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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4561 - 4580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4561 | 2025-10-06 |
Discovering molecular signatures in kidney transplant biopsies with borderline changes and isolated V-lesions: single-cell RNA-sequencing analysis of human blood and tissue Spatial transcriptomics
2025-Jul-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05191-x
PMID:40610502
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析肾移植活检组织，发现与T细胞介导排斥反应相关的分子特征 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术分析肾移植排斥反应，识别出CD8效应记忆T细胞亚群和STAT1枢纽基因 | 样本量较小（仅6例患者），空间分析仅比较两名患者 | 研究肾移植中T细胞介导排斥反应的分子机制 | 肾移植患者的血液单核细胞和肾移植活检组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 6例患者（4例排斥反应患者，2例无排斥反应对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4562 | 2025-10-06 |
Machine learning-assisted multi-dimensional transcriptomic analysis of cytoskeleton-related molecules and their relationship with prognosis in hepatocellular carcinoma
2025-Jul-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10056-4
PMID:40610613
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研究论文 | 通过机器学习辅助的多维转录组分析，研究细胞骨架相关分子在肝细胞癌中的预后价值 | 首次构建基于细胞骨架相关基因的五基因预后模型，并结合单细胞测序和空间转录组学揭示其与免疫抑制微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索细胞骨架相关基因在肝细胞癌中的预后价值和治疗潜力 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | LASSO回归,随机森林 | 转录组数据 | TCGA-LIHC数据集加上两个独立验证队列(ICGC LIRI-JP和CHCC-HBV) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4563 | 2025-10-06 |
The role of JPT1 in hepatocellular carcinoma: tumor progression, microtubule dynamics regulation, and potential mechanisms within the immune microenvironment
2025-Jul-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03066-1
PMID:40610765
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研究论文 | 本研究系统探讨了JPT1在肝细胞癌中的表达特征、预后价值及其通过调控微管动力学和免疫微环境促进肿瘤进展的潜在机制 | 首次在肝细胞癌中系统研究JPT1的功能机制，结合空间转录组学揭示其与免疫微环境的关联，并证实其作为诊断生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证JPT1的具体分子机制 | 阐明JPT1在肝细胞癌进展中的作用机制及其临床意义 | 肝细胞癌患者组织样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析，空间转录组学，功能富集分析 | Cox比例风险模型，Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据，临床病理数据，空间转录组数据 | TCGA-LIHC和GEO（GSE14520）数据库的肝细胞癌样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4564 | 2025-10-06 |
Spatial histology and gene-expression representation and generative learning via online self-distillation contrastive learning
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf317
PMID:40618351
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研究论文 | 提出一种名为Magic的自训练对比学习模型，用于从组织学图像预测空间基因表达 | 采用基于动量的模块生成伪目标以减少噪声影响，并利用基于transformer的解码器预测基因表达 | 仅在乳腺癌和结直肠癌样本上验证，需要进一步验证在其他癌症类型的适用性 | 开发从全切片图像直接预测空间基因表达分布的计算方法 | 乳腺癌和结直肠癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌,结直肠癌 | 空间转录组学 | 对比学习,transformer | 图像,基因表达数据 | 训练集: 56个乳腺癌切片中的75,760个点; 验证集: 5个独立切片中的11,026个点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4565 | 2025-10-06 |
Inference of gene coexpression networks from single-cell transcriptome data based on variance decomposition analysis
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf309
PMID:40618350
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研究论文 | 提出基于方差分解分析的单细胞转录组基因共表达网络推断方法GCNVDA | 通过引入基因水平方差和残差误差的随机效应项，有效解决单细胞数据噪声和稀疏性问题 | 未明确说明方法计算复杂度和对大规模数据的适用性 | 从单细胞转录组数据推断基因共表达网络以探索基因调控机制 | 基因共表达网络和功能模块 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 方差分解分析模型 | 单细胞转录组数据 | 三个真实世界单细胞数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4566 | 2025-10-06 |
