单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4541 - 4560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4541 | 2025-10-06 |
Single-nuclei RNA-sequencing fails to detect molecular dysregulation in the preeclamptic placenta
2025-01, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2024.12.011
PMID:39733647
|
研究论文 | 本研究比较单细胞RNA测序和单核RNA测序在检测先兆子痫胎盘分子失调方面的效果 | 首次系统比较scRNA-seq和snRNA-seq在胎盘研究中的敏感性差异，发现单核测序无法检测疾病相关应激和炎症信号 | 样本量相对较小，仅针对早发型先兆子痫进行研究 | 评估单核RNA测序在检测先兆子痫胎盘分子失调方面的有效性 | 人类胎盘组织 | 单细胞基因组学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 45,836个细胞和27,078个核，来自10例早发型先兆子痫和5例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 4542 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic and m6A methylation analyses reveal platelet-mediated immune regulatory mechanisms in sepsis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1607732
PMID:40625751
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研究论文 | 通过单细胞转录组和m6A甲基化分析揭示脓毒症中血小板介导的免疫调节机制 | 首次整合单细胞RNA测序与m6A甲基化测序数据，系统揭示脓毒症进程中血小板功能重塑的m6A依赖性调控机制，并鉴定出关键靶基因RPA1 | 研究基于公共数据集GSE167363，样本来源和数量可能受限，需要进一步实验验证 | 探究脓毒症中免疫细胞组成变化、细胞间通讯特征及m6A修饰的潜在调控机制 | 脓毒症患者的外周血单个核细胞，包括健康对照、存活者和非存活者 | 单细胞生物学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, m6A甲基化测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传学数据 | GSE167363数据集中的脓毒症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 甲基化测序 | NA | NA |
| 4543 | 2025-10-06 |
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf106
PMID:40626041
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观点文章 | 讨论调控和系统基因组学领域的最新进展与挑战，重点关注顺式调控元件的解码方法 | 整合3D染色质组织研究与序列到功能神经网络，提出构建跨细胞类型和个体的通用顺式调控模型策略 | 存在知识空白、技术限制和计算方法基准测试的挑战 | 解码顺式调控代码，预测遗传变异对表型结果的影响 | 顺式调控元件、基因调控网络、遗传变异 | 基因组学 | 人类疾病 | 空间转录组学、基因组学分析 | 序列到功能神经网络 | 基因组序列数据、3D染色质结构数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4544 | 2025-10-06 |
CYLD as a key regulator of myocardial infarction-to-heart failure transition revealed by multi-omics integration
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1592985
PMID:40626177
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研究论文 | 通过多组学整合分析识别CYLD作为心肌梗死向心力衰竭转变的关键调控基因 | 首次通过多组学整合分析揭示CYLD在心肌梗死向心力衰竭转变中的关键调控作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索心肌梗死向心力衰竭转变的分子机制 | 心肌梗死和心力衰竭患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析, 单细胞转录组测序, 机器学习 | 随机森林, WGCNA, Limma | 基因表达数据 | 5个GEO数据集(GSE59867, GSE62646, GSE168281, GSE267644, GSE269269) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4545 | 2025-10-06 |
Neutralization of the autophagy-repressive tissue hormone DBI/ACBP (diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein) enhances anticancer immunosurveillance
2024-12, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2024.2411854
PMID:39419485
|
研究论文 | 研究通过中和自噬抑制因子DBI/ACBP来增强抗癌免疫监视 | 首次发现DBI/ACBP可作为自噬检查点，其中和能增强效应T细胞浸润并改善癌症控制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚不充分 | 探索DBI/ACBP在癌症免疫监视中的作用机制 | 癌症患者血浆样本和小鼠癌症模型 | 癌症免疫学 | 乳腺癌、非小细胞肺癌、肉瘤 | 单细胞RNA测序、单克隆抗体中和 | NA | 血浆样本、基因表达数据 | 癌症易感综合征患者和普通癌症患者群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4546 | 2025-10-06 |
The G4 resolvase Dhx36 modulates cardiomyocyte differentiation and ventricular conduction system development
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52809-1
PMID:39366945
|
研究论文 | 本研究揭示了Dhx36解旋酶通过调控启动子G-四链体结构在心肌细胞分化和心室传导系统发育中的关键作用 | 首次发现Dhx36通过解析启动子G-四链体结构调控关键心脏基因网络，影响心室传导系统发育和心肌细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Dhx36在心脏传导系统发育和心肌细胞分化中的分子机制 | 胚胎期和新生期小鼠心脏组织 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 4547 | 2025-10-06 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614841
PMID:39386468
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术识别了果蝇侧角亮氨酸激肽神经元中整合睡眠与代谢状态的关键基因 | 首次在单神经元水平揭示饥饿状态下睡眠-代谢相互作用的转录调控机制 | 研究仅聚焦于果蝇特定神经元类型，结果在其他物种中的普适性有待验证 | 探究睡眠与代谢状态相互作用的细胞分子机制 | 果蝇侧角亮氨酸激肽神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, Patch-seq, CEL-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇LHLK神经元（饱食与24小时饥饿状态对比） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4548 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in pediatric research: Focusing on differentiation trajectories and immune microenvironment of neuroblastoma
2024-Sep, Pediatric discovery..
DOI:10.1002/pdi3.61
PMID:40625458
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经母细胞瘤研究中的应用，重点关注分化轨迹和肿瘤免疫微环境 | 系统总结了单细胞测序技术在神经母细胞瘤研究中揭示肿瘤分化轨迹、异质性和免疫微环境的新发现 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在儿科神经母细胞瘤研究中的应用价值 | 神经母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4549 | 2025-10-06 |
Signature morphoelectric properties of diverse GABAergic interneurons in the human neocortex
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf6484
PMID:37824669
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研究论文 | 本研究通过病毒遗传标记和Patch-seq技术系统表征了人类新皮质中多种GABA能中间神经元的形态电生理特性 | 揭示了PVALB和SST亚类之间的过渡特征，发现了丰富转录组类型中的形态异质性，识别了灵长类特化的双束细胞多个空间独特类型 | 研究基于脑切片样本，可能无法完全反映在体状态下的神经元特性 | 完善新兴的转录组细胞类型分类并理解人类脑细胞类型的保守和特化特性 | 人类新皮质中的GABA能中间神经元 | 神经科学 | NA | 病毒遗传标记，Patch-seq（膜片钳电生理学加单细胞RNA测序） | NA | 电生理数据，单细胞转录组数据，形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4550 | 2025-10-06 |
Neuronal identity defines α-synuclein and tau toxicity
2023-05-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.02.033
PMID:36948206
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研究论文 | 本研究通过分析人脑数据集和果蝇模型，探索神经元身份对α-突触核蛋白和tau蛋白毒性的影响 | 发现神经元易损性与α-突触核蛋白或tau蛋白表达水平无关，揭示了突触和钙稳态相关基因作为tau毒性调节因子 | 研究主要基于果蝇模型，需要在哺乳动物系统中进一步验证 | 确定对α-突触核蛋白或tau蛋白毒性反应最敏感的细胞环境 | 人脑神经元和果蝇活神经元类型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，深度表型分析 | 果蝇模型 | 基因表达数据，转录组数据 | 超过200种活神经元类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4551 | 2025-10-06 |
SigEMD: A powerful method for differential gene expression analysis in single-cell RNA sequencing data
2018-08-01, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2018.04.017
PMID:29702224
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研究论文 | 提出一种名为SigEMD的新方法，用于单细胞RNA测序数据中的差异基因表达分析 | 结合数据插补方法、逻辑回归模型和基于Earth Mover's Distance的非参数方法，并利用基因互作网络信息减少假阳性 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中差异表达基因的精确识别方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型, 非参数方法 | 单细胞RNA测序数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4552 | 2025-10-06 |
Sirtuin 2 regulates NOD-like receptor protein 3/nuclear factor kappa B axis to promote cartilage repair in osteoarthritis
2025-Sep, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70031
PMID:40620356
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研究论文 | 本研究揭示了SIRT2通过调节NF-κB/NLRP3信号轴促进骨关节炎软骨修复的分子机制 | 首次阐明SIRT2通过去乙酰化NF-κB p65抑制NLRP3炎症小体激活，从而促进软骨修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未进行人体临床试验验证 | 阐明SIRT2在骨关节炎中调节NLRP3/NF-κB信号轴促进软骨修复的作用机制 | 骨关节炎小鼠模型和软骨细胞培养物 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 实时PCR, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4553 | 2025-10-06 |
Cluster-guided contrastive learning with masked autoencoder for spatial domain identification based on spatial transcriptomics
2025-Jul-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3586483
PMID:40622835
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研究论文 | 提出一种结合掩码自编码器和聚类引导对比学习的自监督学习框架STMCCL，用于空间转录组数据的空间域识别 | 首次将掩码自编码器与聚类引导对比学习相结合，并引入多聚类视角模块同时考虑几何和结构关系 | NA | 开发更准确的空间域识别方法以分析空间转录组数据 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 掩码自编码器, 对比学习 | 基因表达谱, 空间信息 | 7个公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4554 | 2025-07-09 |
Author Correction: Spatial transcriptomics reveals regionally altered gene expression that drives retinal degeneration
2025-Jul-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08451-8
PMID:40624286
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4555 | 2025-10-06 |
Integration of Single-cell Sequencing Analysis Reveals Disulfidptosis Related Molecular Subtype and Novel Prognosis System for Osteosarcoma
2025-Jul-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序分析揭示了骨肉瘤中二硫化物死亡相关分子亚型并建立了新的预后系统 | 首次在骨肉瘤中探索二硫化物死亡的作用，建立了基于DRG的预后模型并发现POLR1D的致癌功能 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析，实验验证相对有限 | 研究二硫化物死亡相关基因在骨肉瘤预后分层和治疗策略中的作用 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，Western blotting，qRT-PCR，细胞迁移和侵袭实验 | Cox回归，LASSO回归，聚类分析 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 公共数据库中的骨肉瘤样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4556 | 2025-10-06 |
Lactate-related gene signatures predict prognosis and immune profiles in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jul-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10456-6
PMID:40617965
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研究论文 | 本研究通过识别食管鳞状细胞癌中六个乳酸相关枢纽基因，探索了乳酸代谢与肿瘤预后和免疫特征的关系 | 首次在食管鳞状细胞癌中系统识别了六个乳酸相关枢纽基因，并建立了乳酸化评分系统用于评估肿瘤免疫微环境 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证基因特征的预测价值 | 探索乳酸代谢相关基因在食管鳞状细胞癌预后预测和免疫特征分析中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者样本和细胞系 | 癌症生物学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, CellChat分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 食管鳞状细胞癌样本和正常样本，两个ESCC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4557 | 2025-10-06 |
Targeting PFKFB3 to restore glucose metabolism in acute pancreatitis via nanovesicle delivery
2025-Jul-05, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01261-y
PMID:40618046
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研究论文 | 本研究探索通过纳米囊泡递送抑制PFKFB3以恢复急性胰腺炎中葡萄糖代谢的方法 | 首次发现PFKFB3在急性胰腺炎葡萄糖代谢紊乱中的关键作用，并开发纳米囊泡递送系统进行靶向治疗 | 研究主要基于动物和细胞模型，尚未进行临床试验验证 | 探索PFKFB3在急性胰腺炎葡萄糖代谢调节中的作用及纳米囊泡递送治疗的潜力 | 急性胰腺炎模型中的葡萄糖代谢机制 | 生物医学工程 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 纳米囊泡递送技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4558 | 2025-10-06 |
Reduced somatosensory innervation alters the skeletal transcriptome at a single cell level in a mouse model of type 2 diabetes
2025-Jul-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00436-x
PMID:40615376
|
研究论文 | 本研究通过高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型，探索了糖尿病外周神经病变对骨骼代谢的影响机制 | 首次在单细胞水平揭示糖尿病状态下骨骼神经支配减少对骨骼转录组的改变，并重建了神经-骨骼信号传导相互作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究糖尿病外周神经病变对骨骼代谢的影响机制 | 高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 高脂饮食喂养的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4559 | 2025-10-06 |
Single‑cell RNA sequencing reveals TMEM71 as an immunomodulatory biomarker predicting immune checkpoint blockade response in breast cancer
2025-Jul-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03068-z
PMID:40608205
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TMEM71是预测乳腺癌免疫检查点阻断反应的免疫调节生物标志物 | 首次系统揭示TMEM71在乳腺癌中的免疫调节功能及其对免疫治疗反应的预测价值 | TMEM71的具体作用机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证 | 探索TMEM71在乳腺癌中的预后价值、免疫相关性及治疗意义 | 乳腺癌患者样本及公共数据库数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 免疫浸润分析 | ssGSEA, CIBERSORT, GSEA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和公共scRNA-seq数据集的多个数据库整合 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 4560 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the potential role of estrogen in tuberous sclerosis complex related renal angiomyolipoma
2025-Jul-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02909-1
PMID:40608217
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究雌激素在结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤中的潜在作用 | 首次在单细胞水平揭示TSC-AML中雌激素相关的异质性，发现雌激素通过调控免疫抑制微环境和干细胞样肿瘤形成在女性患者中的特殊作用机制 | 样本量较小（仅4例患者），缺乏功能验证实验 | 探究雌激素在结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤发病机制中的作用 | 结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤患者组织样本 | 单细胞组学 | 结节性硬化症 | 单细胞RNA测序 | AUCell分析, CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 4例TSC-AML患者（2女2男） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |