑屏障破坏的关键机制,并提供了特异性基因敲除的实验证据 | 研究基于小鼠实验模型,其结论在人类临床中的转化有效性尚需进一步验证,且未探讨其他可能参与的血脑屏障调控通路 | 探究缺血性卒中后血脑屏障破坏的胶质细胞介导机制,并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠脑缺血再灌注模型中的小胶质细胞、星形胶质细胞及血脑屏障 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析,电子显微镜,葡聚糖渗漏实验,细胞间通讯分析,邻近连接实验 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2026-04-11 |
Loss of Tumor-Infiltrating Lymphocytes and Poor Response to Immunotherapy in IDH GOF Mutant Melanoma
2026-Apr-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195384
PMID:41955022
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研究论文 | 本研究探讨了IDH GOF突变黑色素瘤患者对免疫检查点阻断疗法反应差的原因,通过分析临床、免疫和转录组数据揭示了IDH突变与免疫排斥及DNA甲基化紊乱的关联 | 首次在人类黑色素瘤中表征IDH GOF突变的作用,揭示了其与肿瘤微环境中免疫浸润减少和免疫治疗抵抗的关联 | 未明确说明样本量大小,且IDH突变在黑色素瘤中的机制仍需进一步验证 | 探究IDH GOF突变黑色素瘤对免疫治疗抵抗的机制 | IDH GOF突变黑色素瘤患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2026-04-11 |
Multi-Omics Graph Attention Network for Key Gene Prediction in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Apr-09, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682485
PMID:41955157
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研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的多模态框架,整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和影像组学数据,用于预测三阴性乳腺癌的关键基因 | 创新点在于首次将scRNA-seq、scATAC-seq和影像组学数据通过图注意力网络整合,利用多模态图结构捕捉跨模态调控相互作用,并采用集成多层感知机进行患者预后分层 | NA | 开发一个可解释的多模态生物标志物发现框架,用于三阴性乳腺癌的个性化治疗 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq, scATAC-seq, 影像组学 | 图注意力网络, 集成多层感知机 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 影像特征数据 | 外部TCGA-TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 444 | 2026-04-11 |
scAClc: A Multi-Objective Adaptive Clustering Framework for Single-Cell Transcriptomics via Contrastive and Resolution-Aware Representation Learning
2026-Apr-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c06601
PMID:41955402
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研究论文 | 本文提出了一种名为scAClc的新型单细胞转录组学聚类框架,该框架通过对比学习和自适应分辨率发现来解决数据稀疏性、高维度和噪声等挑战 | 提出了三个关键创新模块:1) 分层基因相关性模块整合全局基因变异性和局部邻域特异性信号;2) 锚点中心对比学习模块自适应选择代表性锚点指导嵌入学习;3) 自适应分辨率发现模块通过联合建模簇内和簇间距离自动推断聚类数量 | 未明确说明框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个能够自动推断聚类数量并提高单细胞RNA测序数据聚类准确性的多目标自适应聚类框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习、多目标优化框架 | 基因表达数据 | 15个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2026-04-11 |
Sonodynamic Therapy Attenuates TLR4/NF-κB Signaling in Epicardial Adipose Tissue of Atrial Fibrillation: Insights from Animal Models, scRNA-seq, and Mendelian Randomization
2026-Apr-09, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001825
PMID:41955609
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研究论文 | 本研究探讨了声动力疗法(SDT)通过靶向TLR4/NF-κB信号通路,减轻心房颤动(AF)模型心外膜脂肪组织(EAT)中巨噬细胞介导的炎症反应,并评估其临床转化潜力 | 首次结合动物模型、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和孟德尔随机化方法,系统验证了SDT通过调控TLR4/NF-κB通路(特别是CXCL8)减轻EAT炎症,为AF治疗提供了新的靶向策略 | 研究主要基于兔AF模型,临床样本量有限,SDT在人体中的长期安全性和疗效仍需进一步验证 | 探究声动力疗法(SDT)对心房颤动(AF)中心外膜脂肪组织(EAT)炎症的调控作用及潜在治疗机制 | 兔AF模型、人类心外膜脂肪组织(EAT)及右心耳组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、网络药理学、Western blot、RT-qPCR、免疫组化(RAM11)、Masson染色、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 | 兔AF模型分组(假手术组、起搏组、SDT组)及人类EAT与右心耳单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2026-04-11 |
RNA helicase SKIV2L impedes tumor immunity by reprogramming arginine metabolism of hepatocellular carcinomas
2026-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014192
PMID:41956538
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研究论文 | 本研究揭示了RNA解旋酶SKIV2L通过调控肝细胞癌的精氨酸代谢,促进肿瘤免疫逃逸,并作为c-Myc的转录靶点,为克服CAR T细胞疗法耐药性提供了新策略 | 首次发现SKIV2L通过招募GNL3稳定精氨酸代谢相关mRNAs,驱动c-Myc-SKIV2L-精氨酸代谢轴,重塑肿瘤微环境并损害T细胞功能 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证;机制细节如SKIV2L与GNL3互作的具体结构域未完全阐明 | 阐明肝细胞癌免疫抑制微环境的分子机制,以提升免疫疗法(如CAR T细胞疗法)疗效 | 肝细胞癌(HCC)细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞(如T细胞) | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RNA免疫沉淀测序, 免疫沉淀-质谱分析, 邻近连接实验, 流式细胞术, 肿瘤-T细胞共培养实验 | NA | RNA测序数据, 质谱数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2026-04-11 |
Neuronal Subtype-Specific Ribosomal Protein mRNA Expression
2026-Apr-09, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080954.126
PMID:41956739
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了小鼠大脑皮层和海马体的单细胞RNA-seq数据,揭示了神经元亚型中核糖体蛋白mRNA表达的特定模式 | 首次在神经元亚型水平上全面绘制核糖体蛋白基因表达图谱,揭示了兴奋性与抑制性神经元之间以及不同神经元亚类之间的差异表达模式 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚需验证;且仅关注mRNA表达水平,蛋白质翻译活性的直接关联未深入探讨 | 探究核糖体蛋白mRNA在神经元亚型中的表达组织,以理解其超越经典翻译功能的调控作用 | 小鼠大脑皮层和海马体的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 基于多个单细胞RNA-seq数据集,具体样本数量未明确说明,但覆盖了小鼠大脑皮层和海马体的神经元亚型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 研究中使用了两种独立的单细胞技术:Smart-seq2和10x Genomics,但未指定10x Genomics的具体产品细节,推测为10x Chromium单细胞3'或类似平台 |
| 448 | 2026-04-11 |
Podoplanin-defined tumour plasticity and CCR7-mediated lymphatic metastasis in triple-negative breast cancer
2026-Apr-09, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03402-4
PMID:41957138
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌中podoplanin定义的肿瘤可塑性与CCR7介导的淋巴转移之间的关系 | 揭示了缺氧促进的PDPN表达与CCR7功能在淋巴转移中的协同作用,并提出了联合CCR7-PDPN评分作为淋巴结阳性患者预后指标的新方法 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系数据,人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤细胞可塑性与淋巴转移的机制 | 三阴性乳腺癌细胞系、小鼠模型和人类肿瘤样本 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, 转录组分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 包括小鼠模型、细胞系和METABRIC乳腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2026-04-11 |
CD73high fibroblasts orchestrate keratinocyte inflammation in the psoriasis-associated epithelial immune microenvironment
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71323-0
PMID:41957361
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研究论文 | 本研究通过代谢组学、单细胞和空间转录组学分析,揭示了CD73高表达成纤维细胞通过腺苷介导角质形成细胞炎症,在银屑病相关上皮免疫微环境中的作用机制 | 首次发现CD73高表达成纤维细胞亚群通过代谢微环境与角质形成细胞相互作用,调控上皮炎症,为靶向成纤维细胞-角质形成细胞串扰的治疗策略提供了原理证明 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本,人类临床转化需进一步验证;机制细节如腺苷具体代谢途径有待深入探索 | 探究银屑病中上皮免疫微环境的代谢失调机制,特别是成纤维细胞与角质形成细胞间的相互作用 | 银屑病患者皮肤样本、咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠皮肤炎症模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 代谢组学分析、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | 银屑病患者样本和小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 450 | 2026-04-11 |
Single-cell and spatial transcriptomics analyses reveal tumor microenvironment-driven proliferation of NF2-associated vestibular schwannomas
2026-Apr-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03799-y
PMID:41957607
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2026-04-11 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to reveal the spatiotemporal dynamics of retinal cells during ischemia-reperfusion injury progression in rats
2026-Apr-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01571-6
PMID:41957682
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2026-04-11 |
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05006-4
PMID:41957847
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研究论文 | 本文开发了一种快速共分化平台,利用人诱导多能干细胞生成具有生物响应性的结肠样肠道组织补片 | 开发了一种新型早期阶段hiPSC共分化平台,能在8天内生成多种肠道细胞谱系,简化了流程并减少了动物产品使用 | 研究仍处于早期阶段,需要进一步开发以用于临床治疗 | 开发可移植的肠道黏膜组织移植物,以辅助肠道疾病愈合 | 人诱导多能干细胞及其衍生的肠道细胞谱系 | 再生医学 | 肠道疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据、蛋白质表达数据 | 多个hiPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2026-04-11 |
Guanylate-binding proteins balance iNOS/Arg-1 in myeloid cells during L. major infection and promote host defense to infection
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02825-25
PMID:41805192
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白(Gbps)在利什曼原虫感染期间对宿主巨噬细胞免疫反应的调控作用 | 揭示了Gbps通过平衡iNOS/Arg-1表达调控巨噬细胞极化,其保护作用不依赖于Gbp定位于寄生虫的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;Gbps的具体信号通路机制尚未完全阐明 | 阐明Gbps在皮肤利什曼病感染期间对宿主免疫防御的调控机制 | C57BL/6小鼠、骨髓来源巨噬细胞、单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | Gbp敲除小鼠和C57BL/6对照小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 454 | 2026-04-11 |
Comprehensive immune profiling reveals IFN-γ signaling in T cells mediates parasite phagocytosis in a rodent malaria model
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03938-25
PMID:41810957
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研究论文 | 本研究通过啮齿动物疟疾模型和综合转录组学分析,揭示了IFN-γ信号在T细胞中通过增强T细胞-单核细胞相互作用,介导寄生虫吞噬,从而在疟疾相关肺部病理中发挥关键作用 | 首次在疟疾模型中结合流式细胞术、时间序列批量转录组学和空间转录组学,系统描绘了肺部免疫景观,并发现IFN-γ信号通过调控T细胞-单核细胞相互作用影响寄生虫吞噬,特别是鉴定出具有高吞噬能力的CD8表达促炎单核细胞亚群 | 研究基于啮齿动物模型,结果在人类疟疾中的直接适用性需进一步验证;空间转录组学等技术可能受分辨率限制,未能完全解析细胞间相互作用的精细机制 | 阐明疟疾相关肺部病理的免疫机制,特别是IFN-γ信号在T细胞中的作用及其对寄生虫清除的影响 | 啮齿动物疟疾模型中的肺部免疫细胞,特别是T细胞和单核细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术、时间序列批量转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 批量转录组学 | NA | NA |
| 455 | 2026-04-11 |
Hypoxia-inducible factor signaling regulates embryonic interneuron development, GRIN2B expression and adult cortical function
2026-Apr-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2026.01.007
PMID:41650955
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导因子(HIF)信号通路在胚胎中间神经元发育、GRIN2B表达及成年皮层功能中的非经典作用 | 首次发现HIF信号通过调节Lhx6阳性中间神经元前体增殖和直接激活GRIN2B基因,影响PV中间神经元生成和皮层环路成熟 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;单细胞转录组学分析可能受样本量限制 | 探究HIF信号在抑制性神经元发育和皮层功能中的作用机制 | 小鼠内侧神经节隆起(MGE)来源的中间神经元前体及成年皮层PV中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、条件性基因敲除、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据、图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠胚胎和成年皮层组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2026-04-11 |
Gut microbiota-derived indole-3-lactic acid suppresses anti-PD-1 efficacy in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Apr-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.02.019
PMID:41881017
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研究论文 | 本研究揭示了唾液乳杆菌通过产生吲哚-3-乳酸抑制抗PD-1免疫疗法在食管鳞状细胞癌中疗效的机制 | 首次将特定肠道菌(唾液乳杆菌)及其代谢产物(吲哚-3-乳酸)与ESCC免疫治疗耐药性联系起来,并阐明其通过AhR/NF-κB信号通路抑制NKG7⁺CD8⁺ Tpex细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接验证仍需进一步扩大样本量;未探讨其他可能共存的菌群或代谢物影响 | 探究肠道菌群影响食管鳞状细胞癌抗PD-1免疫疗法疗效的机制 | 食管鳞状细胞癌患者、人源化微生物组小鼠模型、原位ESCC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 人源化微生物组小鼠模型、原位肿瘤小鼠模型 | 粪便样本、单细胞转录组数据 | 122例ESCC患者粪便样本(含两个验证队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2026-04-11 |
Identification and comparison of orthologous cell types from primate embryoid bodies shows limits of marker gene transferability
2026-Apr-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.105398
PMID:41949281
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研究论文 | 本研究通过分析四种灵长类动物胚胎样体的单细胞RNA测序数据,开发了一种半自动化计算流程来识别跨物种的同源细胞类型,并揭示了物种间标记基因的可转移性有限 | 开发了结合分类和基于标记的聚类注释的半自动化计算流程,首次在四种灵长类动物胚胎样体数据中系统识别同源细胞类型并评估标记基因的跨物种保守性 | 研究仅基于体外诱导多能干细胞衍生的胚胎样体模型,未涵盖体内发育环境;物种数量有限(四种灵长类),且细胞类型为连续发育谱系,增加了注释难度 | 开发跨物种同源细胞类型识别方法并评估标记基因的跨物种可转移性 | 人类、猩猩、食蟹猴和恒河猴的诱导多能干细胞衍生的胚胎样体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分类与聚类分析的计算流程 | 单细胞转录组数据 | 四种灵长类物种的诱导多能干细胞衍生的胚胎样体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 458 | 2026-04-11 |
ACAT1-mediated lactylation reprogramming governs immune-stromal crosstalk in ulcerative colitis
2026-Apr-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116626
PMID:41955702
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研究论文 | 本研究通过整合分析发现ACAT1作为乳酰化修饰的关键枢纽基因,在溃疡性结肠炎中调控乳酸代谢和免疫-基质互作网络 | 首次系统性地将乳酰化修饰与溃疡性结肠炎发病机制联系起来,并鉴定ACAT1为核心调控因子,建立了乳酰化亚型分层系统 | 研究主要基于生物信息学分析和体外/小鼠模型验证,缺乏大规模临床样本的直接实验证据 | 阐明乳酰化修饰在溃疡性结肠炎发病机制中的作用,并寻找潜在诊断标志物和治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的基因表达数据、结肠上皮细胞、小鼠结肠炎模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 差异表达分析、WGCNA、PPI网络、单细胞RNA测序、分子对接 | 高斯混合模型、支持向量机、随机森林、梯度提升机、XGBoost、LASSO回归 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | GEO数据集中的溃疡性结肠炎与健康对照样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-04-11 |
Mapping plant cell-type-specific responses to environmental stresses
2026-Apr-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.003
PMID:41956877
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综述 | 本文综述了单细胞/核RNA测序和空间转录组学在绘制植物细胞类型特异性响应环境胁迫转录程序方面的最新进展 | 利用单细胞和空间转录组学技术,在空间、时间和细胞类型特异性维度上解析植物对胁迫的响应,弥补了传统批量RNA测序的不足 | NA | 通过高分辨率技术加深对植物细胞水平响应环境胁迫的理解,以推动气候智能型农业策略的发展 | 植物细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞/核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 460 | 2026-04-11 |
Reconstructing biologically coherent cellular profiles from imaging-based spatial transcriptomics
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.08.710395
PMID:41959255
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研究论文 | 本文提出了一种名为TRACER的方法,用于在基于成像的空间转录组学中重构生物学上一致的细胞轮廓,以改善转录本到细胞的分配和下游分析质量 | TRACER通过利用数据中直接观察到的基因-基因一致性和转录本空间共定位,无需外部注释或参考图谱,即可解决混合细胞轮廓问题并重构未检测到细胞核的部分细胞 | 未在摘要中明确提及 | 改善基于成像的空间转录组学中细胞轮廓的重构,以提升下游生物学解释的准确性 | 基于成像的空间转录组学数据中的细胞轮廓 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组学成像数据 | NA | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |