单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41240 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-07-01 |
Modeling metabolic-associated steatohepatitis with human pluripotent stem cell-derived liver organoids
2024-12-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000585
PMID:39621053
|
研究论文 | 利用人多能干细胞衍生的肝脏类器官模拟代谢相关脂肪性肝炎 | 首次结合批量与单细胞RNA测序对肝脏类器官模型进行详细的分子表征，并验证了五味子提取物在该模型中的抗氧化、抗炎和抗纤维化作用 | 当前肝脏类器官模型缺乏详细的分子表征，需要进一步改进 | 建立改进的人类肝脏类器官疾病模型，以研究代谢相关脂肪性肝炎的发病机制并发现有效治疗方法 | 人多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 数字病理学 | 代谢相关脂肪性肝炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2026-07-01 |
MCAM is a prognostic biomarker in patients with liver cirrhosis and HCC
2024-10-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000532
PMID:39992088
|
研究论文 | 评估MCAM在肝硬化与肝细胞癌患者中的预后生物标志物价值 | 首次揭示sMCAM作为肝硬化及肝细胞癌预后血液生物标志物的潜力，并与传统标志物（透明质酸、TIMP1、甲胎蛋白）进行诊断性能比较 | 未说明 | 探究MCAM在慢性肝病中的表达特征并评估sMCAM作为肝硬化及HCC预后血液生物标志物的价值 | 肝硬化及肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝硬化, 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 血浆检测 | NA | 转录组数据, 免疫组化图像, 血浆样本数据 | 健康对照8例、慢性肝病66例、肝硬化236例、肝细胞癌72例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2026-07-01 |
ResSAT: Enhancing Spatial Transcriptomics Prediction from H&E- Stained Histology Images with Interactive Spot Transformer
2024-Aug-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4707959/v1
PMID:39149477
|
研究论文 | 提出ResSAT框架，利用残差网络和自注意力变换器从H&E染色组织学图像预测空间转录组数据 | 通过交互式点变换器捕捉组织结构的空间关系，突破了现有方法忽略空间关联的局限 | 未提及局限性 | 开发从H&E图像预测空间基因表达的算法，降低空间转录组分析成本 | H&E染色组织学图像与空间转录组数据 | 数字病理学 | 未指定疾病 | 空间转录组学 | 残差网络结合自注意力变换器（ResSAT） | 图像与基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 444 | 2026-07-01 |
Compound models and Pearson residuals for single-cell RNA-seq data without UMIs
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551637
PMID:37577688
|
研究论文 | 提出一种适用于无UMI单细胞RNA-seq数据的复合模型与皮尔逊残差归一化方法 | 通过复合分布（负二项分布与扩增分布结合）建模非UMI数据的额外扩增步骤，并利用碎幂律描述不同测序方案的扩增分布 | 未详细讨论模型在不同测序平台和数据集上的泛化性能及计算效率 | 将基于皮尔逊残差的归一化方法从UMI数据扩展到非UMI单细胞RNA-seq数据 | 无UMI的单细胞RNA-seq数据（如Smart-seq2数据集） | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, Smart-seq2 | 复合模型（负二项分布与扩增分布） | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | NA |
| 445 | 2026-07-01 |
Increased prevalence of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110116
PMID:38974967
|
研究论文 | 利用多模态转录组数据（批量、单细胞、空间转录组）分析乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本中上皮-间充质转化（EMT）与腔-基底可塑性之间的关联 | 整合多模态转录组数据（批量、单细胞和空间转录组）并结合数学建模，系统揭示基底乳腺癌中混合上皮/间充质表型增多及表型异质性增强的分子机制 | NA | 探究乳腺癌中上皮-间充质转化（EMT）与腔-基底可塑性之间的相互作用，以及其对肿瘤内表型异质性的影响 | 乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 数学建模, 基因调控网络 | 转录组数据（批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学） | 乳腺癌细胞系和原发肿瘤样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2026-07-01 |
γδ T cell profiling in a cohort of preterm infants reveals elevated frequencies of CD83+ γδ T cells in sepsis
2024-07-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231987
PMID:38753245
|
研究论文 | 对早产儿γδ T细胞进行纵向单细胞分析，发现脓毒症患儿中CD83+ γδ T细胞频率升高 | 首次系统描绘早产儿出生后γδ T细胞的发育轨迹，并发现新生儿特有的CD83+ γδ T细胞亚群在脓毒症中的作用，区别于成人的CD86表达机制 | 研究未明确胎儿来源Vγ9Vδ2 T细胞在脓毒症中的精确功能机制，且样本量可能有限 | 探究早产儿γδ T细胞的发育特征及其在新生儿败血症中的作用 | 早产儿外周血γδ T细胞 | 单细胞转录组学 | 新生儿败血症 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、功能实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 纵向队列早产儿多个时间点样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 447 | 2026-07-01 |
Single-cell technologies in psoriasis
2024-07, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110242
PMID:38750947
|
综述 | 综述单细胞技术在银屑病研究中的应用，以增进对该疾病机制的理解 | 系统总结了单细胞技术在银屑病免疫微环境研究中的最新应用，涵盖单细胞转录组、蛋白质组和代谢组多层次分析，为理解银屑病发病和复发机制提供了新视角 | 未提及单细胞技术当前在银屑病研究中的具体局限性，如技术成本、数据复杂性或临床转化挑战 | 通过综述单细胞技术在银屑病中的应用，深化对银屑病发病和复发机制的理解 | 银屑病相关的免疫细胞和皮肤实质细胞及其相互作用 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞技术（包括单细胞转录组、蛋白质组、代谢组） | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞蛋白质组学，单细胞代谢组学 | NA | NA |
| 448 | 2026-07-01 |
Human inherited PD-L1 deficiency is clinically and immunologically less severe than PD-1 deficiency
2024-06-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231704
PMID:38634869
|
研究论文 | 报道两例PD-L1缺陷患者，其临床与免疫学严重程度低于PD-1缺陷 | 首次比较PD-L1和PD-1缺陷在人类中的临床和免疫表型差异，揭示PD-L1缺陷不导致致命性自身免疫和广泛白细胞失调 | 仅报道两个家系，样本量小，可能限制结论的普适性 | 探索人类遗传性PD-L1缺陷的临床和免疫学特征，并与PD-1缺陷进行比较 | 两名PD-L1缺陷的兄弟姐妹（年龄10和11岁）及其免疫细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2名PD-L1缺陷患者及其对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2026-07-01 |
Single-cell sequencing reveals distinct immune cell features in cutaneous lesions of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid
2024-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110219
PMID:38631594
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞VDJ测序，解析寻常型天疱疮与大疱性类天疱疮皮肤病变中的免疫细胞特征 | 首次系统描绘两种自身免疫性大疱病皮肤病变的单细胞转录组及T/B细胞克隆型图谱，揭示CD8 Trm在PV中的扩增及其分化轨迹，并发现BP病变中CD8 Tem和CD4 Treg高表达耗竭相关基因 | 未提供明确的局限性描述 | 探究寻常型天疱疮和大疱性类天疱疮皮肤病变中的免疫细胞特征 | 寻常型天疱疮和大疱性类天疱疮患者的皮肤病变组织 | 单细胞组学 | 自身免疫性大疱病 | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞免疫组库数据 | BP患者、PV患者及健康对照的皮肤病变样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞VDJ-seq | NA | NA |
| 450 | 2026-07-01 |
Differential expression and prognostic value of TLR4 in kidney renal clear cell carcinoma
2024-06, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2024.101959
PMID:38579915
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，结合体外实验，评估TLR4在肾透明细胞癌中的表达及其预后价值 | 首次系统揭示TLR4在KIRC中的差异表达及其与免疫细胞浸润的关联，并发现其仅在女性患者中具有保护性预后意义 | 未深入探讨TLR4调控免疫微环境的具体分子机制，且体外实验仅在786-O细胞系中进行验证 | 阐明TLR4在肾透明细胞癌中的表达模式、预后价值及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肾透明细胞癌组织样本及786-O细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学染色, 体外细胞实验 | NA | RNA测序数据, 组织切片图像 | 包含KIRC肿瘤组织与正常肾组织样本，具体数量未明确提及 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-07-01 |
Bone marrow CD8+ Trm cells induced by IL-15 and CD16+ monocytes contribute to HSPC destruction in human severe aplastic anemia
2024-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110223
PMID:38636890
|
研究论文 | 揭示IL-15和CD16+单核细胞诱导的骨髓CD8+组织驻留记忆T细胞在重度再生障碍性贫血中破坏造血干祖细胞的机制 | 首次在重度再生障碍性贫血中发现CD8 Trm细胞作为致病细胞，并阐明IL-15和CD16单核细胞在其诱导中的作用及CD38抑制剂78c的抑制作用 | NA | 探究重度再生障碍性贫血中T细胞破坏造血干祖细胞的机制 | 重度再生障碍性贫血患者和健康捐献者的外周血单核细胞和骨髓单核细胞 | 单细胞组学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 重度再生障碍性贫血患者和健康捐献者的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 452 | 2026-07-01 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-04, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和批量mRNA测序数据，探索颅内动脉瘤中浸润的中性粒细胞的生物学特性和临床意义 | 首次全面解析颅内动脉瘤中中性粒细胞的功能异质性和转录谱特征，揭示了中性粒细胞在动脉瘤形成和破裂中的不同亚群关联以及潜在致病机制 | 研究基于公开数据集，可能受限于样本异质性和数据来源的偏差，且缺乏直接的功能验证实验 | 探索颅内动脉瘤中中性粒细胞的功能异质性和临床意义，为未来治疗提供依据 | 颅内动脉瘤中浸润的中性粒细胞 | 机器学习 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠颅内动脉瘤样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2026-07-01 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 首次通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序技术，系统阐明CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中介导内皮细胞与中间单核细胞相互作用的遗传机制 | 基于公开数据库的分析可能存在人群偏倚，且孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探索炎症相关细胞因子和免疫特征与主动脉瘤的因果关系，并解析CX3CL1-CX3CR1信号通路的致病机制 | 主动脉瘤患者的血液免疫特征、主动脉组织转录组数据及单细胞测序数据 | 机器学习、数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、Cellchat分析 | na | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 91种循环炎症蛋白和731种免疫特征的GWAS数据，以及批量RNA测序和单细胞RNA测序的公共数据集 | na | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | na | na |
| 454 | 2026-07-01 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
|
research paper | 通过单细胞转录组学揭示胰管细胞在糖尿病炎症中可能作为介质的作用 | 首次发现胰管细胞亚群在所有胰腺细胞类型中呈现独特的促炎特征，为理解胰岛炎症传播机制提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探索暴露于炎症环境的人类胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 455 | 2026-07-01 |
Network-based pharmacology and UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS reveal Jinhua Qinggan granule's mechanism in reducing cellular inflammation in COVID-19
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382524
PMID:39026676
|
研究论文 | 通过网络药理学和UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS技术揭示金花清感颗粒在新冠肺炎中减轻细胞炎症的机制 | 本研究结合UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS、网络药理学和单细胞RNA测序技术，系统分析了金花清感颗粒的活性成分及其在免疫细胞调控中的作用，揭示其通过调节中性粒细胞、单核细胞等免疫细胞活性来减轻新冠肺炎炎症的机制 | NA | 探究金花清感颗粒在治疗新冠肺炎中的疗效和作用机制 | 金花清感颗粒的活性成分及其对新冠肺炎患者外周血单核细胞中免疫细胞的影响 | 网络药理学 | 新冠肺炎 | UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS, 单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2026-07-01 |
B-cell immune dysregulation with low soluble CD22 levels in refractory seronegative myasthenia gravis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382320
PMID:38711503
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆蛋白质组分析，揭示了难治性血清阴性重症肌无力患者中以B细胞为中心的免疫失调及可溶性CD22水平降低的免疫病理机制 | 首次利用单细胞RNA测序联合血浆蛋白质组学分析，阐明难治性血清阴性MG中B细胞免疫失调与可溶性CD22水平降低的关联，为B细胞靶向治疗提供新方向 | 样本量较小（仅30名女性参与者），且仅限于外周血分析，未涉及组织或中枢免疫器官的免疫状态验证 | 阐明血清阴性重症肌无力的免疫病理机制，探索免疫失调状态与疾病严重程度的关系 | 30名女性患者（10名健康对照、10名早发型AChR阳性MG、10名难治性早发型血清阴性MG）的外周血样本 | machine learning | geriatric disease | single-cell RNA-seq, plasma proteome analysis | NA | gene expression data, proteomic data | 30例女性患者外周血样本（每组10例，治疗前后对比） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2026-07-01 |
Data Analysis Pipeline for scRNA-seq Experiments to Study Early Oogenesis
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3698-5_15
PMID:38351456
|
研究论文 | 介绍用于研究早期卵子发生的单细胞RNA测序数据分析流程 | 针对生殖细胞发育过程中异步分化和高度细胞异质性的挑战，利用单细胞RNA测序技术以单细胞分辨率揭示转录调控机制 | 未明确说明局限性 | 描述如何使用单细胞RNA测序分析早期雌性生殖细胞发育 | 小鼠E11.5至E14.5卵巢中的早期生殖细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠E11.5至E14.5卵巢的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 458 | 2026-07-01 |
Integrating genomics and AI to uncover molecular targets for mRNA vaccine development in lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381445
PMID:39430760
|
研究论文 | 整合基因组学与人工智能，揭示狼疮性肾炎mRNA疫苗开发的分子靶点 | 将单细胞基因组学与无矩阵分解和机器学习算法相结合，系统识别狼疮性肾炎中潜在的mRNA疫苗靶点 | 信息来源有限，无法确定具体局限性 | 通过单细胞和批量转录组数据，利用机器学习识别LN中mRNA疫苗开发的潜在分子靶点 | 24名狼疮性肾炎患者和10名健康对照的单个核细胞，以及额外患者和对照的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 非负矩阵分解，机器学习算法 | 基因表达数据 | 24例LN患者和10例健康对照的单个核细胞，以及额外LN患者和对照的批量RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-07-01 |
Multi-modal transcriptomic analysis unravels enrichment of hybrid epithelial/mesenchymal state and enhanced phenotypic heterogeneity in basal breast cancer
2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.30.558960
PMID:37873432
|
研究论文 | 通过多模态转录组数据分析，揭示基底型乳腺癌中混合上皮/间质状态富集及表型异质性增强 | 整合批量、单细胞和空间转录组数据，结合数学模型解析上皮-间质转化与腔-基底可塑性之间的表观遗传串扰 | 依赖细胞系及原发肿瘤样本，未进行体内功能验证，且数学模型的预测需要实验进一步验证 | 探究乳腺癌中上皮-间质转化与腔-基底可塑性如何驱动肿瘤内表型异质性 | 乳腺癌细胞系及原发肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因调控网络数学模型 | 转录组数据 | 乳腺癌细胞系及原发肿瘤样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2026-07-01 |
ScopeViewer: A Browser-Based Solution for Visualizing Spatial Transcriptomics Data
2023-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.549256
PMID:37546786
|
研究论文 | ScopeViewer是一种基于浏览器的空间转录组学数据可视化软件，旨在解决大数据处理、共享和可视化挑战 | 首次提供浏览器端的空间转录组数据交互可视化方案，实现原始图像与注释的双重查看，通过优化带宽和避免数据传输增强安全性 | 文章未提及局限性 | 开发用于空间转录组数据可视化的浏览器端软件工具 | 空间转录组数据的可视化方法 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |