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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-05-16 |
Recurrent transcriptional responses in AML and MDS patients treated with decitabine
2022-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2022.04.002
PMID:35429619
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研究论文 | 系统鉴定了地西他滨在体内诱导的全局基因组和转录组改变,包括全基因组亚硫酸氢盐测序、RNA测序和单细胞RNA测序分析 | 首次系统描述了地西他滨在体内治疗过程中诱导的全局性、可逆性低甲基化及其相关转录组变化,并发现红系相关通路在治疗中受抑制而在复发时逆转 | 样本量有限且患者间变异大,限制了检测较小临床效应的统计效力 | 阐明地西他滨治疗骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者时引起的体内分子变化机制 | 接受地西他滨治疗的骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者的原代骨髓样本 | 机器学习和生物信息学 | 骨髓增生异常综合征, 急性髓系白血病 | 全基因组亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多名患者的原代骨髓样本 | NA | 全基因组亚硫酸氢盐测序, 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2026-05-16 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 系统比较外侧下丘脑投射至外侧缰核和腹侧被盖区的谷氨酸能神经元在转录、电生理和功能上的差异 | 结合病毒示踪、单细胞测序、电生理和体内钙成像技术,首次系统解析了外侧下丘脑不同投射路径神经元的分子和功能异质性 | 未明确神经元亚型对摄食和奖赏行为的具体因果作用,且仅聚焦两条投射通路 | 揭示外侧下丘脑谷氨酸能神经元投射至外侧缰核和腹侧被盖区的功能差异 | 小鼠外侧下丘脑投射至外侧缰核和腹侧被盖区的谷氨酸能神经元 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞测序、电生理记录、体内钙成像 | NA | 电生理数据、单细胞转录组数据、钙成像视频 | 小鼠(数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2026-05-16 |
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03341-5
PMID:33731931
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研究论文 | 本研究揭示AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的恶化作用 | 首次阐明JAK2突变通过DNA复制应激激活AIM2炎症小体加剧动脉粥样硬化的机制 | 未提及具体局限性 | 探究克隆性造血相关基因突变(JAK2)促进动脉粥样硬化的分子机制 | 携带JAK2突变的巨噬细胞和模拟克隆性造血的嵌合小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 444 | 2026-05-16 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
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研究论文 | 本文介绍了Constellation-Seq,一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术,能显著提高灵敏度并降低成本 | 实现两个数量级的灵敏度提升,通过最大化读取利用率减少数据稀疏性和测序成本 | 仅展示了在外周血单核细胞样本中的应用,未提及对多种复杂组织的验证 | 开发一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤方法,用于稀缺转录本识别和下游分析 | 外周血单核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,Constellation-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2026-05-16 |
Input-output signal processing plasticity of vagal motor neurons in response to cardiac ischemic injury
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102143
PMID:33665562
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示迷走神经背侧运动核神经元在心脏缺血损伤中的输入-输出信号处理可塑性 | 首次揭示稳态下DMV神经元可组织为可区分的输入-输出信号处理单元,并发现远程缺血预适应和慢性心脏缺血损伤诱导的神经元状态转变及其相关的调控microRNA变化 | 研究仅限于DMV神经元,且样本量可能有限,未能涵盖所有相关脑区或长期动态变化 | 探索DMV神经元的分子表型及其在心脏缺血损伤中的可塑性,为生物电子医学提供新靶点 | 数百个DMV神经元(稳态及生理扰动后) | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百个DMV神经元(稳态及生理扰动后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2026-05-16 |
Isolation of human ESC-derived cardiac derivatives and embryonic heart cells for population and single-cell RNA-seq analysis
2021-03-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100339
PMID:33644774
|
