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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-07-05 |
YAP-Induced Glycolysis Drives Fibroinflammation and Disrupts Fibroblast Fidelity
2025-Dec-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326480
PMID:41165345
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研究论文 | 本研究揭示了YAP诱导的糖酵解驱动纤维炎症并破坏成纤维细胞谱系保真度的机制 | 首次发现右心房成纤维细胞比其他心脏腔室具有更高的糖酵解活性和YAP活性,并揭示YAP通过诱导糖酵解驱动纤维化,同时破坏成纤维细胞谱系保真度使其转化为表达SOX9的骨软骨祖细胞状态 | NA | 探究Hippo/YAP通路如何调控心脏成纤维细胞的代谢微环境及其在纤维炎症中的作用 | 心脏成纤维细胞及其在不同心脏腔室的代谢和转录组差异 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序, 空间转录组学, 同位素标记葡萄糖摄取实验 | NA | 转录组数据, 表观组数据, 空间转录组数据 | 人类和小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 442 | 2026-07-05 |
PFKFB3 Promotes Myofibroblast Differentiation and Cardiac Fibrosis Through its Intra- and Extra- Cellular Roles
2025-10, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10688-x
PMID:41166052
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研究论文 | 本研究揭示了PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号双重作用促进心脏纤维化的机制 | 首次发现PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号双重驱动心脏纤维化,并揭示其作为治疗靶点的转化潜力 | NA | 阐明PFKFB3在心脏纤维化发病机制中的角色及其潜在治疗价值 | 小鼠模型(异丙肾上腺素和冠状动脉结扎诱导)和心肌病患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot、ELISA | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型(异丙肾上腺素和冠状动脉结扎诱导)以及心肌病患者血浆样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于分析心肌病中激活的心脏肌成纤维细胞 |
| 443 | 2026-07-05 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究胶质母细胞瘤的基因型与免疫表型关系 | 利用基因工程小鼠模型在单细胞水平系统性地描绘了三种胶质母细胞瘤亚型(EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动)的基因型-免疫表型关系 | 未明确提及局限性,但可能包括小鼠模型与人类肿瘤的差异以及样本量限制 | 揭示胶质母细胞瘤中驱动突变对肿瘤微环境免疫表型的影响,为人鼠整合分析平台提供基础 | 基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型(EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动突变) | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因工程小鼠模型,具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2026-07-05 |
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325196
PMID:40047069
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研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA MIR181A1HG在血管炎症和动脉粥样硬化中的调控作用 | 首次发现MIR181A1HG通过隔离Foxp1远离目标基因启动子,激活NLRP3炎症小体,驱动血管内皮炎症和动脉粥样硬化,独立于miR-181a1/b1簇功能 | 未进一步研究其他潜在分子机制或临床人群样本验证 | 研究MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用和分子机制 | 人类和小鼠动脉粥样硬化病变中的内皮细胞及免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠主动脉样本,MIR181A1HG敲除和过表达小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 445 | 2026-07-05 |
Protocol for directly selecting cell type marker genes for single-cell clustering analyses by Festem
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103514
PMID:39700012
|
研究论文 | 提出Festem协议,直接从单细胞RNA测序数据中选择细胞类型标记基因,以优化下游聚类分析 | 利用期望最大化检验(Festem)直接选择细胞类型标记基因,无需预先聚类即可识别关键基因,提高单细胞数据分析的效率和可解释性 | 未提及具体局限,但依赖单细胞RNA测序数据质量和参数设置可能影响结果 | 开发一种直接选择细胞类型标记基因的方法,以简化单细胞聚类分析流程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 446 | 2026-07-05 |
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627006
PMID:39713439
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研究论文 | 提出一种用于分析成分高通量测序数据的差异丰度检验方法cosmoDA | 将α-β幂相互作用模型扩展以包含协变量信息,并结合广义分数匹配估计框架,开发出可减少相关特征导致的假阳性发现的差异丰度检验方案 | 未明确提及 | 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖性并降低相关特征假阳性率的差异丰度检验方法 | 成分高通量测序数据,包括单细胞RNA-Seq和扩增子测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 扩增子测序 | α-β幂相互作用模型 | 成分计数数据 | 模拟数据和真实数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 扩增子测序 | NA | NA |
| 447 | 2026-07-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq revealed key genes for bone metastasis and chemoresistance in prostate cancer
2024-12, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01575-x
PMID:39395905
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示前列腺癌骨转移和化疗耐药的关键基因LDHA | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,系统识别出LDHA作为前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的关键基因,并通过细胞实验验证其功能 | 未提及具体的样本量和多中心验证,可能缺乏临床样本的进一步验证 | 探究前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的分子机制 | 前列腺癌相关基因和细胞系,包括PCa细胞和破骨细胞分化相关基质 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, TRAP染色 | Lasso回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 448 | 2026-07-05 |
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08105-5
PMID:39506125
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、显微成像和蛋白质组学分析,研究免疫检查点抑制剂相关心肌炎在心脏、血液和肿瘤中的免疫反应 | 揭示了免疫检查点抑制剂相关心肌炎(irMyocarditis)中细胞毒性T细胞、传统树突状细胞和炎症性成纤维细胞在心脏组织中的共定位及频率增加,并发现心脏扩增的TCR克隆不识别假定的心脏自身抗原,且与肿瘤组织中的TCR库重叠性低 | 样本量有限(28例患者和41例健康对照),且未深入探讨心脏扩增TCRs与致命性心肌炎病例之间的具体机制 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系,并识别潜在生物标志物 | 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体的心脏、肿瘤和血液样本 | 数字病理学 | 免疫相关心肌炎 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 多重显微成像, 蛋白质组学分析 | NA | 图像, 文本, 蛋白质组数据 | 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体(包括心脏细胞84,576个,血细胞366,066个) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA和TCR测序;Illumina NovaSeq用于测序 |
| 449 | 2026-07-05 |
Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells
2024-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175147
PMID:39312740
|
研究论文 | 发现Egfl6通过与β3整合素结合并激活p38和SYK信号,作为趋化因子促进髓系细胞迁移并使其分化至免疫抑制状态,从而推动卵巢癌进展 | 首次鉴定Egfl6作为髓系细胞功能的调节因子,阐明其通过β3整合素-p38/SYK信号轴促进肿瘤免疫抑制的机制,并证明Egfl6中和抗体可恢复抗PD-L1疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,需进一步验证Egfl6在其他癌症类型中的作用及临床转化潜力 | 研究Egfl6在卵巢癌中调节肿瘤相关髓系细胞免疫抑制功能的机制 | 卵巢癌小鼠模型及人类卵巢癌组织样本 | 机器学 | 卵巢癌 | NA | NA | NA | 人类卵巢癌组织样本(未明确数量)及小鼠模型(同基因型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2026-07-05 |
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178628
PMID:39352749
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研究论文 | 在PTEN缺失的胶质母细胞瘤模型中,双重靶向巨噬细胞和小胶质细胞是一种治疗脆弱性 | 首次发现巨噬细胞与微胶质细胞在GBM肿瘤微环境中呈负相关,并揭示LOX抑制通过NF-κB-PATZ1通路上调OLFML3表达,导致微胶质细胞代偿性浸润 | 未在人类临床试验中验证,仅限于小鼠模型 | 探究PTEN缺失型胶质母细胞瘤中巨噬细胞和微胶质细胞的相互作用及双重靶向的治疗潜力 | PTEN缺失的胶质母细胞瘤小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光 | NA | 转录组数据、免疫荧光图像 | PTEN缺失型GBM小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-07-05 |
Endothelial YAP/TAZ activation promotes atherosclerosis in a mouse model of Hutchinson-Gilford progeria syndrome
2024-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173448
PMID:39352768
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞YAP/TAZ激活促进HGPS小鼠动脉粥样硬化 | 首次阐明内皮YAP/TAZ信号通路在HGPS血管病理中的关键作用,为开发靶向YAP/TAZ药物治疗早衰症相关动脉粥样硬化开辟新途径 | 未介绍 | 探究HGPS血管病变的分子机制,特别是内皮细胞中YAP/TAZ通路的作用 | 表达早衰蛋白的LmnaG609G/G609G小鼠及野生型对照小鼠的主动脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq,原子力显微镜,超声评估 | NA | 基因表达数据,力学数据,超声图像 | 未明确样本数量,涉及HGPS模型小鼠和野生型对照小鼠 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 未明确 | 未明确 |
| 452 | 2026-07-05 |
UnTWISTing intestinal fibrosis: single-cell transcriptomics deciphers fibroblast heterogeneity, uncovers molecular pathways, and identifies therapeutic targets
2024-09-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184112
PMID:39286981
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示肠道纤维化中成纤维细胞异质性、分子通路并识别治疗靶点 | 首次鉴定出TWIST1+FAP+成纤维细胞亚群与CXCL9+巨噬细胞的相互作用,并发现TWIST1是纤维化微环境的关键调节因子 | NA | 解析肠道纤维化的细胞和分子机制 | 克罗恩病相关的肠道纤维化组织中的成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病, 肠道纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2026-07-05 |
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-09-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180109
PMID:39287985
|
研究论文 | PAC1通过促进ILC2中的CGRP信号传导来约束2型炎症 | 发现PAC1以细胞内在方式选择性促进ILC2对CGRP信号的响应,并揭示其在2型炎症相关疾病中的调控作用 | NA | 探究ILC2如何内在调控对神经信号的响应及其在2型炎症中的作用 | 小鼠和人体的2型先天淋巴样细胞(ILC2s) | NA | 哮喘、肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人体外周血ILC2样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 454 | 2026-07-05 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病肠道纤维化发病机制中TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次鉴定出FAP+成纤维细胞是纤维化肠道中ECM产生最多的关键亚型,并发现TWIST1作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 阐明克罗恩病肠道纤维化的细胞和分子机制 | 克罗恩病伴肠梗阻患者的纤维化和非纤维化回肠组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 455 | 2026-07-05 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新鲜或冷冻组织中的细胞,发现冷冻会激活应激和活化相关基因表达 | 首次系统比较新鲜与冷冻组织单细胞RNA测序数据,揭示冷冻过程对细胞转录组的特异性影响模式 | 主要聚焦于T细胞、ILC和NK细胞亚群,其他免疫细胞类型可能具有不同冷冻敏感性 | 评估冷冻保存对单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、固有淋巴细胞(ILC)和自然杀伤(NK)细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 456 | 2026-07-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
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研究论文 | 描述了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 | 首次在转录组水平上深入表征调节性B细胞,超越了表面标志物的传统方法 | 未提供实验结果的验证或大规模样本分析 | 建立调节性B细胞的分离方案以进行单细胞转录组分析,探究其在自身免疫和癌症免疫中的作用 | 从狼疮易感小鼠中分离的调节性B细胞 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病(狼疮) | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据(单细胞RNA测序) | 狼疮易感MRL/lpr小鼠(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 457 | 2026-07-05 |
Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1189520
PMID:37256127
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了肥大细胞标志基因特征,用于肺腺癌的预后和免疫治疗反应预测 | 首次基于单细胞测序鉴定肥大细胞特异性标志基因,并构建了包含九种肥大细胞相关基因的预后特征,用于肺腺癌患者风险分层和免疫治疗反应预测 | 未提及外部验证队列中不同种族或地理区域的差异,且未对特征基因的生物学机制进行深入体内验证 | 评估肥大细胞在肺腺癌预后及免疫治疗反应预测中的作用 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本和公开数据集 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习预测模型(基于九种基因特征的预后评分模型) | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | 涉及训练集和四个外部验证集,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2026-07-04 |
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124503
PMID:42214611
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示昼夜节律紊乱通过TREM2+巨噬细胞介导的骨吸收加剧牙周炎的机制 | 首次发现TREM2+巨噬细胞亚群在昼夜节律紊乱条件下选择性扩增,并建立BMAL1-TREM2调控轴,揭示昼夜节律紊乱通过破坏该时间门控机制导致持续性TREM2过表达和骨吸收 | 研究主要基于小鼠模型,未在人体组织中验证该机制;CUT&Tag测序仅限于体外实验,体内直接证据不足 | 阐明昼夜节律紊乱如何感知并转化为局部炎症性骨丢失的分子机制 | CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织及巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag测序 | NA | 单细胞转录组数据 | CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-07-04 |
METTL3 depletion mitigates hypoxic pulmonary arterial smooth muscle cell over-proliferation via YTHDF2-dependent regulation of FOXO1 mRNA N6-methyladenosine modification: a potential mechanism of hypoxic pulmonary hypertension
2026-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124466
PMID:42162687
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研究论文 | 本文探究了METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖的作用及其分子机制 | 首次发现METTL3-YTHDF2-FOXO1轴通过调控FOXO1 mRNA的m6A甲基化修饰驱动低氧性肺动脉平滑肌细胞增殖,为肺动脉高压治疗提供新靶点 | NA | 阐明METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖中的作用 | 人肺动脉高压组织、平滑肌特异性Mettl3敲除小鼠、低氧性肺动脉高压模型、人肺动脉平滑肌细胞 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, MeRIP-qPCR, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2026-07-04 |
Myeloid Piezo1 Drives Cardiac Repair Through Orai1-Rac1-Dependent Efferocytosis
2026-Jul-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.328012
PMID:42227117
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研究论文 | 研究揭示了髓系Piezo1通过Orai1-Rac1依赖的胞葬作用驱动心肌修复的机制 | 首次发现Piezo1-Orai1-Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬作用和溶酶体成熟,改善心肌梗死后的心脏功能 | 未在人类样本中验证该信号轴,且未探讨其他细胞类型(如成纤维细胞)的潜在作用 | 阐明髓系Piezo1在心肌梗死后心脏修复中的功能及分子机制 | 髓系Piezo1特异性敲除小鼠及骨髓来源的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、实时PCR、膜片钳、Western blot | 小鼠基因敲除模型(Piezo1ΔLysM) | 基因表达数据、钙成像数据、蛋白质数据 | 未明确样本量,涉及小鼠(n未具体说明)及体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞胞葬相关基因表达 |