Optimized Midgut Tissue Dissociation of Mosquitoes and Sandflies for High-Quality Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5352
PMID:40620806
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研究论文 | 提出了一种用于蚊子和沙蝇中肠组织的高质量单细胞RNA测序的优化组织解离方案 | 使用深共晶溶剂在组织解离前稳定RNA，避免了解离过程中温度和酶处理引起的转录变化 | 仅针对三种医学重要昆虫载体进行了验证，未在其他物种中测试 | 开发适用于非模式生物的高质量单细胞RNA测序组织解离方法 | 蚊子和沙蝇的中肠组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三种医学重要昆虫载体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4567 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic insights into endosulfan-induced liver injury: Key pathways and inflammatory responses
2025-Jun, Liver research (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.livres.2025.05.002
PMID:40620502
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示硫丹诱导肝损伤的关键通路和炎症反应机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示硫丹诱导肝损伤的细胞分子机制，发现肝星状细胞与CD8+ T细胞间相互作用的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；暴露时间较短（两周） | 阐明硫丹诱导肝毒性的细胞和分子机制 | C57BL/6小鼠肝脏细胞 | 单细胞组学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4568 | 2025-10-06 |
Reduced Thioredoxin Regulates IL-1β Secretion via NLRP3 of IL-1β+ Alveolar Macrophages in COPD
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S513004
PMID:40620599
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性阻塞性肺疾病中还原型硫氧还蛋白通过调节NLRP3炎症小体活性影响IL-1β+肺泡巨噬细胞分泌IL-1β的机制 | 首次在单细胞水平揭示COPD中IL-1β+肺泡巨噬细胞的TRX氧化还原状态异常通过TXNIP-NLRP3轴调控IL-1β分泌的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系验证，需要进一步在人类原代细胞中确认 | 探究COPD中硫氧还蛋白的变化及其在IL-1β释放中的作用 | COPD肺组织、肺泡巨噬细胞、COPD小鼠模型、THP-1细胞系 | 生物医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质活性分析, 分子动力学模拟, 免疫共沉淀 | Monocle2, 分子动力学模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | GEO数据库中的COPD肺组织scRNA-seq数据、小鼠模型和THP-1细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4569 | 2025-10-06 |
Electroacupuncture at ST36 Treatment Suppresses the Microglial Pyroptosis Through Activating α7nAChR in a Rat Model of Asphyxial Cardiac Arrest
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525373
PMID:40620602
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研究论文 | 本研究探讨电针足三里穴通过激活α7nAChR抑制小胶质细胞焦亡在心脏骤停大鼠模型中的神经保护作用 | 首次揭示电针足三里穴通过α7nAChR依赖途径抑制小胶质细胞焦亡的神经保护新机制 | 研究仅使用大鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究电针足三里穴对心脏骤停后全脑缺血损伤的神经保护作用及机制 | 窒息性心脏骤停大鼠模型和原代小胶质细胞氧糖剥夺/再灌注模型 | 神经科学 | 心脏骤停 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，流式细胞术，ELISA，组织病理染色 | 动物疾病模型，细胞模型 | 基因表达数据，行为学数据，细胞学数据，蛋白质数据 | 大鼠模型和原代细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4570 | 2025-10-06 |
Unveiling PANoptosis in Acute Kidney Injury: An Integrative Multi-Dimensional Approach to Identify Key Biomarkers
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525222
PMID:40620603
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据识别急性肾损伤中PANoptosis关键生物标志物 | 首次在AKI中系统研究PANoptosis，整合单细胞和转录组数据结合机器学习算法识别关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 阐明PANoptosis在急性肾损伤中的作用机制并识别关键生物标志物 | 急性肾损伤患者和动物模型的细胞及组织样本 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习算法, Western blot, 免疫组织化学 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据, 转录组数据 | 未明确具体样本数量，包含AKI患者和动物模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 4571 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq and network pharmacology reveals protective effect of salidroside in peritoneal dialysis-associated peritoneal fibrosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1558366
PMID:40620673
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和网络药理学方法，揭示了红景天苷对腹膜透析相关腹膜纤维化的保护作用及其作用机制 | 首次将单细胞RNA测序、批量RNA测序与网络药理学相结合，系统研究红景天苷在腹膜透析相关腹膜纤维化中的治疗潜力，并鉴定出四个关键治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究深度有限 | 探究红景天苷对腹膜透析相关腹膜纤维化的保护作用及分子机制 | 腹膜纤维化小鼠模型和相关的分子靶点 | 生物信息学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 网络药理学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4572 | 2025-10-06 |
Prognostic implications of high- OXPHOS macrophages in gastric cancer: a single-cell transcriptomics and tumor microenvironment communication study
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1533990
PMID:40620715
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了胃癌肿瘤微环境中高OXPHOS巨噬细胞的预后意义 | 首次基于单细胞转录组数据构建了高OXPHOS巨噬细胞相关的19基因预后特征，并鉴定了NPC2、LY96和TPP1等关键巨噬细胞标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量有限，需要进一步实验验证 | 解析胃癌单细胞转录组景观，研究肿瘤相关巨噬细胞在疾病进展中的作用 | 胃癌患者肿瘤组织和正常胃组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 预后特征模型 | 单细胞转录组数据 | 435例胃癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4573 | 2025-10-06 |
BCMA: An integrative and versatile database for multi-scale and multi-omics molecular atlas of breast cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.031
PMID:40621063
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研究论文 | 开发了一个整合多尺度多组学数据的乳腺癌分子图谱数据库BCMA | 整合了6个批量多组学数据集和9个单细胞转录组数据集，系统性表征乳腺癌分子特征并提供用户友好的基因中心搜索界面 | 未提及数据集的样本来源限制或平台技术局限性 | 建立乳腺癌多尺度多组学整合分析平台以促进精准治疗研究 | 乳腺癌患者样本（5424例病例和236,363个细胞） | 生物信息学 | 乳腺癌 | 多组学分析，单细胞转录组测序 | NA | 基因组学数据，转录组数据，表观基因组数据，临床数据 | 5424例病例和236,363个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，批量多组学分析 | NA | NA |
| 4574 | 2025-10-06 |
Inference of single cell profiles from histology stains with the Single Cell omics from Histology Analysis Framework (SCHAF)
2025-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533680
PMID:36993643
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研究论文 | 开发了从H&E组织学染色图像推断单细胞转录组图谱的计算框架SCHAF | 首次利用视觉变换器和对抗深度学习从常规H&E染色图像生成空间分辨的单细胞全转录组数据 | 存在一些局限性，但未在摘要中具体说明 | 从组织学染色图像推断单细胞分子图谱 | 肺癌、转移性乳腺癌、胎盘和整只小鼠幼崽等多种组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、H&E染色 | 视觉变换器、对抗深度学习 | 图像、转录组数据 | 多种组织的匹配样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 4575 | 2025-10-06 |
Lung Tissue Multilayer Network Analysis Uncovers the Molecular Heterogeneity of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Nov-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0500OC
PMID:38626356
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研究论文 | 通过多层网络分析整合肺组织多组学数据，揭示慢性阻塞性肺疾病的分子异质性 | 首次采用多层网络方法整合mRNA、microRNA和甲基化组数据，识别出具有不同分子特征但临床表现相似的COPD患者亚群 | 样本仅来自135名前吸烟COPD患者，需在更广泛人群中验证 | 解析COPD的分子异质性及其与临床特征的关系 | 135名前吸烟COPD患者的肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | mRNA测序,microRNA测序,甲基化测序,空间转录组学 | 多层网络分析,机器学习模型 | 分子组学数据,临床数据 | 135名前吸烟COPD患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4576 | 2025-10-06 |
In situ reprogramming of cardiac fibroblasts into cardiomyocytes in mouse heart with chemicals
2024-Nov, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01308-6
PMID:38890526
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研究论文 | 本研究通过化学混合物在小鼠心脏中原位将心脏成纤维细胞重编程为心肌细胞 | 首次在全心脏水平通过化学混合物实现原位成纤维细胞向心肌细胞的重编程，并利用组织透明化技术进行三维观察 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在大型动物或人体中验证 | 探索化学诱导心脏成纤维细胞原位重编程为心肌细胞的方法 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 组织透明化技术, 3D成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 两种遗传追踪小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | CUBIC组织透明化技术 |
| 4577 | 2025-10-06 |
Poor clinical outcomes and immunoevasive contexture in CD161+CD8+ T cells barren human pancreatic cancer
2024-03-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008694
PMID:38531664
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研究论文 | 本研究探讨了CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子特征 | 首次系统评估CD161+CD8+ T细胞在PDAC中的临床意义，发现其与生存期和治疗反应的相关性，并鉴定其为具有细胞毒性和免疫检查点分子特征的特殊T细胞亚型 | 需要进一步研究验证其在风险分层和治疗策略优化中的作用 | 阐明CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子特征 | 186例经根治性切除的胰腺导管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、临床数据、分子数据 | 186例PDAC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4578 | 2025-10-06 |
Maximum Likelihood Inference of Time-scaled Cell Lineage Trees with Mixed-type Missing Data
2024-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.05.583638
PMID:38496496
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研究论文 | 提出一种用于动态谱系追踪数据的最大似然推断方法，能够从CRISPR诱导的突变中准确推断细胞谱系树 | 开发了概率混合型缺失(PMM)模型和LAML算法，专门处理CRISPR谱系追踪数据的三个独特特征：基因组位置的单次编辑、突变率随时间衰减、高比例的可遗传和非可遗传缺失数据 | 在存在可遗传缺失数据的情况下需要采用块坐标上升方法，计算效率可能受限 | 解决动态谱系追踪中的细胞谱系树推断问题 | 细胞谱系树、CRISPR诱导的突变数据 | 计算生物学 | 肺腺癌 | CRISPR基因组编辑、单细胞测序 | 概率混合型缺失(PMM)模型、期望最大化(EM)算法 | 基因突变数据、基因表达数据 | 小鼠肺腺癌模型数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4579 | 2025-10-06 |
Molecular assessment of intratumoral immune cell subsets and potential mechanisms of resistance to odronextamab, a CD20×CD3 bispecific antibody, in patients with relapsed/refractory B-cell non-Hodgkin lymphoma
2024-03-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008338
PMID:38519055
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研究论文 | 评估肿瘤内免疫细胞亚群特征及odronextamab耐药机制的研究 | 首次系统分析CD20×CD3双特异性抗体odronextamab在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的分子作用机制和耐药性 | 样本量有限，主要基于观察性数据 | 探索odronextamab在复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的生物标志物和耐药机制 | 复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤免疫学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 免疫组织化学，流式细胞术，单细胞RNA测序，全基因组测序 | NA | 分子生物学数据，临床数据 | ELM-1研究中的患者队列 | NA | 单细胞RNA测序，全基因组测序 | NA | NA |
| 4580 | 2025-10-06 |
Mefloquine enhances the efficacy of anti-PD-1 immunotherapy via IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3-induced ferroptosis in tumors
2024-03-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008554
PMID:38471712
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研究论文 | 本研究揭示甲氟喹通过IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3信号通路诱导铁死亡，增强抗PD-1免疫疗法对黑色素瘤和肺癌的疗效 | 首次发现甲氟喹通过激活IFN-γ-STAT1-IRF1信号通路上调LPCAT3表达诱导铁死亡，并证实LPCAT3表达与抗PD-1免疫疗法疗效正相关 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺癌，未涉及其他肿瘤类型；机制研究主要在细胞和动物模型中进行 | 探究甲氟喹增强抗PD-1免疫疗法疗效的分子机制 | 黑色素瘤和肺癌细胞系及动物模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺癌 | RNA测序,实时定量PCR,蛋白质印迹,染色质免疫沉淀,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | 细胞系实验和动物模型，包含临床患者转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |