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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-06-25 |
A novel EGR1-driven GLUL/mTOR axis regulates macropinocytosis-mediated crosstalk in pancreatic stellate cell-cancer metastasis
2026-Jun-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08479-2
PMID:42337536
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研究论文 | 揭示EGR1驱动的GLUL/mTOR轴通过抑制胰腺星状细胞活化及癌细胞巨胞饮作用,调控胰腺癌肝转移的新机制 | 首次发现EGR1作为转录因子直接调控GLUL表达,并通过mTOR信号通路抑制胰腺星状细胞活化,进而减少癌细胞的巨胞饮营养摄取和肝转移 | 未提及具体局限性 | 探索胰腺星状细胞与癌细胞之间新型转录调控通路,特别是通过巨胞饮作用影响营养获取和肝转移的机制 | 胰腺星状细胞、胰腺癌细胞及肝转移相关的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、ChIP、EMSA、荧光素酶报告基因检测、免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据、分子生物学数据 | 人胰腺癌组织样本(数量未明确)及小鼠胰腺癌肝转移模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 442 | 2026-06-25 |
Multi-omics integration and clinical validation identify CKAP2 as a diagnostic biomarker for bladder cancer
2026-Jun-23, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-026-04464-7
PMID:42337544
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研究论文 | 通过多组学整合与临床验证,确定CKAP2为膀胱癌的诊断生物标志物 | 首次结合多组学分析、孟德尔随机化与独立的临床队列验证,系统性确定CKAP2在膀胱癌诊断中的价值及其在肿瘤微环境中的作用 | 未明确提及局限,但可能受限于样本量(127例组织样本)及缺乏更广泛的验证 | 鉴定并严格验证CKAP2作为膀胱癌的诊断生物标志物 | 膀胱癌组织和正常组织样本 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 孟德尔随机化 | 逻辑回归, 机器学习特征选择 | 基因表达数据, 临床样本数据 | 127例组织样本(包括50对匹配肿瘤与癌旁组织、21例独立肿瘤组织和6例独立癌旁组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2026-06-25 |
Self-supervised graph contrastive learning for scRNA-seq clustering
2026-Jun-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08450-1
PMID:42337558
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研究论文 | 提出一种自监督图对比学习框架SSGL,用于提升单细胞RNA测序数据聚类的准确性和稳定性 | 创新点在于联合利用双随机基因掩码的增强视图、内在细胞间关系以及伪标签引导的图精化策略,在图对比学习框架中实现鲁棒表示学习 | 文中未明确提及局限性,可能包括对超参数的敏感性或计算复杂度较高 | 开发一种自监督图对比学习框架,通过联合增强视图、内在细胞间关系和伪标签引导的图精化来提高scRNA-seq聚类鲁棒性和生物学可解释性 | 公共scRNA-seq基准数据集,涵盖不同组织和测序平台 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习 | 基因表达矩阵 | 八个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2026-06-25 |
Late-stage dedifferentiation and epigenetic memory of cancer stem cells in hepatocellular carcinoma
2026-Jun-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08494-3
PMID:42337581
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研究论文 | 通过单细胞测序和多组学分析,揭示了肝细胞癌中肿瘤干细胞通过晚期去分化产生,并存在表观遗传记忆现象 | 首次通过单细胞证据证明肝细胞癌中肿瘤干细胞是晚期去分化产物而非初始肿瘤起始细胞,并发现其表观遗传记忆维持干细胞特性 | 主要基于公开数据集和有限患者样本,未在独立大规模队列中验证核心印记风险评分 | 探究肝细胞癌中肿瘤干细胞起源:是肿瘤起始细胞还是晚期去分化产物 | 肝细胞癌患者样本、Huh7细胞系及组织芯片 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、靶向亚硫酸盐测序、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、基因组变异数据、表观基因组数据 | 44名患者的109个样本共410,608个细胞,外加2名患者EpCAM富集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2026-06-25 |
Spatial architecture of the melanoma immune niche reveals CORO1A as a functional hub for T cell cytotoxicity and immunotherapy synergy
2026-Jun-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08435-0
PMID:42337596
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学整合分析,揭示了黑色素瘤免疫微环境的空间结构,并确定CORO1A为T细胞细胞毒性和免疫治疗协同作用的功能枢纽 | 首次在空间水平上解析黑色素瘤免疫微环境的两大区域(免疫区和黑色素细胞区),并发现CORO1A作为免疫微环境中的关键调控因子,其敲低可与抗PD-1治疗协同抑制肿瘤生长 | 未明确提及具体局限性 | 明确黑色素瘤肿瘤微环境的空间结构,并识别决定抗肿瘤免疫和免疫检查点阻断反应的关键分子调控因子 | 黑色素瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和黑色素细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 446 | 2026-06-25 |
PD-L1-targeted OMV priming licenses myeloid co-stimulation and chemokine circuits to potentiate CAR-T therapy in advanced-stage solid tumors
2026-Jun-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04722-6
PMID:42337606
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研究论文 | 利用PD-L1靶向细菌外膜囊泡预处理来重塑肿瘤微环境,增强CAR-T疗法在晚期实体瘤中的疗效 | 首次将PD-L1靶向的细菌外膜囊泡(OMV)作为CAR-T预处理的模块化平台,通过重塑髓系细胞区室和增强肿瘤内共刺激信号,实现剂量递减CAR-T治疗的强大抗肿瘤效果 | 未提及相关局限性 | 探索通过OMV预处理重编程实体瘤免疫微环境以增强CAR-T疗法的策略 | 晚期实体瘤小鼠模型及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个同源小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 447 | 2026-06-25 |
Laser-induced skin microenvironment remodeling via exosomal CEBPA-mediated crosstalk between keratinocyte and fibroblast
2026-Jun-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04709-3
PMID:42337624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示激光治疗后角朊细胞与成纤维细胞间的外泌体CEBPA介导的微环境重塑机制 | 首次系统描绘激光治疗后早期皮肤微环境中的细胞特化与细胞间通讯机制,发现角朊细胞亚群通过富含CEBPA的外泌体调控成纤维细胞活性,并通过YAP/TAZ通路促进自身增殖 | 未明确提及限制,但可能包括样本量有限、仅关注早期阶段、体内验证不足等 | 阐明激光治疗诱导皮肤重塑早期阶段的细胞特化与细胞间通讯机制 | 激光处理与未处理的人类皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 激光处理与未处理的皮肤样本(具体数量未提及) | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 448 | 2026-06-25 |
Tumor-derived progranulin promotes macrophage cholesterol efflux and associated immunosuppressive features in oral squamous cell carcinoma
2026-Jun-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08422-5
PMID:42337741
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序等手段揭示了口腔鳞状细胞癌中肿瘤来源的颗粒蛋白前体通过调控巨噬细胞胆固醇外流促进免疫抑制特征的作用机制 | 首次鉴定出口腔鳞状细胞癌中高表达PGRN的恶性上皮细胞亚群,并阐明其通过SORT1-PPARγ-LXRα-ABCA1/ABCG1信号轴调控巨噬细胞胆固醇外流及免疫抑制表型 | 临床样本量较小(3例OSCC原发肿瘤),且免疫抑制特征的临床相关性尚需进一步验证 | 阐明口腔鳞状细胞癌中肿瘤来源的PGRN调控巨噬细胞胆固醇外流及相关免疫抑制特征的分子机制 | 口腔鳞状细胞癌原发肿瘤样本及头颈部鳞状细胞癌相关公共数据集中的巨噬细胞 | digital pathology | oral squamous cell carcinoma | scRNA-seq, genetic knockdown, pharmacologic inhibition, PPARγ signaling activation | NA | 单细胞转录组数据 | 3例OSCC原发肿瘤,77例HNSCC相关公共数据集样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2026-06-25 |
Single-cell transcriptomics unveils pyroptosis-related immune microenvironment dynamics and prognostic modeling in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Jun-23, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-04474-2
PMID:42337781
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示食管鳞状细胞癌中焦亡相关的免疫微环境动态及预后模型构建 | 首次利用单细胞RNA测序整合7例食管癌组织和1例正常对照,系统解析了焦亡相关基因在食管癌免疫微环境中的动态变化,并构建了基于GSDMB和CYCS的双基因焦亡相关预后模型 | 预后模型在外部验证集GSE53625中表现有限,该模型应视为探索性预后特征而非经临床验证的预测工具 | 表征食管癌中焦亡相关的免疫机制并构建临床预测模型以改进预后评估 | 食管鳞状细胞癌组织及正常对照组织中的免疫细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 预后模型(基于GSDMB和CYCS的双基因模型) | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | 7例食管癌组织及1例正常对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2026-06-25 |
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Smoking-Related Periodontitis
2026-Jun-23, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70392
PMID:42338007
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示吸烟相关牙周炎的细胞组成和分子微环境特征 | 首次在单细胞水平描绘吸烟相关牙周炎的细胞图谱,并发现CXCR6+调节性T细胞与衰老上皮细胞通过CXCL16-CXCR6轴及CD2-CD58相互作用的致病机制 | 样本数量较少(健康对照2例、牙周炎2例、吸烟相关牙周炎3例),后续需扩大样本量验证 | 阐明吸烟相关牙周炎的细胞组成和分子微环境特征 | 牙周组织样本(健康对照、牙周炎患者、吸烟相关牙周炎患者) | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照2例、牙周炎2例、吸烟相关牙周炎3例 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 451 | 2026-06-25 |
Single-Cell Transcriptomics in Triple-Negative Breast Cancer: Implications for Radionuclide Therapy in Precision Oncology
2026-Jun-23, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785261458513
PMID:42338131
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析三阴性乳腺癌的异质性,并识别与放射性核素治疗相关的潜在分子靶点 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化分析结合,系统鉴定三阴性乳腺癌中放射性核素治疗相关的风险基因和保护基因,为精准肿瘤学提供新策略 | 研究仅基于公开数据集GSE155109,样本量有限,且缺乏体内实验验证,结果需进一步临床验证 | 阐明三阴性乳腺癌的基因表达特征和细胞异质性,为放射性核素治疗提供分子靶点和理论依据 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的细胞群体,包括内皮细胞、基质细胞和恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、qRT-PCR | UMAP、扩散伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 公开数据集GSE155109,样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于GSE155109数据集的单细胞转录组分析,使用Scanpy进行质控和聚类 |
| 452 | 2026-06-25 |
Multi-omics analyses reveal BPA accelerates glioma progression via cell cycle dysregulation
2026-Jun-22, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.128624
PMID:42331244
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研究论文 | 通过多组学分析揭示双酚A通过细胞周期失调加速胶质瘤进展 | 首次整合多组学分析与实验验证,阐明环境内分泌干扰物BPA通过结合细胞周期相关蛋白促进胶质瘤恶性进展的新机制 | 未明确具体样本量及临床验证数据,部分靶点预测依赖计算模型 | 探究BPA对胶质瘤恶性进展的影响及其分子机制 | BPA的潜在靶点、胶质瘤相关基因、单细胞RNA测序数据 | 计算机视觉 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、分子对接、机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2026-06-25 |
Hierarchical classification of immune cell transcriptomes at population-scale
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728980
PMID:42282793
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研究论文 | 提出了一种基于分层分类的免疫细胞转录组分析方法,应用于大规模人群研究 | 构建了独立的统一专家注释资源Suco和模块化分层分类器Compocyte,显著优于现有分类器,并能在大规模人群中识别新的免疫细胞亚型 | 依赖专家注释的准确性和可重复性,可能无法涵盖所有稀有细胞类型 | 实现大规模单细胞RNA测序数据的免疫细胞自动准确分类 | 从3965名患者中提取的1560万个白细胞 | 计算机视觉 | 肿瘤免疫、细胞因子释放综合征、转移性疾病 | 单细胞RNA测序 | 分层分类器 | 单细胞转录组数据 | 3965名患者的1560万个白细胞,来自50项研究(含3个新生成数据集) | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 454 | 2026-06-25 |
Protocol for identifying recirculating thymic regulatory T cells and characterizing the role of Eos in their function using scRNA-seq and TCR-seq
2026-Jun-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104620
PMID:42258356
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研究论文 | 提供一种使用单细胞RNA测序和TCR测序鉴定小鼠胸腺再循环调节性T细胞并表征Eos在其功能中作用的实验方案 | 首次提出基于单细胞RNA测序和TCR测序数据的精细分类方法,用于鉴定胸腺再循环调节性T细胞并揭示Eos转录因子在其中的功能作用 | 仅基于小鼠模型,缺乏人类样本验证;方案依赖特定实验设备和计算分析流程 | 建立鉴定胸腺再循环调节性T细胞并研究Eos在它们功能中作用的实验方案 | 小鼠胸腺中的再循环调节性T细胞及Eos转录因子 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序、TCR测序、流式细胞术、磁珠分选 | NA | 单细胞基因表达数据、TCR序列数据 | 小鼠胸腺细胞样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒及TCR测序试剂盒 |
| 455 | 2026-06-25 |
Lamprey 3D single-cell transcriptomics reveals ancestral and specialized features of the vertebrate brain
2026-Jun-18, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea2535
PMID:42313957
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研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序,构建了七鳃鳗大脑的三维分子图谱,揭示了脊椎动物大脑的祖先特征和特化特征 | 首次从三维分子层面解析了七鳃鳗大脑的细胞结构,并通过跨物种比较揭示了脊椎动物大脑的保守组织蓝图和谱系特异的神经元分化 | 未明确提及,可能包括样本数量、跨物种比较的深度或技术本身的局限性 | 阐明脊椎动物大脑进化的祖先特征和谱系特化的细胞机制 | 七鳃鳗大脑的细胞类型和空间组织 | 数字病理学,计算生物学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间位置数据 | 七鳃鳗大脑组织,14个脑区,209个细胞簇 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2026-06-25 |
Transcriptional and functional profiling reveals unique activation of Adapter CAR T cells in acute myeloid leukemia
2026-Jun-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08461-y
PMID:42316369
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研究论文 | 本文通过功能分析和单细胞RNA测序系统研究了急性髓系白血病模型中适配体浓度对适配体CAR T细胞激活、转录状态和功能的影响,并鉴定出关键基因特征 | 首次系统揭示了适配体浓度如何调控适配体CAR T细胞的激活动力学、转录状态和代谢重编程,并识别出跨不同适配体和靶细胞的标志基因特征 | 未提及具体限制 | 阐明适配体浓度对适配体CAR T细胞反应的调控机制,为优化适配体剂量以增强可调控CAR T细胞疗法的安全性和有效性提供见解 | 适配体CAR T细胞和急性髓系白血病模型 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 457 | 2026-06-25 |
Epigenetic Information Loss and Chronosenescence in Liver Aging: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Interventions
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504570RR
PMID:42205070
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综述 | 本文综述了肝脏衰老中表观遗传信息丢失与时钟衰老的分子机制及治疗干预策略 | 将肝脏衰老定义为调控信息与时间协调紊乱,整合单细胞多组学、空间转录组学和CRISPR表观遗传编辑技术的最新进展 | 人类直接因果证据有限,多数年轻化策略仍处于临床前或早期转化阶段 | 建立理解肝脏衰老的统一框架,并提出可修改节点的转化路线图 | 肝脏衰老的表观遗传和昼夜节律调控机制 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞多组学, 空间转录组学, CRISPR表观遗传编辑 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 458 | 2026-06-25 |
Single-cell transcriptome profiling of primordial germ cells reveals differences between right and left gonads in chickens
2026-Jun-10, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107247
PMID:42335766
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示鸡胚胎左右性腺中原始生殖细胞的差异 | 首次在单细胞水平上揭示了鸡胚左右性腺原始生殖细胞在早期分化阶段的转录差异,并发现从DNA损伤/细胞周期程序到衰老相关程序的阶段性转变以及右侧特有的NOTCH信号相互作用 | 仅分析了两个发育时间点(HH29和HH34),缺乏更早或更晚时间点的动态变化数据;qPCR验证仅限于部分基因,缺乏功能验证实验 | 探究雌性鸡胚左右性腺中原始生殖细胞在早期性腺分化过程中的差异及其调控机制 | 雌性鸡胚左右性腺中的原始生殖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | HH29和HH34阶段的雌性鸡胚左右性腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 459 | 2026-06-25 |
Multi-Dimensional Transcriptomics Reveals the Prominent Role of Neuroinflammation in Alzheimer's Disease
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115020
PMID:42278544
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综述文章 | 本文综述了多组学转录组学技术在揭示阿尔茨海默病神经炎症中的关键作用 | 系统性地整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,刻画了阿尔茨海默病神经炎症的细胞和分子图谱,揭示了微胶质细胞和星形胶质细胞的状态特异性转变及区域异质性 | 仅基于现有研究进行综述,未提出新实验数据 | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的机制,概述单细胞和空间组学平台的技术演进与比较能力 | 阿尔茨海默病动物模型和人类脑组织样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 460 | 2026-06-25 |
Implications of the Cuproptosis Protein SLC31A1 for the Immune Microenvironment and Temozolomide Sensitivity in Glioblastoma
2026-Jun, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.18188
PMID:42203322
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研究论文 | 探索铜死亡蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境及替莫唑胺敏感性中的意义 | 首次系统研究铜死亡关键蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的分布及其与替莫唑胺敏感性的关联 | 未明确说明研究局限 | 探究SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的表达分布及铜死亡激动剂对替莫唑胺敏感性的影响 | 胶质母细胞瘤(GBM)的肿瘤组织、细胞系及异种移植瘤模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 定量荧光PCR | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 图像, 分子生物学数据 | 生物信息学分析基于公共数据库数据;体外实验使用GBM细胞系;体内实验使用异种移植瘤模型(具体样本数未提及) | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞和批量转录组测序平台 |