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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4501 | 2026-02-14 |
Deep learning-based multimodal spatial transcriptomics analysis for cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.08.001
PMID:39271260
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书本章节 | 本章探讨了深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的整合应用 | 将深度学习与多模态空间转录组学结合,为癌症诊断和治疗提供全面且可操作的见解,代表了肿瘤学向更精准和个性化方向的范式转变 | NA | 推进癌症诊断、治疗规划和精准医学 | 癌症生物学,包括肿瘤异质性、微环境相互作用和治疗反应 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学,多模态数据分析 | 卷积神经网络 | 多模态数据(包括基因组、蛋白质组、影像和临床数据) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4502 | 2026-02-14 |
Current computational methods for spatial transcriptomics in cancer biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.006
PMID:39271268
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综述 | 本文综述了当前在癌症生物学中用于空间转录组学的计算方法 | NA | NA | 回顾和总结空间转录组学在癌症生物学中的计算分析方法 | 空间转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 计算生物学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4503 | 2026-02-14 |
Data enhancement in the age of spatial biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.008
PMID:39271267
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综述 | 本文综述了空间转录组学与其他数据类型(如单细胞转录组学和详细组织染色图像)整合的计算方法,旨在克服当前空间转录组学技术在分辨率或同时分析基因数量方面的限制 | 深入探讨了整合空间转录组学与互补数据源的计算方法,以克服现有技术在分辨率或基因分析数量上的局限,并强调了这些方法在癌症生物学理解中的革命性潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或新算法开发,主要聚焦于现有挑战和解决方案的概述 | 旨在通过整合空间转录组学与其他数据类型,提升对细胞异质性和微环境的理解,特别是在癌症等复杂疾病中 | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、详细组织染色图像 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞转录组学、组织染色 | NA | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4504 | 2026-02-14 |
Integrated multi-omics single cell atlas of the human retina
2023-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3471275/v1
PMID:38014002
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研究论文 | 本文构建了一个综合多模态的人类视网膜细胞图谱,整合了转录组和染色质可及性数据 | 首次整合了大规模多模态单细胞数据,揭示了超过110种细胞类型,并精细映射了GWAS和eQTL变异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 约240万个细胞,来自55名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4505 | 2026-02-13 |
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2624191
PMID:41606824
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结核病患者肉芽肿淋巴结细针穿刺样本,揭示了细胞组成、感染细胞识别及细胞间通讯网络 | 首次在结核病肉芽肿淋巴结穿刺样本中应用单细胞RNA测序技术,同时检测宿主细胞转录组和结核分枝杆菌RNA,实现感染细胞的单细胞水平识别 | 样本量较小(19例患者),个体间细胞亚群丰度差异较大,穿刺样本可能无法完全代表整个淋巴结的细胞组成 | 解析结核病肉芽肿淋巴结的细胞组成特征和细胞间通讯网络 | 结核病患者的肉芽肿淋巴结细针穿刺样本 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19例结核病患者的淋巴结穿刺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4506 | 2026-02-13 |
Bufei formula attenuates airway mucus hypersecretion in COPD through inhibition of TRIM56-mediated ITGB4 ubiquitination
2026-Apr-24, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121215
PMID:41580166
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研究论文 | 本研究探讨了补肺方通过抑制TRIM56介导的ITGB4泛素化来减轻慢性阻塞性肺疾病气道黏液高分泌的机制 | 首次揭示了补肺方活性组分BFF-4通过靶向TRIM56并抑制其介导的ITGB4泛素化,从而调控MUC5AC表达的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化效果有待进一步验证;分子对接预测的小分子相互作用需要实验证实 | 阐明传统中药补肺方治疗慢性阻塞性肺疾病气道黏液高分泌的具体分子机制 | 香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型、香烟烟雾提取物诱导的气道上皮细胞 | 基础医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | DARTS技术、Co-IP-MS、单细胞测序、分子对接 | 动物疾病模型、细胞模型 | 蛋白质组学数据、单细胞测序数据、分子对接数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4507 | 2026-02-13 |
Temporal transcriptomic profiling of bone autograft healing reveals dynamic immune, vascular, and osteogenic programs
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117771
PMID:41478392
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研究论文 | 本研究通过时序转录组分析揭示了骨自体移植愈合过程中动态的免疫、血管和成骨程序 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术,在小鼠骨膜介导的自体移植模型中系统描绘了14天内移植相关组织的分子和细胞程序动态变化,并发现了供体来源细胞稀少而宿主来源细胞类型转换的现象,提示了愈合过程中活跃的神经血管互作 | 研究基于小鼠模型,结果在人体中的适用性有待验证;观察时间限于14天内,长期愈合过程未涵盖 | 阐明驱动早期骨自体移植整合的分子和细胞程序 | 小鼠骨膜介导的自体移植模型中的移植相关组织 | 数字病理 | 骨科疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4508 | 2026-02-13 |
The role of insulin-like growth factor binding proteins in TGF-β1-induced fibroblast-myofibroblast transition during endometriosis fibrosis
2026-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112362
PMID:41520746
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBPs)在子宫内膜异位症纤维化过程中TGF-β1诱导的成纤维细胞-肌成纤维细胞转化(FMT)中的作用 | 首次定义了IGFBPs在子宫内膜异位症纤维化中的作用,并发现IGFBP6是一种潜在的抗纤维化因子和治疗靶点 | NA | 研究IGFBPs在子宫内膜异位症相关纤维化中TGF-β1诱导的FMT过程中的作用 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜组织及异位子宫内膜基质细胞(EcESCs) | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4509 | 2026-02-13 |
Integrated methylome and hydroxymethylome analysis identifies CAMK2G, NFATC4, and SFRP2 as TET1-regulated drivers of odontoblastic differentiation in human dental pulp cells
2026-Apr, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2026.117775
PMID:41534676
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研究论文 | 本研究通过整合甲基组和羟甲基组分析,揭示了TET1调控的CAMK2G、NFATC4和SFRP2作为人牙髓细胞成牙本质分化的关键驱动因子 | 首次在全基因组水平描绘了人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态,并识别出TET1通过5hmC修饰调控的新表观遗传驱动因子 | 研究主要基于体外细胞模型,未在体内验证这些驱动因子的功能 | 阐明人牙髓细胞成牙本质分化过程中的DNA甲基化动态及TET1介导的调控机制 | 人牙髓细胞 | 表观遗传学 | 牙科疾病 | 微阵列、hMeDIP-seq、scRNA-seq | NA | 基因组DNA甲基化数据、羟甲基化数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4510 | 2026-02-13 |
Zebrafish neural regeneration: mechanistic insights into human nervous system repair
2026-Mar-05, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了斑马鱼在神经再生研究中的关键发现,强调了其在模拟人类神经退行性疾病和指导治疗策略中的转化意义 | 整合了斑马鱼在视网膜、脊髓和大脑中神经再生的多系统机制,并引入了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9等先进技术来解析再生过程中的细胞状态和调控网络 | 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据,且斑马鱼与人类在生理和病理上存在差异,其发现直接转化至临床应用仍需进一步验证 | 解码脊椎动物中枢神经系统的再生机制,以指导人类神经修复的治疗策略 | 斑马鱼(Danio rerio)作为研究模型,聚焦于其视网膜、脊髓和大脑的神经再生过程 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9, 谱系追踪, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4511 | 2026-02-13 |
Spatially resolved single-cell analysis of transcriptomic changes linked with neuropathic pain in human neuromas
2026-Mar-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003907
PMID:41553171
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学,在单细胞分辨率下分析了人类三叉神经和神经瘤的转录组景观,揭示了与神经病理性疼痛相关的细胞和分子变化 | 首次在人类三叉神经和神经瘤中结合单细胞分辨率与空间信息进行分析,并发现了HLA-A在神经病理性疼痛中的新作用 | 样本量相对较小,且研究主要集中于三叉神经损伤,结论在其他类型神经损伤中的普适性有待验证 | 探究与神经病理性疼痛相关的分子机制和细胞组成变化 | 人类三叉神经和神经瘤组织 | 空间转录组学 | 神经病理性疼痛 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及人类三叉神经和神经瘤组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4512 | 2026-02-13 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在Alport综合征小鼠模型中发现了早期上调的Tnfsf15基因,并证明其在疾病早期具有减轻蛋白尿和限制肾小球损伤的保护作用 | 首次在Alport综合征早期阶段,通过单细胞RNA测序技术揭示了Tnfsf15基因在肾小球细胞(尤其是足细胞)中的早期上调现象,并通过基因敲除实验证实了其保护性功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中得到验证;且机制研究尚不深入,Tnfsf15的具体作用通路有待进一步阐明 | 探究Alport综合征早期分子变化,寻找潜在的保护性因子以理解疾病发生机制 | Col4a5 G5X Alport综合征小鼠模型,重点关注肾小球细胞(特别是足细胞) | 单细胞组学 | 肾脏疾病(Alport综合征) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因敲除技术 | NA | 单细胞转录组数据 | Alport小鼠模型在5周龄(发病前)和8周龄(发病早期)的肾小球样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4513 | 2026-02-13 |
[Impact of bone metastasis on the prognosis of lung adenocarcinoma patients treated with third-generation EGFR-TKIs and the underlying mechanisms]
2026-Feb-12, Zhonghua yi xue za zhi
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研究论文 | 本研究评估了骨转移对接受一线第三代EGFR-TKI治疗的肺腺癌患者预后的影响,并通过单细胞RNA测序探索了骨转移导致EGFR-TKI耐药的潜在机制 | 首次结合大规模临床回顾性分析与单细胞RNA测序技术,系统揭示了骨转移肺腺癌患者对第三代EGFR-TKI预后不佳的免疫微环境机制,并构建了基于免疫调控基因的预后评分模型 | 研究为回顾性分析,存在选择偏倚;单细胞测序样本量较小(n=4);验证队列样本量有限 | 评估骨转移对第三代EGFR-TKI治疗肺腺癌患者预后的影响,并探索其耐药机制 | EGFR突变晚期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox回归模型 | 临床数据,单细胞转录组数据 | 临床队列370例患者(161例有骨转移,209例无骨转移);单细胞测序4个样本(2个原发肺肿瘤,2个骨转移灶);TCGA训练队列41例;亚洲验证队列93例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4514 | 2026-02-13 |
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Feb-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514786
PMID:41674342
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞激活蛋白(FAP)通过非酶促机制,经由FAP/PLAUR/ITGB1/FAK轴介导的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用,促进胸主动脉夹层(TAD)的发生发展 | 首次发现FAP在TAD中通过非酶促功能(而非其已知的蛋白酶活性)发挥作用,具体机制是FAP直接结合巨噬细胞上的PLAUR,激活ITGB1/FAK信号通路,驱动促炎巨噬细胞极化 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;FAP非酶促作用的具体结构域和结合位点有待进一步阐明;靶向该通路的治疗策略尚未进行临床前疗效评估 | 探究成纤维细胞激活蛋白(FAP)在胸主动脉夹层(TAD)发病机制中的作用及其分子机制 | 人类TAD组织标本、β-氨基丙腈诱导的小鼠TAD模型、全局性和成纤维细胞特异性Fap基因敲除小鼠 | 病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、表面等离子共振(SPR)、免疫共沉淀(co-IP)、药理学抑制 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确具体样本数量,涉及人类TAD标本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4515 | 2026-02-13 |
SpatialESD: Spatial Ensemble Domain Detection in Spatial Transcriptomics
2026-Feb-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520912
PMID:41677098
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialESD的空间集成域检测方法,用于改进空间转录组学数据中的空间域检测 | SpatialESD通过整合不同空间域检测方法的结果,捕获直接共现模式和多尺度间接关系,提高了空间域检测的鲁棒性和准确性 | NA | 改进空间转录组学数据中的空间域检测任务 | 空间转录组学数据,包括模拟数据集和真实样本(如人脑、乳腺癌和卵巢癌) | 空间转录组学 | 乳腺癌, 卵巢癌 | 空间转录组学 | 集成方法 | 空间转录组学数据 | 多个10x Visium空间转录组学数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 4516 | 2026-02-13 |
Diagnostic model and identification of IGFBP2 as an aging-related biomarker and therapeutic target for systemic sclerosis-associated interstitial lung disease through integrated bioinformatics and machine learning approaches
2026-Feb-12, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004351
PMID:41677271
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了IGFBP2作为系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)的衰老相关生物标志物和治疗靶点 | 结合临床数据、基因表达分析和机器学习算法,首次将IGFBP2鉴定为SSc-ILD的关键衰老相关基因,并构建了诊断模型 | 研究样本量有限(106例患者),且主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证和更大规模临床研究 | 识别SSc-ILD的临床特征和衰老相关遗传标志物,验证IGFBP2在基底细胞衰老和纤维化进展中的作用 | 系统性硬化症患者(SSc-ILD和SSc-NILD组)、小鼠模型、基因表达数据集 | 机器学习 | 系统性硬化症相关间质性肺病 | 基因表达分析、免疫荧光、定量PCR、Western blotting、单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据、临床数据 | 106例患者(73例SSc-ILD,33例SSc-NILD)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4517 | 2026-02-13 |
A systems biology framework uncovers multi-level genetic regulation of dizziness/vertigo through eQTL-GWAS integration and single-cell analysis
2026-Feb-11, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2627258
PMID:41640369
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研究论文 | 本研究通过整合GWAS、eQTL和单细胞分析,构建了一个系统生物学框架,以揭示眩晕/头晕的多层次遗传调控机制 | 首次将GWAS与脑单细胞类型、免疫细胞和血浆的eQTL数据整合,并结合听觉神经的单细胞RNA测序分析,系统性地揭示了眩晕/头晕的遗传和细胞基础 | 研究主要基于遗传关联和表达数据,功能验证和临床转化仍需进一步实验 | 揭示眩晕/头晕的分子机制,发现新的治疗靶点 | 眩晕/头晕患者及相关遗传和表达数据 | 系统生物学 | 神经系统疾病 | GWAS, eQTL分析, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 系统生物学整合框架 | 遗传数据, 表达数据, 单细胞转录组数据 | 涉及多个公共数据集(包括oneK1K免疫细胞等),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4518 | 2026-02-13 |
Efficacy and Safety of Tunlametinib in Adults with Inoperable Neurofibromatosis Type 1-Associated Plexiform Neurofibromas: Phase IIa Trial and Biomarker Research
2026-Feb-11, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3291
PMID:41671075
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研究论文 | 本文报道了tunlametinib在成人不可手术的神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤中的疗效和安全性的IIa期临床试验及生物标志物研究 | 首次在成人PN患者中评估tunlametinib的疗效和安全性,并结合单细胞转录组学分析探索了治疗反应的异质性 | 单臂、开放标签设计,样本量较小(15例),且单细胞测序仅分析了3例患者的样本 | 评估tunlametinib治疗成人不可手术PN的疗效和安全性,并探索生物标志物 | 成人不可手术、放射学可测量的丛状神经纤维瘤患者 | NA | 神经纤维瘤病1型相关丛状神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、患者报告结果、单细胞转录组数据 | 15例成人患者(10男5女,中位年龄27岁) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4519 | 2026-02-13 |
Single-cell resolution of splicing regulation in peripheral blood mononuclear cells uncovers heterogeneity-driven mechanisms underlying human complex traits
2026-Feb-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69325-z
PMID:41672992
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,在欧洲人群的外周血单个核细胞中,系统性地研究了遗传变异对选择性剪接的调控及其与复杂性状的关联机制 | 首次在单细胞分辨率下,系统性地揭示了遗传变异对选择性剪接的细胞类型特异性调控,并阐明了剪接调控作为复杂性状易感位点作用机制的重要性 | 研究仅针对欧洲血统人群,结果可能无法直接推广到其他人群;样本量相对有限(980人) | 探究遗传变异在免疫细胞类型和人口统计学层次上对选择性剪接的调控机制,及其与复杂性状的关联 | 欧洲血统人群的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 复杂性状(多基因性状) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因分型 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因型数据 | 980名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4520 | 2026-02-13 |
B-Cell Landscape in Inflamed Dental Pulp Reveals Potential Autoimmune Involvement
2026-Feb-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251415328
PMID:41673562
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和组织病理学分析,揭示了牙髓炎中B细胞的动态变化及其潜在的自身免疫参与机制 | 首次从B细胞角度全面解析牙髓炎,发现B细胞在炎症中的促炎作用及自身反应性倾向,为牙髓炎发病机制提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型和有限的组织样本,人类样本的验证及长期临床意义需进一步探索 | 探究牙髓炎中B细胞的角色及其在局部病理和全身免疫特征中的潜在贡献 | 健康和炎症状态下的牙髓组织,包括人类和小鼠样本 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 单细胞RNA测序,组织病理学分析,多重免疫荧光,流式细胞术,孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织图像,血清学数据 | 未明确指定样本数量,但包括健康和炎症牙髓组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |