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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4501 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15145
PMID:38010064
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示小细胞肺癌相关恶性胸腔积液的肿瘤免疫微环境特征 | 首次在SCLC-MPE中应用单细胞转录组测序分析肿瘤免疫微环境 | 仅基于单一样本分析,样本量有限 | 揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 | 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8008个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
4502 | 2025-10-06 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
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研究论文 | 提出了一种称为计数分割的灵活框架,用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的统计推断 | 开发了计数分割方法,能够在潜在变量估计后实现有效的统计推断,解决了标准方法无法控制I型错误的问题 | 方法基于泊松假设,可能不适用于不符合此假设的数据类型 | 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计推断框架 | 基因表达数据 | 多能干细胞向心肌细胞分化的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4503 | 2025-10-06 |
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-08-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0593
PMID:37216570
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过T细胞介导的细胞因子信号从免疫抑制表型向免疫激活表型转化的分子机制 | 首次发现CAFs具有表型可塑性,能够通过T细胞来源的IFNγ和TNFα协调调控趋化因子表达,实现从CXCL12+/CXCL9-免疫抑制表型向CXCL12-/CXCL9+免疫激活表型的转化 | 研究主要基于小鼠胰腺腺癌模型,在人类肿瘤中的适用性需要进一步验证 | 探究癌症相关成纤维细胞是否能够适应不同免疫微环境并形成免疫促进性趋化因子谱 | 小鼠胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞和CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4504 | 2025-10-06 |
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2518338
PMID:40596758
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研究论文 | 本研究揭示肠道微生物代谢产物NDGA通过抑制巨噬细胞焦亡调节肠道上皮稳态和炎症的机制 | 首次发现衰老相关肠道菌群失调导致NDGA减少,并通过GSDMD/NR4A1/NLRP3轴调控巨噬细胞焦亡影响结肠炎易感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;机制研究尚未完全阐明NDGA的具体作用靶点 | 探究衰老相关肠道菌群失调在炎症性肠病恶化中的作用机制 | 野生型和IL-10缺陷小鼠、IBD患者和老年人粪便样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 粪便微生物移植、16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类粪便样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
4505 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
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撤稿声明 | 因同行评审过程存在问题而撤回已发表的单细胞转录组分析研究论文 | NA | NA | NA | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4506 | 2025-10-06 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70021
PMID:40580015
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研究论文 | 本研究通过构建Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,追踪发育过程中鼻子区域的早期迁移神经元 | 开发了新型的Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,首次实现对嗅觉系统早期迁移神经元的时间可控性追踪和操作 | 研究主要聚焦于啮齿类动物模型,结果向其他物种的推广性需要进一步验证 | 研究胚胎发育过程中嗅觉系统神经元的迁移机制 | 啮齿类动物发育过程中鼻子区域的早期迁移神经元,特别是终末神经神经元 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪,Cre-loxP系统 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4507 | 2025-10-06 |
Cellular heterogeneity and patterning strategies as revealed by upper respiratory epithelium single cell atlas
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112845
PMID:40612507
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序结合空间验证构建了小鼠上呼吸道上皮细胞图谱 | 首次结合单细胞RNA测序与空间验证揭示上呼吸道上皮细胞的18种类型及其三维空间分布模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 解析上呼吸道上皮细胞的异质性和空间分布模式 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组验证 | NA | 单细胞转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4508 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Highlights a Contribution of Human Amniotic Mesenchymal Stem Cells-Derived Exosomes to Androgenetic Alopecia
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500853R
PMID:40622121
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示人羊膜间充质干细胞外泌体通过Wnt/β-catenin信号通路促进雄激素性脱发模型小鼠毛发生长的分子机制 | 首次在单细胞水平解析hAMSC-exo促进毛发生长的细胞图谱和分子机制,发现其通过增强毛囊细胞与真皮乳头细胞间的通讯并改善线粒体功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证;机制研究主要聚焦Wnt/β-catenin通路,可能存在其他未探索的调控途径 | 探索人羊膜间充质干细胞外泌体对雄激素性脱发的治疗作用及分子机制 | 雄激素性脱发模型小鼠的背部皮肤组织 | 单细胞组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4509 | 2025-10-06 |
Impact of IKCa Channels on CD34+ Cells in Arteriole Remodeling in Angiotensin II-Induced Hypertension Model Mice
2025-Jul-09, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究探讨了IKCa通道在Ang II诱导的高血压模型中CD34+细胞介导的动脉内皮修复作用 | 首次揭示非骨髓来源的CD34+细胞通过IKCa通道调控ERK/P38信号通路参与高血压血管修复的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明高血压条件下内皮修复的细胞分子机制 | CD34+细胞在Ang II诱导的高血压小鼠动脉重塑中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,transwell迁移实验,膜片钳技术,骨髓移植 | NA | 基因表达数据,图像数据,电生理数据 | Ang II处理的高血压模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4510 | 2025-10-06 |
Proneural-Mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Jul-08, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf160
PMID:40627673
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中同时表达前神经和间充质标记的混合细胞亚群对常规疗法具有耐药性 | 首次发现并表征了胶质母细胞瘤中前神经-间充质混合细胞亚群,揭示了其通过核质转运机制介导治疗抵抗的新机制 | 研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤细胞可塑性及其治疗抵抗的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞,特别是前神经-间充质混合细胞亚群 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 核蛋白质组学, 高分辨率成像, 正交小鼠模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 多个患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4511 | 2025-10-06 |
Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics
2025-Jul-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00343-5
PMID:40629105
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研究论文 | 通过单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示儿童暴发性心肌炎的外周免疫失衡特征 | 首次系统描绘儿童暴发性心肌炎急性期和恢复期的外周免疫细胞图谱,发现多种独特细胞类型及CXCR4、S100A家族基因的广泛高表达 | 样本量有限,未明确验证IL-10和TGFB1在治疗中的具体作用机制 | 解析暴发性心肌炎的外周免疫病理机制 | 儿童暴发性心肌炎患者外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序, TCR/BCR分析, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, TCR/BCR序列数据, 蛋白质组数据 | 儿童暴发性心肌炎患者急性期和恢复期样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
4512 | 2025-10-06 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
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研究论文 | 本研究揭示了肠道和肝内CD8+ T细胞的相反调控在酒精性肝病进展中的关键作用 | 首次发现肠道和肝内CD8+ T细胞在酒精性肝病中呈现相反的变化趋势,并证明BCL2在调控这些细胞存活中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大 | 探究肠道和肝内CD8+ T淋巴细胞在酒精性肝病中的调控机制及其贡献 | 酒精性肝病患者和野生型、CD8特异性Bcl2转基因及Cd8基因敲除小鼠 | 免疫学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 酒精性肝病患者和多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4513 | 2025-10-06 |
Regulation of revival stem cell differentiation by CREPT/RPRD1B during intestinal regeneration
2025-Jul-07, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01434-6
PMID:40624542
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研究论文 | 本研究揭示了CREPT/RPRD1B在肠道再生过程中调控复苏干细胞分化的机制 | 首次发现CREPT/RPRD1B蛋白在肠道再生过程中对复苏干细胞分化的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证 | 探究肠道再生过程中复苏干细胞分化的调控机制 | 小鼠肠道复苏干细胞 | 干细胞生物学 | 肠道损伤修复 | 单细胞转录组分析,谱系追踪,基因敲除 | Villin-Cre介导的CREPT敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4514 | 2025-10-06 |
Glioma promotes macrophage immunosuppressive phenotype through ANXA1 in a methionine metabolism-dependent manner
2025-Jul-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03112-y
PMID:40618309
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研究论文 | 本研究探讨了胶质瘤中甲硫氨酸代谢与肿瘤免疫抑制微环境的关系,发现胶质瘤通过ANXA1以甲硫氨酸代谢依赖的方式促进巨噬细胞免疫抑制表型 | 首次揭示胶质瘤细胞通过甲硫氨酸代谢上调ANXA1表达,促进巨噬细胞M2极化和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要更多体内实验验证 | 探究甲硫氨酸代谢在胶质瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 胶质瘤患者队列、胶质瘤细胞、巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 胶质瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4515 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas reveals mitophagy dynamics in acute chemical injury model and the role of MSCs transplantation
2025-Jul-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04491-3
PMID:40619426
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示急性肝损伤模型中线粒体自噬动态及间充质干细胞移植的作用 | 首次构建了急性肝衰竭的单细胞转录组图谱,揭示了不同细胞类型中线粒体自噬的差异状态及MSCs治疗的调节机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化价值需要进一步验证 | 探索MSCs治疗急性肝衰竭过程中肝细胞和巨噬细胞中线粒体自噬的不同状态 | 健康小鼠、急性肝衰竭小鼠和人脐带间充质干细胞移植小鼠的肝组织 | 单细胞组学 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠肝组织样本(健康组、ALF组、hUC-MSC移植组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4516 | 2025-10-06 |
Systematic assessment of microenvironment-dependent transcriptional patterns and intercellular communication
2025-Jul-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03677-5
PMID:40619422
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统评估空间微环境对基因表达和细胞间通讯的影响 | 首次系统性地将scRNA-seq与空间转录组学结合,评估空间生态位对细胞转录模式和细胞间通讯的影响 | 使用scRNA-seq数据捕捉生态位特异性分子相互作用存在局限性,即使利用空间信息也难以完全揭示细胞间通讯动态 | 研究空间微环境如何影响基因表达和细胞间通讯 | 乳腺癌、大脑皮层和心脏组织样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 配体-受体对分析 | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4517 | 2025-10-06 |
The impact of T cells on immune-related liver diseases: an overview
2025-Jul-04, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00387-0
PMID:40616144
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综述 | 概述T细胞在免疫相关肝病中的作用机制及最新治疗策略 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学等组学技术揭示T细胞在肝纤维化进程中的新功能 | 未涉及病毒性肝病,且存在领域内尚未解决的重要需求 | 探讨T细胞在非病毒性免疫相关肝病中的生物学作用及治疗靶点 | 自身免疫性肝炎、原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎和代谢相关脂肪性肝炎 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 人类和小鼠组织小样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4518 | 2025-10-06 |
Unraveling the oxidative stress landscape in diabetic foot ulcers: insights from bulk RNA and single-cell RNA sequencing data
2025-Jul-04, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00672-5
PMID:40616164
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的分子机制和诊断标志物 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据系统描绘糖尿病足溃疡的氧化应激景观,发现BCL2和FOXP2作为诊断标志物,并揭示成纤维细胞在氧化应激中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对初步,需要进一步的功能实验确认机制 | 揭示糖尿病足溃疡中氧化应激的分子机制和潜在治疗靶点 | 糖尿病足溃疡患者组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习, 体外实验 | SVM-RFE, LASSO, RF | 基因表达数据, 单细胞数据 | 31,787个细胞(来自10个不同细胞群) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
4519 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of ecto-mesenchymal cells derived from the neural crest reveals the regulatory role of P75NTR in odontogenic and osteogenic differentiation
2025-Jul-03, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-06399-z
PMID:40611059
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析p75NTR基因在神经嵴来源外胚间充质干细胞成牙和成骨分化中的调控作用 | 首次在单细胞水平揭示p75NTR通过调控细胞因子网络影响外胚间充质干细胞迁移、增殖和分化的分子机制 | 研究仅使用小鼠胚胎模型,未在人类样本中验证结果 | 探索p75NTR对颌面部发育过程中硬组织形成的影响机制 | p75NTR基因敲除和野生型小鼠胚胎的外胚间充质干细胞 | 单细胞组学 | 颌面部发育异常 | 单细胞RNA测序, 矿化诱导实验, 伤口愈合实验 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | p75NTR-/-和p75NTR+/+小鼠胚胎外胚间充质干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4520 | 2025-10-06 |
Maximum likelihood inference of time-scaled cell lineage trees with mixed-type missing data using LAML
2025-Jul-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03649-9
PMID:40604857
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研究论文 | 提出一种基于最大似然推断的时间尺度细胞谱系树重建方法LAML,用于分析动态谱系追踪数据 | 开发了概率混合类型缺失模型来描述动态谱系追踪系统特征,首次实现同时推断树拓扑结构和代表实验时间的分支长度 | NA | 从动态谱系追踪数据中准确推断细胞谱系树结构 | 细胞谱系树和细胞迁移时间 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序,基因组编辑 | 最大似然估计,概率混合类型缺失模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序,动态谱系追踪 | NA | NA |