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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-06-09 |
BIRC5 drives cell-cycle dysregulation and represents a novel molecular target in retinoblastoma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1854143
PMID:42255235
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和功能验证,确定BIRC5(survivin)是视网膜母细胞瘤恶性增殖的细胞状态特异性调节因子,并可作为新型分子靶点 | 首次在单细胞水平上鉴定BIRC5为视网膜母细胞瘤MKI67+增殖亚群的细胞状态特异性驱动因子,揭示了其通过CCND1/CDK4激活和CHEK2-p21检查点抑制促进细胞周期紊乱的机制 | 研究主要在细胞系中进行功能验证,缺乏体内动物模型的进一步验证;样本量相对有限(13个肿瘤和3个正常样本) | 识别视网膜母细胞瘤恶性增殖的分子调节因子和潜在治疗靶点 | 视网膜母细胞瘤肿瘤细胞和正常胎儿视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达 | NA | 单细胞转录组数据 | 13个视网膜母细胞瘤肿瘤和3个正常胎儿视网膜样本,共189431个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2026-06-09 |
A cell death program-based tumor signature stratifies prognosis, immune landscape, and therapeutic response in glioma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1824504
PMID:42255240
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研究论文 | 基于细胞死亡程序构建胶质瘤预后特征,揭示其与免疫微环境和治疗响应的关联 | 首次构建整合焦亡与凋亡相关基因的预后特征(PA.Sig),从单细胞水平揭示恶性细胞状态与免疫微环境的动态互作 | 未提及具体限制 | 开发一种基于细胞死亡信号的预后特征,并阐明其在胶质瘤中的生物学和临床相关性 | 胶质瘤患者样本及细胞系 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据,临床数据 | TCGA-GBMLGG及外部验证队列 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2026-06-09 |
Transplantation immunology: paradigm shift from systemic suppression to microenvironment remodeling and precision modulation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1835561
PMID:42255472
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综述 | 系统阐述了移植免疫学从系统性免疫抑制向微环境重塑与精准调节的范式转变,重点介绍了四种前沿治疗策略 | 整合高维技术(单细胞测序、表观基因组学、代谢组学)与人工智能,提出从“广谱抑制”转向“精准调节”的免疫管理新框架 | 未提供临床试验证据,缺乏对具体策略效果的定量比较 | 推动移植免疫学从系统性免疫抑制向精准免疫微环境调节的范式转变 | 同种异体移植排斥反应中的免疫细胞、细胞因子及微环境组分 | 机器学习 | 终末期器官衰竭 | 单细胞测序、表观基因组学、代谢组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2026-06-09 |
Deciphering skeletal muscle development: cellular heterogeneity and molecular regulatory networks from single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1827120
PMID:42255477
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综述 | 从单细胞和空间转录组学角度解析骨骼肌发育过程中的细胞异质性和分子调控网络 | 系统总结了单细胞RNA测序和空间转录组学在骨骼肌发育研究中的最新进展,揭示了跨物种保守机制与物种特异性调控特征,并强调了微环境作为肌肉干细胞行为空间调节因子的作用 | 未提及具体技术局限或研究空白 | 综述单细胞和空间转录组学在骨骼肌发育研究中的应用,揭示细胞异质性和分子调控网络 | 骨骼肌发育过程中的细胞和分子事件 | NA | 肌肉相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 445 | 2026-06-09 |
Integrative Transcriptomic and Single-Cell Analyses Identify ATP1A1 as a Prognostic and Immune-Associated Factor in Esophageal Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/1461834
PMID:42255487
|
研究论文 | 通过整合转录组和单细胞分析,确定ATP1A1是食管癌中一个与预后和免疫相关的因子 | 首次通过LASSO Cox回归和单细胞RNA测序数据,鉴定了ATP1A1作为食管癌预后和免疫相关因子,并揭示了其在肿瘤微环境中的表达模式和功能相关性 | 研究主要基于公共数据库,缺乏大规模临床样本验证,且ATP1A1的机制机制仍需进一步实验验证 | 识别食管癌中与线粒体应激相关的预后标志物,并分析其与免疫微环境的相互作用 | 食管癌患者的转录组数据、临床数据以及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE160269队列中的单细胞RNA测序数据 |
| 446 | 2026-06-09 |
Single Cell and Machine Learning-Based Analysis of Lysosome Mediated Cell Death Reveals Novel Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets in Cervical Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/8487184
PMID:42255486
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序与机器学习整合分析,揭示溶酶体介导的细胞死亡在宫颈癌中的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下结合15种机器学习算法系统分析LDCD在宫颈癌中的作用,并识别出六个新的预后相关枢纽基因 | 研究依赖公开数据集,可能缺乏多中心验证;未进行体外或体内功能实验验证 | 探索宫颈癌中溶酶体介导的细胞死亡的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用,并开发预后模型 | 宫颈癌患者的单细胞和转录组数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost, RFSurvival, Lasso-Cox | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多队列转录组数据来自TCGA和GEO数据库,单细胞数据来自GSE138080数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2026-06-09 |
The miR-30c-5p/SOCS3 axis is a potential driver of inflammation and metabolic imbalance in Duchenne muscular dystrophy
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1841851
PMID:42255483
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据鉴定miR-30c-5p/SOCS3轴在杜氏肌营养不良症中驱动炎症和代谢失衡的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、small RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统鉴定并验证miR-30c-5p/SOCS3轴在DMD中驱动炎症和代谢失衡的关键作用 | 未提供明确的局限性信息 | 探究miRNA-mRNA调控网络在DMD发病机制中的关键驱动因子 | DMD患者肌肉组织、mdx小鼠、C2C12肌母细胞和原代骨骼肌细胞 | 机器学习 | 杜氏肌营养不良症 | RNA-seq, 小RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析, 靶基因预测, 功能通路富集, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据 | 整合GSE38417、GSE109178、GSE157668和GSE213925数据集,具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, small RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2026-06-09 |
Network Pharmacology and Single-Cell Transcriptomic Investigation of Molecular Mechanisms Underlying Erigeron breviscapus Treatment in Acute Myocardial Infarction
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7715750
PMID:42255489
|
研究论文 | 结合网络药理学和单细胞转录组学,建立预测性计算框架,探究灯盏细辛治疗急性心肌梗死的分子机制 | 首次将网络药理学与单细胞转录组学系统整合,构建多组分、多靶点、多通路机制的计算建模框架,揭示灯盏细辛在急性心肌梗死中的细胞特异性靶向作用 | 研究基于计算预测和公共数据库数据,缺乏大规模临床试验验证;单细胞转录组数据来源有限,可能无法完全反映人体复杂性;结论需要进一步实验验证 | 建立预测性计算框架,阐明灯盏细辛治疗急性心肌梗死的多靶点分子机制 | 灯盏细辛的活性化合物及其治疗靶点、急性心肌梗死相关基因、心脏细胞群(心肌细胞、心脏成纤维细胞、内皮细胞、巨噬细胞和T淋巴细胞) | 生物信息学、网络药理学、单细胞转录组学 | 急性心肌梗死、心血管疾病 | 网络药理学、单细胞RNA测序、UMAP降维、Monocle 3拟时序分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠AMI模型样本、公共数据库基因集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 449 | 2026-06-09 |
Identification of genes associated with smell dysfunction in Parkinson's disease
2026, Clinical parkinsonism & related disorders
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.prdoa.2026.100453
PMID:42255497
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研究论文 | 整合临床和转录组数据分析帕金森病嗅觉功能障碍相关基因 | 通过机器学习特征排序确定嗅觉功能丧失是区分帕金森病与健康对照的最有价值临床指标,并整合WGCNA、DNA甲基化和单细胞RNA测序数据揭示其分子机制 | 研究主要依赖外周血转录组数据,可能无法完全反映大脑嗅觉区域的分子变化;缺乏独立队列验证 | 探究帕金森病中嗅觉功能障碍的遗传基础及其作为早期诊断标志物的潜力 | 帕金森病患者和健康对照个体 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | 加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | 临床数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 来自PPMI数据库的外周血样本及独立单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2026-06-09 |
Integrative Analysis of Genetic Risk Factors for Acute Myeloid Leukemia Using Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Validation
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5584620
PMID:42255490
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序验证,综合分析急性髓系白血病的遗传风险因素 | 将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序验证相结合,全面评估遗传暴露与AML风险之间的因果关系,并揭示风险基因在造血谱系中的细胞特异性表达模式 | 未明确提及,但基于描述,可能受限于MR分析中的潜在混杂因素和单细胞测序样本量有限 | 评估遗传因素与急性髓系白血病风险之间的因果关系,并验证基因表达模式 | 急性髓系白血病相关的遗传因素和造血细胞群体 | 机器学习和计算生物学 | 急性髓系白血病 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和遗传变异数据 | NA(未明确说明样本量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-06-09 |
Correction: Detection of differentially expressed genes in spatial transcriptomics data by spatial analysis of spatial transcriptomics: A novel method based on spatial statistics
2026, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2026.1867303
PMID:42255936
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更正 | 对前期发表的关于通过空间转录组学数据的空间分析检测差异表达基因的文章进行更正 | 更正本身不具备创新性 | 更正内容局限于对原文错误的修正 | 修正空间转录组学数据中差异表达基因检测方法的错误 | 更正通知本身无研究对象 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2026-06-09 |
Immunoengineering in the field of tendon and bone regeneration: immunomodulatory biomaterials, delivery platforms, and preclinical models for chronic diseases
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1844904
PMID:42256713
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综述 | 系统总结了旨在克服肌腱-骨界面再生挑战的“骨免疫工程”最新范式转变 | 提出下一代智能生物物理和化学干预策略,包括压电纳米水凝胶、Janus不对称微流体接口和精准空间递送平台,并强调闭环动态自适应生物材料与人工智能的深度融合 | NA | 综述骨免疫工程在肌腱和骨再生中的最新进展,旨在克服慢性疾病导致的再生微环境破坏问题 | 肌腱-骨界面及其在慢性退行性病变(如衰老、糖尿病和类风湿关节炎)下的再生 | 机器学习 | 肌腱和骨损伤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 453 | 2026-06-08 |
Age-associated differences in XBB.1.5 trivalent booster vaccine-induced adaptive responses revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2026.2627067
PMID:41631690
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示XBB.1.5三价加强疫苗诱导的适应性反应中与年龄相关的差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统比较老年人和年轻人在接种XBB.1.5三价重组蛋白加强疫苗后免疫反应的年龄相关差异,揭示了B细胞和T细胞转录轨迹的年龄特异性变化 | 需要进一步的纵向和功能研究来阐明这些观察结果的机制基础和临床意义 | 表征老年人对更新版COVID-19加强疫苗免疫反应的年龄相关差异 | 22名年轻个体(<38岁)和20名老年个体(≥73岁),均曾接种过2-3剂灭活COVID-19疫苗 | 机器学习 | 新型冠状病毒肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42名个体(22名年轻和20名老年)的外周血单核细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 454 | 2026-06-08 |
Molecular Characterization and Immune Modulation of Schwann Cells in Vestibular Schwannoma
2026-Aug, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70179
PMID:42226390
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序研究前庭神经鞘瘤中施万细胞的分子特征及其免疫调控作用 | 鉴定出一个新的施万细胞亚群Schwann 4,该亚群高表达MHC II类分子且富集PI3K信号通路,并发现CTSZ基因通过PVR-TIGIT通路与调节性T细胞功能标志物相关,揭示了施万细胞介导免疫调控的新机制 | YM201636和AT7867等候选药物对前庭神经鞘瘤的适用性尚需专门验证 | 探究前庭神经鞘瘤中施万细胞的分子特征及其在肿瘤微环境中的免疫调控作用 | 前庭神经鞘瘤中的施万细胞亚群 | 机器学习 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2026-06-08 |
Neutrophil extracellular traps-related biomarkers in idiopathic pulmonary arterial hypertension: A machine learning-based identification and experimental validation study
2026-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2026.04.008
PMID:42085826
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研究论文 | 通过机器学习和生物信息学方法鉴定特发性肺动脉高压中与中性粒细胞胞外陷阱相关的生物标志物并进行实验验证 | 首次结合加权基因共表达网络分析、多种机器学习算法和实验验证,系统鉴定特发性肺动脉高压中中性粒细胞胞外陷阱相关分子标志物,并揭示中性粒细胞功能受损作为关键致病机制 | 研究主要基于公开数据集和动物模型,样本量有限,且验证仅在蛋白水平进行,缺乏更大队列临床验证和功能机制深入研究 | 鉴定特发性肺动脉高压中与中性粒细胞胞外陷阱相关的分子生物标志物,揭示其致病机理 | 特发性肺动脉高压患者和对照组的转录组数据,以及单细胞RNA测序数据和动物模型组织样本 | 机器学习 | 肺动脉高压 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习 | WGCNA, 多种机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 40个IPAH样本和34个对照样本(训练集),以及独立验证集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2026-06-08 |
Transcriptomic sequencing analysis of the tumor microenvironment atlas and potential mechanisms of metastasis in papillary thyroid carcinoma
2026-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2026.05.006
PMID:42134246
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与批量转录组数据,构建甲状腺乳头状癌肿瘤微环境图谱并揭示转移机制 | 首次系统描绘肿瘤、瘤旁及淋巴结组织的细胞异质性图谱,结合机器学习模型实现高精度淋巴结转移预测及预后分层 | 单细胞数据样本量有限,且未开展功能验证实验进一步确认关键细胞亚群的作用 | 阐明甲状腺乳头状癌转移的微环境基础,并开发临床预测工具 | 甲状腺乳头状癌患者的肿瘤组织、瘤旁甲状腺组织及淋巴结组织 | 机器学习 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林、Lasso-Cox回归 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 转移性与非转移性病例的多组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2026-06-08 |
Synergistic Oncogenesis Cooperative Role of Epstein Barr Virus and Human Papillomavirus in Cancer Progression
2026-Jul, Reviews in medical virology
IF:9.0Q1
DOI:10.1002/rmv.70173
PMID:42250259
|
综述 | 本文综述了EB病毒和人乳头瘤病毒在癌症进展中的协同致癌作用,探讨其分子机制和临床意义 | 系统总结了EBV与HPV在致癌过程中的协同作用,区分了病毒的共存在与具有生物学活性的共感染,并强调了空间转录组学和单细胞分析等新兴技术在表征共感染中的作用 | EBV-HPV协同作用的因果关系因方法学异质性和病毒检测技术的变异性而尚未得到充分验证 | 总结EB病毒和人乳头瘤病毒在癌症进展中的协同致癌作用的现有证据 | EB病毒和人乳头瘤病毒及其在宫颈癌、口咽癌和鼻咽癌中的共感染 | 机器学习 | 宫颈癌,口咽癌,鼻咽癌 | PCR,原位杂交,免疫组化,空间转录组学,单细胞分析 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA |
| 458 | 2026-06-08 |
Hypomethylation of FAM83A in lung adenocarcinoma mirrors an epigenetic signature of airway cell differentiation states
2026-Jun-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05380-8
PMID:42251611
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研究论文 | 本研究通过分析正常肺组织的单细胞RNA测序数据,发现FAM83A在肺腺癌中的低甲基化并非表观遗传异常,而是反映了恶性细胞向气道分化程序的重定向 | 首次揭示FAM83A在肺腺癌中的上调并非异常的DNA去甲基化过程,而是肺泡细胞向气道分化程序重定向的表观遗传特征,与癌症-种系基因MAGEA1的激活机制形成鲜明对比 | 未提及具体分析方法的局限性,如单细胞数据的解析度或样本量对结果的影响 | 探究肺腺癌中FAM83A的激活是表观遗传异常还是恶性细胞向现有上皮程序重定向的结果 | 正常肺组织、肺腺癌细胞系和组织样本中的FAM83A和MAGEA1表达模式 | 数字病理学, 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 亚硫酸氢盐测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据集 | 正常肺组织细胞亚群、原代和永生化人肺基底细胞、肺腺癌细胞系和组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-06-08 |
Multi-omics and experimental evidence in human chondrocytes identify caspase-8 as a non-apoptotic regulator of inflammatory, senescent, and fibrotic signaling in osteoarthritis
2026-Jun-06, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02985-y
PMID:42249421
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研究论文 | 通过多组学与实验证据,在人软骨细胞中发现caspase-8是骨关节炎中炎症、衰老和纤维化信号的非凋亡调节因子 | 首次揭示caspase-8在骨关节炎中作为非凋亡信号中枢,连接炎症、衰老与纤维化重构,并整合多组学数据与因果推断验证其治疗潜力 | 未提及具体局限性 | 探究caspase-8在骨关节炎发病机制中的作用及其治疗潜力 | 人软骨细胞(骨关节炎与正常) | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 多个公开数据集,包括GSE168505、GSE246425、GSE287861、GSE26475、GSE254844、GSE255460 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 460 | 2026-06-08 |
Refined single-cell profiling captures a CCR5high CD4+ cytotoxic T-cell precursor in multiple sclerosis
2026-Jun-06, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106324
PMID:42250325
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研究论文 | 通过精细单细胞分析发现了多发性硬化症中CCR5high CD4+细胞毒性T细胞前体 | 首次鉴定了多发性硬化症中与CCR5高表达相关的Th17.1细胞亚群,该亚群具有增强的细胞毒性和中枢神经系统浸润潜力,并揭示了其在疾病监测和精准医学中的潜在靶点价值 | 未提及具体局限性 | 探究多发性硬化症中Th17.1细胞的功能异质性和独特作用机制 | 多发性硬化症患者的血液和脑脊液样本,以及那他珠单抗治疗前后的血液样本 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多发性硬化症患者的配对血液和脑脊液样本,以及治疗前后血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |