单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 4561 - 4580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4561 | 2025-01-30 |
MAIT Cell-Mediated Immune Mechanisms of Dialysis-Induced Peritoneal Fibrosis and Therapeutic Targeting
2025-Jan-28, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000627
PMID:39874111
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研究论文 | 本研究探讨了MAIT细胞在长期腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的免疫机制及治疗靶点 | 首次揭示了MAIT细胞通过MR1受体与间皮细胞相互作用，激活mTORC1信号通路，促进腹膜纤维化的机制，并提出了通过阻断MR1-MAIT相互作用来治疗纤维化的新策略 | 研究主要基于体外模型和Mr1基因敲除小鼠，尚未在人体临床试验中验证其治疗效果 | 探讨MAIT细胞在腹膜透析诱导的腹膜纤维化中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 长期接受腹膜透析的患者及Mr1基因敲除小鼠 | 免疫学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据 | 长期腹膜透析患者及Mr1基因敲除小鼠 |
| 4562 | 2025-01-30 |
DDO1002, an NRF2-KEAP1 inhibitor, improves hematopoietic stem cell aging and stress response
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae043
PMID:39872153
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研究论文 | 本文研究了DDO1002作为NRF2-KEAP1抑制剂在改善造血干细胞衰老和应激反应中的作用 | 首次阐明了DDO1002通过激活NRF2-ARE信号通路来减少细胞内活性氧水平，从而延缓细胞衰老和改善造血功能 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨DDO1002在缓解全身照射后或衰老过程中造血功能下降的作用 | 造血干细胞（HSCs） | 生物医学 | 老年疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | 老年小鼠 |
| 4563 | 2025-01-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intercellular crosstalk and the regulatory landscape of stromal cells during the whole life of the mouse ovary
2024-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae041
PMID:39872151
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠卵巢整个生命周期中基质细胞的细胞间通讯和调控景观 | 首次整合了从胚胎期到成年期的单细胞RNA测序数据，揭示了卵巢基质细胞的动态变化和细胞间通讯网络，并识别了基质细胞的起源——间充质祖细胞（CD24） | 研究主要基于小鼠模型，人类卵巢中的相关机制仍需进一步验证 | 研究卵巢基质细胞的异质性、发育轨迹及细胞间通讯网络 | 小鼠卵巢中的基质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从E11.5（胚胎第11.5天）到M12（12月龄）的小鼠卵巢样本 |
| 4564 | 2025-01-30 |
Spatial multi-omics characterizes GPR35-relevant lipid metabolism signatures across liver zonation in MASLD
2024-Dec, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loae021
PMID:39873004
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研究论文 | 本研究通过结合脂质代谢组学、空间转录组学（ST）和空间代谢组学（SM），旨在识别由GPR35调控的MASLD中不同肝脏分区的特定基因和代谢物的空间分布 | 首次在肝脏分区水平上揭示了GPR35在MASLD中的调控机制，特别是其对脂质代谢和炎症反应的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨GPR35在MASLD中的调控机制及其对肝脏分区的影响 | 小鼠肝脏 | 代谢组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 脂质代谢组学、空间转录组学（ST）、空间代谢组学（SM） | NA | 代谢物和基因表达数据 | NA |
| 4565 | 2025-01-30 |
The evolution of ovarian somatic cells characterized by transcriptome and chromatin accessibility across rodents, monkeys, and humans
2024-Oct, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae028
PMID:39872443
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子卵巢在进化过程中的保守性和差异性 | 首次通过单细胞转录组和染色质可及性联合分析，揭示了卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化，并发现了跨物种的共同调控架构 | 研究主要依赖于非人类模型生物，可能无法完全反映人类卵巢的复杂性 | 研究卵巢细胞在进化过程中的分子机制变化，以理解人类卵巢生理和疾病 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 人类、猴子、小鼠、大鼠和兔子的卵巢细胞样本 |
| 4566 | 2025-01-30 |
Comparative dissection of transcriptional landscapes of human iPSC-NK differentiation and NK cell development
2024-Aug, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae032
PMID:39872864
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研究论文 | 本文通过比较分析单细胞RNA测序数据，揭示了人类iPSC-NK细胞分化和NK细胞发育过程中的关键转录因子调控网络 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了iPSC-NK细胞分化过程中缺乏的关键因子，并验证了STAT5A-iPSCs新细胞系的抗肿瘤功能 | 研究中未明确提及样本的具体数量，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解iPSC-NK细胞的分化过程，以优化其生产和工程化 | 人类iPSC-NK细胞和胎儿肝脏NK细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未明确说明 |
| 4567 | 2025-01-30 |
Integration of single-cell transcriptome and chromatin accessibility and its application on tumor investigation
2024-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnae015
PMID:39872661
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组和染色质可及性测序方法的最新突破，并描述了整合这些单细胞测序数据的生物信息学策略及其在肿瘤研究中的应用 | 整合单细胞转录组和染色质可及性测序数据，以更深入地理解肿瘤发生和进展 | 讨论了该领域面临的挑战和预期发展，但未具体说明当前方法的局限性 | 总结单细胞测序方法的最新进展及其在肿瘤研究中的应用 | 单细胞转录组和染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 4568 | 2025-01-30 |
Generation of renal tubular organoids from adult SOX9+ kidney progenitor cells
2023-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad047
PMID:39872058
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研究论文 | 本文研究了从成年SOX9+肾脏祖细胞生成肾小管类器官的能力 | 首次研究了SOX9阳性肾脏祖细胞自主生成肾脏类器官的能力，并发现其具有更强的肾小管分化潜力 | SOX9肾脏祖细胞未能分化为肾小球细胞 | 研究SOX9阳性肾脏祖细胞的分化潜力及其在生成肾小管类器官中的应用 | 小鼠和人类的SOX9肾脏祖细胞 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类的SOX9肾脏祖细胞 |
| 4569 | 2025-01-30 |
Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids
2023-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac034
PMID:39872117
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研究论文 | 本文通过构建胆固醇暴露模型，利用人类多能干细胞衍生的脑类器官，揭示了母体高胆固醇暴露可能导致后代神经发育障碍的机制 | 首次使用人类多能干细胞衍生的脑类器官构建胆固醇暴露模型，揭示了高胆固醇对神经祖细胞增殖的抑制作用及其与自闭症谱系障碍（ASD）的潜在关联 | 研究主要基于体外模型，未涉及动物或人体实验，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨母体高胆固醇暴露对后代神经发育的影响及其机制 | 人类多能干细胞衍生的脑类器官 | 神经发育生物学 | 自闭症谱系障碍（ASD） | 单细胞测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据 | NA |
| 4570 | 2025-01-30 |
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad006
PMID:39872951
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研究论文 | 本文通过两步诱导协议从人类孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，以研究基因组印记在胚胎发育中的作用 | 首次从孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，为研究基因组印记提供了新模型 | 由于发育缺陷和伦理限制，对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 | 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及父母起源偏差对人类发育和病理机制的影响 | 孤雌生殖干细胞（hPg-ESCs）及其衍生的扩展多能干细胞（hPg-EPSCs） | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4571 | 2025-01-30 |
Decoding liver fibrogenesis with single-cell technologies
2022-Dec, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac040
PMID:39872749
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序技术如何改变我们对肝纤维化调控机制的理解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肝纤维化过程中疾病相关细胞亚群、分子事件和细胞间相互作用 | 需要进一步努力以全面理解这些变化对肝纤维化的功能贡献，并将新知识转化为有效的治疗方法 | 探讨单细胞RNA测序技术在肝纤维化研究中的应用 | 肝细胞、肝窦内皮细胞、肌成纤维细胞和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4572 | 2024-12-09 |
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740
PMID:39642726
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研究论文 | 研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用 | 首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用，并提出了潜在的治疗策略 | NA | 探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制 | 肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞 | NA | 辐射诱导的肺损伤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术 | NA | 细胞和组织微环境数据 | NA |
| 4573 | 2025-01-29 |
Improving Spatial Transcriptomics with Membrane-Based Boundary Definition and Enhanced Single-Cell Resolution
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401056
PMID:39871658
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研究论文 | 本文介绍了一种新的空间转录组学方法，通过使用基因编码的荧光蛋白标记细胞膜，精确索引切片上的测序点和细胞内的转录本 | 提出了一种基于细胞膜标记的新方法，相比基于细胞核的方法，显著提高了基因捕获数量，并实现了更一致的单细胞RNA测序数据表达谱 | 未提及具体的技术限制或挑战 | 改进空间转录组学技术，提高细胞边界定义的准确性和单细胞分辨率 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道 | 空间转录组学 | NA | 基因编码的荧光蛋白标记 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道样本 |
| 4574 | 2025-01-29 |
Human Dermal Microvascular Arterial and Venous Blood Endothelial Cells and Their Use in Bioengineered Dermo-Epidermal Skin Substitutes
2025-Jan-28, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401588
PMID:39871784
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4575 | 2024-12-24 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.05.627027
PMID:39713433
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研究论文 | 研究了视网膜波对视网膜神经节细胞类型转录组变化的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了视网膜波对不同类型视网膜神经节细胞基因表达的微弱影响 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量较小 | 探讨视网膜波对视网膜神经节细胞基因表达的影响 | 视网膜神经节细胞的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞 |
| 4576 | 2025-01-29 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
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研究论文 | 本文探讨了造血衰老的三个表型特征的原因，特别是炎症如何促进这些衰老表型 | 提出了一个实验模型（IkappaBminus）来解析NFkappaB在造血衰老表型中的作用，并发现HSC自主的NFkappaB活动损害其功能，而骨髓环境中的炎症驱动髓系偏倚 | 研究主要基于实验模型，可能无法完全反映人类造血衰老的复杂性 | 解析造血衰老的三个表型特征的独立调控机制 | 造血干细胞（HSC）及其在衰老过程中的功能变化 | 生物医学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | IkappaBminus模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类的HSC数据集 |
| 4577 | 2025-01-28 |
COSIME: Cooperative multi-view integration and Scalable and Interpretable Model Explainer
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.11.632570
PMID:39868220
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研究论文 | 本文介绍了COSIME，一种用于多组学数据集成和可解释性模型解释的新方法 | COSIME通过可学习的最优传输（LOT）的反向传播和蒙特卡洛采样，实现了多视图数据的集成和特征关系的解释 | NA | 解决多组学数据集成和特征关系解释的瓶颈问题 | 单细胞转录组学、单细胞空间转录组学、表观基因组学和代谢组学数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 可学习的最优传输（LOT）、蒙特卡洛采样 | 深度神经网络 | 多组学数据 | 模拟数据和真实世界数据集 |
| 4578 | 2025-01-28 |
Inhibition of Glutamine Metabolism Suppresses Tumor Progression through Remodeling of the Macrophage Immune Microenvironment
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.10.632174
PMID:39868269
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研究论文 | 本研究探讨了抑制谷氨酰胺代谢通过重塑巨噬细胞免疫微环境来抑制肿瘤进展的机制 | 使用免疫活性小鼠模型和单细胞RNA测序技术，开发了一种仅在癌组织中生物激活的GLNi前药JHU083，揭示了其对肿瘤微环境中不同巨噬细胞亚型的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索谷氨酰胺代谢抑制剂在癌症治疗中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 免疫活性小鼠模型中的妇科癌症 | 癌症研究 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 免疫活性小鼠模型 | RNA测序数据 | 免疫活性小鼠模型中的肿瘤样本 |
| 4579 | 2024-12-18 |
Endogenous Retroelement Activation is Implicated in Interferon-α Production and Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Autoantibody Generation in Early Rheumatoid Arthritis
2024-Dec-16, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43083
PMID:39681508
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研究论文 | 本文研究了内源性逆转录元件（EREs）在早期类风湿性关节炎（eRA）中的表达及其与IFN-α产生和抗CCP自身抗体生成的关系 | 首次在eRA中研究了EREs的表达，揭示了EREs与IFN-I产生和抗CCP自身抗体的潜在因果关系 | 研究样本量较小，且仅限于早期类风湿性关节炎和早期银屑病关节炎患者 | 探讨EREs在早期类风湿性关节炎中的表达及其与IFN-α和抗CCP自身抗体的关系 | 早期类风湿性关节炎患者的全血和滑膜组织，以及早期银屑病关节炎患者的循环淋巴细胞亚群 | NA | 类风湿性关节炎 | RT-PCR, Nanostring, 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 22例eRA滑膜组织样本，56例全血样本，以及eRA和ePsA患者的循环淋巴细胞亚群 |
| 4580 | 2024-12-11 |
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001182
PMID:39656099
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓（PVTT）的免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PVTT中免疫细胞的组成和功能，特别是C5aR+ TAMs在免疫抑制环境中的作用 | 研究主要集中在PVTT的免疫微环境，未涉及其他类型的肿瘤血栓 | 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 | 肝细胞癌中的门静脉肿瘤血栓（PVTT） | 数字病理学 | 肝癌 | 时间飞行质谱（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞数据 | 使用了PVTT细胞系CSQT2和单核细胞系THP-1进行实验 |