单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4521	2025-07-03	Anti-PD-1 cancer immunotherapy induces central nervous system immune-related adverse events by microglia activation 2024-06-12, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adj9672 PMID:38865481	研究论文	本文研究了抗PD-1免疫疗法在癌症治疗中引起的中枢神经系统免疫相关不良事件（CNS-irAEs）及其与小胶质细胞激活的关系	揭示了小胶质细胞在抗PD-1免疫疗法诱导的CNS-irAEs中的关键作用，并提出了基于脾酪氨酸激酶（Syk）抑制的治疗方法	研究主要基于小鼠模型，人类患者数据有限，需要进一步验证	探究抗PD-1免疫疗法引起的中枢神经系统免疫相关不良事件的机制	小鼠模型和接受抗PD-1治疗的患者中枢神经系统组织	免疫疗法	癌症	单细胞RNA测序、成像质谱流式细胞术、蛋白质组学方法	NA	基因表达数据、蛋白质数据、影像数据	小鼠模型和一组接受抗PD-1治疗的患者组织样本
4522	2025-07-03	Single cell spatial transcriptomic profiling of childhood-onset lupus nephritis reveals complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells 2023-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.09.566503 PMID:38014158	research paper	利用单细胞空间转录组技术研究儿童发病型狼疮肾炎中肾脏基质与浸润免疫细胞间的复杂相互作用	首次在儿童发病型狼疮肾炎中应用高分辨率的单细胞空间转录组技术，揭示了免疫细胞在肾脏中的特定区域定位及与基质细胞的基因表达变化	组织学评分与肾小球细胞转录特征在单个肾小球水平上相关性较低，样本量相对较小（8例患者和2例对照）	探索儿童发病型狼疮肾炎的免疫发病机制	儿童发病型狼疮肾炎患者的肾脏组织和浸润免疫细胞	digital pathology	lupus nephritis	单细胞空间转录组技术	NA	单细胞转录组数据	8例儿童发病型狼疮肾炎患者和2例对照的肾脏组织，超过40万个细胞
4523	2025-07-03	Development of a cell-free strategy to recover aged skeletal muscle after disuse 2023-11, The Journal of physiology DOI:10.1113/JP282867 PMID:35318675	研究论文	本研究开发了一种无细胞策略，用于恢复老年人在长期卧床或肢体固定后的骨骼肌萎缩	利用健康供体的周细胞经H2O2刺激产生的小细胞外囊泡（sEVs），有效恢复成年和老年小鼠在废用后的肌纤维大小	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探索一种无细胞方法以改善老年人骨骼肌在废用后的恢复	小鼠骨骼肌中的周细胞及其分泌的小细胞外囊泡（sEVs）	肌肉生物学	肌肉萎缩	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析	小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质组数据	年轻成年和老年小鼠
4524	2025-07-03	Single-cell RNA sequencing reveals gene expression signatures of breast cancer-associated endothelial cells 2018-Feb-16, Oncotarget DOI:10.18632/oncotarget.23760 PMID:29541388	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌相关内皮细胞的基因表达特征	首次通过scRNA-seq技术比较了乳腺癌肿瘤内皮细胞与正常内皮细胞的基因表达差异，并鉴定了与细胞外基质信号通路相关的关键基因	研究样本来源有限，仅针对乳腺癌组织，未涉及其他癌症类型的广泛验证	探究乳腺癌肿瘤内皮细胞的分子特征及其在肿瘤生物学中的作用	人类乳腺癌组织和减乳整形术组织中的内皮细胞	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	PCA分析、层次聚类分析	基因表达数据	未明确说明样本数量（乳腺癌组织与减乳整形术组织的内皮细胞样本）
4525	2025-07-02	Anti-tumor effects on tumor-infiltrating natural killer cells by localized ablative immunotherapy and immune checkpoint inhibitors: An integrated and comparative study using scRNAseq analysis 2025-Sep-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217825 PMID:40436260	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤浸润自然杀伤细胞的抗肿瘤效应	揭示了LAIT和ICI通过不同但互补的机制增强NK细胞介导的抗肿瘤反应，并支持组合免疫疗法策略的开发	研究主要基于小鼠乳腺癌模型，临床相关性需进一步验证	阐明局部消融免疫疗法和免疫检查点抑制剂对肿瘤微环境中NK细胞的调控机制	肿瘤浸润自然杀伤细胞（TINK cells）	免疫治疗	乳腺癌	scRNAseq	NA	基因表达数据	小鼠乳腺癌模型及TCGA数据库中的患者数据
4526	2025-07-02	TSC2/mTORC1 integrates deoxynivalenol signals recognized by membrane receptors IR and EGFR to restrict intestinal stem cell function 2025-Aug-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138769 PMID:40466374	研究论文	该研究探讨了脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）如何通过膜受体IR和EGFR整合信号，进而通过TSC2/mTORC1通路限制肠道干细胞功能	揭示了DON通过膜受体IR和EGFR与TSC2/mTORC1通路的相互作用机制，以及IR/EGFR过表达对DON诱导的肠道干细胞损伤的修复作用	研究主要基于体外和离体模型，未在完整动物模型中验证	探究DON如何通过膜受体信号通路影响肠道干细胞功能	猪肠道类器官和IPEC-J2细胞系	细胞生物学	肠道疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、等温滴定量热法（ITC）	NA	基因表达数据	NA
4527	2025-07-02	Cancer stem cells-derived exosomal TSPAN8 enhances non-stem cancer cells stemness and promotes malignant progression in PDAC 2025-Jul, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03412-1 PMID:40251391	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中癌症干细胞(CSC)通过外泌体TSPAN8增强非干细胞癌细胞(NSCC)的干细胞特性并促进恶性进展的机制	首次发现CSC分泌的TSPAN8富集外泌体通过激活Sonic Hedgehog信号通路增强NSCC的干细胞特性	研究主要基于体外和动物模型，临床转化应用仍需进一步验证	阐明PDAC中CSC通过外泌体介导的细胞间通讯机制	胰腺导管腺癌(PDAC)中的癌症干细胞(CSC)和非干细胞癌细胞(NSCC)	肿瘤生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、外泌体分析	NA	RNA测序数据、外泌体蛋白数据	未明确说明样本数量，使用PDAC细胞系和动物模型
4528	2025-07-02	Neuroprotective liver portal area macrophages attenuate hepatic inflammation 2025-Jul, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-025-02190-y PMID:40537510	research paper	该研究通过整合全肝叶成像和小鼠肝脏中CX3CR1细胞的单细胞RNA测序分析，发现了一种新型的肝门区巨噬细胞（LPAMs），其在维持肝脏免疫稳态中发挥重要作用	识别了一种新型的CX3CR1CD63肝门区巨噬细胞（LPAMs），并揭示了其在肝脏免疫稳态中的独特功能和与交感神经的密切互动	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究肝脏中特定巨噬细胞亚群的功能及其在肝脏免疫稳态中的作用	小鼠肝脏中的CX3CR1细胞	免疫学	非酒精性脂肪性肝炎	全肝叶成像、单细胞RNA测序	NA	图像、RNA测序数据	小鼠肝脏样本
4529	2025-07-02	Infiltrative classical monocyte-derived and SPP1 lipid-associated macrophages mediate inflammation and fibrosis in ANCA-associated glomerulonephritis 2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association DOI:10.1093/ndt/gfae292 PMID:39694817	research paper	该研究通过单细胞转录组分析揭示了ANCA相关性肾小球肾炎中肾脏巨噬细胞的多样性及其在炎症和纤维化中的作用	首次在ANCA相关性肾小球肾炎中鉴定出四种主要巨噬细胞亚群，包括经典单核细胞来源的巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞，并揭示了它们在炎症和纤维化中的不同作用	样本量较小（仅5名AGN患者），且未探讨这些巨噬细胞亚群在其他肾脏疾病中的普遍性	探究ANCA相关性肾小球肾炎中肾脏巨噬细胞的多样性及其在疾病进展中的作用机制	ANCA相关性肾小球肾炎患者的肾脏CD45+免疫细胞	免疫学	ANCA相关性肾小球肾炎	单细胞转录组分析，免疫染色，流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据，免疫组化数据，流式细胞数据	5名活动期AGN患者，1名狼疮性肾炎患者和1名肾切除对照的25,485个新鲜肾脏CD45+免疫细胞
4530	2025-07-02	Identification of key genes and development of an identifying machine learning model for sepsis 2025-Jun-30, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2 DOI:10.1007/s00011-025-02068-7 PMID:40583108	研究论文	本研究旨在通过整合多器官单细胞RNA测序和机器学习，识别脓毒症的关键基因并构建脓毒症识别模型	结合多器官scRNA-seq数据和机器学习方法识别脓毒症关键基因并构建高精度识别模型	需要进一步研究验证发现的关键基因和模型	脓毒症关键基因识别和诊断模型开发	脓毒症小鼠心脏和肺组织样本	机器学习	脓毒症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)	基因表达数据	5个GEO数据集(GSE207363, GSE207651, GSE185263, GSE69063, GSE134347)
4531	2025-07-02	Pan-cancer analysis of enhancer-induced MIR17HG and validation as a SIRT1-promoting factor in colorectal cancer 2025-Jun-30, Medical oncology (Northwood, London, England) DOI:10.1007/s12032-025-02841-y PMID:40586938	研究论文	本研究通过泛癌分析探讨了MIR17HG在恶性肿瘤中的作用，并验证了其在结直肠癌中作为SIRT1促进因子的功能	发现HSF1介导的增强子活性是MIR17HG过表达的新驱动因素，促进SIRT1依赖的结直肠癌进展	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏更深入的体内机制验证	探究MIR17HG在多种癌症中的致癌作用及其在结直肠癌中的调控机制	MIR17HG基因及其在23种肿瘤类型中的表达模式	癌症基因组学	结直肠癌	生物信息学分析、单细胞测序数据分析、敏感性分析、虚拟筛选	NA	基因表达数据、临床样本数据、小鼠样本数据	23种肿瘤类型的表达数据及临床和小鼠样本
4532	2025-07-02	Single-cell transcriptomics reveals Sox6 positive interneurons enriched in the prefrontal cortex of female mice vulnerable to chronic social stress 2025-Jun-28, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-025-03088-9 PMID:40581656	研究论文	本研究通过单细胞转录组学技术揭示了雌性小鼠前额叶皮层中Sox6阳性中间神经元在慢性社交压力易感性中的重要作用	首次发现Sox6中间神经元在雌性小鼠慢性社交压力易感性中的富集现象及其与抑郁样行为的关联	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究女性抑郁症的细胞和分子机制	雌性小鼠前额叶皮层的细胞类型	神经科学	抑郁症	单核RNA测序(snRNA-Seq)，加权基因共表达网络分析(WGCNA)	慢性社交挫败压力(CSDS)小鼠模型	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量，使用雌性小鼠前额叶皮层细胞
4533	2025-07-02	Single-cell sequencing has revealed the palmitoylation landscape in lung adenocarcinoma and identified ABHD17C as a novel biomarker 2025-Jun-27, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.024 PMID:40582697	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了肺腺癌中的蛋白质棕榈酰化景观，并鉴定出ABHD17C作为一种新型生物标志物	首次在单细胞水平上描绘了肺腺癌中的蛋白质棕榈酰化景观，并发现ABHD17C作为C4上皮亚型的关键标志物	研究主要聚焦于肺腺癌，未涉及其他癌症类型	探索肿瘤细胞中蛋白质棕榈酰化的异质性及其在肿瘤进展中的作用	肺腺癌(LUAD)中的上皮细胞	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	未明确说明样本数量，但分析了23种棕榈酰转移酶和7种去棕榈酰转移酶
4534	2025-07-02	Uncovering minimal pathways in melanoma initiation 2025-Jun-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-60742-0 PMID:40571713	研究论文	该研究揭示了黑色素瘤起始过程中的最小通路，特别是在仅携带Braf突变的小鼠中观察到的肿瘤发生机制	发现仅Braf突变即可引发黑色素瘤，并鉴定出一种类似神经嵴的细胞类型作为恶性细胞的前体	未能找到解释大多数肿瘤发生的de novo突变或结构变异	探索黑色素瘤起始的遗传机制和细胞起源	小鼠模型中的黑色素瘤	肿瘤生物学	黑色素瘤	单细胞转录组学	小鼠模型	基因表达数据	NA
4535	2025-07-02	Distinct expression of CD56 and CD19 marks molecular and functional endotypes of tetanus- versus RBD-specific human bone marrow plasma cells 2025-Jun-24, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf059 PMID:40581803	研究论文	本研究探讨了CD19和CD56在抗原特异性和总人类骨髓浆细胞(BMPC)上的共表达，揭示了它们在分子和功能上的差异	首次详细比较了破伤风类毒素(TT)和SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域(RBD)特异性BMPC的CD56和CD19表达模式，并发现了它们在转录特征和功能上的显著差异	研究主要基于流式细胞术和单细胞RNA测序数据，缺乏直接的体内功能验证实验	探究不同抗原特异性骨髓浆细胞亚群的表型和转录特征差异	人类骨髓浆细胞(BMPC)，特别是TT特异性和RBD特异性BMPC亚群	免疫学	传染病(破伤风和COVID-19)	多参数流式细胞术，单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	流式细胞数据，RNA测序数据	未明确说明样本数量的人类骨髓浆细胞
4536	2025-07-02	Direct single cell-type gene expression analysis in peripheral blood: novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for detection of bacterial infection 2025-Jun-23, Human molecular genetics IF:3.1Q2 DOI:10.1093/hmg/ddaf103 PMID:40581066	研究论文	开发了一种名为DIRECT LS-TA的新型比率生物标志物，用于直接从外周血中定量单核细胞特异性基因表达，无需细胞分选	提出了无需细胞分选即可定量单核细胞特异性基因表达的新方法，并鉴定了两个新的单核细胞参考基因PSAP和CTSS	方法在多数据集中的验证结果未提及样本的具体多样性或潜在的混杂因素	开发一种直接从外周血中定量单核细胞特异性基因表达的方法，用于细菌感染的检测	外周血中的单核细胞	基因表达分析	细菌感染	单细胞RNA测序的替代方法，比率生物标志物分析	数学模型的ICEBERG图	基因表达数据	多个数据集，具体样本数量未明确说明
4537	2025-07-02	Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confers multidrug resistance in PCNSL 2025-Jun-21, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf154 PMID:40580931	研究论文	该研究通过单细胞转录组学和B细胞受体测序等方法，揭示了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）中浆母细胞样淋巴瘤细胞（PBLCs）的独特亚群及其在多药耐药中的作用	首次在PCNSL中鉴定出PBLCs这一独特B细胞亚群，并阐明其通过特定基因表达模式导致多药耐药的分子机制	样本量相对有限（56例患者），且PBLCs在肿瘤中的比例较低（1.3%-8.1%）	探究PCNSL的分子特征和多药耐药机制	56例新诊断的PCNSL患者的肿瘤样本	肿瘤生物学	淋巴瘤	单细胞转录组学、B细胞受体测序、转录组信息多重免疫组化、离体药物反应试验	NA	转录组数据、免疫组化数据、药物反应数据	56例PCNSL患者活检样本
4538	2025-07-02	SOX2 regulates foregut squamous epithelial homeostasis and is lost during Barrett's esophagus development 2025-Jun-19, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI190374 PMID:40587339	研究论文	本研究探讨了SOX2在前肠鳞状上皮稳态中的作用及其在Barrett食管发展中的缺失	建立了人类BE类器官生物库，揭示了BE分化中SOX2和CDX2转录因子的平衡作用，并通过小鼠模型验证了SOX2在鳞状上皮分化中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和体外类器官，人类样本的验证仍需进一步研究	探究Barrett食管（BE）发展的分子机制，特别是SOX2在前肠鳞状上皮稳态中的作用	人类BE类器官和小鼠模型	分子生物学	食管腺癌	单细胞转录组学、CUT&RUN分析	小鼠模型（Krt5CreER/+; Sox2∆/∆; ROSA26tdTomato/+）	转录组数据、组织分析数据	人类BE类器官生物库和小鼠模型
4539	2025-07-02	HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity 2025-Jun-16, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2025.06.14.25328971 PMID:40585110	研究论文	本研究探讨了HLA-DQB1*03:01对1型发作性睡病发病年龄的影响，并进行了首个跨种族研究	首次跨种族研究HLA-DQB1*03:01对发作性睡病发病年龄的影响，发现该基因独立于DQA1和种族背景显著影响发病年龄	尚未确定导致疾病的T细胞，病理生理学机制仍需进一步研究	探究HLA-DQB1*03:01对1型发作性睡病发病年龄的影响	5,339例来自中国、欧洲、韩国、日本和美国的1型发作性睡病患者	遗传学	发作性睡病	GWAS, HIBAG, RNA-seq	NA	基因数据	5,339例患者（来自5个国家）
4540	2025-07-02	Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer 2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304 PMID:40358364	研究论文	本研究探讨了PARP抑制剂与雄激素抑制联合治疗在原发性前列腺癌中的作用及其生物学机制	在无同源重组修复通路突变的情况下，探索了PARP抑制剂与雄激素抑制联合治疗的临床效果及生物学机制	研究样本量较小，且未明确长期治疗效果	研究PARP抑制剂与雄激素抑制联合治疗在原发性前列腺癌中的效果及生物学机制	原发性前列腺癌患者	肿瘤学	前列腺癌	IHC、肿瘤基因测序、突变分析、RNA-seq（包括bulk和single-cell RNA-seq）	NA	组织样本	未明确具体样本数量，但涉及诊断活检和根治性前列腺切除术样本