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当前共找到 33643 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-12-01 |
Deep Transfer Learning Links Benign Glands to Prostate Cancer Progression via Transcriptomics
2025-Nov-29, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf119
PMID:41317378
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习分析前列腺癌空间转录组数据，揭示形态学良性腺体与癌症进展的关联 | 首次将DEGAS深度迁移学习框架应用于前列腺癌空间转录组学，发现形态学良性腺体中MSMB表达降低与癌症进展的关联 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；空间转录组技术分辨率限制可能影响细胞类型精确识别 | 探索前列腺癌进展中的场效应现象，识别与癌症进展相关的分子特征 | 前列腺癌患者的空间转录组数据、单细胞转录组数据和免疫组织化学样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 深度迁移学习, 免疫组织化学 | 深度迁移学习, 深度学习图像分析 | 转录组数据, 图像数据, 蛋白质表达数据 | 包含有和无5年远处转移患者的前列腺组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-12-01 |
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2025-Nov-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518277
PMID:41317402
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研究论文 | 提出一种名为RegGAIN的双角色图对比学习模型，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 采用自监督对比学习最大化基因嵌入在扰动图视图间的一致性，并利用双编码器同时学习基因的调控者和靶标双重角色表征 | 未明确说明模型对特定生物环境或数据类型的适用性限制 | 从单细胞转录组数据准确重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2025-12-01 |
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15345-9
PMID:41318472
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别了与SUN修饰和抗PD-1免疫治疗耐药相关的六基因标志物，并构建了胶质母细胞瘤预后预测模型 | 首次整合泛素化、SUMO化和neddylation（统称SUN修饰）与抗PD-1耐药性，建立了六基因预后风险模型，并利用单细胞RNA测序和空间转录组分析验证基因表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于细胞系水平，需要进一步临床样本验证 | 探讨SUN修饰在胶质母细胞瘤预后和抗PD-1免疫治疗耐药中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞系和生物信息学数据集 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 差异表达分析、WGCNA、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序、空间转录组分析 | 预后风险模型、机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 胶质母细胞瘤细胞系和公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 444 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptome analysis defines novel molecular subtypes and reveals therapeutic implications of T/myeloid mixed-phenotype acute leukemia
2025-Nov-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01585-8
PMID:41318446
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析定义了T/髓系混合表型急性白血病的新型分子亚型并揭示其治疗意义 | 首次构建T/My MPAL的单细胞转录组图谱，识别出三种恶性细胞亚群并发现传统流式细胞术分类的局限性 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证亚型分类的普适性 | 解析T/髓系混合表型急性白血病的分子异质性并开发个性化治疗策略 | T/髓系混合表型急性白血病患者样本，包括AML、T-ALL和正常供体对照 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约275,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2025-12-01 |
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02853-7
PMID:41318555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组等技术揭示了上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速口腔黏膜炎症的机制 | 首次发现上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔慢性炎症中的关键作用，并建立了ORGUAMIA在线数据库 | NA | 研究口腔慢性炎症的发病机制 | 口腔黏膜组织 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序,空间转录组,多重免疫组化,细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据 | 大型临床随访队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组,批量RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06341-6
PMID:41318588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境下的叶片细胞基因表达模式 | 首次在异形叶性研究中使用水蓑衣作为模式植物，并应用单细胞转录组技术解析其环境适应性分子机制 | 未明确说明样本具体数量，且作为新兴模式植物其分子机制研究基础较为薄弱 | 探索异形叶性现象的分子机制和植物环境适应性 | 水蓑衣（Hygrophila difformis）的陆生和水生茎部原生质体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2025-12-01 |
CD74+CCL5+ effector CD8+ T cells drive mucosal inflammation and predict biologics response in inflammatory bowel disease
2025-Nov-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07509-9
PMID:41318676
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现CD74+CCL5+效应CD8+T细胞是驱动炎症性肠病黏膜炎症的关键细胞亚群，并开发了预测生物制剂治疗反应的六基因模型 | 首次系统识别CCL5+效应CD8+T细胞作为IBD关键致病细胞，建立基于六基因的诊断和治疗反应预测模型 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证，外周血变化不如组织明显 | 识别驱动IBD发病的免疫细胞亚群和分子程序，开发治疗反应预测生物标志物 | 炎症性肠病患者和健康对照的结肠组织及外周血样本 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 转录组反卷积, 孟德尔随机化, 肠道微生物组分析, 免疫组织化学, 流式细胞术 | 六基因预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 组织图像, 流式细胞数据 | 12名IBD患者和10名健康对照的结肠组织，7名IBD患者和12名健康个体的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组分析 | NA | NA |
| 448 | 2025-12-01 |
Preoperative pembrolizumab (anti-PD-1 antibody) combined with chemoradiotherapy for esophageal squamous cell carcinoma: a phase 1/2 trial (PALACE-2)
2025-Nov-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02477-4
PMID:41309527
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研究论文 | 本研究评估了术前帕博利珠单抗联合放化疗治疗局部晚期可切除食管鳞癌的疗效和安全性 | 首个大规模多中心1/2期试验报告帕博利珠单抗联合放化疗在食管鳞癌中的短期结果，并发现IL-6水平可作为治疗反应预测指标 | 短期疗效未优于新辅助放化疗，需要更长期随访数据验证生存获益 | 评估帕博利珠单抗联合放化疗在局部晚期可切除食管鳞癌中的治疗效果和安全性 | 局部晚期可切除食管鳞癌患者 | 临床医学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序，细胞因子分析，体内实验 | 小鼠肿瘤模型 | 临床数据，分子数据，实验数据 | 143名入组患者，140名接受新辅助治疗，125名接受手术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-12-01 |
T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 3-mediated immunomodulation in myeloid cells and keratinocytes in the development of severe acne
2025-Nov-27, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00367-3
PMID:41307843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TIM3在重度痤疮发展中作为免疫检查点的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析揭示TIM3在重度痤疮中的免疫调节功能 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究TIM3在重度痤疮发病机制中的免疫调节作用 | 重度痤疮患者皮肤样本、人永生化角质形成细胞(HaCaT)、痤疮丙酸杆菌诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化分析, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | 重度痤疮、普通痤疮和正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2025-12-01 |
Spatial gene expression profiling reveals the distinct microenvironment of tuberous sclerosis complex-associated angiomyolipoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26541-9
PMID:41309810
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的独特微环境特征 | 首次使用空间转录组技术比较TSC-AML、散发性AML和肾细胞癌的转录景观，识别出TSC特异性分子特征 | 研究仅基于单例样本设计，样本量有限 | 表征结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的转录特征并识别TSC特异性分子标志物 | 结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤、散发性肾血管平滑肌脂肪瘤和肾细胞癌组织样本 | 空间转录组学 | 结节性硬化症相关肾肿瘤 | 空间转录组测序 | 无监督聚类分析 | 空间基因表达数据 | 3例样本（TSC-AML、散发性AML和RCC各1例） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | CytAssist Visium平台，使用福尔马林固定石蜡包埋组织切片 |
| 451 | 2025-12-01 |
Cathepsin B as a potential serum biomarker for early diagnosis and progression of diabetic foot ulcer complicated with peripheral vascular disease
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26599-5
PMID:41309848
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现组织蛋白酶B可作为糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清诊断标志物 | 首次通过单细胞转录组分析鉴定CTSB在DFU合并PVD血管内皮细胞中的富集，并验证其血清检测价值 | 样本量有限，需要更大规模临床研究验证CTSB的诊断效能 | 探索糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清生物标志物 | 糖尿病足溃疡合并外周血管疾病患者 | 生物医学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞转录组分析,免疫组化,ELISA,临床相关性分析,血管生成实验,CCK8实验,划痕实验 | NA | 基因表达数据,血清样本,组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 452 | 2025-12-01 |
Multi-omics and experimental validation identify methylation-related genes and METTL16 as key regulators in diabetic foot ulcer pathogenesis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26306-4
PMID:41310324
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，系统研究了甲基化相关基因在糖尿病足溃疡发病机制中的作用，并确定METTL16作为关键调控因子 | 首次系统鉴定糖尿病足溃疡中的甲基化相关基因，发现METTL16在成纤维细胞功能和细胞间通讯中的动态作用，并验证其保护性功能 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，需要进一步体内验证和临床样本验证 | 研究甲基化相关基因在糖尿病足溃疡发病机制中的作用及其诊断和治疗潜力 | 糖尿病足溃疡组织样本和高糖处理的人皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 多组学分析,RNA测序,单细胞RNA测序,微阵列,机器学习算法 | LASSO,GBM,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 多个公共数据集中的糖尿病足溃疡组织和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2025-12-01 |
Integrative multi-omics and single-cell transcriptomics reveal ARHGEF12 driving chemoresistance in bladder cancer
2025-Nov-27, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00606-1
PMID:41310897
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和单细胞转录组学，揭示了ARHGEF12基因在膀胱癌顺铂耐药中的关键作用机制 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组学相结合探索膀胱癌顺铂耐药的遗传基础，发现ARHGEF12通过RhoA/ROCK依赖的PI3K/AKT轴驱动化疗耐药的新机制 | NA | 阐明膀胱癌顺铂耐药的遗传驱动因素和肿瘤进展机制 | 膀胱癌顺铂耐药细胞和UM-UC-3/DDP耐药模型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 全基因组关联研究,表达数量性状位点分析,孟德尔随机化,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 19,942个基因的eQTL数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 454 | 2025-12-01 |
Protocol to track single-cell-derived clones using DNA barcoding combined with single-cell RNA sequencing
2025-Nov-27, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104229
PMID:41317321
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研究论文 | 提出一种结合DNA条形码与单细胞RNA测序追踪单细胞来源克隆的实验方案 | 通过DNA条形码永久标记细胞并结合单细胞RNA测序，实现克隆生长活性与转录组特征的关联分析 | NA | 开发追踪单细胞来源克隆动态的实验方法 | 肿瘤细胞克隆 | 单细胞测序技术 | 肿瘤 | 慢病毒DNA条形码文库构建，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-12-01 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals metabolic reprogramming and tumor microenvironment remodeling in aldosterone-producing adenoma
2025-Nov-27, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111164
PMID:41317749
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示醛固酮腺瘤中的代谢重编程和肿瘤微环境重塑 | 首次构建APA单细胞图谱，发现CAPS ZG样细胞的代谢重编程特征和肿瘤微环境中免疫细胞浸润、血管生成激活及成纤维细胞驱动的基质重塑 | 样本量较小（仅3例APA患者和3例对照） | 解析醛固酮腺瘤的细胞异质性和肿瘤发生机制 | 醛固酮腺瘤患者和对照者的肾上腺组织 | 单细胞组学 | 肾上腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 伪时序分析 | 单细胞转录组数据 | 3例APA患者和3例对照的肾上腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2025-12-01 |
Mechanistic insights into nitric oxide signaling in shaping root architecture under challenging environments
2025-Nov-27, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112903
PMID:41317792
|
综述 | 本文综述了一氧化氮在逆境条件下调控植物根系构型的作用机制及其与活性氧和植物激素的互作关系 | 系统阐述了一氧化氮作为气体信号分子通过翻译后修饰调控根系发育的新机制，并强调单细胞转录组等新兴技术在解析NO-ROS互作中的创新应用 | NO介导的根系构型调控的生化与分子机制仍复杂且尚未完全阐明 | 探究一氧化氮信号在植物应对环境胁迫时调控根系构型形成的作用机制 | 植物根系系统 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器、高分辨率活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2025-12-01 |
Resolving single-cell gene expression by pseudo-temporal integration of transcriptomic and proteomic datasets
2025-Nov-27, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
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研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞转录组和蛋白质组数据的新方法，以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 首次使用伪时间细胞排序方法整合单细胞RNA测序和单细胞蛋白质组数据，构建统一的转录-翻译表达谱 | NA | 理解缺氧应激下的细胞表型和转录-翻译动态调控机制 | 缺氧处理后的纵向单细胞样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 458 | 2025-12-01 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2025-Nov-26, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术识别出双阳性平滑肌-内皮细胞簇，并证实TGF-β/Snail信号轴驱动的EndMT机制 | 需要在临床前模型中进一步验证 | 阐明TGF-β信号在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学, HE染色, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 伪时间轨迹分析, 细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据, 组织图像 | 11例烟雾病标本进行空间转录组分析，总计51例烟雾病和11例对照血管标本进行组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 459 | 2025-12-01 |
Mitochondrial iron transport via MFRN1 is required for erythroid cell cycle progression
2025-Nov-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014887
PMID:40601908
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体铁转运蛋白MFRN1通过调控红细胞周期进程对红细胞生成的重要作用 | 首次在体内证明MFRN1介导的线粒体铁转运对红细胞周期G2/M期进展的关键需求 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段，成年生物中的功能尚未验证 | 探究铁代谢如何调控红细胞生成过程 | 斑马鱼胚胎红细胞及其前体细胞 | 发育生物学 | 贫血 | 单细胞RNA测序,流式细胞分选 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 斑马鱼胚胎(1.5-3天受精后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2025-12-01 |
Exploring putative links between gut microbiota and allergic rhinitis: insights from Mendelian randomization and multi-transcriptome integration
2025-Nov-25, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01987-2
PMID:41288916
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和多转录组整合分析探索肠道微生物群与过敏性鼻炎之间的因果关系及分子机制 | 首次结合孟德尔随机化、批量RNA测序和单细胞RNA测序多维度分析肠道微生物群与过敏性鼻炎的因果关系 | 数据来源于公共数据库，缺乏实验验证 | 探索肠道微生物群与过敏性鼻炎之间的因果关系及分子机制 | 过敏性鼻炎患者和肠道微生物群 | 生物信息学 | 过敏性鼻炎 | 孟德尔随机化, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |