单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 4541 - 4560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4541 | 2025-01-31 |
Construction and Validation of a Novel T/NK-Cell Prognostic Signature for Pancreatic Cancer Based on Single-Cell RNA Sequencing
2024-Nov, Cancer investigation
IF:1.8Q3
DOI:10.1080/07357907.2024.2424328
PMID:39523741
|
研究论文 | 本文基于单细胞RNA测序数据，构建并验证了一种新的胰腺癌T/NK细胞预后特征模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术，识别出胰腺癌原发肿瘤与肝转移之间的T/NK细胞亚群差异，并构建了基于6个特定基因的预后模型 | 样本量较小，仅包括3名胰腺癌患者的配对原发和转移肿瘤组织 | 研究胰腺癌原发肿瘤与转移肿瘤之间的差异，并构建预后模型 | 胰腺癌患者的原发和转移肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | 3名胰腺癌患者的配对原发和转移肿瘤组织 |
| 4542 | 2025-01-31 |
Scoping Review: Methods and Applications of Spatial Transcriptomics in Tumor Research
2024-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16173100
PMID:39272958
|
综述 | 本文综述了空间转录组学（ST）在肿瘤研究中的方法和应用，总结了当前的方法、趋势和数据分析技术 | 总结了空间转录组学在肿瘤研究中的最新进展和应用，提出了提高研究可重复性和可靠性的建议 | 近一半的研究缺乏全面的数据处理协议，影响了其可重复性 | 探讨空间转录组学在肿瘤研究中的挑战和实际应用 | 肿瘤组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST）、单细胞测序、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、免疫组织化学数据 | 分析了41篇截至2023年底发表的文章和公共数据仓库 |
| 4543 | 2025-01-31 |
Delving deeper into the mechanisms fundamental to HIV-associated immunopathology using single-cell sequencing techniques: A scoping review of current literature
2024-Aug-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35856
PMID:39224354
|
综述 | 本文通过综述14篇已发表的HIV相关单细胞RNA测序研究，探讨了HIV感染和发病机制的潜在机制，并探索了HIV疾病进展和抗病毒治疗的潜在候选生物标志物 | 利用单细胞RNA测序技术深入探讨HIV相关免疫病理学的基本机制，识别特定细胞类型的转录变化，作为HIV疾病监测和治疗靶向的潜在生物标志物 | 综述文章，未进行新的实验研究，依赖于已有文献的分析 | 探讨HIV感染和发病机制的潜在机制，并探索HIV疾病进展和抗病毒治疗的潜在候选生物标志物 | HIV感染者 | 生物信息学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 14篇已发表的研究 |
| 4544 | 2025-01-29 |
Molecular dynamics of chemotactic signalling orchestrates dental pulp stem cell fibrosis during aging
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1530644
PMID:39866843
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了衰老过程中牙髓纤维化的分子机制，特别是Ccrl2巨噬细胞在早期衰老阶段的脆弱性 | 发现了RARRES2/CCRL2/CMKLR1轴在牙髓纤维化中的作用，为针对巨噬细胞和调节免疫微环境的治疗策略提供了新视角 | 研究主要基于单细胞转录组分析，需要进一步的体内实验验证 | 揭示衰老过程中牙髓纤维化的分子机制 | 牙髓干细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 牙髓疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 包括自有和公开数据集中的样本 |
| 4545 | 2025-01-31 |
Tuberculous meningitis diagnosis and treatment: classic approaches and high-throughput pathways
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1543009
PMID:39867878
|
综述 | 本文综述了结核性脑膜炎（TBM）的诊断和治疗方法，包括传统方法和高通量技术 | 探讨了核酸检测、基因组学、代谢组学和蛋白质组学等新技术在TBM诊断中的应用，提高了诊断的敏感性和特异性 | 未提及具体的研究局限性 | 优化TBM诊断策略，探索多组学技术的整合和临床转化 | 结核性脑膜炎（TBM） | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 核酸检测、基因组学、代谢组学、蛋白质组学、Xpert Ultra、mNGS、单细胞测序 | NA | 核酸、代谢物、蛋白质 | NA |
