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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-05-22 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析,揭示抗瓜氨酸化蛋白抗体阳性早期类风湿关节炎患者单核细胞和T细胞中干扰素-γ应答基因的上调 | 首次在单细胞水平上系统比较ACPA阳性与阴性早期RA患者的外周免疫细胞差异,发现IFN-γ应答基因在单核细胞和T细胞中特异性上调 | NA | 探究ACPA阳性与阴性早期RA患者免疫系统的差异 | 抗瓜氨酸化蛋白抗体阳性与阴性的早期类风湿关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,血清细胞因子数据 | 37,318个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 442 | 2026-05-22 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病的免疫代谢改变,并识别出亚型和潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞转录组学分析将2型糖尿病患者分为三种免疫代谢亚型,并利用机器学习模型基于代谢特征进行分类,结合转录因子和药物富集分析发现潜在治疗靶点 | 样本量相对较小(37例患者和11例健康对照),且研究仅基于外周血单个核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞或代谢器官的微环境 | 阐明2型糖尿病中免疫细胞在单细胞水平的代谢异质性及其与疾病亚型的关联,并探索潜在治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 37例T2DM患者和11例健康对照的PBMCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2026-05-22 |
Inflammatory Activity of Epithelial Stem Cell Variants from Cystic Fibrosis Lungs Is Not Resolved by CFTR Modulators
2023-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202305-0818OC
PMID:37695863
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研究论文 | 该研究探讨了囊性纤维化肺中上皮干细胞变体的炎症活性,并发现CFTR调节剂无法解决这一问题 | 首次识别出囊性纤维化肺中存在多种促炎性干细胞变体,并证明CFTR调节剂无法消除其炎症活性 | 研究仅限于终末期囊性纤维化肺的样本,且仅分析了少数患者,可能无法代表早期或不同基因型的情况 | 确定囊性纤维化肺是否含有类似慢性阻塞性肺病的致病性干细胞变体,并评估它们对炎症的贡献及CFTR调节剂的影响 | 囊性纤维化患者的终末期肺组织(来自4例患者) | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序、RNA测序、异种移植 | NA | RNA测序数据、异种移植实验结果 | 4例囊性纤维化患者的肺组织(3例纯合CFTR:F508D,1例CFTR F508D/L1254X;FEV范围为14-30%) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2026-05-22 |
ScRNA-seq defines dynamic T-cell subsets in longitudinal colon and peripheral blood samples in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007358
PMID:37586769
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析免疫检查点抑制剂诱导结肠炎患者纵向结肠和外周血样本中T细胞亚群的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术,纵向追踪结肠炎发展及治疗过程中结肠和外周免疫环境的动态变化,揭示了CD8+ T细胞在生物治疗中的优先耗竭及其与炎症和免疫抑制反应的关联 | 基于单个病例的研究,样本量有限,无法推广至更广泛人群;且未阐明驱动ICI结肠炎的具体分子机制 | 探究免疫检查点抑制剂诱导结肠炎在结肠和外周免疫环境中的动态变化机制 | 一名患有梅克尔细胞癌并接受帕博利珠单抗治疗后发生结肠炎的患者 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和 T细胞受体测序 (TCR-seq) | NA | 单细胞基因表达数据和T细胞受体序列 | 一名患者的多个时间点(治疗前后)的结肠组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 445 | 2026-05-22 |
Stress resilience-enhancing drugs preserve tissue structure and function in degenerating retina via phosphodiesterase inhibition
2023-05-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221045120
PMID:37126699
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研究论文 | 通过系统药理学平台识别环核苷酸磷酸二酯酶抑制作为增强视网膜应激韧性的治疗策略,在多种视网膜退行性模型中保护组织结构与功能 | 首次通过整合单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学,揭示年龄相关和遗传性视网膜退行性病变的通用分子机制,并证明选择性抑制环核苷酸磷酸二酯酶可同时激活保护性机制并协同抑制退行性过程 | 未提供 | 开发针对视网膜退行性疾病早期阶段的治疗方法,以保留视网膜结构和视觉功能 | 年龄相关和遗传性视网膜退行性病变的多种模型 | 系统药理学 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、视网膜色素变性 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、磷酸蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | NA | NA |
| 446 | 2026-05-22 |
The relationship between the gut microbiome and host gene expression: a review
2021-May, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-020-02237-0
PMID:33221945
|
综述 | 本文综述了肠道微生物组与宿主基因表达之间的相互作用关系 | 系统总结了肠道微生物组通过重塑宿主染色质、引起差异剪接、改变表观遗传景观和直接干扰宿主信号级联等方式调节宿主基因表达的新发现 | 目前对微生物组与宿主基因表达相互作用的具体分子机制仍不完全清楚,且研究对象主要局限于模式生物和体外实验 | 探讨肠道微生物组与宿主基因表达之间的双向调控关系及其在健康和疾病中的作用 | 模式生物、人体活检样本和细胞培养模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | NA(综述文章,不涉及具体样本量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2026-05-22 |
Circadian clock genes promote glioma progression by affecting tumour immune infiltration and tumour cell proliferation
2021-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12988
PMID:33442944
|
研究论文 | 探讨昼夜节律时钟基因通过影响肿瘤免疫浸润和肿瘤细胞增殖促进胶质瘤进展的机制 | 首次系统揭示昼夜节律时钟基因失调与胶质瘤进展的关系,并建立基于时钟基因表达的风险预测模型 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要更多体内和临床样本验证 | 研究昼夜节律时钟基因失调对胶质瘤进展的影响及其潜在机制 | 胶质瘤患者样本及其肿瘤组织 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq | LASSO回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 训练集672个样本,4个验证集共1570个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 448 | 2026-05-22 |
Single-cell transcriptome analysis revealed the heterogeneity and microenvironment of gastrointestinal stromal tumors
2021-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14795
PMID:33393143
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研究论文 | 对胃肠道间质瘤患者的肿瘤内外组织进行单细胞RNA测序,揭示了肿瘤细胞异质性及其与微环境中其他细胞相互作用的全景图 | 首次在单细胞水平上系统描绘了GIST肿瘤微环境的细胞组成和异质性,发现了两类具有不同增殖和转移风险的肿瘤细胞亚群,并揭示了脂肪内皮细胞与肿瘤细胞的高相互作用以及巨噬细胞在微环境中的核心地位 | 未明确说明局限性 | 探索胃肠道间质瘤中肿瘤细胞的异质性及其与微环境其他细胞的相互作用 | 胃肠道间质瘤患者的肿瘤内外组织样本 | 数字病理 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 65个GIST样本用于RNA-seq验证,单细胞数据来自多个GIST患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2026-05-22 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
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研究论文 | 本研究发现GLP-1受体激动剂利拉鲁肽通过β细胞GLP-1R依赖性方式增加α细胞中GLP-1表达,并利用新单细胞RNA测序技术DART-Seq验证其在人胰岛中的翻译相关性 | 首次证明GLP-1R信号传导可激活α细胞中PC1/3表达并促进β细胞样特征,同时验证了高灵敏度DART-Seq技术在人类胰岛中的应用 | 未具体说明研究局限性 | 阐明α细胞中PC1/3表达的激活机制,为糖尿病治疗发现新靶点 | 人胰岛α细胞和β细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | DART-Seq | DART-Seq是一种新型单细胞RNA测序技术 |
| 450 | 2026-05-22 |
Identification of an Early Unipotent Neutrophil Progenitor with Pro-tumoral Activity in Mouse and Human Bone Marrow
2018-08-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.07.097
PMID:30157427
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研究论文 | 利用CyTOF和单细胞RNA测序技术,在小鼠和人类骨髓中发现了一种具有促肿瘤活性的早期单向中性粒细胞祖细胞 | 首次在小鼠和人类骨髓中鉴定出明确的单向中性粒细胞祖细胞,并发现其在肿瘤生长中的促进作用 | 未详细说明NeP和hNeP的分子特征及其在疾病中的详细机制 | 鉴定小鼠和人类骨髓中单向中性粒细胞祖细胞,并探索其在肿瘤发生中的作用 | 小鼠和人类骨髓中的中性粒细胞祖细胞 | 机器学习 | 癌症 | CyTOF, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类骨髓样本,包括黑色素瘤患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-05-22 |
A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes
2018-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0393-7
PMID:30069044
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和谱系追踪,修正了小鼠气管上皮细胞层次结构,发现了表达CFTR的离子细胞等重要细胞类型 | 首次鉴定出Foxi1肺离子细胞为罕见的细胞类型,发现离子细胞是囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)转录本的主要来源,开发了结合单细胞RNA测序和谱系追踪的“脉冲测序”技术,建立新的气道疾病细胞叙事 | 主要基于小鼠模型(气管上皮)的研究,可能不完全代表人类气道特征,谱系追踪依赖于特定标记物(如Foxi1),可能遗漏其他谱系关系 | 研究小鼠气管上皮的细胞组成和层次结构,特别是与哮喘和囊性纤维化等气道疾病相关的细胞类型 | 小鼠气管上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化,哮喘 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,脉冲测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠气管上皮细胞(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2026-05-21 |
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115789
PMID:42002019
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研究论文 | 实验上调Lancl1促进视神经损伤后体内轴突再生 | 首次发现Lancl1作为新型轴突再生促进因子,通过体内实验证明其上调可直接修复受损中枢神经轴突,且不依赖mTOR通路 | 未阐明Lancl1促进轴突再生的下游分子机制 | 探究Lancl1上调是否促进中枢神经系统损伤后的轴突再生 | 小鼠视网膜神经节细胞(RGC)及视神经损伤模型 | 自然语言处理 | 中枢神经损伤和疾病 | 单细胞RNA测序、基因过表达实验、AAV2载体递送 | NA | 基因表达数据(scRNA-seq) | 小鼠视网膜神经节细胞(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'用于视网膜神经节细胞的scRNA-seq分析 |
| 453 | 2026-05-21 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2026-Jun, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙髓干细胞在血管生成、成牙本质和神经分化过程中的细胞异质性和分化序列 | 首次揭示牙髓干细胞在体内先进行血管生成分化,随后再进行神经分化的时间顺序,并利用单细胞RNA测序证实了细胞异质性和特异性基因表达模式 | 未明确说明限制,但可能包括体内模型的人为性和分化时间的个体差异 | 阐明牙髓干细胞分化过程中血管生成先于神经分化的机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人牙髓干细胞样本;免疫缺陷小鼠移植实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 454 | 2026-05-21 |
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04131-5
PMID:41396398
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平揭示口腔癌中炎症性肠病相关基因的表达异质性,并发现NFKBIA表达与趋化因子介导信号通路显著关联 | 研究样本量有限,未涉及功能性验证实验,缺乏健康对照组织比较 | 阐明炎症性肠病相关基因在口腔癌中的细胞和分子通路机制 | 口腔癌组织样本 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 口腔癌组织样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2026-05-21 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals the impact of inflammatory microglia on prognosis and immunotherapy response in primary glioblastoma
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04135-1
PMID:41420790
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示炎症性小胶质细胞在原发性胶质母细胞瘤中对预后和免疫治疗反应的影响 | 首次基于炎症性小胶质细胞相关基因对GBM患者进行分层,并揭示两种不同亚型在预后和免疫治疗反应上的显著差异 | NA | 阐明炎症性小胶质细胞在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的亚型特异性影响,并探索其预后和免疫治疗反应的预测价值 | 原发性胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的炎症性小胶质细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 三个独立数据集的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2026-05-21 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular heterogeneity and prognostic subtypes in colorectal cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04153-z
PMID:41430524
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌的细胞异质性并识别预后亚型 | 整合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据,在单细胞水平揭示结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成,并基于标记基因对患者进行基因分型,识别出具有预后意义的分子亚型 | 需要进一步的功能验证以充分理解这些发现的临床意义 | 探索结直肠癌的细胞组成,整合单细胞与批量转录组数据以识别预后标志物并表征肿瘤异质性 | 结直肠癌肿瘤样本的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17例结直肠癌样本用于单细胞RNA-seq,566例结直肠癌样本用于批量RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2026-05-21 |
CCR5 expression defines the functional heterogeneity of tumor-infiltrating CD8+ T cells and predicts enhanced antitumor immunity and favorable prognosis in non-small cell lung cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04170-y
PMID:41432877
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研究论文 | 本研究通过综合转录组、单细胞RNA测序及功能实验,揭示了CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其作为预后标志物的潜力 | 首次在非小细胞肺癌中系统验证CCR5+CD8+ T细胞的功能异质性及其独立预后价值,并采用多方法联合验证(转录组、单细胞、染色、功能实验) | 未提供明显局限性,可能包括样本量有限或机制深度不足(基于摘要推断) | 评估CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤功能和预后价值 | 非小细胞肺癌患者肿瘤浸润CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 体外细胞共培养杀伤实验 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 组织图像 | TCGA和GEO队列(多个队列),15例NSCLC患者样本(单细胞RNA测序) | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2026-05-21 |
Macrophage-Fibroblast Crosstalk Shapes Wound Repair Signaling In Vitro
2026-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601156R
PMID:42149092
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研究论文 | 利用体外2D和3D伤口愈合模型结合活细胞钙成像和单细胞RNA测序,研究巨噬细胞与成纤维细胞之间的接触依赖性和旁分泌互作机制 | 揭示了接触依赖性钙信号和连接蛋白信号与转录重塑的整合如何协调巨噬细胞-成纤维细胞行为,特别是发现连接蛋白Cx43介导的细胞-细胞接触增强巨噬细胞IL10生成并抑制TNFα分泌 | 研究仅基于体外模型,尚未在体内伤口愈合环境中验证相关信号通路 | 阐明巨噬细胞与成纤维细胞之间接触依赖性信号如何与旁分泌通路整合以调控伤口愈合过程中的相互行为 | 骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序、活细胞钙成像 | NA | 基因表达数据、钙成像数据 | 使用骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞进行体外实验,未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-05-21 |
Molecular insight into the interplay among heterogeneous plasmacytes and microenvironment cells and their clinical relevance in myeloma
2026-May-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537965123
PMID:42154554
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研究论文 | 通过多组学分析揭示多发性骨髓瘤中异质性浆细胞与微环境细胞之间的相互作用及其临床相关性 | 首次在中国多发性骨髓瘤患者中结合全基因组/全外显子测序、RNA测序和单细胞RNA测序,系统解析了浆细胞亚群(特别是高增殖性的mSP2亚群)与微环境细胞的互作网络,并基于mSP2特征构建了具有预后价值的Score100分层模型 | 单中心研究且样本量有限,部分分析依赖公共数据库,缺乏功能性验证实验 | 阐明多发性骨髓瘤中浆细胞异质性及肿瘤-微环境互作机制,建立实用预后分层模型 | 277例初诊多发性骨髓瘤患者(SMMO队列)、20例复发患者(公共数据库)和30例正常对照 | 数字病理学, 自然语言处理 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 全外显子测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列, 转录组数据 | 267例(全基因组/全外显子测序+RNA测序),59例(单细胞RNA测序)初诊患者,20例复发患者,30例正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2026-05-21 |
TAZ integrates ECM remodeling with uterine stromal differentiation to maintain early pregnancy
2026-May-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2528309123
PMID:42154563
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和小鼠模型,发现TAZ通过整合细胞外基质重塑与子宫基质分化来维持早期妊娠 | 首次揭示Hippo信号效应子TAZ在早期妊娠中通过调控胶原相关ECM重塑促进蜕膜形成的新机制 | 主要基于小鼠模型和有限人类样本,临床转化验证不足 | 阐明早期妊娠中子宫基质分化和血管化的分子调控机制 | 小鼠和人类子宫内膜组织,包括患者样本 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠子宫组织及人类子宫内膜患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学分析 |