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当前共找到 39345 篇文献,本页显示第 441 - 460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
441 2026-05-08
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-04-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出一种名为NeighbourNet的可扩展细胞特异性共表达网络构建方法,用于单细胞RNA测序数据中细粒度调控模式发现 首次实现基于K近邻局部回归的细胞特异性共表达网络构建,解决小样本量和数据稀疏性问题,并支持下游元网络聚类和信号推断 文中未明确提及局限性,但可能对极端稀疏数据或非常异质性的细胞群体表现有限 开发一种可扩展方法,构建细胞特异性共表达网络,以捕捉单个细胞水平上的动态调控变异 单细胞RNA测序数据中的基因共表达关系 机器学生物学 NA scRNA-seq KNN回归、主成分分析 单细胞基因表达数据 大规模单细胞数据集(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
442 2026-05-08
High-fidelity bidirectional translation between single-cell transcriptomes and DNA methylomes with scBOND
2026-04-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出scBOND框架,实现单细胞转录组与DNA甲基化组之间的高保真双向翻译 引入混合专家模块捕获上下文依赖调控模式,结合自注意力机制和特征校准模块增强生物信号保真度,并采用生物信息数据增强策略提升少配对数据场景下的泛化能力 现有方法存在单向性、缺乏对上下文特异性DNA甲基化-表达关联的建模、评价中忽视生物学相关性、在有限配对训练数据中表现差等问题 开发计算框架实现单细胞RNA测序与单细胞DNA甲基化数据间的双向跨模态翻译 小鼠胚胎数据、人类脑神经元数据、少突胶质细胞谱系数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单细胞DNA甲基化测序 混合专家模型、自注意力机制 基因表达数据、DNA甲基化数据 小鼠胚胎样本、人类脑神经元样本、少突胶质细胞谱系样本 NA 单细胞RNA测序、单细胞DNA甲基化测序 NA NA
443 2026-05-08
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过比较感染早期与晚期治疗后的SIV感染恒河猴模型,结合免疫PET/CT引导采样和空间转录组学,定义了维持病毒库持久性的组织病毒微环境(VME) 首次空间定义病毒微环境(VME)作为病毒库持久性的关键决定因素,并揭示其与肿瘤微环境相似的应激适应、代谢重编程等特征 研究仅基于非人灵长类模型,未在人体组织直接验证VME机制;样本量可能有限 探究HIV/SIV病毒库在抗逆转录病毒治疗期间持续存在的组织微环境机制 SIV感染的恒河猴肠道相关淋巴组织中的病毒微环境 数字病理学 艾滋病 空间转录组学, 免疫PET/CT引导采样, 免疫荧光显微镜 NA 影像数据, 空间转录组数据 SIV感染的恒河猴(早期治疗组与晚期治疗组) NA 空间转录组学 NA NA
444 2026-05-08
Genome and Single-Cell Transcriptome Reveal the Evolution of Holoparasitic Plants: A Case Study of Cistanche deserticola
2026-Apr, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 构建了荒漠肉苁蓉首个染色体级别基因组图谱,并结合单细胞转录组解析全寄生植物的分子与细胞进化机制 首次构建了荒漠肉苁蓉的染色体级别基因组和单细胞转录组图谱,揭示了全寄生植物中光合作用和免疫相关基因大量丢失、水平转移基因获得,以及寄生过程中细胞阶段特异性分化 文章未明确提及局限性 探究全寄生植物在分子和细胞水平上的进化机制 荒漠肉苁蓉(Cistanche deserticola) 基因组学, 单细胞转录组学 NA 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 比较基因组分析 NA 基因组序列, 单细胞转录组数据 一个荒漠肉苁蓉个体用于基因组组装;单细胞转录组样本数未明确提供 NA 单细胞RNA-seq NA NA
445 2026-05-08
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Apr, Experimental physiology IF:2.6Q2
研究论文 结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和顺序免疫荧光技术,表征缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的细胞微环境 首次通过多种技术结合,详细描述了缺氧和损伤条件下REP细胞的直接微环境及其与近端肾小管细胞和内皮细胞的空间关系 仅基于小鼠模型,未验证在人类肾脏中的适用性;未深入探讨细胞间相互作用的分子机制 阐明肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境及其调控机制 小鼠肾脏中的促红细胞生成素产生细胞(REP细胞)及其邻近细胞 数字病理学 肾脏疾病 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 顺序免疫荧光 NA 图像, 转录组数据 小鼠肾脏样本(具体数量未明确) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium 空间转录组学平台用于小鼠肾脏组织切片分析
446 2026-05-08
Metabolic reprogramming in lacrimal gland GVHD: Stage-specific shifts in acinar cells as drivers of disease progression
2026-Apr, The ocular surface
研究论文 通过整合单细胞RNA测序,揭示泪腺移植物抗宿主病从急性到慢性阶段的细胞生态动态变化,重点阐明腺泡细胞代谢重编程在疾病进展中的作用 首次构建泪腺oGVHD的时间分辨单细胞图谱,发现腺泡细胞代谢重编程和髓系-上皮串扰是慢性期关键驱动因素,并鉴定出新型配体-受体对(Gm-Sort1和Ptprc-Cd22) 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;计算预测的细胞间相互作用需进一步功能实验确认 阐明泪腺移植物抗宿主病从炎症期到纤维化期的阶段特异性细胞和分子机制 小鼠泪腺组织(急性GVHD第7天和慢性GVHD第28天) 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠泪腺样本(急性期7天和慢性期28天各一组) 10x Genomics(根据单细胞RNA-seq推断) 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
447 2026-05-08
A pH-responsive hyaluronic acid hydrogel facilitates lesion-localized integrin α5β1 agonism to attenuate osteopontin signaling and fibrosis in intrauterine adhesions
2026-04, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 本文开发了一种pH响应性透明质酸水凝胶,通过递送α5β1选择性激动剂肽,在宫腔粘连部位实现局部整合素激活,从而抑制骨桥蛋白信号传导和纤维化 首次将pH响应性脂质体硫醇化透明质酸水凝胶与α5β1选择性激动剂肽结合,实现病变局部持久的α5β1激活,并利用单细胞RNA-seq验证了巨噬细胞为中心的免疫-基质通讯重塑机制 NA 开发一种可局部注射的pH响应性水凝胶平台,通过激活整合素α5β1来调节巨噬细胞功能,抑制SPP1介导的促纤维化信号,从而治疗宫腔粘连及相关纤维炎症性疾病 大鼠宫腔粘连模型中的巨噬细胞和子宫内膜基质细胞 机器学习和数字病理学 宫腔粘连 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大鼠宫腔粘连模型样本(具体数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
448 2026-05-08
Multidimensional profiling of heterogeneity in supratentorial ependymomas
2026-04, Nature IF:50.5Q1
研究论文 整合单细胞和空间转录组学等技术,揭示幕上室管膜瘤的细胞异质性、空间组织及动态行为 首次在单细胞和空间水平上定义幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织及动态行为,并发现脑驻留细胞在异质性形成中的作用 未明确提及具体局限性,但可能受限于样本量或模型系统的代表性 理解幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织及动态行为,揭示肿瘤异质性的驱动因素 幕上室管膜瘤的肿瘤细胞及其神经微环境中的细胞 数字病理学 儿童脑癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、活细胞成像 NA 基因表达数据、空间转录数据、活细胞成像数据 未明确提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium空间转录组学试剂盒
449 2026-05-08
Small and Large Extracellular Vesicles in Circulation of Diffuse Large B-Cell Lymphoma Patients Originate From Different Cell Types of the Tumor Microenvironment
2026-Apr, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 研究了弥漫大B细胞淋巴瘤患者循环中大小细胞外囊泡的起源及其在肿瘤微环境中的细胞类型来源 首次揭示DLBCL肿瘤微环境中不同细胞类型优先分泌小或大细胞外囊泡,且循环中的S-EVs和L-EVs携带互补的生物学信息 未明确说明具体局限性 探讨弥漫大B细胞淋巴瘤患者循环中小细胞外囊泡和大细胞外囊泡的细胞起源及其生物学意义 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的血浆样本以及肿瘤组织单细胞测序数据 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 密度梯度分离、可调电阻脉冲感应分析、小RNA测序、信使RNA测序、单细胞测序 NA 测序数据 17个DLBCL肿瘤组织的单细胞测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
450 2026-05-08
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Chemotherapy-Induced Changes in Osteosarcoma With a Pyroptosis-Related Gene-Based Prognostic Model
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 利用单细胞转录组学分析化疗诱导的骨肉瘤变化,并基于焦亡相关基因构建预后模型 首次通过单细胞转录组学揭示化疗对骨肉瘤细胞亚群和肿瘤微环境的改变,并基于焦亡相关基因开发了名为 Pyroscore 的预后模型,实现了多算法集成 未提及具体局限性 探究化疗引起的骨肉瘤细胞和分子水平变化,并构建基于焦亡相关基因的预后模型 骨肉瘤患者的细胞亚群及肿瘤微环境 机器学习 骨肉瘤 单细胞RNA测序 机器学习集成模型(基于101种算法) 单细胞转录组数据 多数据集,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
451 2026-05-08
ZFP36L1 promotes non-small cell lung cancer progression under hypoxia by modulating CXCL9:SPP1 polarity: A single-cell transcriptomic study
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析,发现ZFP36L1在缺氧条件下通过调节CXCL9:SPP1极性促进非小细胞肺癌进展 首次揭示ZFP36L1通过转录调控SPP1,在缺氧环境下改变巨噬细胞CXCL9:SPP1比率,从而驱动非小细胞肺癌恶性进展的新机制 NA 探究ZFP36L1在非小细胞肺癌缺氧微环境中的作用机制 非小细胞肺癌细胞、巨噬细胞、患者来源类器官、巨噬细胞特异性ZFP36L1敲除小鼠模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光、流式细胞术、ELISA、双荧光素酶报告实验、ChIP实验、CCK-8、Transwell、集落形成、划痕实验、H&E、EdU、CellTiter-Glo NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序
452 2026-05-08
Cell-Type-Resolved Acetylation Regulator Atlas Defines Immune Endotypes and Druggable Vulnerabilities in Psoriasis
2026-Apr-01, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 通过整合转录组与单细胞数据,构建银屑病中乙酰化调节因子细胞类型分辨图谱,定义免疫内型与可药物靶点 首次在单细胞分辨率下系统揭示银屑病皮肤中乙酰化调节因子的细胞类型特异性表达模式,并基于此定义两种具有不同炎症程序特征的乙酰化内型 主要基于公开数据集分析,关键调节因子的验证仅在银屑病小鼠模型和有限的外部数据集上进行 解析银屑病中赖氨酸乙酰化调节因子的细胞类型特异性景观及其临床分层价值 银屑病患者和健康对照的皮肤样本(746例银屑病、515例对照)及两个公共皮肤单细胞RNA测序数据集 生物信息学 银屑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 746例银屑病和515例对照的皮肤样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
453 2026-05-08
FURIN Stimulates NOTCH2 and NOTCH3 Pathways, Leading to Return of Function in Aged Cells
2026-Apr-01, Life (Basel, Switzerland)
研究论文 研究发现FURIN通过激活NOTCH2和NOTCH3通路恢复衰老细胞功能 首次揭示FURIN表达下降导致衰老肌肉细胞NOTCH2/3信号通路受损,并通过过表达FURIN部分恢复肌原分化能力 仅使用体外细胞模型(C2C12肌母细胞)验证,缺乏体内实验支持;样本量有限,需进一步在人体组织中验证 探究年龄相关的FURIN下调是否导致NOTCH2/3信号通路受损以及肌原功能衰退 早代次和晚代次C2C12肌母细胞(作为肌肉细胞衰老的模型) 机器学习 老年病 单细胞RNA测序,质粒转染 NA 基因表达数据 公开单细胞RNA测序数据(GTEx项目),C2C12细胞系培养 NA 单细胞RNA测序 NA NA
454 2026-05-08
Lineage-Specific Sex-Biased Transcriptional Programs in Healthy Human Truncal Skin Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar-31, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞转录组学构建健康人类躯干皮肤的性别解析图谱,揭示谱系特异性性别偏向转录程序 首次在单细胞分辨率下系统描绘健康人类躯干皮肤的性别差异,发现性别偏向基因呈谱系特异性而非广泛表达变化 样本量有限(12名捐赠者),且仅聚焦躯干皮肤,未涵盖其他身体部位 明确健康成人躯干皮肤在细胞组成和基因表达上的性别关联差异 健康人类躯干皮肤的细胞组成和性别偏向转录程序 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12名捐赠者(5男,7女),共107,967个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
455 2026-05-08
Lactylation-Associated Immune Metabolic Reprogramming Identifies S100A2 and S100A14 as Candidate Diagnostic Biomarkers in Primary Open-Angle Glaucoma: An Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026-Mar-31, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析,确定S100A2和S100A14作为原发性开角型青光眼的候选诊断生物标志物,并揭示其与免疫代谢重编程的相关性 首次将乳酰化相关免疫代谢重编程与原发性开角型青光眼联系起来,通过机器学习识别出S100A2和S100A14作为候选诊断标志物,并利用单细胞分析揭示其细胞类型特异性表达模式 NA 探索原发性开角型青光眼中乳酰化相关的免疫代谢重编程,并识别可靠的诊断生物标志物 原发性开角型青光眼患者的骨小梁组织样本 数字病理学 原发性开角型青光眼 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习模型 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
456 2026-05-08
Single-Cell Multi-Omics Reveal Gene Regulatory Mechanisms Underlying Cardiac Embryonic Development
2026-Mar-31, Genes IF:2.8Q2
综述 综述单细胞多组学技术在解析心脏胚胎发育基因调控机制中的应用 系统总结了单细胞多组学(如scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学)在构建高分辨率心脏细胞图谱、揭示细胞异质性和谱系分化机制方面的最新进展 技术方法仍需进一步完善,整合分析策略有待优化以更全面揭示发育过程 阐明单细胞多组学技术如何揭示心脏胚胎发生中的基因调控机制及其对先天性心脏病的启示 心脏胚胎发育过程中的细胞类型、谱系轨迹和基因调控网络 数字病理学 先天性心脏病 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA NA
457 2026-05-08
Astrocytes in neuroinflammation and brain cancer
2026-Mar-30, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 合成单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学和多重成像证据,描绘星形胶质细胞在神经炎症和脑癌中的主要肿瘤相关程序,并提出4D时空映射框架和胶质液体活检概念 提出基于星形胶质细胞的4D时空映射框架和胶质液体活检概念,识别可干预的分子节点 尚缺乏临床纵向采样和空间图谱验证,星形胶质细胞靶向干预的体内验证和患者分层需要进一步研究 阐明星形胶质细胞在脑癌(尤其是胶质瘤)进展中的状态转变机制,并探索治疗转化策略 肿瘤相关星形胶质细胞 数字病理学 脑癌(胶质瘤) 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 图像、文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
458 2026-05-08
Integrated Multi-Omics and Machine Learning Framework Identifies Diagnostic Signatures and Druggable Targets in Breast Cancer
2026-Mar-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合多组学与机器学习框架,鉴定乳腺癌诊断标志物及可药靶点 首次结合127种机器学习算法与SMR因果推断,筛选出关键诊断基因CHEK1,并利用AI辅助虚拟筛选与分子对接优先识别靶向化合物 研究结果为基于计算预测的假设生成,尚需实验验证才能得出治疗结论 鉴定乳腺癌高灵敏度、高特异性的诊断生物标志物及靶向治疗分子靶点 乳腺癌转录组数据,包括7个GEO数据集与TCGA-BRCA队列(共1231个样本) 机器学习 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞转录组测序 集成机器学习(127种算法组合) 转录组数据、单细胞转录组数据 1231个乳腺癌样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq(推测) NA
459 2026-05-08
Single-Cell Sequencing Reveals γδT Cell Heterogeneity Under Distinct Microsatellite Statuses as a Potential Biomarker for Immunotherapy and Prognosis in Colorectal Cancer
2026-Mar-29, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞测序揭示不同微卫星状态下γδT细胞的异质性,并探讨其作为结直肠癌免疫治疗和预后生物标志物的潜力 首次在单细胞分辨率下鉴定出微卫星不稳定结直肠癌中富集的C4_CXCL13 γδT细胞亚群,该亚群具有耗竭样T细胞表型但保留强大的细胞毒功能,并基于其17个标记基因构建了与生存、免疫浸润和治疗反应相关的特征评分 基于公共数据集的验证可能受限于样本异质性,且功能验证实验不够充分 阐明不同微卫星状态下γδT细胞的异质性特征及其在调控结直肠癌免疫治疗反应中的作用 结直肠癌患者中的γδT细胞亚群 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量转录组分析 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据 NA(基于公共数据集,未明确样本数量) NA(未在标题和摘要中提及具体平台公司) 单细胞RNA测序 NA NA
460 2026-05-08
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 开发了一种新型双重细胞免疫疗法,将人脐带间充质干细胞与CD19 CAR T细胞联合使用,以增强抗肿瘤效果并减轻副作用 首次揭示hUC-MSC通过Th17分化诱导CD8 NK样细胞毒性T淋巴细胞,从而在肿瘤高负荷条件下增强CAR T细胞疗效 基于异种移植模型,可能无法完全模拟人体免疫环境 探索hUC-MSC与CAR T细胞联合疗法在肿瘤高负荷条件下的抗肿瘤效果和安全性 人脐带间充质干细胞和CD19 CAR T细胞 机器学习 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 高负荷B细胞淋巴瘤异种移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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