protocol | 描述了一种结合人口和单细胞RNA测序分析,从人胚胎干细胞分化和发育组织中分离心脏衍生物和胚胎心脏细胞的方法 | 结合群体和单细胞RNA测序分析,利用hESC分化和发育组织建立器官特异性细胞和分子图谱 | NA | 建立人胚胎发生中器官特异性细胞和分子图谱 | 人胚胎干细胞分化的心脏衍生物和人类胚胎心脏细胞 | NA | NA | RNA-seq, Smart-seq2 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 群体RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2026-05-16 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在单细胞分辨率下描绘人类肠道发育的时空图谱 | 首次在单细胞水平系统性地构建人类肠道发育的时空图谱,揭示肠道形成的动态过程及多种细胞类型的分化层次 | 研究仅基于胎儿组织样本,可能无法完全代表出生后肠道发育的完整过程 | 解析人类肠道发育过程中的细胞组成、基因表达动态和空间组织规律 | 人类胎儿肠道组织的发育阶段(不同时间点的样本) | 数字病理学 | 罕见肠道发育障碍 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 未具体说明样本数量,涉及多个时间点的人类胎儿肠道组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium进行单细胞RNA测序,10x Visium进行空间转录组学分析 |
| 448 | 2026-05-16 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
|
研究论文 | 通过Wnt信号抑制诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞分化 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定出诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞,并证明XAV-939通过抑制经典Wnt信号通路促进其分化 | 未明确说明局限性(原文未提及) | 研究肺泡I型细胞的分化机制 | 人诱导多能干细胞来源的肺泡上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量(涉及成纤维细胞依赖的肺泡类器官) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 449 | 2026-05-16 |
Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid
2021-01-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011
PMID:33382973
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析COVID-19神经系统并发症患者脑脊液中的免疫细胞图谱,发现去分化单核细胞和耗竭CD4 T细胞的特征性变化 | 首次在脑脊液水平揭示COVID-19神经系统并发症患者存在T细胞耗竭和单核细胞去分化现象,并系统性比较不同类型神经系统疾病的免疫特征差异 | 样本量较小(具体数量未说明),且未阐明脑脊液免疫改变与临床预后的直接因果关系 | 探究COVID-19患者神经系统并发症的免疫学发病机制 | COVID-19神经系统并发症患者(Neuro-COVID)、非炎症性神经系统疾病、自身免疫性神经系统疾病及病毒性脑炎患者 | 单细胞免疫学、神经系统疾病 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 脑脊液免疫细胞单细胞转录组数据 | 多组患者脑脊液样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'基因表达与免疫谱分析 |
| 450 | 2026-05-16 |
High levels of soluble CD25 in COVID-19 severity suggest a divergence between anti-viral and pro-inflammatory T-cell responses
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1251
PMID:33614032
|
研究论文 | 本研究探讨COVID-19患者中可溶性CD25水平与疾病严重程度的关系,提示抗病毒与促炎T细胞反应之间的分歧 | 首次发现可溶性CD25是COVID-19严重程度的独立危险因素,并与病毒脱落时间正相关,揭示CD25+CD8+ T细胞扩增对促炎反应的贡献 | 基于单中心研究,小鼠模型与人类COVID-19的病理差异可能影响结论普适性,且未深入验证sCD25作为治疗靶点的可行性 | 解析COVID-19患者T细胞功能缺陷与过度激活并存现象背后的免疫机制 | COVID-19住院患者及淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染的小鼠模型 | 免疫学 | COVID-19 | 细胞因子检测、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 临床数据、小鼠模型实验数据、单细胞RNA测序数据 | 280例COVID-19住院患者及LCMV感染小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 支气管肺泡灌洗液(BALF)中免疫细胞的单细胞RNA测序 |
| 451 | 2026-05-16 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
|
研究论文 | 对儿童胆汁淤积性肝脏进行转录组分析,识别出三种不同的巨噬细胞群体 | 首次对人类儿童胆汁淤积性肝脏进行单细胞RNA测序,识别出与健康肝脏巨噬细胞转录特征不同的三种巨噬细胞亚群 | 未完全确定这些巨噬细胞亚群在不同病因的胆汁淤积性肝病中的异同 | 进一步表征儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录谱 | 儿童胆汁淤积性肝病患者(胆道闭锁和Alagille综合征)的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞荧光分选,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 胆道闭锁患者6例,Alagille综合征患者6例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 452 | 2026-05-15 |
Integrative multi-omics analysis identifies coronin 1C as a potential mediator linking circadian rhythm disruption to neuroimmune dysregulation in ischemic stroke
2026-Jul-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116732
PMID:42068898
|
研究论文 | 该研究通过整合多组学分析,发现冠状蛋白1C(CORO1C)是连接昼夜节律紊乱与缺血性卒中后神经免疫失调的潜在中介因子 | 首次利用机器学习构建昼夜节律紊乱评分模型,并结合单细胞转录组学和虚拟基因敲除分析,揭示CORO1C在昼夜节律紊乱驱动的神经免疫失调中的核心调控作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白水平和表观遗传学层面的验证;且动物模型及体外实验的临床转化意义需进一步评估 | 探讨昼夜节律紊乱是否通过免疫失衡促进缺血性卒中进展,并阐明其潜在的分子机制 | 人类缺血性卒中脑组织转录组数据、外周血单核细胞单细胞RNA测序数据、以及小鼠昼夜节律依赖的卒中模型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因敲除, AAV介导的基因干预 | 机器学习模型(如CRD评分模型), 虚拟基因敲除框架(scTenifoldKnk) | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 人类缺血性卒中脑组织样本(具体数量未提供)及小鼠卒中模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2026-05-15 |
Ebselen's role in overcoming cisplatin resistance in colorectal Cancer via SQSTM1 ubiquitination modulation
2026-Jul-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116705
PMID:42085841
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研究论文 | 本研究通过体内外实验、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示Ebselen通过调节SQSTM1泛素化逆转结直肠癌顺铂耐药的机制 | 首次阐明Ebselen通过抑制SQSTM1介导的RAD51蛋白酶体降解来逆转顺铂耐药,并结合单细胞和空间转录组学全面解析肿瘤微环境重塑 | 未提及 | 探究Ebselen逆转结直肠癌顺铂耐药的分子机制 | HCT116/DDP顺铂耐药结直肠癌细胞、人源化PBMC皮下CDX小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫共沉淀,泛素化分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 454 | 2026-05-15 |
Transcriptome and single-cell RNA sequencing data identify and validate candidate biomarkers associated with lysosomal and ferroptosis in osteoarthritis
2026-Jun-15, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2026.113141
PMID:42025819
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据,鉴定并验证了与骨关节炎中溶酶体功能和铁死亡相关的候选生物标志物SLC7A5和SLC3A2 | 首次整合溶酶体相关基因与铁死亡相关基因筛选骨关节炎候选生物标志物,并通过单细胞测序确定成纤维细胞为关键细胞群 | 需要进一步的实验和临床验证来确认生物标志物的可靠性 | 鉴定骨关节炎中与溶酶体功能和铁死亡相关的候选生物标志物,为后续实验研究提供理论基础 | 骨关节炎患者样本数据及正常对照样本 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的骨关节炎数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2026-05-15 |
Bisphenol A potentiates ischemia-reperfusion-induced endothelial and blood-brain barrier dysfunction associated with CX3CL1-CX3CR1 signaling
2026-Jun-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120195
PMID:42085735
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研究论文 | 本研究综合运用网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接和单细胞转录组学等方法,发现双酚A通过CX3CL1-CX3CR1信号通路加剧缺血再灌注引起的内皮和血脑屏障功能障碍 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接和单细胞转录组学多种方法,系统揭示双酚A加剧缺血性中风损伤的分子机制,并锁定CX3CL1-CX3CR1信号通路作为关键靶点 | 仅使用体外细胞模型,缺乏体内动物实验验证;双酚A浓度较高(50和100 μM)可能不完全反映环境暴露水平 | 探究双酚A是否以及如何调节缺血性神经血管损伤 | bEnd.3脑内皮细胞和内皮-星形胶质细胞Transwell血脑屏障共培养模型 | NA | 缺血性中风 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 456 | 2026-05-15 |
scRAPID-web: a web server for predicting protein-RNA interactions from single-cell transcriptomics
2026-May-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12870-0
PMID:42129640
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研究论文 | 介绍scRAPID-web网络服务器,用于从单细胞转录组数据预测蛋白质-RNA相互作用 | 通过整合单细胞基因调控网络推断与catRAPID结合倾向预测,开发了用户友好的网络服务器,支持八个模式生物的分析 | NA | 提供一个用户友好的网络工具,用于从单细胞RNA测序数据预测RNA结合蛋白与RNA的相互作用 | 单细胞RNA测序数据中的RNA结合蛋白和RNA | 机器学习 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2026-05-15 |
RNA-based CLEM (RCLEM) bridging RNA localisation and ultrastructural mapping in 3D
2026-May-14, Journal of microscopy
IF:1.5Q3
DOI:10.1111/jmi.70105
PMID:42131894
|
研究论文 | 开发了一种基于RNA的三维相关光镜与电镜(RCLEM)工作流程,用于在超微结构环境中高分辨率可视化RNA分子 | 首次将RNA标记与连续块面扫描电子显微镜(SBF-SEM)整合,实现厚组织中mRNA三维超微结构定位,无需抗体优化,通过优化去污剂条件保持超微结构与探针可及性 | NA | 克服当前空间转录组学分辨率限制,建立连接基因表达与细胞超微结构的高分辨率三维空间转录组分析平台 | 脉络丛和肝脏组织中的mRNA分子 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 空间转录组学, 原位杂交, 连续块面扫描电子显微镜 | NA | 图像, 三维数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 458 | 2026-05-15 |
Integrated Single-Cell Atlas Reveals Cross-Subtype Heterogeneity in Human Pulmonary Hypertension
2026-May-14, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324594
PMID:42131915
|
research paper | 通过整合单细胞RNA测序数据构建人类肺动脉高压核心单细胞图谱,揭示跨亚型异质性,并开发了多任务学习工具PH-Map用于快速分层细胞注释 | 首次构建涵盖多个临床亚型的人类肺动脉高压核心单细胞图谱,并开发基于该图谱的预训练多任务学习工具PH-Map,实现快速分层细胞注释 | 未提及具体局限性 | 整合单细胞RNA测序数据,构建人类肺动脉高压核心单细胞图谱,揭示跨亚型细胞异质性,并为下游研究提供可重复的分层注释工具 | 64个人类样本(包括特发性肺动脉高压、系统性硬化症相关肺动脉高压、慢性血栓栓塞性肺动脉高压和健康对照)的235621个高质量细胞 | machine learning | pulmonary hypertension | single-cell RNA-seq | multitask learning | single-cell RNA sequencing data | 64个人类样本,包含235621个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 459 | 2026-05-15 |
Perk Is Dispensable for Smooth Muscle Cell Phenotype Switching in Atherosclerosis
2026-May-14, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323869
PMID:42131916
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研究论文 | 本研究探讨Perk蛋白在平滑肌细胞表型转换及动脉粥样硬化病变中的作用,发现其并非必需 | 首次通过体内基因敲除和单细胞分析明确Perk在动脉粥样硬化平滑肌细胞调节中不发挥关键作用 | 主要基于小鼠模型,且未在更多人类样本中验证Perk通路与病变稳定性的直接因果关系 | 阐明未折叠蛋白反应蛋白Perk在动脉粥样硬化平滑肌细胞调控和病变稳定性中的作用 | 成年Ldlr基因敲除高胆固醇血症小鼠的平滑肌细胞及人颈动脉病变组织 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、Xenium空间转录组、基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(样本量未明确说明)、人类颈动脉病变样本(具体数量未提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序,Xenium空间转录组学平台 |
| 460 | 2026-05-15 |
A skeletal muscle atlas shows neuromuscular junction adaptations to growth and atrophy
2026-May-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2026.03.010
PMID:42019489
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研究论文 | 该研究构建了小鼠后肢骨骼肌的单细胞和单核转录组图谱,结合空间转录组分析,揭示了神经肌肉接头在肌肉萎缩和肥大过程中的适应性变化 | 首次通过多组学联合分析(单细胞转录组、单核转录组和空间转录组)系统描绘了小鼠骨骼肌在休息、萎缩和肥大状态下的细胞图谱,并发现神经肌肉接头处的突触肌核和终末施万细胞在不同状态下发生显著重塑 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅用于验证部分结果,且实验诱导的萎缩和肥大条件可能无法完全模拟自然衰老或疾病状态下的肌肉变化 | 阐明骨骼肌在萎缩和肥大过程中的分子机制,特别是神经肌肉接头的重塑机制 | 小鼠后肢骨骼肌(静止状态和实验诱导的萎缩或肥大状态)及人类骨骼肌样本(去神经支配和运动后) | 转录组学, 空间组学 | 肌肉萎缩相关疾病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 高分辨率3D成像 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据, 成像数据 | 小鼠后肢骨骼肌样本(具体数量未提及),人类去神经支配和运动后肌肉样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'基因表达测序,10x Visium空间转录组学 |