| 4546 | 2025-01-31 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494476
PMID:39867899
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了人类良性前列腺增生（BPH）中浸润的富含脂质的巨噬细胞亚群，并探讨了这些细胞在前列腺体积增大中的作用 | 首次定义了BPH中的两种新的免疫亚群——TREM2high和MARCOhigh巨噬细胞，并揭示了这些富含脂质的巨噬细胞在前列腺体积增大和症状加重中的潜在作用 | 需要进一步研究以评估针对这些细胞的治疗在BPH中的益处 | 探讨巨噬细胞亚群在前列腺体积增大中的作用及其对BPH的影响 | 人类良性前列腺增生（BPH）组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 20个人类前列腺样本（10个大前列腺和10个小前列腺） |
| 4547 | 2025-01-31 |
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517467
PMID:39867910
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了青鳉淋巴细胞发育的独特特征，特别是在胸腺中缺乏完全成熟的T细胞以及肾脏中T系细胞的早期承诺 | 首次在青鳉中通过单细胞转录组分析揭示了其淋巴细胞发育的独特特征，包括胸腺中缺乏完全成熟的T细胞和肾脏中T系细胞的早期承诺 | 研究仅限于青鳉和斑马鱼两种模式生物，可能无法完全代表所有硬骨鱼的淋巴细胞发育机制 | 探讨青鳉和斑马鱼在淋巴细胞发育中的分子和细胞机制的差异 | 青鳉的淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型青鳉的淋巴细胞 |
| 4548 | 2025-01-31 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的功能特征，并探讨了绿原酸对免疫微环境的调节作用及其临床应用潜力 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示胶质瘤相关巨噬细胞的亚群和功能特征，并探索绿原酸对免疫微环境的调节作用 | 研究主要基于小鼠模型和单一临床案例，样本量有限，需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示胶质瘤相关巨噬细胞的亚群和功能特征，探索绿原酸对免疫微环境的调节作用及其临床应用潜力 | 胶质瘤相关巨噬细胞和绿原酸 | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | PPI和分子对接模型 | RNA测序数据 | 小鼠模型和1例临床案例 |
| 4549 | 2025-01-31 |
Genetic variation in patent foramen ovale: a case-control genome-wide association study
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1523304
PMID:39872005
|
研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究（GWAS）识别与卵圆孔未闭（PFO）相关的常见遗传变异 | 首次在全基因组范围内识别与PFO相关的遗传变异，并通过单细胞测序分析验证这些变异在心脏发育中的表达变化 | 研究样本主要来自中国人群，可能限制了结果的普适性 | 识别与卵圆孔未闭（PFO）相关的遗传变异，并探讨其在心脏发育中的作用 | 3,227名中国参与者，包括517例PFO患者和517名匹配对照 | 基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组测序、Sanger测序、单细胞测序 | GWAS、eQTL分析、伪时间轨迹建模 | 基因组数据、单细胞表达数据 | 3,227名中国参与者（517例PFO患者和517名对照），验证队列包括111例PFO患者和152名对照 |
| 4550 | 2025-01-30 |
Integration of histone modification-based risk signature with drug sensitivity analysis reveals novel therapeutic strategies for lower-grade glioma
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1523779
PMID:39872055
|
研究论文 | 本研究旨在开发基于组蛋白修饰的风险特征，并探讨其与药物敏感性的关系，以指导低级别胶质瘤的个性化治疗策略 | 首次构建了基于组蛋白修饰的风险特征模型，并揭示了其与药物敏感性的关联，为低级别胶质瘤的个性化治疗提供了新的视角 | 样本量相对较小，尤其是单细胞RNA测序分析的样本量仅为4个，可能影响结果的普适性 | 开发基于组蛋白修饰的风险特征模型，并探讨其与药物敏感性的关系，以指导低级别胶质瘤的个性化治疗 | 低级别胶质瘤（LGG）患者 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | TCGA-LGG数据集（n = 513），CGGA数据集（n = 693和n = 325），单细胞RNA测序样本（n = 4） |
| 4551 | 2025-01-30 |
Identification of a pancreatic stellate cell gene signature and lncRNA interactions associated with type 2 diabetes progression
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1532609
PMID:39872314
|
研究论文 | 本研究旨在识别2型糖尿病（T2D）胰岛细胞中特定的基因表达模式，并探索胰腺星状细胞（PSCs）通过lncRNA-mRNA相互作用调控网络在T2D进展中的潜在作用 | 发现了一个特定的基因面板（COL1A2、VCAN和SULF1），这些基因在T2D胰岛样本中持续上调，并与PSCs的激活密切相关，揭示了PSCs在T2D进展中的独特作用 | 研究主要依赖于已有的测序数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探索T2D进展中PSCs的基因表达模式和lncRNA-mRNA相互作用 | 2型糖尿病（T2D）胰岛细胞和胰腺星状细胞（PSCs） | 生物信息学 | 2型糖尿病 | bulk sequencing (bulkseq), 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | RNA测序数据 | 多个T2D和T1D的scRNAseq和bulkseq数据集 |
| 4552 | 2025-01-31 |
Computational discovery of co-expressed antigens as dual targeting candidates for cancer therapy through bulk, single-cell, and spatial transcriptomics
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae096
PMID:39872360
|
研究论文 | 本文提出了一种计算管道，用于识别双特异性抗体（bsAbs）的靶点，结合了批量RNA-seq和单细胞RNA-seq的优势，并以肝细胞癌（HCC）为例展示了该方法的实用性 | 结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq的优势，提出了一种新的计算管道，用于识别双特异性抗体的靶点，并通过空间转录组学验证了共表达对 | 单细胞RNA-seq的低覆盖率问题可能影响大规模共表达对的表征 | 识别双特异性抗体的靶点，用于癌症治疗 | 肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝癌 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq), 空间转录组学 | NA | RNA-seq数据 | 39,361个健康细胞和18,000个HCC肿瘤细胞 |
| 4553 | 2025-01-31 |
Multiomics characterization of breast angiosarcoma from an Asian cohort reveals enrichment for angiogenesis signaling pathway and tumor-infiltrating macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1515935
PMID:39872529
|
研究论文 | 本文通过对亚洲人群的乳腺血管肉瘤（AS-B）进行多组学特征分析，揭示了其与血管生成信号通路和肿瘤浸润巨噬细胞的关联 | 首次在亚洲人群中系统性地分析了乳腺血管肉瘤的分子和免疫特征，并与头颈部血管肉瘤（AS-HN）进行了比较 | 样本量较小（AS-B仅16例），且研究仅限于亚洲人群，可能限制了结果的普适性 | 研究乳腺血管肉瘤的分子和免疫特征，探索其与血管生成信号通路的关系 | 亚洲人群中的乳腺血管肉瘤患者（n=16）和头颈部血管肉瘤患者（n=104） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序（WGS）、NanoString基因表达谱分析、10x Genomics Visium空间转录组学 | NA | 基因组数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 176例血管肉瘤患者（其中16例为乳腺血管肉瘤，104例为头颈部血管肉瘤） |
| 4554 | 2025-01-31 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了BATF在急性髓性白血病（AML）中的作用及其作为预后生物标志物和免疫细胞浸润调节剂的潜力 | 首次全面研究了BATF在AML中的表达及其与预后、免疫细胞浸润和药物敏感性的关系，揭示了BATF作为AML治疗靶点的潜力 | 研究主要依赖于数据库分析和体外实验，缺乏大规模的临床验证 | 探讨BATF在AML中的表达及其与预后、免疫细胞浸润和药物敏感性的关系 | 急性髓性白血病（AML）患者和细胞 | 生物信息学 | 急性髓性白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据 |
| 4555 | 2025-01-31 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了纤维化皮肤疾病中免疫细胞的异质性，并发现Th17细胞在瘢痕疙瘩中的比例显著增加 | 首次构建了纤维化皮肤疾病的单细胞图谱，并深入探讨了Th17细胞与成纤维细胞在皮肤纤维化中的相互作用 | 研究未对所有细胞进行基因表达检测，仅富集了免疫细胞，可能遗漏其他细胞类型的信息 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫细胞的复杂细胞景观及其在疾病发展中的作用 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织中的CD45+免疫细胞 | 单细胞RNA测序 | 纤维化皮肤疾病 | 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、Ki-67染色、划痕实验、实时PCR、Western blotting | NA | RNA测序数据 | 瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织样本 |
| 4556 | 2025-01-31 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术、单细胞RNA测序和染色质可及性分析，深入表征了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型和功能多样性 | 首次提供了足月胎盘绒毛髓系细胞的染色质可及性图谱，并揭示了孕前肥胖对绒毛髓系细胞表型和功能的显著影响 | 研究样本仅来自无并发症的足月妊娠，未涵盖早产或其他妊娠并发症的情况 | 探究足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型和功能多样性，以及孕前肥胖对这些细胞的影响 | 人类足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq, CITE-seq）、染色质可及性分析（snATAC-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据 | 足月、无并发症妊娠的绒毛组织样本 |
| 4557 | 2025-01-31 |
Upregulation of interferon-γ response genes in monocytes and T cells identified by single-cell transcriptomics in patients with anti-citrullinated peptide antibody-positive early rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1439082
PMID:39877346
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了抗瓜氨酸肽抗体阳性早期类风湿性关节炎患者中单核细胞和T细胞中干扰素-γ反应基因的上调 | 首次在单细胞水平上比较了ACPA+和ACPA-早期类风湿性关节炎患者的免疫系统差异，并识别了IFITM2和IFITM3作为ACPA+ eRA的潜在关键标志物 | 样本量相对较小，且仅分析了外周血样本，未涉及关节组织 | 探讨抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性早期类风湿性关节炎患者免疫系统的差异 | 抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性早期类风湿性关节炎患者 | 单细胞转录组学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 37,318个细胞 |
| 4558 | 2025-01-30 |
Immunometabolic alterations in type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell RNA sequencing: insights into subtypes and therapeutic targets
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1537909
PMID:39877357
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病（T2DM）中的免疫代谢改变，并探讨了其亚型和治疗靶点 | 首次使用单细胞RNA测序技术对T2DM患者的免疫细胞进行详细分析，揭示了T细胞亚群的代谢异质性，并基于代谢特征对T2DM进行了亚型分类 | 样本量相对较小，仅包括37名T2DM患者和11名健康对照 | 揭示T2DM中的免疫代谢改变，并探索其亚型和潜在治疗靶点 | 2型糖尿病患者和健康对照的外周血单核细胞（PBMCs） | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 37名T2DM患者和11名健康对照 |
| 4559 | 2025-01-31 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to explore prognostic value and immune landscapes of methionine metabolism-related signature in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1521269
PMID:39877420
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，探索了乳腺癌中甲硫氨酸代谢相关特征的预后价值和免疫景观 | 首次构建并验证了基于八个甲硫氨酸相关基因的乳腺癌预后模型，并揭示了APOC1基因在调节巨噬细胞极化和乳腺癌细胞行为中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏临床样本的直接验证 | 探索甲硫氨酸代谢相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫调节作用 | 乳腺癌患者和乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），Cox回归 | RNA测序数据 | 基于TCGA和GEO数据库的乳腺癌患者数据，以及MDA-MB-231和MDA-MB-468乳腺癌细胞系 |
| 4560 | 2025-01-31 |
Revisiting the female germline cell development
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1525729
PMID:39877734
|
综述 | 本文回顾了雌性生殖细胞发育的最新进展，探讨了关键基因调控网络、表观遗传途径、细胞周期调节因子和植物激素在这一过程中的作用 | 利用先进技术如smFISH、LCM、染色质免疫沉淀/测序和CRISPR基因编辑，揭示了雌性生殖细胞发育不同阶段的机制 | NA | 探索雌性生殖细胞发育的机制 | 雌性生殖细胞 | 植物生物学 | NA | smFISH, LCM, 染色质免疫沉淀/测序, CRISPR基因编辑, 单细胞转录组/空间转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA |